MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Nitrosomonas europaea ATCC 19718 chromosome

Total Repeats: 1167

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004757	TGTT	2	8	135	142	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004757	TTAA	2	8	1783	1790	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004757	TTTC	2	8	7315	7322	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_004757	TTGA	2	8	15384	15391	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004757	TCTT	2	8	22817	22824	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6	NC_004757	TCTG	2	8	34507	34514	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_004757	CGGT	2	8	36590	36597	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_004757	CAGG	2	8	37458	37465	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_004757	TTCG	2	8	39775	39782	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_004757	TTTC	2	8	45454	45461	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_004757	AAAC	2	8	53505	53512	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_004757	CCTG	2	8	58931	58938	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_004757	TTGC	2	8	59858	59865	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
14	NC_004757	TGAG	2	8	68721	68728	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004757	GTGA	2	8	69535	69542	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004757	GAAA	2	8	69577	69584	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004757	TACC	2	8	70114	70121	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_004757	ACCC	2	8	71209	71216	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
19	NC_004757	GCGA	2	8	71325	71332	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
20	NC_004757	GCAT	2	8	71596	71603	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_004757	GACA	2	8	72016	72023	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_004757	AAAG	2	8	72158	72165	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004757	TTTA	2	8	72479	72486	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004757	AAGT	2	8	72619	72626	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004757	TAAA	2	8	72664	72671	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004757	GGTG	2	8	72694	72701	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004757	GTTT	2	8	74170	74177	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004757	GATT	2	8	78808	78815	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004757	CCAG	2	8	81549	81556	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_004757	ATAA	2	8	85408	85415	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004757	TTAC	2	8	88574	88581	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_004757	AAAT	2	8	102190	102197	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004757	CCGG	2	8	112184	112191	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_004757	GACC	2	8	114685	114692	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
35	NC_004757	CACC	2	8	120970	120977	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
36	NC_004757	CAGG	2	8	120987	120994	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
37	NC_004757	TAGA	2	8	121155	121162	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004757	TGCC	2	8	121383	121390	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_004757	ATTG	2	8	121717	121724	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004757	ATGA	2	8	131077	131084	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004757	TGAA	2	8	134870	134877	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004757	ATCG	2	8	135821	135828	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_004757	AAGA	2	8	139850	139857	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004757	AAGA	2	8	139921	139928	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004757	CGAA	2	8	152992	152999	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_004757	ACCA	2	8	154032	154039	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_004757	CAGC	2	8	154131	154138	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_004757	TGAT	2	8	154753	154760	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004757	TTGT	2	8	154813	154820	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004757	TAGC	2	8	154877	154884	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_004757	GCCC	2	8	154909	154916	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
52	NC_004757	CGGG	2	8	155650	155657	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_004757	ACAT	2	8	158406	158413	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_004757	CATT	2	8	159610	159617	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_004757	TGAT	2	8	159842	159849	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004757	CATG	2	8	159891	159898	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_004757	GCAT	2	8	160489	160496	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_004757	CCCT	2	8	161692	161699	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
59	NC_004757	ATTG	2	8	161978	161985	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004757	AGCG	2	8	162501	162508	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_004757	CAGA	2	8	162546	162553	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_004757	AAAT	2	8	162976	162983	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004757	ATCC	2	8	163111	163118	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_004757	AGAT	2	8	168533	168540	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004757	GCGA	2	8	168627	168634	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
66	NC_004757	TGAT	2	8	180247	180254	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004757	ATGA	2	8	180265	180272	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004757	TGAT	2	8	180277	180284	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004757	GCCA	2	8	180285	180292	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_004757	ACTG	2	8	180415	180422	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
71	NC_004757	GCGA	2	8	201306	201313	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_004757	GATT	2	8	201707	201714	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004757	TTTG	2	8	202547	202554	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004757	TGAT	2	8	207695	207702	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004757	TGAA	2	8	210766	210773	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004757	GGAT	2	8	213749	213756	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004757	ATGA	2	8	221593	221600	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004757	AATG	2	8	223271	223278	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004757	CACC	2	8	224920	224927	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
80	NC_004757	GCAG	2	8	224971	224978	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_004757	GTTT	2	8	225055	225062	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004757	TTAT	2	8	225263	225270	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004757	GTTG	2	8	225343	225350	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004757	TTCT	2	8	227752	227759	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_004757	TCTA	2	8	228235	228242	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
86	NC_004757	ATTG	2	8	230050	230057	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004757	TTGA	2	8	230095	230102	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004757	GATC	2	8	230527	230534	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_004757	CTTT	2	8	233548	233555	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_004757	ATTG	2	8	235423	235430	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004757	TGAA	2	8	237070	237077	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004757	ATGT	2	8	242538	242545	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004757	GAAG	2	8	246038	246045	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004757	GCTT	2	8	251432	251439	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_004757	ATTT	2	8	256023	256030	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004757	CTTT	2	8	257719	257726	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_004757	TGAT	2	8	257737	257744	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004757	GGCC	2	8	263406	263413	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_004757	CAAT	2	8	264823	264830	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_004757	CGCC	2	8	265322	265329	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
101	NC_004757	TTAA	2	8	265536	265543	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004757	TAAT	2	8	265544	265551	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004757	AGCT	2	8	268312	268319	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_004757	ATTC	2	8	272494	272501	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_004757	CTAG	2	8	278105	278112	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
106	NC_004757	TCCG	2	8	280055	280062	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_004757	TGCT	2	8	283815	283822	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_004757	TGCT	2	8	284580	284587	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_004757	AGCG	2	8	284721	284728	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_004757	CAGG	2	8	284917	284924	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_004757	AAAC	2	8	285823	285830	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_004757	GGGC	2	8	289048	289055	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
113	NC_004757	TGCG	2	8	289102	289109	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
114	NC_004757	TATT	2	8	291328	291335	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004757	AGGT	2	8	293074	293081	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004757	CATA	2	8	293123	293130	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_004757	TTAA	2	8	295498	295505	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004757	CAGC	2	8	296279	296286	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_004757	AAGA	2	8	298104	298111	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004757	GGTG	2	8	298884	298891	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
121	NC_004757	GATA	2	8	298908	298915	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004757	ATAG	2	8	299413	299420	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004757	TCTG	2	8	300811	300818	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
124	NC_004757	GCCA	2	8	301072	301079	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
125	NC_004757	CGTT	2	8	301087	301094	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_004757	CAGA	2	8	301701	301708	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
127	NC_004757	TCCT	2	8	301812	301819	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_004757	CAGA	2	8	302015	302022	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
129	NC_004757	CTGT	2	8	302849	302856	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
130	NC_004757	GGTT	2	8	304499	304506	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_004757	TGAT	2	8	308840	308847	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004757	GAAT	2	8	314866	314873	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_004757	CAAA	2	8	317512	317519	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
134	NC_004757	ACTG	2	8	317770	317777	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_004757	AAAC	2	8	317965	317972	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
136	NC_004757	TCGA	2	8	318156	318163	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_004757	GGCT	2	8	318611	318618	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_004757	CAGG	2	8	318873	318880	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
139	NC_004757	GTCG	2	8	318881	318888	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
140	NC_004757	CCCG	2	8	319087	319094	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
141	NC_004757	CCTG	2	8	319178	319185	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_004757	ATGA	2	8	319354	319361	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
143	NC_004757	TTCA	2	8	320713	320720	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_004757	AGTT	2	8	326296	326303	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004757	ATCG	2	8	335962	335969	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
146	NC_004757	CTAT	2	8	337972	337979	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
147	NC_004757	CCTT	2	8	342395	342402	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
148	NC_004757	ACTG	2	8	342465	342472	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_004757	TTTA	2	8	342588	342595	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_004757	AATA	2	8	351330	351337	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_004757	ATGT	2	8	351479	351486	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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499	NC_004757	ATTG	2	8	1183787	1183794	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
500	NC_004757	TGCT	2	8	1183870	1183877	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding

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