MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Nitrosomonas europaea ATCC 19718 chromosome

Total Repeats: 101

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004757	AATCTA	2	12	71014	71025	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_004757	GCTCCA	2	12	108746	108757	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3	NC_004757	GCACGG	2	12	121219	121230	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_004757	CTGATA	2	12	154669	154680	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_004757	GAAATG	2	12	200740	200751	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004757	TTTCCG	2	12	201001	201012	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_004757	GCGCTT	2	12	201582	201593	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_004757	TTTTTG	2	12	228197	228208	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004757	TGTCCG	2	12	284991	285002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_004757	TTCGGT	2	12	297153	297164	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_004757	GTGATC	2	12	318143	318154	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_004757	ATATTC	2	12	368280	368291	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_004757	TCGTAT	2	12	390707	390718	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_004757	CTGATT	2	12	489421	489432	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_004757	ATTAAC	2	12	516372	516383	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_004757	TGTATG	2	12	558516	558527	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004757	TTGATG	2	12	610325	610336	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004757	GACTGG	2	12	614858	614869	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_004757	ATTTTT	2	12	635520	635531	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004757	GAAATA	2	12	677975	677986	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004757	CTGATC	2	12	691814	691825	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_004757	GCGCAC	2	12	691873	691884	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
23	NC_004757	AGAAAG	2	12	785022	785033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004757	ATTCGT	2	12	832071	832082	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_004757	TCCAGA	2	12	855638	855649	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_004757	CACCAA	2	12	856436	856447	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_004757	CACCAA	2	12	856532	856543	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_004757	CACTAA	2	12	856592	856603	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_004757	CACCAA	2	12	856628	856639	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_004757	CACCAA	2	12	856724	856735	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_004757	CACCAA	2	12	856790	856801	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_004757	CACCAA	2	12	856856	856867	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_004757	GTGCCA	2	12	857077	857088	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_004757	GGCAGG	2	12	916167	916178	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_004757	CTTTAA	2	12	970093	970104	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_004757	TGAGAT	2	12	1062053	1062064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004757	TCCCGA	2	12	1067447	1067458	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
38	NC_004757	GCCAAT	2	12	1126981	1126992	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_004757	GTATAG	2	12	1149778	1149789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004757	CAATAT	2	12	1156897	1156908	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_004757	ATGTCC	2	12	1157031	1157042	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_004757	TGGAGA	2	12	1161271	1161282	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004757	AGCGAA	2	12	1189347	1189358	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_004757	GATTCT	2	12	1196594	1196605	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_004757	ATTCAG	2	12	1258365	1258376	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_004757	TCCGGT	2	12	1294405	1294416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_004757	TGCACG	2	12	1322676	1322687	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_004757	ATATAA	2	12	1335119	1335130	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004757	CTGGCG	2	12	1381416	1381427	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_004757	AGCTGA	2	12	1382004	1382015	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_004757	GCGGCA	2	12	1399785	1399796	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_004757	CGTTAT	2	12	1449175	1449186	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_004757	TCACTT	2	12	1481937	1481948	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_004757	TCACTT	2	12	1487393	1487404	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_004757	TCACTT	2	12	1488173	1488184	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_004757	ACGAGT	2	12	1520053	1520064	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_004757	GAACCC	2	12	1525261	1525272	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
58	NC_004757	AATGCC	2	12	1525368	1525379	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_004757	ATGGTG	2	12	1539956	1539967	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004757	TTGTTT	2	12	1540081	1540092	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004757	TACCGG	2	12	1556284	1556295	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_004757	TCATTC	2	12	1679528	1679539	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_004757	AACGGC	2	12	1713630	1713641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_004757	ATCAAA	2	12	1743451	1743462	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_004757	GGTAAA	2	12	1799032	1799043	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004757	ATTCTG	2	12	1807359	1807370	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_004757	ACTATG	2	12	1828338	1828349	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
68	NC_004757	TATTGA	2	12	1851279	1851290	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004757	AATCTT	2	12	1931842	1931853	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_004757	ATCACG	2	12	1951100	1951111	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_004757	AATTCA	2	12	1952538	1952549	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_004757	TTGCGC	2	12	1961964	1961975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_004757	GTTGCG	2	12	1963607	1963618	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_004757	CAAAAA	2	12	2109496	2109507	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_004757	CGATGG	2	12	2152193	2152204	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
76	NC_004757	TGCATT	2	12	2158939	2158950	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_004757	AAATAA	2	12	2168996	2169007	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004757	TACTTG	2	12	2169858	2169869	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_004757	CACGCA	2	12	2170216	2170227	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
80	NC_004757	AATCAG	2	12	2206553	2206564	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_004757	TAAAAA	2	12	2211688	2211699	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004757	TAACCT	2	12	2224245	2224256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_004757	GGCAAG	2	12	2285190	2285201	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_004757	GAAATG	2	12	2289665	2289676	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004757	GAAATA	2	12	2294519	2294530	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004757	TACGCA	2	12	2299087	2299098	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_004757	GATCGT	2	12	2301032	2301043	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_004757	GCCCTT	2	12	2303144	2303155	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
89	NC_004757	ATATTA	2	12	2305795	2305806	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004757	ACTATA	2	12	2305807	2305818	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_004757	CATAAT	2	12	2371311	2371322	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_004757	TTCAAT	2	12	2375976	2375987	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_004757	CTTGCC	2	12	2380047	2380058	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
94	NC_004757	CAAATC	2	12	2382871	2382882	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_004757	GAGGAA	2	12	2480393	2480404	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004757	GCTCCA	2	12	2482720	2482731	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
97	NC_004757	ATCGGT	2	12	2645069	2645080	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_004757	AGAATG	2	12	2658059	2658070	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004757	TCTGCT	2	12	2709424	2709435	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_004757	ATCTTT	2	12	2714555	2714566	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_004757	TCCGGA	2	12	2811954	2811965	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.