MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Yersinia pestis KIM plasmid pMT-1

Total Repeats: 95

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004838	T	6	6	3654	3659	0 %	100 %	0 %	0 %	31795336
2	NC_004838	T	6	6	4377	4382	0 %	100 %	0 %	0 %	31795336
3	NC_004838	C	7	7	4427	4433	0 %	0 %	0 %	100 %	31795336
4	NC_004838	A	7	7	4591	4597	100 %	0 %	0 %	0 %	31795337
5	NC_004838	A	7	7	6509	6515	100 %	0 %	0 %	0 %	31795340
6	NC_004838	A	6	6	8943	8948	100 %	0 %	0 %	0 %	31795342
7	NC_004838	T	6	6	9577	9582	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004838	T	6	6	10311	10316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004838	T	6	6	11808	11813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004838	A	6	6	11913	11918	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004838	A	6	6	11961	11966	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004838	A	6	6	12233	12238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004838	T	6	6	12484	12489	0 %	100 %	0 %	0 %	31795349
14	NC_004838	T	6	6	12928	12933	0 %	100 %	0 %	0 %	31795349
15	NC_004838	T	6	6	13064	13069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004838	A	8	8	13081	13088	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004838	C	7	7	13377	13383	0 %	0 %	0 %	100 %	39980767
18	NC_004838	T	6	6	15491	15496	0 %	100 %	0 %	0 %	31795353
19	NC_004838	T	6	6	16338	16343	0 %	100 %	0 %	0 %	31795354
20	NC_004838	A	6	6	16961	16966	100 %	0 %	0 %	0 %	39980768
21	NC_004838	A	6	6	21810	21815	100 %	0 %	0 %	0 %	31795362
22	NC_004838	A	6	6	23198	23203	100 %	0 %	0 %	0 %	31795362
23	NC_004838	A	6	6	25719	25724	100 %	0 %	0 %	0 %	31795365
24	NC_004838	A	6	6	28577	28582	100 %	0 %	0 %	0 %	31795371
25	NC_004838	G	6	6	36953	36958	0 %	0 %	100 %	0 %	31795378
26	NC_004838	A	6	6	37718	37723	100 %	0 %	0 %	0 %	31795379
27	NC_004838	A	6	6	42353	42358	100 %	0 %	0 %	0 %	31795380
28	NC_004838	G	6	6	42411	42416	0 %	0 %	100 %	0 %	31795380
29	NC_004838	T	6	6	45415	45420	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004838	G	6	6	46733	46738	0 %	0 %	100 %	0 %	31795384
31	NC_004838	T	6	6	47330	47335	0 %	100 %	0 %	0 %	31795385
32	NC_004838	A	6	6	49171	49176	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004838	T	6	6	49480	49485	0 %	100 %	0 %	0 %	31795390
34	NC_004838	T	6	6	50423	50428	0 %	100 %	0 %	0 %	31795391
35	NC_004838	A	6	6	50563	50568	100 %	0 %	0 %	0 %	31795391
36	NC_004838	T	6	6	50581	50586	0 %	100 %	0 %	0 %	31795391
37	NC_004838	A	6	6	50900	50905	100 %	0 %	0 %	0 %	31795391
38	NC_004838	A	6	6	50935	50940	100 %	0 %	0 %	0 %	31795391
39	NC_004838	A	7	7	52131	52137	100 %	0 %	0 %	0 %	31795392
40	NC_004838	T	6	6	52259	52264	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004838	T	7	7	52335	52341	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004838	A	7	7	52360	52366	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004838	A	6	6	52436	52441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004838	A	6	6	52591	52596	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004838	T	9	9	56448	56456	0 %	100 %	0 %	0 %	31795399
46	NC_004838	T	6	6	56506	56511	0 %	100 %	0 %	0 %	31795399
47	NC_004838	T	6	6	56607	56612	0 %	100 %	0 %	0 %	31795399
48	NC_004838	T	7	7	56805	56811	0 %	100 %	0 %	0 %	31795399
49	NC_004838	T	6	6	57107	57112	0 %	100 %	0 %	0 %	31795399
50	NC_004838	T	7	7	57269	57275	0 %	100 %	0 %	0 %	31795399
51	NC_004838	G	6	6	57461	57466	0 %	0 %	100 %	0 %	31795399
52	NC_004838	A	8	8	58161	58168	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004838	A	6	6	58384	58389	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004838	T	6	6	58405	58410	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004838	A	6	6	58597	58602	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004838	T	7	7	58619	58625	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004838	T	6	6	60720	60725	0 %	100 %	0 %	0 %	31795403
58	NC_004838	T	6	6	60781	60786	0 %	100 %	0 %	0 %	31795403
59	NC_004838	T	8	8	61500	61507	0 %	100 %	0 %	0 %	31795405
60	NC_004838	T	6	6	61761	61766	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004838	T	6	6	64035	64040	0 %	100 %	0 %	0 %	31795408
62	NC_004838	A	6	6	66834	66839	100 %	0 %	0 %	0 %	31795412
63	NC_004838	A	6	6	67968	67973	100 %	0 %	0 %	0 %	39980775
64	NC_004838	T	6	6	69202	69207	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004838	A	6	6	70763	70768	100 %	0 %	0 %	0 %	31795420
66	NC_004838	A	7	7	70778	70784	100 %	0 %	0 %	0 %	31795420
67	NC_004838	A	6	6	73778	73783	100 %	0 %	0 %	0 %	31795421
68	NC_004838	C	6	6	74375	74380	0 %	0 %	0 %	100 %	31795422
69	NC_004838	T	6	6	77008	77013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004838	A	6	6	77374	77379	100 %	0 %	0 %	0 %	39980776
71	NC_004838	A	6	6	77777	77782	100 %	0 %	0 %	0 %	39980776
72	NC_004838	G	6	6	78909	78914	0 %	0 %	100 %	0 %	39980777
73	NC_004838	G	6	6	80073	80078	0 %	0 %	100 %	0 %	31795427
74	NC_004838	G	6	6	80195	80200	0 %	0 %	100 %	0 %	31795427
75	NC_004838	A	8	8	80410	80417	100 %	0 %	0 %	0 %	31795427
76	NC_004838	A	6	6	80663	80668	100 %	0 %	0 %	0 %	31795427
77	NC_004838	T	7	7	80720	80726	0 %	100 %	0 %	0 %	31795427
78	NC_004838	A	6	6	80788	80793	100 %	0 %	0 %	0 %	31795427
79	NC_004838	A	6	6	81136	81141	100 %	0 %	0 %	0 %	31795427
80	NC_004838	A	6	6	81522	81527	100 %	0 %	0 %	0 %	31795427
81	NC_004838	A	6	6	81595	81600	100 %	0 %	0 %	0 %	31795427
82	NC_004838	A	7	7	81737	81743	100 %	0 %	0 %	0 %	31795428
83	NC_004838	T	7	7	82541	82547	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004838	T	6	6	82668	82673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004838	T	7	7	82816	82822	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004838	T	6	6	84187	84192	0 %	100 %	0 %	0 %	31795430
87	NC_004838	A	7	7	87205	87211	100 %	0 %	0 %	0 %	31795432
88	NC_004838	A	6	6	87455	87460	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004838	T	6	6	92944	92949	0 %	100 %	0 %	0 %	31795436
90	NC_004838	T	6	6	93588	93593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004838	A	6	6	94076	94081	100 %	0 %	0 %	0 %	31795437
92	NC_004838	T	6	6	99148	99153	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004838	A	6	6	99613	99618	100 %	0 %	0 %	0 %	31795443
94	NC_004838	A	6	6	99623	99628	100 %	0 %	0 %	0 %	31795443
95	NC_004838	A	6	6	100956	100961	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.