MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Nitrosomonas europaea ATCC 19718 chromosome

Total Repeats: 1627

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004757	GTGCT	2	10	3801	3810	0 %	40 %	40 %	20 %	30248034
2	NC_004757	TGTCA	2	10	5409	5418	20 %	40 %	20 %	20 %	30248035
3	NC_004757	TTTTA	2	10	6479	6488	20 %	80 %	0 %	0 %	30248036
4	NC_004757	TTTTG	2	10	7751	7760	0 %	80 %	20 %	0 %	30248038
5	NC_004757	TGATT	2	10	8577	8586	20 %	60 %	20 %	0 %	30248039
6	NC_004757	ACTGG	2	10	10029	10038	20 %	20 %	40 %	20 %	30248039
7	NC_004757	CTGCG	2	10	10960	10969	0 %	20 %	40 %	40 %	30248039
8	NC_004757	TCGAT	2	10	10991	11000	20 %	40 %	20 %	20 %	30248039
9	NC_004757	CGATA	2	10	11018	11027	40 %	20 %	20 %	20 %	30248039
10	NC_004757	AAATC	2	10	11300	11309	60 %	20 %	0 %	20 %	30248039
11	NC_004757	GGTGA	2	10	11312	11321	20 %	20 %	60 %	0 %	30248039
12	NC_004757	GCCCA	2	10	11780	11789	20 %	0 %	20 %	60 %	30248040
13	NC_004757	CATGG	2	10	13305	13314	20 %	20 %	40 %	20 %	30248041
14	NC_004757	GTTCA	2	10	13650	13659	20 %	40 %	20 %	20 %	30248041
15	NC_004757	TCTGG	2	10	16981	16990	0 %	40 %	40 %	20 %	30248044
16	NC_004757	ACAAG	2	10	20171	20180	60 %	0 %	20 %	20 %	30248048
17	NC_004757	ATGGC	2	10	20350	20359	20 %	20 %	40 %	20 %	30248048
18	NC_004757	GTACG	2	10	22957	22966	20 %	20 %	40 %	20 %	30248050
19	NC_004757	GCAAC	2	10	23101	23110	40 %	0 %	20 %	40 %	30248050
20	NC_004757	TGAAT	2	10	26721	26730	40 %	40 %	20 %	0 %	30248050
21	NC_004757	GGCCG	2	10	27024	27033	0 %	0 %	60 %	40 %	30248051
22	NC_004757	GCGGG	2	10	27673	27682	0 %	0 %	80 %	20 %	30248051
23	NC_004757	CCCGA	2	10	30306	30315	20 %	0 %	20 %	60 %	30248053
24	NC_004757	CAGTC	2	10	31722	31731	20 %	20 %	20 %	40 %	30248056
25	NC_004757	GGCCA	2	10	35886	35895	20 %	0 %	40 %	40 %	30248059
26	NC_004757	GCAGG	2	10	36762	36771	20 %	0 %	60 %	20 %	30248060
27	NC_004757	ATGAC	2	10	41188	41197	40 %	20 %	20 %	20 %	30248064
28	NC_004757	TCAGG	2	10	41552	41561	20 %	20 %	40 %	20 %	30248064
29	NC_004757	AGCTG	2	10	41810	41819	20 %	20 %	40 %	20 %	30248064
30	NC_004757	TTGTC	2	10	42260	42269	0 %	60 %	20 %	20 %	30248064
31	NC_004757	ATGTT	2	10	42598	42607	20 %	60 %	20 %	0 %	30248064
32	NC_004757	GCATT	2	10	45787	45796	20 %	40 %	20 %	20 %	30248066
33	NC_004757	ATCTT	2	10	46134	46143	20 %	60 %	0 %	20 %	30248066
34	NC_004757	GTCCG	2	10	47313	47322	0 %	20 %	40 %	40 %	30248066
35	NC_004757	CATTG	2	10	52549	52558	20 %	40 %	20 %	20 %	30248070
36	NC_004757	AAAGA	2	10	54641	54650	80 %	0 %	20 %	0 %	30248073
37	NC_004757	CACCT	2	10	58383	58392	20 %	20 %	0 %	60 %	30248077
38	NC_004757	TTGCC	2	10	58703	58712	0 %	40 %	20 %	40 %	30248077
39	NC_004757	GTCTG	2	10	59435	59444	0 %	40 %	40 %	20 %	30248078
40	NC_004757	TGTGA	2	10	65389	65398	20 %	40 %	40 %	0 %	30248081
41	NC_004757	AGGAG	2	10	65753	65762	40 %	0 %	60 %	0 %	30248082
42	NC_004757	TTGCT	2	10	66556	66565	0 %	60 %	20 %	20 %	30248083
43	NC_004757	GCGAT	2	10	78250	78259	20 %	20 %	40 %	20 %	30248088
44	NC_004757	TTTCC	2	10	78282	78291	0 %	60 %	0 %	40 %	30248088
45	NC_004757	GATCC	2	10	78339	78348	20 %	20 %	20 %	40 %	30248088
46	NC_004757	ATGAC	2	10	82272	82281	40 %	20 %	20 %	20 %	30248093
47	NC_004757	TTGAG	2	10	82320	82329	20 %	40 %	40 %	0 %	30248093
48	NC_004757	GCCAT	2	10	84446	84455	20 %	20 %	20 %	40 %	30248095
49	NC_004757	ATCAG	2	10	86453	86462	40 %	20 %	20 %	20 %	30248097
50	NC_004757	GCAGC	2	10	87524	87533	20 %	0 %	40 %	40 %	30248099
51	NC_004757	GGTTC	2	10	87564	87573	0 %	40 %	40 %	20 %	30248099
52	NC_004757	GATGA	2	10	91394	91403	40 %	20 %	40 %	0 %	30248103
53	NC_004757	ACCAT	2	10	92901	92910	40 %	20 %	0 %	40 %	30248105
54	NC_004757	TCCAT	2	10	95859	95868	20 %	40 %	0 %	40 %	30248106
55	NC_004757	GTGTC	2	10	97710	97719	0 %	40 %	40 %	20 %	30248108
56	NC_004757	GGGAT	2	10	103061	103070	20 %	20 %	60 %	0 %	30248114
57	NC_004757	TTGCC	2	10	108279	108288	0 %	40 %	20 %	40 %	30248120
58	NC_004757	GCCTG	2	10	113915	113924	0 %	20 %	40 %	40 %	30248122
59	NC_004757	TACAG	2	10	114120	114129	40 %	20 %	20 %	20 %	30248122
60	NC_004757	TGCCA	2	10	114186	114195	20 %	20 %	20 %	40 %	30248122
61	NC_004757	TTGCC	2	10	116103	116112	0 %	40 %	20 %	40 %	30248124
62	NC_004757	GCCCG	2	10	117701	117710	0 %	0 %	40 %	60 %	30248124
63	NC_004757	CGTGG	2	10	120205	120214	0 %	20 %	60 %	20 %	30248124
64	NC_004757	CTGCA	2	10	122727	122736	20 %	20 %	20 %	40 %	30248125
65	NC_004757	TTGCC	2	10	122763	122772	0 %	40 %	20 %	40 %	30248125
66	NC_004757	GAGCT	2	10	123049	123058	20 %	20 %	40 %	20 %	30248125
67	NC_004757	GCAGC	2	10	128468	128477	20 %	0 %	40 %	40 %	30248131
68	NC_004757	GCCAA	2	10	135555	135564	40 %	0 %	20 %	40 %	30248136
69	NC_004757	CTCAC	2	10	135934	135943	20 %	20 %	0 %	60 %	30248137
70	NC_004757	TTGCC	2	10	136652	136661	0 %	40 %	20 %	40 %	30248137
71	NC_004757	ACCTT	2	10	138697	138706	20 %	40 %	0 %	40 %	30248139
72	NC_004757	CGCAA	2	10	138851	138860	40 %	0 %	20 %	40 %	30248139
73	NC_004757	ATGCA	2	10	141078	141087	40 %	20 %	20 %	20 %	30248142
74	NC_004757	TGCGG	2	10	143199	143208	0 %	20 %	60 %	20 %	30248144
75	NC_004757	CGCGC	2	10	146023	146032	0 %	0 %	40 %	60 %	30248148
76	NC_004757	ATGTG	2	10	146132	146141	20 %	40 %	40 %	0 %	30248148
77	NC_004757	GTGAG	2	10	146260	146269	20 %	20 %	60 %	0 %	30248149
78	NC_004757	TCAGG	2	10	150265	150274	20 %	20 %	40 %	20 %	30248153
79	NC_004757	CAGCG	2	10	152805	152814	20 %	0 %	40 %	40 %	30248154
80	NC_004757	ATTCA	2	10	157051	157060	40 %	40 %	0 %	20 %	30248156
81	NC_004757	TGCCG	2	10	158560	158569	0 %	20 %	40 %	40 %	30248158
82	NC_004757	AAAGT	2	10	159400	159409	60 %	20 %	20 %	0 %	30248160
83	NC_004757	TCGGT	2	10	167164	167173	0 %	40 %	40 %	20 %	30248168
84	NC_004757	GGCAG	2	10	170912	170921	20 %	0 %	60 %	20 %	30248171
85	NC_004757	GGCCG	2	10	176918	176927	0 %	0 %	60 %	40 %	30248178
86	NC_004757	GCTGC	2	10	179490	179499	0 %	20 %	40 %	40 %	30248181
87	NC_004757	ATGCG	2	10	182399	182408	20 %	20 %	40 %	20 %	30248183
88	NC_004757	CTGAT	2	10	184331	184340	20 %	40 %	20 %	20 %	30248183
89	NC_004757	CAAGG	2	10	184726	184735	40 %	0 %	40 %	20 %	30248183
90	NC_004757	TACGC	2	10	184856	184865	20 %	20 %	20 %	40 %	30248183
91	NC_004757	ATCCA	2	10	187100	187109	40 %	20 %	0 %	40 %	30248185
92	NC_004757	ACAGC	2	10	187141	187150	40 %	0 %	20 %	40 %	30248185
93	NC_004757	TCAGC	2	10	189095	189104	20 %	20 %	20 %	40 %	30248186
94	NC_004757	AGTGG	2	10	189914	189923	20 %	20 %	60 %	0 %	30248187
95	NC_004757	CGGTG	2	10	192718	192727	0 %	20 %	60 %	20 %	30248187
96	NC_004757	CGGTG	2	10	193687	193696	0 %	20 %	60 %	20 %	30248187
97	NC_004757	CGGTG	2	10	194026	194035	0 %	20 %	60 %	20 %	30248187
98	NC_004757	CGGTG	2	10	194365	194374	0 %	20 %	60 %	20 %	30248187
99	NC_004757	CGGTG	2	10	194704	194713	0 %	20 %	60 %	20 %	30248187
100	NC_004757	CGGTG	2	10	195673	195682	0 %	20 %	60 %	20 %	30248187
101	NC_004757	CGGTG	2	10	196642	196651	0 %	20 %	60 %	20 %	30248187
102	NC_004757	CGGTG	2	10	196981	196990	0 %	20 %	60 %	20 %	30248187
103	NC_004757	CGGTG	2	10	197320	197329	0 %	20 %	60 %	20 %	30248187
104	NC_004757	CGGTG	2	10	197659	197668	0 %	20 %	60 %	20 %	30248187
105	NC_004757	CGGTG	2	10	197998	198007	0 %	20 %	60 %	20 %	30248187
106	NC_004757	TGGCC	2	10	198468	198477	0 %	20 %	40 %	40 %	30248187
107	NC_004757	GGGCT	2	10	201954	201963	0 %	20 %	60 %	20 %	30248189
108	NC_004757	AATTG	2	10	204374	204383	40 %	40 %	20 %	0 %	30248192
109	NC_004757	ATGGA	2	10	204618	204627	40 %	20 %	40 %	0 %	30248192
110	NC_004757	GCTGT	2	10	205494	205503	0 %	40 %	40 %	20 %	30248192
111	NC_004757	CAACG	2	10	205984	205993	40 %	0 %	20 %	40 %	30248192
112	NC_004757	TGACC	2	10	210282	210291	20 %	20 %	20 %	40 %	30248195
113	NC_004757	GAGCA	2	10	211393	211402	40 %	0 %	40 %	20 %	30248196
114	NC_004757	TTGAG	2	10	212441	212450	20 %	40 %	40 %	0 %	30248196
115	NC_004757	TTCTT	2	10	214888	214897	0 %	80 %	0 %	20 %	30248198
116	NC_004757	GCAGG	2	10	215047	215056	20 %	0 %	60 %	20 %	30248199
117	NC_004757	CGAAA	2	10	215308	215317	60 %	0 %	20 %	20 %	30248199
118	NC_004757	TCAGG	2	10	215475	215484	20 %	20 %	40 %	20 %	30248199
119	NC_004757	TGATC	2	10	217243	217252	20 %	40 %	20 %	20 %	30248201
120	NC_004757	GTTGT	2	10	218335	218344	0 %	60 %	40 %	0 %	30248203
121	NC_004757	GCGCC	2	10	219068	219077	0 %	0 %	40 %	60 %	30248204
122	NC_004757	CCGGA	2	10	219528	219537	20 %	0 %	40 %	40 %	30248204
123	NC_004757	AGGTA	2	10	219603	219612	40 %	20 %	40 %	0 %	30248204
124	NC_004757	TGATT	2	10	220921	220930	20 %	60 %	20 %	0 %	30248205
125	NC_004757	TGCCT	2	10	224784	224793	0 %	40 %	20 %	40 %	30248210
126	NC_004757	ACCTG	2	10	224822	224831	20 %	20 %	20 %	40 %	30248210
127	NC_004757	GATTT	2	10	225387	225396	20 %	60 %	20 %	0 %	30248211
128	NC_004757	TTAAT	2	10	225442	225451	40 %	60 %	0 %	0 %	30248211
129	NC_004757	TCGGC	2	10	228411	228420	0 %	20 %	40 %	40 %	30248214
130	NC_004757	TGCAG	2	10	228801	228810	20 %	20 %	40 %	20 %	30248214
131	NC_004757	GTGTC	2	10	229553	229562	0 %	40 %	40 %	20 %	30248215
132	NC_004757	TATTT	2	10	234357	234366	20 %	80 %	0 %	0 %	30248221
133	NC_004757	GCAAG	2	10	236932	236941	40 %	0 %	40 %	20 %	30248225
134	NC_004757	TTGGC	2	10	238291	238300	0 %	40 %	40 %	20 %	30248228
135	NC_004757	GTCGT	2	10	238426	238435	0 %	40 %	40 %	20 %	30248228
136	NC_004757	ATGAA	2	10	241144	241153	60 %	20 %	20 %	0 %	30248230
137	NC_004757	TGACT	2	10	241475	241484	20 %	40 %	20 %	20 %	30248230
138	NC_004757	TCAAT	2	10	241944	241953	40 %	40 %	0 %	20 %	30248230
139	NC_004757	AGCTG	2	10	242340	242349	20 %	20 %	40 %	20 %	30248231
140	NC_004757	CATAC	2	10	245812	245821	40 %	20 %	0 %	40 %	30248233
141	NC_004757	AACAG	2	10	251858	251867	60 %	0 %	20 %	20 %	30248242
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143	NC_004757	TGTGT	2	10	254667	254676	0 %	60 %	40 %	0 %	30248245
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149	NC_004757	GTCAG	2	10	262088	262097	20 %	20 %	40 %	20 %	30248253
150	NC_004757	CTCGG	2	10	263774	263783	0 %	20 %	40 %	40 %	30248254
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153	NC_004757	GGCAG	2	10	270147	270156	20 %	0 %	60 %	20 %	30248259
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156	NC_004757	TCAGA	2	10	274347	274356	40 %	20 %	20 %	20 %	30248264
157	NC_004757	TAACT	2	10	274730	274739	40 %	40 %	0 %	20 %	30248264
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167	NC_004757	CCCAG	2	10	290930	290939	20 %	0 %	20 %	60 %	30248275
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170	NC_004757	ACTTT	2	10	292689	292698	20 %	60 %	0 %	20 %	30248276
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201	NC_004757	ATTGC	2	10	357866	357875	20 %	40 %	20 %	20 %	30248340
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203	NC_004757	GACCT	2	10	358056	358065	20 %	20 %	20 %	40 %	30248340
204	NC_004757	CCTGA	2	10	359903	359912	20 %	20 %	20 %	40 %	30248341
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233	NC_004757	GCAGA	2	10	418476	418485	40 %	0 %	40 %	20 %	30248390
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248	NC_004757	GCTGA	2	10	441116	441125	20 %	20 %	40 %	20 %	30248403
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250	NC_004757	CGATG	2	10	446040	446049	20 %	20 %	40 %	20 %	30248410
251	NC_004757	CTGGC	2	10	447016	447025	0 %	20 %	40 %	40 %	30248411
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253	NC_004757	GGTGC	2	10	448341	448350	0 %	20 %	60 %	20 %	30248413
254	NC_004757	GTATG	2	10	448604	448613	20 %	40 %	40 %	0 %	30248413
255	NC_004757	GTGAC	2	10	449159	449168	20 %	20 %	40 %	20 %	30248414
256	NC_004757	TGATC	2	10	449211	449220	20 %	40 %	20 %	20 %	30248414
257	NC_004757	CTGCC	2	10	449892	449901	0 %	20 %	20 %	60 %	30248415
258	NC_004757	TATCG	2	10	450399	450408	20 %	40 %	20 %	20 %	30248415
259	NC_004757	TGCGT	2	10	450572	450581	0 %	40 %	40 %	20 %	30248415
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262	NC_004757	GCTTT	2	10	455399	455408	0 %	60 %	20 %	20 %	30248421
263	NC_004757	CATTG	2	10	455549	455558	20 %	40 %	20 %	20 %	30248421
264	NC_004757	TACGT	2	10	457154	457163	20 %	40 %	20 %	20 %	30248424
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