MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 2457T

Total Repeats: 2306

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004741	CGCTG	2	10	692	701	0 %	20 %	40 %	40 %	30061573
2	NC_004741	ATTGC	2	10	3395	3404	20 %	40 %	20 %	20 %	30061574
3	NC_004741	TGCGT	2	10	4986	4995	0 %	40 %	40 %	20 %	30061575
4	NC_004741	CGCAG	2	10	8359	8368	20 %	0 %	40 %	40 %	30061578
5	NC_004741	CGTAC	2	10	9787	9796	20 %	20 %	20 %	40 %	30061579
6	NC_004741	CGCGC	2	10	10774	10783	0 %	0 %	40 %	60 %	30061581
7	NC_004741	CCGAT	2	10	16491	16500	20 %	20 %	20 %	40 %	30061587
8	NC_004741	AGCGA	2	10	16879	16888	40 %	0 %	40 %	20 %	30061587
9	NC_004741	ATCAC	2	10	19074	19083	40 %	20 %	0 %	40 %	30061589
10	NC_004741	CATCG	2	10	29587	29596	20 %	20 %	20 %	40 %	30061600
11	NC_004741	GCGAA	2	10	31384	31393	40 %	0 %	40 %	20 %	30061601
12	NC_004741	CACGG	2	10	32655	32664	20 %	0 %	40 %	40 %	30061601
13	NC_004741	CGAAT	2	10	35365	35374	40 %	20 %	20 %	20 %	30061605
14	NC_004741	CCATG	2	10	36903	36912	20 %	20 %	20 %	40 %	30061606
15	NC_004741	CCGTA	2	10	38549	38558	20 %	20 %	20 %	40 %	30061607
16	NC_004741	GTACA	2	10	39039	39048	40 %	20 %	20 %	20 %	30061607
17	NC_004741	TTAAA	2	10	39287	39296	60 %	40 %	0 %	0 %	30061607
18	NC_004741	ACCCA	2	10	40030	40039	40 %	0 %	0 %	60 %	30061608
19	NC_004741	TGATC	2	10	41541	41550	20 %	40 %	20 %	20 %	161486553
20	NC_004741	CGGCG	2	10	41790	41799	0 %	0 %	60 %	40 %	161486553
21	NC_004741	CGGTT	2	10	43027	43036	0 %	40 %	40 %	20 %	30061610
22	NC_004741	GTGAT	2	10	43422	43431	20 %	40 %	40 %	0 %	30061610
23	NC_004741	TGGCG	2	10	44719	44728	0 %	20 %	60 %	20 %	30061612
24	NC_004741	TGCAC	2	10	46484	46493	20 %	20 %	20 %	40 %	30061613
25	NC_004741	AGGGC	2	10	47569	47578	20 %	0 %	60 %	20 %	30061614
26	NC_004741	GAAAC	2	10	48416	48425	60 %	0 %	20 %	20 %	30061614
27	NC_004741	AACGT	2	10	50327	50336	40 %	20 %	20 %	20 %	30061617
28	NC_004741	CCCCA	2	10	52806	52815	20 %	0 %	0 %	80 %	30061620
29	NC_004741	GCGTC	2	10	53311	53320	0 %	20 %	40 %	40 %	30061620
30	NC_004741	ATGTT	2	10	54125	54134	20 %	60 %	20 %	0 %	30061621
31	NC_004741	CTTCG	2	10	54558	54567	0 %	40 %	20 %	40 %	30061621
32	NC_004741	TGCGT	2	10	54844	54853	0 %	40 %	40 %	20 %	30061621
33	NC_004741	AAAGT	2	10	60578	60587	60 %	20 %	20 %	0 %	30061624
34	NC_004741	AGTCG	2	10	61547	61556	20 %	20 %	40 %	20 %	30061625
35	NC_004741	GGTGA	2	10	62826	62835	20 %	20 %	60 %	0 %	30061625
36	NC_004741	TCGCG	2	10	65464	65473	0 %	20 %	40 %	40 %	30061627
37	NC_004741	CTGGA	2	10	75730	75739	20 %	20 %	40 %	20 %	30061635
38	NC_004741	CTGGT	2	10	79023	79032	0 %	40 %	40 %	20 %	161486552
39	NC_004741	GACCG	2	10	79571	79580	20 %	0 %	40 %	40 %	30061639
40	NC_004741	ATGTT	2	10	82119	82128	20 %	60 %	20 %	0 %	161486551
41	NC_004741	AAAAC	2	10	82534	82543	80 %	0 %	0 %	20 %	161486551
42	NC_004741	TGCAT	2	10	83061	83070	20 %	40 %	20 %	20 %	161486550
43	NC_004741	ATTCC	2	10	83231	83240	20 %	40 %	0 %	40 %	161486550
44	NC_004741	GTGAT	2	10	86780	86789	20 %	40 %	40 %	0 %	30061647
45	NC_004741	AGTTC	2	10	89102	89111	20 %	40 %	20 %	20 %	30061649
46	NC_004741	CGTGG	2	10	90475	90484	0 %	20 %	60 %	20 %	30061651
47	NC_004741	TATCG	2	10	90982	90991	20 %	40 %	20 %	20 %	30061651
48	NC_004741	GCCTG	2	10	95314	95323	0 %	20 %	40 %	40 %	30061655
49	NC_004741	ACCGT	2	10	97227	97236	20 %	20 %	20 %	40 %	30061656
50	NC_004741	ATCAG	2	10	99000	99009	40 %	20 %	20 %	20 %	30061658
51	NC_004741	AGCCG	2	10	100768	100777	20 %	0 %	40 %	40 %	30061659
52	NC_004741	GCGCA	2	10	103096	103105	20 %	0 %	40 %	40 %	30061661
53	NC_004741	TGGCG	2	10	104090	104099	0 %	20 %	60 %	20 %	30061662
54	NC_004741	CCGGC	2	10	107060	107069	0 %	0 %	40 %	60 %	30061665
55	NC_004741	CGCGG	2	10	110269	110278	0 %	0 %	60 %	40 %	30061669
56	NC_004741	ATCCC	2	10	112513	112522	20 %	20 %	0 %	60 %	30061673
57	NC_004741	CATCG	2	10	112526	112535	20 %	20 %	20 %	40 %	30061673
58	NC_004741	AACGC	2	10	113221	113230	40 %	0 %	20 %	40 %	30061673
59	NC_004741	ATGCC	2	10	113679	113688	20 %	20 %	20 %	40 %	30061673
60	NC_004741	TCTGT	2	10	115670	115679	0 %	60 %	20 %	20 %	30061675
61	NC_004741	AGCAG	2	10	118101	118110	40 %	0 %	40 %	20 %	30061678
62	NC_004741	CGAAG	2	10	120016	120025	40 %	0 %	40 %	20 %	30061679
63	NC_004741	ACACG	2	10	120149	120158	40 %	0 %	20 %	40 %	30061679
64	NC_004741	TCGCG	2	10	120410	120419	0 %	20 %	40 %	40 %	30061679
65	NC_004741	GCATC	2	10	120500	120509	20 %	20 %	20 %	40 %	30061679
66	NC_004741	GACTG	2	10	121818	121827	20 %	20 %	40 %	20 %	30061680
67	NC_004741	AGAGC	2	10	122228	122237	40 %	0 %	40 %	20 %	30061680
68	NC_004741	TCTGG	2	10	130886	130895	0 %	40 %	40 %	20 %	30061683
69	NC_004741	GGGCA	2	10	132297	132306	20 %	0 %	60 %	20 %	161486548
70	NC_004741	CAGCG	2	10	132576	132585	20 %	0 %	40 %	40 %	30061685
71	NC_004741	ACGAC	2	10	133856	133865	40 %	0 %	20 %	40 %	30061686
72	NC_004741	GCGCG	2	10	138615	138624	0 %	0 %	60 %	40 %	30061689
73	NC_004741	CCGTC	2	10	139406	139415	0 %	20 %	20 %	60 %	161486547
74	NC_004741	GTGAA	2	10	139416	139425	40 %	20 %	40 %	0 %	161486547
75	NC_004741	GTTCA	2	10	139803	139812	20 %	40 %	20 %	20 %	30061691
76	NC_004741	ATCCA	2	10	140129	140138	40 %	20 %	0 %	40 %	30061691
77	NC_004741	CTTTA	2	10	141392	141401	20 %	60 %	0 %	20 %	30061693
78	NC_004741	TGGCG	2	10	141619	141628	0 %	20 %	60 %	20 %	30061693
79	NC_004741	TTTCA	2	10	143932	143941	20 %	60 %	0 %	20 %	30061696
80	NC_004741	TGAAG	2	10	147155	147164	40 %	20 %	40 %	0 %	30061699
81	NC_004741	GTGAT	2	10	147974	147983	20 %	40 %	40 %	0 %	30061701
82	NC_004741	GCGAG	2	10	149692	149701	20 %	0 %	60 %	20 %	161486546
83	NC_004741	GGCGT	2	10	150130	150139	0 %	20 %	60 %	20 %	161486546
84	NC_004741	ATCAG	2	10	150768	150777	40 %	20 %	20 %	20 %	161486545
85	NC_004741	ACCAC	2	10	153033	153042	40 %	0 %	0 %	60 %	30061707
86	NC_004741	GGCGT	2	10	154736	154745	0 %	20 %	60 %	20 %	30061708
87	NC_004741	CGACG	2	10	155775	155784	20 %	0 %	40 %	40 %	30061708
88	NC_004741	AAAAC	2	10	159762	159771	80 %	0 %	0 %	20 %	30061710
89	NC_004741	TGGTT	2	10	160019	160028	0 %	60 %	40 %	0 %	30061710
90	NC_004741	AACCT	2	10	162100	162109	40 %	20 %	0 %	40 %	30061712
91	NC_004741	TGGTC	2	10	162142	162151	0 %	40 %	40 %	20 %	30061712
92	NC_004741	TGGCG	2	10	163387	163396	0 %	20 %	60 %	20 %	30061713
93	NC_004741	CGGCG	2	10	164017	164026	0 %	0 %	60 %	40 %	30061713
94	NC_004741	TGGTG	2	10	164029	164038	0 %	40 %	60 %	0 %	30061713
95	NC_004741	TTCCA	2	10	164628	164637	20 %	40 %	0 %	40 %	30061713
96	NC_004741	GGTCC	2	10	168951	168960	0 %	20 %	40 %	40 %	30061718
97	NC_004741	ACGGG	2	10	170868	170877	20 %	0 %	60 %	20 %	30061720
98	NC_004741	GTGAT	2	10	173027	173036	20 %	40 %	40 %	0 %	30061721
99	NC_004741	GTGAT	2	10	173318	173327	20 %	40 %	40 %	0 %	30061721
100	NC_004741	GCCAG	2	10	177035	177044	20 %	0 %	40 %	40 %	30061724
101	NC_004741	GTTCT	2	10	178476	178485	0 %	60 %	20 %	20 %	30061724
102	NC_004741	CTGAA	2	10	180468	180477	40 %	20 %	20 %	20 %	30061726
103	NC_004741	AAGCG	2	10	180532	180541	40 %	0 %	40 %	20 %	30061726
104	NC_004741	TGGTG	2	10	182438	182447	0 %	40 %	60 %	0 %	30061728
105	NC_004741	TGCAC	2	10	182564	182573	20 %	20 %	20 %	40 %	30061728
106	NC_004741	TGCGC	2	10	182957	182966	0 %	20 %	40 %	40 %	30061728
107	NC_004741	CATGG	2	10	184800	184809	20 %	20 %	40 %	20 %	30061730
108	NC_004741	CAGAT	2	10	185839	185848	40 %	20 %	20 %	20 %	30061731
109	NC_004741	ACTTT	2	10	185972	185981	20 %	60 %	0 %	20 %	30061731
110	NC_004741	GTTGG	2	10	186383	186392	0 %	40 %	60 %	0 %	161486544
111	NC_004741	GACGT	2	10	189892	189901	20 %	20 %	40 %	20 %	30061734
112	NC_004741	CGACG	2	10	191719	191728	20 %	0 %	40 %	40 %	30061736
113	NC_004741	ATGCC	2	10	194287	194296	20 %	20 %	20 %	40 %	30061739
114	NC_004741	ACCGC	2	10	195626	195635	20 %	0 %	20 %	60 %	30061741
115	NC_004741	GTAAC	2	10	196356	196365	40 %	20 %	20 %	20 %	30061741
116	NC_004741	AGCCG	2	10	196984	196993	20 %	0 %	40 %	40 %	30061741
117	NC_004741	GGTGG	2	10	197093	197102	0 %	20 %	80 %	0 %	30061741
118	NC_004741	TTAAC	2	10	205236	205245	40 %	40 %	0 %	20 %	30061747
119	NC_004741	ACGGT	2	10	208103	208112	20 %	20 %	40 %	20 %	30061751
120	NC_004741	TGATT	2	10	210944	210953	20 %	60 %	20 %	0 %	30061754
121	NC_004741	GGCAA	2	10	221611	221620	40 %	0 %	40 %	20 %	30061759
122	NC_004741	GTGAA	2	10	224213	224222	40 %	20 %	40 %	0 %	30061762
123	NC_004741	TAATT	2	10	224397	224406	40 %	60 %	0 %	0 %	30061762
124	NC_004741	ACTGG	2	10	227323	227332	20 %	20 %	40 %	20 %	30061765
125	NC_004741	CGCGG	2	10	228368	228377	0 %	0 %	60 %	40 %	30061767
126	NC_004741	TCTGC	2	10	229417	229426	0 %	40 %	20 %	40 %	30061768
127	NC_004741	GCAGC	2	10	229982	229991	20 %	0 %	40 %	40 %	30061768
128	NC_004741	ACGCC	2	10	230975	230984	20 %	0 %	20 %	60 %	30061771
129	NC_004741	GCCAT	2	10	231186	231195	20 %	20 %	20 %	40 %	30061771
130	NC_004741	CGCCA	2	10	231790	231799	20 %	0 %	20 %	60 %	30061771
131	NC_004741	GCAGG	2	10	232194	232203	20 %	0 %	60 %	20 %	30061771
132	NC_004741	ACCGG	2	10	233521	233530	20 %	0 %	40 %	40 %	30061773
133	NC_004741	GCACT	2	10	235795	235804	20 %	20 %	20 %	40 %	30061777
134	NC_004741	AGTGG	2	10	235902	235911	20 %	20 %	60 %	0 %	30061777
135	NC_004741	TGGGC	2	10	237407	237416	0 %	20 %	60 %	20 %	30061779
136	NC_004741	GCCCA	2	10	241200	241209	20 %	0 %	20 %	60 %	30061786
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143	NC_004741	CCCAT	2	10	257713	257722	20 %	20 %	0 %	60 %	30061804
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150	NC_004741	CAGTG	2	10	269141	269150	20 %	20 %	40 %	20 %	161486542
151	NC_004741	CTGCG	2	10	270969	270978	0 %	20 %	40 %	40 %	30061818
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153	NC_004741	CCGGT	2	10	274565	274574	0 %	20 %	40 %	40 %	30061822
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157	NC_004741	GTGAT	2	10	281226	281235	20 %	40 %	40 %	0 %	30061831
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248	NC_004741	ATCAC	2	10	478907	478916	40 %	20 %	0 %	40 %	30062016
249	NC_004741	GGCGC	2	10	481282	481291	0 %	0 %	60 %	40 %	30062019
250	NC_004741	TTTTC	2	10	487459	487468	0 %	80 %	0 %	20 %	30062020
251	NC_004741	TAGAG	2	10	487552	487561	40 %	20 %	40 %	0 %	30062020
252	NC_004741	TTTTC	2	10	489101	489110	0 %	80 %	0 %	20 %	30062021
253	NC_004741	TGGCA	2	10	492105	492114	20 %	20 %	40 %	20 %	30062024
254	NC_004741	CCACT	2	10	495004	495013	20 %	20 %	0 %	60 %	30062027
255	NC_004741	CAGTG	2	10	495110	495119	20 %	20 %	40 %	20 %	30062027
256	NC_004741	GGGCG	2	10	498981	498990	0 %	0 %	80 %	20 %	30062029
257	NC_004741	AGCGT	2	10	502818	502827	20 %	20 %	40 %	20 %	30062032
258	NC_004741	AGAGG	2	10	506634	506643	40 %	0 %	60 %	0 %	30062037
259	NC_004741	GTTTT	2	10	509248	509257	0 %	80 %	20 %	0 %	30062041
260	NC_004741	CGCCA	2	10	510719	510728	20 %	0 %	20 %	60 %	30062041
261	NC_004741	GGGAT	2	10	511795	511804	20 %	20 %	60 %	0 %	30062042
262	NC_004741	CCGGT	2	10	513883	513892	0 %	20 %	40 %	40 %	30062043
263	NC_004741	CTGAA	2	10	515650	515659	40 %	20 %	20 %	20 %	30062043
264	NC_004741	TGTTT	2	10	515971	515980	0 %	80 %	20 %	0 %	30062043
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