MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Mycoplasma gallisepticum str. R(low) chromosome

Total Repeats: 539

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004829	ATATTT	2	12	82	93	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004829	AACTAA	2	12	4206	4217	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	31544207
3	NC_004829	GCAATC	2	12	5895	5906	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	294660184
4	NC_004829	GATCTT	2	12	6138	6149	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_004829	AGAAAA	2	12	8488	8499	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	31544211
6	NC_004829	AATCTT	2	12	9894	9905	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	31544213
7	NC_004829	CTGATA	2	12	14026	14037	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294660189
8	NC_004829	ACCTGA	2	12	20004	20015	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	294660193
9	NC_004829	CACTAC	2	12	20039	20050	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	294660193
10	NC_004829	CATTAG	2	12	22272	22283	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294660194
11	NC_004829	TCAAGA	2	12	25328	25339	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	31544225
12	NC_004829	TTAATG	2	12	25809	25820	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	31544225
13	NC_004829	CAAAGA	2	12	27056	27067	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	31544225
14	NC_004829	TGATCT	2	12	28015	28026	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	31544225
15	NC_004829	ATTATC	2	12	32748	32759	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294660198
16	NC_004829	GCTAAA	2	12	33544	33555	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294660198
17	NC_004829	AACTAA	2	12	34526	34537	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	294660198
18	NC_004829	AAGCAA	2	12	35640	35651	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	294660200
19	NC_004829	TGAAGA	2	12	36574	36585	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	294660201
20	NC_004829	AGCTAA	2	12	37622	37633	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294660202
21	NC_004829	AATAAC	2	12	41101	41112	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	31544235
22	NC_004829	CATTAG	2	12	44962	44973	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294660204
23	NC_004829	TTAAGA	2	12	47575	47586	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	31544240
24	NC_004829	CTAAAG	2	12	52433	52444	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294660207
25	NC_004829	AATCGT	2	12	56555	56566	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294660209
26	NC_004829	TTGAGC	2	12	57694	57705	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	31544247
27	NC_004829	ACCTAA	2	12	58258	58269	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	31544247
28	NC_004829	AAACCA	2	12	60427	60438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31544249
29	NC_004829	TTATAT	3	18	61402	61419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004829	AAAATC	2	12	65985	65996	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	31544253
31	NC_004829	AAGAAA	2	12	68596	68607	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	31544258
32	NC_004829	TTTATG	2	12	69836	69847	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	31544260
33	NC_004829	AACAAA	2	12	70803	70814	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	161511517
34	NC_004829	AGGTAA	2	12	71119	71130	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	31544262
35	NC_004829	AGTTAA	2	12	72660	72671	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	31544266
36	NC_004829	TAAAGG	2	12	74402	74413	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	31544270
37	NC_004829	TAGGTG	2	12	79856	79867	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	31544277
38	NC_004829	AAGCGA	2	12	81167	81178	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_004829	ATATCG	2	12	83497	83508	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_004829	CTATTT	2	12	85167	85178	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	294660220
41	NC_004829	AATATT	2	12	85850	85861	50 %	50 %	0 %	0 %	294660220
42	NC_004829	AATAAA	2	12	87349	87360	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	294660221
43	NC_004829	ATTTAG	2	12	87392	87403	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	294660221
44	NC_004829	AATGTT	2	12	89494	89505	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	31544280
45	NC_004829	AATCTT	2	12	91576	91587	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	31544282
46	NC_004829	GATCAT	2	12	91637	91648	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	31544282
47	NC_004829	AAGAAA	2	12	98329	98340	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	294660225
48	NC_004829	CTTGAT	2	12	100838	100849	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	31544290
49	NC_004829	GTGCAA	2	12	104282	104293	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	294660226
50	NC_004829	AAAACA	2	12	106890	106901	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	294660228
51	NC_004829	CAAAAG	2	12	109559	109570	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	31544296
52	NC_004829	GTTTTA	2	12	110479	110490	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	294660231
53	NC_004829	TTAAAG	2	12	114582	114593	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	294660232
54	NC_004829	TAGAAG	2	12	117357	117368	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	294660233
55	NC_004829	ATCCAT	2	12	119783	119794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31544300
56	NC_004829	TTTCTC	2	12	121945	121956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31544301
57	NC_004829	CCAATC	2	12	123164	123175	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	294660234
58	NC_004829	ATTAAT	2	12	124088	124099	50 %	50 %	0 %	0 %	294660234
59	NC_004829	ATTTAT	2	12	125023	125034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294660235
60	NC_004829	GCTTGA	2	12	125726	125737	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294660236
61	NC_004829	CTTTAA	2	12	129134	129145	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294660237
62	NC_004829	ATAAAT	2	12	131344	131355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31544308
63	NC_004829	TTAGTT	2	12	134728	134739	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004829	AAACAA	2	12	136918	136929	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_004829	ACAGAA	2	12	139034	139045	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	294660242
66	NC_004829	TTGCTG	2	12	139299	139310	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	294660243
67	NC_004829	CTCGAT	2	12	142089	142100	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	294660245
68	NC_004829	GAACAA	3	18	144128	144145	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	294660246
69	NC_004829	AAAAAG	2	12	144297	144308	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	294660246
70	NC_004829	AAAACA	2	12	145978	145989	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	31544319
71	NC_004829	TAATAT	2	12	146113	146124	50 %	50 %	0 %	0 %	31544319
72	NC_004829	TTTAAC	2	12	150790	150801	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
73	NC_004829	TGTTAA	2	12	152157	152168	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	294660249
74	NC_004829	TTTGAT	2	12	153566	153577	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	31544324
75	NC_004829	TAAATC	2	12	155703	155714	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	31544325
76	NC_004829	TTAGAT	2	12	157905	157916	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	294660251
77	NC_004829	TGGTGA	2	12	159391	159402	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	31544327
78	NC_004829	TTAAAG	2	12	164691	164702	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	294660255
79	NC_004829	AAAGCT	2	12	166376	166387	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294660255
80	NC_004829	ATTGGT	2	12	171885	171896	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	294660258
81	NC_004829	ACATTC	2	12	172347	172358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294660258
82	NC_004829	ATTCTT	2	12	172703	172714	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	294660258
83	NC_004829	CAGGTG	2	12	176637	176648	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294660260
84	NC_004829	GAAAAA	2	12	176795	176806	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	294660260
85	NC_004829	TTACTA	2	12	181108	181119	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294660265
86	NC_004829	GGTTTA	2	12	182138	182149	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	31544351
87	NC_004829	ATAATC	2	12	182269	182280	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	31544351
88	NC_004829	ATTTAA	2	12	182526	182537	50 %	50 %	0 %	0 %	294660267
89	NC_004829	GATTTT	2	12	184854	184865	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	31544355
90	NC_004829	CTTTAA	2	12	184879	184890	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	31544355
91	NC_004829	CTTTAT	2	12	186811	186822	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	294660269
92	NC_004829	ATTTTT	2	12	187881	187892	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004829	TTTTGT	2	12	187994	188005	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	294660270
94	NC_004829	TTTATT	2	12	192171	192182	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	31544359
95	NC_004829	AGAAAA	2	12	193159	193170	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	294660273
96	NC_004829	TTTTGT	2	12	193358	193369	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	31544361
97	NC_004829	ACTTAA	2	12	193943	193954	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	31544361
98	NC_004829	CTTGGG	2	12	195263	195274	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	294660274
99	NC_004829	ATCTTA	2	12	195370	195381	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294660274
100	NC_004829	TATCAT	2	12	196557	196568	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294660275
101	NC_004829	AAATGA	2	12	201016	201027	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	294660278
102	NC_004829	CAAAAA	2	12	201744	201755	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	294660278
103	NC_004829	AAACAA	2	12	202535	202546	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	31544367
104	NC_004829	TTTATT	2	12	203084	203095	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	31544367
105	NC_004829	ACAGAA	2	12	206844	206855	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	294660281
106	NC_004829	AAAAGA	2	12	211177	211188	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	31544374
107	NC_004829	ATCAAA	2	12	211290	211301	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	31544374
108	NC_004829	AAATTA	2	12	214486	214497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31544377
109	NC_004829	CAATAT	2	12	215382	215393	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
110	NC_004829	GGGTTT	2	12	215844	215855	0 %	50 %	50 %	0 %	31544379
111	NC_004829	AACCAG	2	12	219256	219267	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	294660287
112	NC_004829	TAAATT	2	12	219602	219613	50 %	50 %	0 %	0 %	294660287
113	NC_004829	TATGAT	2	12	221040	221051	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	294660287
114	NC_004829	CAAGTT	2	12	221642	221653	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294660288
115	NC_004829	GGGATT	2	12	222420	222431	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	294660289
116	NC_004829	AAAACT	2	12	223067	223078	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_004829	TCAAGA	2	12	223643	223654	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294660290
118	NC_004829	CCTAAA	2	12	223974	223985	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	294660290
119	NC_004829	AGATTA	2	12	226044	226055	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	294660290
120	NC_004829	GGTATT	2	12	226269	226280	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	294660290
121	NC_004829	AATAAA	2	12	229792	229803	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	31544385
122	NC_004829	ATGCTA	2	12	230163	230174	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	31544386
123	NC_004829	TCAAAA	2	12	236945	236956	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	31544389
124	NC_004829	CCAAAT	2	12	238251	238262	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	31544389
125	NC_004829	CATCGT	2	12	241978	241989	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	31544391
126	NC_004829	CTTTGT	2	12	244669	244680	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	294660294
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129	NC_004829	GAAAAA	2	12	250692	250703	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004829	CAACAC	4	24	250927	250950	50 %	0 %	0 %	50 %	31544399
131	NC_004829	CTCCTA	2	12	251401	251412	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	31544399
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135	NC_004829	AACAGA	2	12	264214	264225	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	31544403
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151	NC_004829	TTAAAT	2	12	296961	296972	50 %	50 %	0 %	0 %	31544410
152	NC_004829	AAAACA	2	12	301060	301071	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	31544414
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240	NC_004829	GAACAA	2	12	446834	446845	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	294660372
241	NC_004829	ACCTCA	3	18	448330	448347	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	294660372
242	NC_004829	AAAACA	2	12	449954	449965	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	31544525
243	NC_004829	GTTAAT	2	12	452580	452591	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	31544525
244	NC_004829	GATGCA	2	12	453497	453508	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	31544525
245	NC_004829	AAAAAC	2	12	456861	456872	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	294660373
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248	NC_004829	GATCAG	2	12	462389	462400	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	294660376
249	NC_004829	TTTATT	2	12	463123	463134	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
250	NC_004829	CAAAAA	2	12	463154	463165	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
251	NC_004829	TCCCCA	2	12	464328	464339	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	294660379
252	NC_004829	ATATTT	2	12	466545	466556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_004829	CTAGAA	2	12	466884	466895	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	31544535
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267	NC_004829	TTACAT	2	12	478218	478229	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294660383
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269	NC_004829	GATAAT	2	12	479937	479948	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	31544541
270	NC_004829	AAGTTG	2	12	481280	481291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31544542
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275	NC_004829	GAATCA	3	18	491621	491638	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	31544546
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293	NC_004829	TTATCA	2	12	521113	521124	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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321	NC_004829	ATTTTT	2	12	571098	571109	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
322	NC_004829	TTAGCT	2	12	572491	572502	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	31544612
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330	NC_004829	GTTTTT	2	12	590267	590278	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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341	NC_004829	ACCTTT	2	12	607308	607319	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	31544633
342	NC_004829	CAACTT	2	12	608573	608584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31544633
343	NC_004829	TAAAAA	3	18	611784	611801	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
344	NC_004829	TTCTTT	2	12	612150	612161	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	31544634
345	NC_004829	TTGATG	2	12	614514	614525	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	294660450
346	NC_004829	TCAAAA	2	12	616458	616469	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	31544637
347	NC_004829	CAAGAT	2	12	620910	620921	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294660456
348	NC_004829	TCTAAA	2	12	621285	621296	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	294660457
349	NC_004829	AGTCTT	2	12	623329	623340	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	294660458
350	NC_004829	CAAAAA	2	12	630042	630053	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	31544652
351	NC_004829	TTGTTC	2	12	632638	632649	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	31544656
352	NC_004829	CTTTTT	2	12	633894	633905	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	294660465
353	NC_004829	TTAAAT	2	12	634208	634219	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
354	NC_004829	GGTTAA	2	12	635627	635638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294660467
355	NC_004829	TGAAGA	2	12	640113	640124	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	31544661
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454	NC_004829	GTAGCA	2	12	827093	827104	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	31544796
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457	NC_004829	GGTGTT	2	12	830740	830751	0 %	50 %	50 %	0 %	31544797
458	NC_004829	GGTGCT	5	30	830752	830781	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	31544797
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460	NC_004829	AGGATT	2	12	837688	837699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31544800
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