MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Yersinia pestis KIM plasmid pMT-1

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004838	T	6	6	3654	3659	0 %	100 %	0 %	0 %	31795336
2	NC_004838	T	6	6	4377	4382	0 %	100 %	0 %	0 %	31795336
3	NC_004838	C	7	7	4427	4433	0 %	0 %	0 %	100 %	31795336
4	NC_004838	A	7	7	4591	4597	100 %	0 %	0 %	0 %	31795337
5	NC_004838	A	7	7	6509	6515	100 %	0 %	0 %	0 %	31795340
6	NC_004838	A	6	6	8943	8948	100 %	0 %	0 %	0 %	31795342
7	NC_004838	T	6	6	12484	12489	0 %	100 %	0 %	0 %	31795349
8	NC_004838	T	6	6	12928	12933	0 %	100 %	0 %	0 %	31795349
9	NC_004838	C	7	7	13377	13383	0 %	0 %	0 %	100 %	39980767
10	NC_004838	T	6	6	15491	15496	0 %	100 %	0 %	0 %	31795353
11	NC_004838	T	6	6	16338	16343	0 %	100 %	0 %	0 %	31795354
12	NC_004838	A	6	6	16961	16966	100 %	0 %	0 %	0 %	39980768
13	NC_004838	A	6	6	21810	21815	100 %	0 %	0 %	0 %	31795362
14	NC_004838	A	6	6	23198	23203	100 %	0 %	0 %	0 %	31795362
15	NC_004838	A	6	6	25719	25724	100 %	0 %	0 %	0 %	31795365
16	NC_004838	A	6	6	28577	28582	100 %	0 %	0 %	0 %	31795371
17	NC_004838	G	6	6	36953	36958	0 %	0 %	100 %	0 %	31795378
18	NC_004838	A	6	6	37718	37723	100 %	0 %	0 %	0 %	31795379
19	NC_004838	A	6	6	42353	42358	100 %	0 %	0 %	0 %	31795380
20	NC_004838	G	6	6	42411	42416	0 %	0 %	100 %	0 %	31795380
21	NC_004838	G	6	6	46733	46738	0 %	0 %	100 %	0 %	31795384
22	NC_004838	T	6	6	47330	47335	0 %	100 %	0 %	0 %	31795385
23	NC_004838	T	6	6	49480	49485	0 %	100 %	0 %	0 %	31795390
24	NC_004838	T	6	6	50423	50428	0 %	100 %	0 %	0 %	31795391
25	NC_004838	A	6	6	50563	50568	100 %	0 %	0 %	0 %	31795391
26	NC_004838	T	6	6	50581	50586	0 %	100 %	0 %	0 %	31795391
27	NC_004838	A	6	6	50900	50905	100 %	0 %	0 %	0 %	31795391
28	NC_004838	A	6	6	50935	50940	100 %	0 %	0 %	0 %	31795391
29	NC_004838	A	7	7	52131	52137	100 %	0 %	0 %	0 %	31795392
30	NC_004838	T	9	9	56448	56456	0 %	100 %	0 %	0 %	31795399
31	NC_004838	T	6	6	56506	56511	0 %	100 %	0 %	0 %	31795399
32	NC_004838	T	6	6	56607	56612	0 %	100 %	0 %	0 %	31795399
33	NC_004838	T	7	7	56805	56811	0 %	100 %	0 %	0 %	31795399
34	NC_004838	T	6	6	57107	57112	0 %	100 %	0 %	0 %	31795399
35	NC_004838	T	7	7	57269	57275	0 %	100 %	0 %	0 %	31795399
36	NC_004838	G	6	6	57461	57466	0 %	0 %	100 %	0 %	31795399
37	NC_004838	T	6	6	60720	60725	0 %	100 %	0 %	0 %	31795403
38	NC_004838	T	6	6	60781	60786	0 %	100 %	0 %	0 %	31795403
39	NC_004838	T	8	8	61500	61507	0 %	100 %	0 %	0 %	31795405
40	NC_004838	T	6	6	64035	64040	0 %	100 %	0 %	0 %	31795408
41	NC_004838	A	6	6	66834	66839	100 %	0 %	0 %	0 %	31795412
42	NC_004838	A	6	6	67968	67973	100 %	0 %	0 %	0 %	39980775
43	NC_004838	A	6	6	70763	70768	100 %	0 %	0 %	0 %	31795420
44	NC_004838	A	7	7	70778	70784	100 %	0 %	0 %	0 %	31795420
45	NC_004838	A	6	6	73778	73783	100 %	0 %	0 %	0 %	31795421
46	NC_004838	C	6	6	74375	74380	0 %	0 %	0 %	100 %	31795422
47	NC_004838	A	6	6	77374	77379	100 %	0 %	0 %	0 %	39980776
48	NC_004838	A	6	6	77777	77782	100 %	0 %	0 %	0 %	39980776
49	NC_004838	G	6	6	78909	78914	0 %	0 %	100 %	0 %	39980777
50	NC_004838	G	6	6	80073	80078	0 %	0 %	100 %	0 %	31795427
51	NC_004838	G	6	6	80195	80200	0 %	0 %	100 %	0 %	31795427
52	NC_004838	A	8	8	80410	80417	100 %	0 %	0 %	0 %	31795427
53	NC_004838	A	6	6	80663	80668	100 %	0 %	0 %	0 %	31795427
54	NC_004838	T	7	7	80720	80726	0 %	100 %	0 %	0 %	31795427
55	NC_004838	A	6	6	80788	80793	100 %	0 %	0 %	0 %	31795427
56	NC_004838	A	6	6	81136	81141	100 %	0 %	0 %	0 %	31795427
57	NC_004838	A	6	6	81522	81527	100 %	0 %	0 %	0 %	31795427
58	NC_004838	A	6	6	81595	81600	100 %	0 %	0 %	0 %	31795427
59	NC_004838	A	7	7	81737	81743	100 %	0 %	0 %	0 %	31795428
60	NC_004838	T	6	6	84187	84192	0 %	100 %	0 %	0 %	31795430
61	NC_004838	A	7	7	87205	87211	100 %	0 %	0 %	0 %	31795432
62	NC_004838	T	6	6	92944	92949	0 %	100 %	0 %	0 %	31795436
63	NC_004838	A	6	6	94076	94081	100 %	0 %	0 %	0 %	31795437
64	NC_004838	A	6	6	99613	99618	100 %	0 %	0 %	0 %	31795443
65	NC_004838	A	6	6	99623	99628	100 %	0 %	0 %	0 %	31795443

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.