MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Yersinia pestis KIM plasmid pMT-1

Total Repeats: 40

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004838	CG	4	8	182	189	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_004838	AG	3	6	291	296	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004838	AG	3	6	496	501	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004838	CT	3	6	699	704	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_004838	CT	3	6	1887	1892	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_004838	CT	3	6	1929	1934	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7	NC_004838	TG	3	6	2112	2117	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004838	AT	3	6	2152	2157	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004838	AG	3	6	2255	2260	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004838	CT	3	6	2291	2296	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_004838	TC	3	6	2399	2404	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_004838	TA	3	6	13179	13184	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004838	TA	3	6	16191	16196	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004838	TA	4	8	19653	19660	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004838	AT	3	6	19681	19686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004838	TA	3	6	28499	28504	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004838	CT	3	6	29341	29346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_004838	AT	3	6	45580	45585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004838	GT	3	6	52553	52558	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004838	CG	3	6	53832	53837	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
21	NC_004838	TC	3	6	53895	53900	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_004838	TA	3	6	58517	58522	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004838	GT	3	6	61767	61772	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004838	AT	3	6	61802	61807	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004838	TA	3	6	65818	65823	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004838	CG	3	6	69750	69755	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_004838	CG	3	6	70186	70191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_004838	TG	3	6	72757	72762	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004838	AC	3	6	75916	75921	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_004838	AC	3	6	76765	76770	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_004838	TG	3	6	78193	78198	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004838	CT	3	6	81686	81691	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_004838	AG	3	6	82450	82455	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004838	CG	3	6	83442	83447	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_004838	AC	3	6	85031	85036	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_004838	AT	3	6	87487	87492	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004838	TA	3	6	87494	87499	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004838	CT	3	6	88797	88802	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_004838	AT	3	6	98025	98030	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004838	TA	3	6	100390	100395	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.