MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Nitrosomonas europaea ATCC 19718 chromosome

Total Repeats: 31524

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004757	TGC	2	6	365	370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248032
2	NC_004757	CGA	2	6	402	407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248032
3	NC_004757	CTG	3	9	877	885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248032
4	NC_004757	GAT	2	6	889	894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248032
5	NC_004757	GAA	2	6	928	933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30248032
6	NC_004757	GAA	2	6	1021	1026	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30248032
7	NC_004757	CCT	2	6	1072	1077	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	30248032
8	NC_004757	CTG	2	6	1102	1107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248032
9	NC_004757	CTG	2	6	1282	1287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248032
10	NC_004757	TAC	2	6	1342	1347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248032
11	NC_004757	GAA	2	6	1374	1379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30248032
12	NC_004757	TGG	2	6	1473	1478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248032
13	NC_004757	CAC	2	6	1488	1493	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30248032
14	NC_004757	CTG	2	6	1818	1823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248033
15	NC_004757	AGA	2	6	2138	2143	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30248033
16	NC_004757	GAT	2	6	2153	2158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248033
17	NC_004757	CAG	2	6	2247	2252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248033
18	NC_004757	TTA	2	6	2261	2266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	30248033
19	NC_004757	TGG	2	6	2311	2316	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248033
20	NC_004757	TCG	2	6	2449	2454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248033
21	NC_004757	TCC	2	6	2593	2598	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	30248033
22	NC_004757	CAG	2	6	2627	2632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248033
23	NC_004757	AGG	2	6	2707	2712	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	30248033
24	NC_004757	GAA	2	6	2721	2726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30248033
25	NC_004757	AAC	2	6	2796	2801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30248033
26	NC_004757	AAT	2	6	2908	2913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30248033
27	NC_004757	TGA	2	6	3146	3151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248034
28	NC_004757	GAT	2	6	3171	3176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248034
29	NC_004757	TCA	2	6	3184	3189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248034
30	NC_004757	GAT	2	6	3255	3260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248034
31	NC_004757	CAG	2	6	3274	3279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248034
32	NC_004757	TGA	2	6	3320	3325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248034
33	NC_004757	CGG	2	6	3344	3349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30248034
34	NC_004757	CGC	2	6	3411	3416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30248034
35	NC_004757	GAA	2	6	3642	3647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30248034
36	NC_004757	TCG	2	6	3679	3684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248034
37	NC_004757	GCA	2	6	3697	3702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248034
38	NC_004757	TGC	2	6	3709	3714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248034
39	NC_004757	CAA	2	6	3815	3820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30248034
40	NC_004757	AAT	2	6	3885	3890	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30248034
41	NC_004757	GAT	2	6	3942	3947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248034
42	NC_004757	TTC	2	6	4001	4006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30248034
43	NC_004757	TCG	2	6	4060	4065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248034
44	NC_004757	CTG	2	6	4086	4091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248034
45	NC_004757	CAA	2	6	4121	4126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30248034
46	NC_004757	ATC	2	6	4128	4133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248034
47	NC_004757	GCC	2	6	4137	4142	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30248034
48	NC_004757	GCC	2	6	4155	4160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30248034
49	NC_004757	TGG	2	6	4270	4275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248034
50	NC_004757	GGT	2	6	4290	4295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248034
51	NC_004757	CAT	2	6	4331	4336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248034
52	NC_004757	TCT	2	6	4392	4397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30248034
53	NC_004757	ATC	3	9	4482	4490	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248034
54	NC_004757	TGC	2	6	4531	4536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248034
55	NC_004757	CCT	2	6	4599	4604	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	30248034
56	NC_004757	GAT	2	6	4647	4652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248034
57	NC_004757	TGG	2	6	4687	4692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248034
58	NC_004757	AAT	2	6	4716	4721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30248034
59	NC_004757	CCG	2	6	4722	4727	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30248034
60	NC_004757	TCT	2	6	4766	4771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30248034
61	NC_004757	GCC	2	6	4798	4803	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30248034
62	NC_004757	GCT	2	6	4829	4834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248034
63	NC_004757	TGC	2	6	4883	4888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248034
64	NC_004757	GAT	2	6	4908	4913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248034
65	NC_004757	ACA	2	6	4976	4981	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30248034
66	NC_004757	GAT	2	6	5010	5015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248034
67	NC_004757	GTG	2	6	5026	5031	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248034
68	NC_004757	GCT	2	6	5150	5155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248034
69	NC_004757	GAA	2	6	5157	5162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30248034
70	NC_004757	TAC	2	6	5306	5311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248034
71	NC_004757	CGA	2	6	5567	5572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248035
72	NC_004757	GGC	2	6	5589	5594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30248035
73	NC_004757	GTT	2	6	5597	5602	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30248035
74	NC_004757	ATC	2	6	5662	5667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248035
75	NC_004757	TGG	2	6	5770	5775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248035
76	NC_004757	GGC	2	6	5825	5830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30248035
77	NC_004757	CAG	2	6	6090	6095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248036
78	NC_004757	AAT	2	6	6177	6182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30248036
79	NC_004757	TCA	2	6	6194	6199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248036
80	NC_004757	TTG	2	6	6282	6287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30248036
81	NC_004757	CGG	2	6	6513	6518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30248036
82	NC_004757	GTA	2	6	7359	7364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248037
83	NC_004757	GAT	2	6	7524	7529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248037
84	NC_004757	ATC	2	6	7593	7598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248037
85	NC_004757	AAT	2	6	7713	7718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30248038
86	NC_004757	GTT	2	6	7738	7743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30248038
87	NC_004757	CAT	2	6	7947	7952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248038
88	NC_004757	CTT	2	6	7998	8003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30248038
89	NC_004757	TCA	2	6	8117	8122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248039
90	NC_004757	TGC	2	6	8210	8215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248039
91	NC_004757	TGT	2	6	8279	8284	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30248039
92	NC_004757	TCA	2	6	8425	8430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248039
93	NC_004757	TGC	2	6	8545	8550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248039
94	NC_004757	CAG	2	6	8595	8600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248039
95	NC_004757	TGC	2	6	8769	8774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248039
96	NC_004757	GGT	2	6	8782	8787	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248039
97	NC_004757	CAG	2	6	8790	8795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248039
98	NC_004757	TGG	2	6	8809	8814	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248039
99	NC_004757	ATG	2	6	8923	8928	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248039
100	NC_004757	CAG	3	9	8937	8945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248039
101	NC_004757	GCT	2	6	8954	8959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248039
102	NC_004757	GCA	2	6	9035	9040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248039
103	NC_004757	CGC	2	6	9107	9112	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30248039
104	NC_004757	GAT	2	6	9141	9146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248039
105	NC_004757	TTC	2	6	9342	9347	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30248039
106	NC_004757	GAT	2	6	9351	9356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248039
107	NC_004757	GAT	3	9	9411	9419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248039
108	NC_004757	CAG	2	6	9564	9569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248039
109	NC_004757	TGG	2	6	9572	9577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248039
110	NC_004757	CAA	2	6	9614	9619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30248039
111	NC_004757	CAC	2	6	9662	9667	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30248039
112	NC_004757	CTG	2	6	9867	9872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248039
113	NC_004757	GCT	2	6	9928	9933	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248039
114	NC_004757	CAC	2	6	9944	9949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30248039
115	NC_004757	TGA	2	6	9959	9964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248039
116	NC_004757	ATC	2	6	10044	10049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248039
117	NC_004757	ACC	2	6	10108	10113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30248039
118	NC_004757	CAG	2	6	10247	10252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248039
119	NC_004757	GCA	2	6	10318	10323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248039
120	NC_004757	AGT	2	6	10405	10410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248039
121	NC_004757	GCT	2	6	10457	10462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248039
122	NC_004757	CGA	2	6	10480	10485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248039
123	NC_004757	GGA	2	6	10618	10623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	30248039
124	NC_004757	TGC	2	6	10732	10737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248039
125	NC_004757	ATA	2	6	10785	10790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30248039
126	NC_004757	CGG	2	6	10799	10804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30248039
127	NC_004757	TCG	2	6	10903	10908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248039
128	NC_004757	GCA	2	6	10928	10933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248039
129	NC_004757	TCG	2	6	11005	11010	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248039
130	NC_004757	TGC	2	6	11162	11167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248039
131	NC_004757	GAA	2	6	11178	11183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	30248039
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133	NC_004757	CGG	2	6	11208	11213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30248039
134	NC_004757	TGA	2	6	11432	11437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248039
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152	NC_004757	TGA	2	6	12499	12504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248040
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241	NC_004757	CAG	2	6	20065	20070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248047
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252	NC_004757	TGG	2	6	20867	20872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248048
253	NC_004757	CTG	2	6	20907	20912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248048
254	NC_004757	CAT	2	6	20996	21001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248048
255	NC_004757	GTG	2	6	21078	21083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248048
256	NC_004757	CTG	2	6	21129	21134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248048
257	NC_004757	CTG	2	6	21213	21218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248048
258	NC_004757	TCC	2	6	21222	21227	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	30248048
259	NC_004757	GTC	2	6	21258	21263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248048
260	NC_004757	GTC	2	6	21273	21278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248048
261	NC_004757	TGC	2	6	21475	21480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248048
262	NC_004757	TGG	2	6	21555	21560	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	30248049
263	NC_004757	GAT	2	6	21570	21575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248049
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265	NC_004757	GTT	2	6	21803	21808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	30248049
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269	NC_004757	GAC	2	6	22086	22091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248049
270	NC_004757	CGT	2	6	22462	22467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248049
271	NC_004757	GAT	2	6	22541	22546	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248049
272	NC_004757	CGT	2	6	22620	22625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248049
273	NC_004757	TCA	2	6	22745	22750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248049
274	NC_004757	AAC	2	6	23214	23219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	30248050
275	NC_004757	TCA	2	6	23332	23337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248050
276	NC_004757	CTG	2	6	23744	23749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248050
277	NC_004757	GAT	2	6	23761	23766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248050
278	NC_004757	TCA	2	6	23935	23940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248050
279	NC_004757	ATG	2	6	23948	23953	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	30248050
280	NC_004757	ATC	3	9	24023	24031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248050
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282	NC_004757	CAG	2	6	24149	24154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248050
283	NC_004757	TCG	2	6	24231	24236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248050
284	NC_004757	CCG	2	6	24270	24275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	30248050
285	NC_004757	GCG	2	6	24343	24348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30248050
286	NC_004757	AAT	2	6	24389	24394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	30248050
287	NC_004757	GCG	2	6	24403	24408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30248050
288	NC_004757	CTT	2	6	24415	24420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	30248050
289	NC_004757	ATC	2	6	24428	24433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248050
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291	NC_004757	GCA	2	6	24615	24620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248050
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312	NC_004757	TAC	2	6	26372	26377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248050
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365	NC_004757	ACT	2	6	29824	29829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248053
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370	NC_004757	ACC	2	6	30145	30150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30248053
371	NC_004757	CTG	2	6	30155	30160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	30248053
372	NC_004757	GCA	2	6	30199	30204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	30248053
373	NC_004757	CCA	2	6	30431	30436	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30248054
374	NC_004757	GCG	2	6	30558	30563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	30248054
375	NC_004757	CAT	2	6	30570	30575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	30248054
376	NC_004757	CCA	2	6	30585	30590	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30248054
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500	NC_004757	ACC	2	6	40525	40530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	30248063

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