MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Mycoplasma gallisepticum str. R(low) chromosome

Total Repeats: 480

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004829	AACTAA	2	12	4206	4217	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	31544207
2	NC_004829	GCAATC	2	12	5895	5906	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	294660184
3	NC_004829	AGAAAA	2	12	8488	8499	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	31544211
4	NC_004829	AATCTT	2	12	9894	9905	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	31544213
5	NC_004829	CTGATA	2	12	14026	14037	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294660189
6	NC_004829	ACCTGA	2	12	20004	20015	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	294660193
7	NC_004829	CACTAC	2	12	20039	20050	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	294660193
8	NC_004829	CATTAG	2	12	22272	22283	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294660194
9	NC_004829	TCAAGA	2	12	25328	25339	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	31544225
10	NC_004829	TTAATG	2	12	25809	25820	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	31544225
11	NC_004829	CAAAGA	2	12	27056	27067	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	31544225
12	NC_004829	TGATCT	2	12	28015	28026	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	31544225
13	NC_004829	ATTATC	2	12	32748	32759	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294660198
14	NC_004829	GCTAAA	2	12	33544	33555	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294660198
15	NC_004829	AACTAA	2	12	34526	34537	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	294660198
16	NC_004829	AAGCAA	2	12	35640	35651	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	294660200
17	NC_004829	TGAAGA	2	12	36574	36585	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	294660201
18	NC_004829	AGCTAA	2	12	37622	37633	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294660202
19	NC_004829	AATAAC	2	12	41101	41112	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	31544235
20	NC_004829	CATTAG	2	12	44962	44973	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294660204
21	NC_004829	TTAAGA	2	12	47575	47586	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	31544240
22	NC_004829	CTAAAG	2	12	52433	52444	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294660207
23	NC_004829	AATCGT	2	12	56555	56566	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294660209
24	NC_004829	TTGAGC	2	12	57694	57705	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	31544247
25	NC_004829	ACCTAA	2	12	58258	58269	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	31544247
26	NC_004829	AAACCA	2	12	60427	60438	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	31544249
27	NC_004829	AAAATC	2	12	65985	65996	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	31544253
28	NC_004829	AAGAAA	2	12	68596	68607	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	31544258
29	NC_004829	TTTATG	2	12	69836	69847	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	31544260
30	NC_004829	AACAAA	2	12	70803	70814	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	161511517
31	NC_004829	AGGTAA	2	12	71119	71130	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	31544262
32	NC_004829	AGTTAA	2	12	72660	72671	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	31544266
33	NC_004829	TAAAGG	2	12	74402	74413	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	31544270
34	NC_004829	TAGGTG	2	12	79856	79867	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	31544277
35	NC_004829	CTATTT	2	12	85167	85178	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	294660220
36	NC_004829	AATATT	2	12	85850	85861	50 %	50 %	0 %	0 %	294660220
37	NC_004829	AATAAA	2	12	87349	87360	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	294660221
38	NC_004829	ATTTAG	2	12	87392	87403	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	294660221
39	NC_004829	AATGTT	2	12	89494	89505	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	31544280
40	NC_004829	AATCTT	2	12	91576	91587	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	31544282
41	NC_004829	GATCAT	2	12	91637	91648	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	31544282
42	NC_004829	AAGAAA	2	12	98329	98340	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	294660225
43	NC_004829	CTTGAT	2	12	100838	100849	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	31544290
44	NC_004829	GTGCAA	2	12	104282	104293	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	294660226
45	NC_004829	AAAACA	2	12	106890	106901	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	294660228
46	NC_004829	CAAAAG	2	12	109559	109570	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	31544296
47	NC_004829	GTTTTA	2	12	110479	110490	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	294660231
48	NC_004829	TTAAAG	2	12	114582	114593	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	294660232
49	NC_004829	TAGAAG	2	12	117357	117368	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	294660233
50	NC_004829	ATCCAT	2	12	119783	119794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31544300
51	NC_004829	TTTCTC	2	12	121945	121956	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	31544301
52	NC_004829	CCAATC	2	12	123164	123175	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	294660234
53	NC_004829	ATTAAT	2	12	124088	124099	50 %	50 %	0 %	0 %	294660234
54	NC_004829	ATTTAT	2	12	125023	125034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294660235
55	NC_004829	GCTTGA	2	12	125726	125737	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	294660236
56	NC_004829	CTTTAA	2	12	129134	129145	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294660237
57	NC_004829	ATAAAT	2	12	131344	131355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31544308
58	NC_004829	ACAGAA	2	12	139034	139045	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	294660242
59	NC_004829	TTGCTG	2	12	139299	139310	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	294660243
60	NC_004829	CTCGAT	2	12	142089	142100	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	294660245
61	NC_004829	GAACAA	3	18	144128	144145	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	294660246
62	NC_004829	AAAAAG	2	12	144297	144308	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	294660246
63	NC_004829	AAAACA	2	12	145978	145989	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	31544319
64	NC_004829	TAATAT	2	12	146113	146124	50 %	50 %	0 %	0 %	31544319
65	NC_004829	TGTTAA	2	12	152157	152168	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	294660249
66	NC_004829	TTTGAT	2	12	153566	153577	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	31544324
67	NC_004829	TAAATC	2	12	155703	155714	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	31544325
68	NC_004829	TTAGAT	2	12	157905	157916	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	294660251
69	NC_004829	TGGTGA	2	12	159391	159402	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	31544327
70	NC_004829	TTAAAG	2	12	164691	164702	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	294660255
71	NC_004829	AAAGCT	2	12	166376	166387	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294660255
72	NC_004829	ATTGGT	2	12	171885	171896	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	294660258
73	NC_004829	ACATTC	2	12	172347	172358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294660258
74	NC_004829	ATTCTT	2	12	172703	172714	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	294660258
75	NC_004829	CAGGTG	2	12	176637	176648	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	294660260
76	NC_004829	GAAAAA	2	12	176795	176806	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	294660260
77	NC_004829	TTACTA	2	12	181108	181119	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294660265
78	NC_004829	GGTTTA	2	12	182138	182149	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	31544351
79	NC_004829	ATAATC	2	12	182269	182280	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	31544351
80	NC_004829	ATTTAA	2	12	182526	182537	50 %	50 %	0 %	0 %	294660267
81	NC_004829	GATTTT	2	12	184854	184865	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	31544355
82	NC_004829	CTTTAA	2	12	184879	184890	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	31544355
83	NC_004829	CTTTAT	2	12	186811	186822	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	294660269
84	NC_004829	TTTTGT	2	12	187994	188005	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	294660270
85	NC_004829	TTTATT	2	12	192171	192182	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	31544359
86	NC_004829	AGAAAA	2	12	193159	193170	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	294660273
87	NC_004829	TTTTGT	2	12	193358	193369	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	31544361
88	NC_004829	ACTTAA	2	12	193943	193954	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	31544361
89	NC_004829	CTTGGG	2	12	195263	195274	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	294660274
90	NC_004829	ATCTTA	2	12	195370	195381	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294660274
91	NC_004829	TATCAT	2	12	196557	196568	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294660275
92	NC_004829	AAATGA	2	12	201016	201027	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	294660278
93	NC_004829	CAAAAA	2	12	201744	201755	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	294660278
94	NC_004829	AAACAA	2	12	202535	202546	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	31544367
95	NC_004829	TTTATT	2	12	203084	203095	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	31544367
96	NC_004829	ACAGAA	2	12	206844	206855	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	294660281
97	NC_004829	AAAAGA	2	12	211177	211188	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	31544374
98	NC_004829	ATCAAA	2	12	211290	211301	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	31544374
99	NC_004829	AAATTA	2	12	214486	214497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	31544377
100	NC_004829	GGGTTT	2	12	215844	215855	0 %	50 %	50 %	0 %	31544379
101	NC_004829	AACCAG	2	12	219256	219267	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	294660287
102	NC_004829	TAAATT	2	12	219602	219613	50 %	50 %	0 %	0 %	294660287
103	NC_004829	TATGAT	2	12	221040	221051	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	294660287
104	NC_004829	CAAGTT	2	12	221642	221653	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	294660288
105	NC_004829	GGGATT	2	12	222420	222431	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	294660289
106	NC_004829	TCAAGA	2	12	223643	223654	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294660290
107	NC_004829	CCTAAA	2	12	223974	223985	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	294660290
108	NC_004829	AGATTA	2	12	226044	226055	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	294660290
109	NC_004829	GGTATT	2	12	226269	226280	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	294660290
110	NC_004829	AATAAA	2	12	229792	229803	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	31544385
111	NC_004829	ATGCTA	2	12	230163	230174	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	31544386
112	NC_004829	TCAAAA	2	12	236945	236956	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	31544389
113	NC_004829	CCAAAT	2	12	238251	238262	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	31544389
114	NC_004829	CATCGT	2	12	241978	241989	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	31544391
115	NC_004829	CTTTGT	2	12	244669	244680	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	294660294
116	NC_004829	CAAAAA	2	12	247157	247168	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	31544396
117	NC_004829	GGGATC	2	12	249000	249011	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	31544397
118	NC_004829	CAACAC	4	24	250927	250950	50 %	0 %	0 %	50 %	31544399
119	NC_004829	CTCCTA	2	12	251401	251412	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	31544399
120	NC_004829	CACCAA	2	12	254157	254168	50 %	0 %	0 %	50 %	294660296
121	NC_004829	AGGAAC	2	12	255340	255351	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	294660296
122	NC_004829	AACAGA	2	12	264214	264225	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	31544403
123	NC_004829	TAATCC	2	12	265627	265638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31544404
124	NC_004829	ATAGTG	2	12	266538	266549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31544404
125	NC_004829	ACTCCA	5	30	267859	267888	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	294660300
126	NC_004829	AACCAA	2	12	270238	270249	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	294660301
127	NC_004829	AACAGA	2	12	278402	278413	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	294660305
128	NC_004829	TAATCC	2	12	279800	279811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	294660306
129	NC_004829	ATAGTG	2	12	280711	280722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	294660306
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132	NC_004829	AATCCT	2	12	284543	284554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31544406
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137	NC_004829	TTAAAT	2	12	296961	296972	50 %	50 %	0 %	0 %	31544410
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224	NC_004829	TGTTGA	2	12	457225	457236	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	294660373
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226	NC_004829	GATCAG	2	12	462389	462400	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	294660376
227	NC_004829	TCCCCA	2	12	464328	464339	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	294660379
228	NC_004829	CTAGAA	2	12	466884	466895	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	31544535
229	NC_004829	GTTAAG	2	12	467523	467534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31544535
230	NC_004829	AAAAAG	2	12	469676	469687	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	294660380
231	NC_004829	AGCTAA	2	12	469698	469709	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	294660380
232	NC_004829	CAAAGA	2	12	470010	470021	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	294660380
233	NC_004829	TCAACT	2	12	472611	472622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31544538
234	NC_004829	AGAAGT	2	12	474074	474085	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	31544538
235	NC_004829	GAACAA	2	12	475849	475860	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	31544539
236	NC_004829	TCAACC	2	12	476992	477003	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	294660382
237	NC_004829	TGGTGC	2	12	477040	477051	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	294660382
238	NC_004829	TTAATT	2	12	477087	477098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	294660382
239	NC_004829	CTCCAG	2	12	477360	477371	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	294660382
240	NC_004829	ACATTT	2	12	477878	477889	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294660382
241	NC_004829	TTACAT	2	12	478218	478229	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	294660383
242	NC_004829	AATCAA	2	12	478274	478285	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	294660383
243	NC_004829	GATAAT	2	12	479937	479948	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	31544541
244	NC_004829	AAGTTG	2	12	481280	481291	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	31544542
245	NC_004829	CTAATA	2	12	481301	481312	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	31544542
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260	NC_004829	TGCAGT	2	12	512162	512173	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	31544558
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345	NC_004829	AGATAA	2	12	691962	691973	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	31544705
346	NC_004829	TCATTC	2	12	693731	693742	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	31544707
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348	NC_004829	TTAGCA	2	12	694626	694637	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	31544707
349	NC_004829	AACTTC	2	12	695141	695152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	31544707
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351	NC_004829	TTTGTT	2	12	697237	697248	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	31544707
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456	NC_004829	TCAGAA	2	12	959077	959088	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	31544896
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463	NC_004829	GTTTGG	2	12	975857	975868	0 %	50 %	50 %	0 %	294660619
464	NC_004829	TTATCG	2	12	977303	977314	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	31544907
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