MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Shigella flexneri 2a str. 2457T

Total Repeats: 8621

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004741	CAGG	2	8	419	426	25 %	0 %	50 %	25 %	30061573
2	NC_004741	ACCA	2	8	465	472	50 %	0 %	0 %	50 %	30061573
3	NC_004741	GCTG	2	8	974	981	0 %	25 %	50 %	25 %	30061573
4	NC_004741	GGAC	2	8	1012	1019	25 %	0 %	50 %	25 %	30061573
5	NC_004741	GCTG	2	8	1801	1808	0 %	25 %	50 %	25 %	30061573
6	NC_004741	CCAG	2	8	2002	2009	25 %	0 %	25 %	50 %	30061573
7	NC_004741	GCAA	2	8	3029	3036	50 %	0 %	25 %	25 %	30061574
8	NC_004741	ATGA	2	8	3127	3134	50 %	25 %	25 %	0 %	30061574
9	NC_004741	CAGC	2	8	3282	3289	25 %	0 %	25 %	50 %	30061574
10	NC_004741	CTGG	2	8	3418	3425	0 %	25 %	50 %	25 %	30061574
11	NC_004741	TTCA	2	8	3427	3434	25 %	50 %	0 %	25 %	30061574
12	NC_004741	AGCG	2	8	3564	3571	25 %	0 %	50 %	25 %	30061574
13	NC_004741	CTGA	2	8	3850	3857	25 %	25 %	25 %	25 %	30061575
14	NC_004741	CAGT	2	8	5765	5772	25 %	25 %	25 %	25 %	30061577
15	NC_004741	AGCG	2	8	6269	6276	25 %	0 %	50 %	25 %	30061577
16	NC_004741	CAAC	2	8	8334	8341	50 %	0 %	0 %	50 %	30061578
17	NC_004741	TTGA	2	8	8387	8394	25 %	50 %	25 %	0 %	30061578
18	NC_004741	CGAC	2	8	8454	8461	25 %	0 %	25 %	50 %	30061578
19	NC_004741	GGCG	2	8	8743	8750	0 %	0 %	75 %	25 %	30061578
20	NC_004741	AAGA	2	8	8810	8817	75 %	0 %	25 %	0 %	30061578
21	NC_004741	AGAT	2	8	9994	10001	50 %	25 %	25 %	0 %	30061580
22	NC_004741	AGAA	2	8	10268	10275	75 %	0 %	25 %	0 %	30061580
23	NC_004741	GCAG	2	8	10671	10678	25 %	0 %	50 %	25 %	30061581
24	NC_004741	CATT	2	8	11349	11356	25 %	50 %	0 %	25 %	30061581
25	NC_004741	CAGT	2	8	11496	11503	25 %	25 %	25 %	25 %	30061583
26	NC_004741	ATGG	2	8	12216	12223	25 %	25 %	50 %	0 %	30061584
27	NC_004741	TGGT	2	8	12307	12314	0 %	50 %	50 %	0 %	30061584
28	NC_004741	ACCG	2	8	12674	12681	25 %	0 %	25 %	50 %	30061584
29	NC_004741	CAAC	2	8	12820	12827	50 %	0 %	0 %	50 %	30061584
30	NC_004741	AAGA	2	8	12894	12901	75 %	0 %	25 %	0 %	30061584
31	NC_004741	CCAT	2	8	13471	13478	25 %	25 %	0 %	50 %	30061584
32	NC_004741	GGTT	2	8	16285	16292	0 %	50 %	50 %	0 %	30061587
33	NC_004741	GTGG	2	8	16909	16916	0 %	25 %	75 %	0 %	30061587
34	NC_004741	CGTT	2	8	17281	17288	0 %	50 %	25 %	25 %	30061587
35	NC_004741	TTTA	2	8	17453	17460	25 %	75 %	0 %	0 %	30061588
36	NC_004741	CCAC	2	8	17756	17763	25 %	0 %	0 %	75 %	30061588
37	NC_004741	GCCA	2	8	18877	18884	25 %	0 %	25 %	50 %	30061589
38	NC_004741	CAGC	2	8	19010	19017	25 %	0 %	25 %	50 %	30061589
39	NC_004741	AGGA	2	8	19350	19357	50 %	0 %	50 %	0 %	30061590
40	NC_004741	CATA	2	8	20378	20385	50 %	25 %	0 %	25 %	30061593
41	NC_004741	TGCG	2	8	20634	20641	0 %	25 %	50 %	25 %	30061593
42	NC_004741	GCTG	2	8	20876	20883	0 %	25 %	50 %	25 %	30061593
43	NC_004741	CCGC	2	8	21265	21272	0 %	0 %	25 %	75 %	30061593
44	NC_004741	CTGG	2	8	21622	21629	0 %	25 %	50 %	25 %	30061594
45	NC_004741	CTGC	2	8	22083	22090	0 %	25 %	25 %	50 %	30061594
46	NC_004741	TGCG	2	8	22633	22640	0 %	25 %	50 %	25 %	30061594
47	NC_004741	TGGT	2	8	23045	23052	0 %	50 %	50 %	0 %	30061594
48	NC_004741	GTGG	2	8	23838	23845	0 %	25 %	75 %	0 %	30061594
49	NC_004741	GCTG	2	8	24192	24199	0 %	25 %	50 %	25 %	30061595
50	NC_004741	ATGG	2	8	25051	25058	25 %	25 %	50 %	0 %	30061596
51	NC_004741	TTGA	2	8	25922	25929	25 %	50 %	25 %	0 %	30061597
52	NC_004741	TGGC	2	8	26465	26472	0 %	25 %	50 %	25 %	30061598
53	NC_004741	CTGG	2	8	26925	26932	0 %	25 %	50 %	25 %	30061598
54	NC_004741	GTGG	2	8	27090	27097	0 %	25 %	75 %	0 %	30061598
55	NC_004741	GCTG	2	8	27442	27449	0 %	25 %	50 %	25 %	30061599
56	NC_004741	CGTG	2	8	27919	27926	0 %	25 %	50 %	25 %	30061599
57	NC_004741	TCCT	2	8	28701	28708	0 %	50 %	0 %	50 %	30061600
58	NC_004741	CTTA	2	8	28729	28736	25 %	50 %	0 %	25 %	30061600
59	NC_004741	AGCC	2	8	29631	29638	25 %	0 %	25 %	50 %	30061600
60	NC_004741	GACC	2	8	29897	29904	25 %	0 %	25 %	50 %	30061601
61	NC_004741	GCTG	2	8	30197	30204	0 %	25 %	50 %	25 %	30061601
62	NC_004741	TGAT	2	8	30346	30353	25 %	50 %	25 %	0 %	30061601
63	NC_004741	CGCA	2	8	30897	30904	25 %	0 %	25 %	50 %	30061601
64	NC_004741	CTGT	2	8	31071	31078	0 %	50 %	25 %	25 %	30061601
65	NC_004741	GGCG	2	8	31247	31254	0 %	0 %	75 %	25 %	30061601
66	NC_004741	ACCG	2	8	31401	31408	25 %	0 %	25 %	50 %	30061601
67	NC_004741	CGTC	2	8	31875	31882	0 %	25 %	25 %	50 %	30061601
68	NC_004741	TGGC	2	8	32338	32345	0 %	25 %	50 %	25 %	30061601
69	NC_004741	GCTG	2	8	32351	32358	0 %	25 %	50 %	25 %	30061601
70	NC_004741	GCAC	2	8	32936	32943	25 %	0 %	25 %	50 %	30061601
71	NC_004741	GGTG	2	8	33283	33290	0 %	25 %	75 %	0 %	161486554
72	NC_004741	AAGA	2	8	33518	33525	75 %	0 %	25 %	0 %	161486554
73	NC_004741	CCAT	2	8	33971	33978	25 %	25 %	0 %	50 %	30061603
74	NC_004741	ATTT	2	8	35185	35192	25 %	75 %	0 %	0 %	30061604
75	NC_004741	TTCT	2	8	35197	35204	0 %	75 %	0 %	25 %	30061605
76	NC_004741	TTCA	2	8	35328	35335	25 %	50 %	0 %	25 %	30061605
77	NC_004741	AGCC	2	8	35542	35549	25 %	0 %	25 %	50 %	30061605
78	NC_004741	CCCG	2	8	35704	35711	0 %	0 %	25 %	75 %	30061605
79	NC_004741	TCGG	2	8	36176	36183	0 %	25 %	50 %	25 %	30061605
80	NC_004741	ACTC	2	8	36288	36295	25 %	25 %	0 %	50 %	30061605
81	NC_004741	GGCG	2	8	36455	36462	0 %	0 %	75 %	25 %	30061605
82	NC_004741	CCAT	2	8	36989	36996	25 %	25 %	0 %	50 %	30061606
83	NC_004741	TGAT	2	8	37011	37018	25 %	50 %	25 %	0 %	30061606
84	NC_004741	AGGC	2	8	37542	37549	25 %	0 %	50 %	25 %	30061606
85	NC_004741	CCGA	2	8	38628	38635	25 %	0 %	25 %	50 %	30061607
86	NC_004741	CCCG	2	8	39024	39031	0 %	0 %	25 %	75 %	30061607
87	NC_004741	TCCA	2	8	39076	39083	25 %	25 %	0 %	50 %	30061607
88	NC_004741	TTAA	2	8	39329	39336	50 %	50 %	0 %	0 %	30061608
89	NC_004741	CACC	2	8	39873	39880	25 %	0 %	0 %	75 %	30061608
90	NC_004741	AGCC	2	8	40440	40447	25 %	0 %	25 %	50 %	30061608
91	NC_004741	CCAG	2	8	40640	40647	25 %	0 %	25 %	50 %	30061608
92	NC_004741	AACC	2	8	40648	40655	50 %	0 %	0 %	50 %	30061608
93	NC_004741	GAAA	2	8	40799	40806	75 %	0 %	25 %	0 %	30061608
94	NC_004741	GTGC	2	8	41226	41233	0 %	25 %	50 %	25 %	161486553
95	NC_004741	TGAT	2	8	41462	41469	25 %	50 %	25 %	0 %	161486553
96	NC_004741	CTGC	2	8	41722	41729	0 %	25 %	25 %	50 %	161486553
97	NC_004741	GTTA	2	8	43072	43079	25 %	50 %	25 %	0 %	30061610
98	NC_004741	GGCG	2	8	43118	43125	0 %	0 %	75 %	25 %	30061610
99	NC_004741	CACC	2	8	43623	43630	25 %	0 %	0 %	75 %	30061610
100	NC_004741	ATTG	2	8	43870	43877	25 %	50 %	25 %	0 %	30061610
101	NC_004741	TTGT	2	8	45154	45161	0 %	75 %	25 %	0 %	30061612
102	NC_004741	TGTT	2	8	45345	45352	0 %	75 %	25 %	0 %	30061612
103	NC_004741	CTGG	2	8	45610	45617	0 %	25 %	50 %	25 %	30061612
104	NC_004741	TGCG	2	8	46818	46825	0 %	25 %	50 %	25 %	30061614
105	NC_004741	ATGA	2	8	46973	46980	50 %	25 %	25 %	0 %	30061614
106	NC_004741	GGCG	2	8	47314	47321	0 %	0 %	75 %	25 %	30061614
107	NC_004741	GGAT	2	8	47928	47935	25 %	25 %	50 %	0 %	30061614
108	NC_004741	AACC	2	8	47998	48005	50 %	0 %	0 %	50 %	30061614
109	NC_004741	CAGG	2	8	48095	48102	25 %	0 %	50 %	25 %	30061614
110	NC_004741	TGGC	2	8	48361	48368	0 %	25 %	50 %	25 %	30061614
111	NC_004741	CCTG	2	8	48695	48702	0 %	25 %	25 %	50 %	30061615
112	NC_004741	TAAA	2	8	48733	48740	75 %	25 %	0 %	0 %	30061615
113	NC_004741	AATC	2	8	48769	48776	50 %	25 %	0 %	25 %	30061615
114	NC_004741	GCAG	2	8	49258	49265	25 %	0 %	50 %	25 %	30061616
115	NC_004741	ACCC	2	8	49273	49280	25 %	0 %	0 %	75 %	30061616
116	NC_004741	AAGA	2	8	49571	49578	75 %	0 %	25 %	0 %	30061616
117	NC_004741	AATG	2	8	50035	50042	50 %	25 %	25 %	0 %	30061617
118	NC_004741	GGCA	2	8	51483	51490	25 %	0 %	50 %	25 %	30061619
119	NC_004741	CGGT	2	8	52084	52091	0 %	25 %	50 %	25 %	30061619
120	NC_004741	GTCA	2	8	52607	52614	25 %	25 %	25 %	25 %	30061620
121	NC_004741	GCTT	2	8	53776	53783	0 %	50 %	25 %	25 %	30061621
122	NC_004741	ACCT	2	8	53856	53863	25 %	25 %	0 %	50 %	30061621
123	NC_004741	CACC	2	8	55250	55257	25 %	0 %	0 %	75 %	30061621
124	NC_004741	CTAC	2	8	55360	55367	25 %	25 %	0 %	50 %	30061621
125	NC_004741	GTAC	2	8	55606	55613	25 %	25 %	25 %	25 %	30061621
126	NC_004741	GCCA	2	8	56405	56412	25 %	0 %	25 %	50 %	30061622
127	NC_004741	GATG	2	8	57446	57453	25 %	25 %	50 %	0 %	30061623
128	NC_004741	CTGC	2	8	57588	57595	0 %	25 %	25 %	50 %	30061623
129	NC_004741	AACC	2	8	57715	57722	50 %	0 %	0 %	50 %	30061623
130	NC_004741	CCTG	2	8	57817	57824	0 %	25 %	25 %	50 %	30061624
131	NC_004741	ATCA	2	8	57966	57973	50 %	25 %	0 %	25 %	30061624
132	NC_004741	TACC	2	8	58241	58248	25 %	25 %	0 %	50 %	30061624
133	NC_004741	TGAT	2	8	58489	58496	25 %	50 %	25 %	0 %	30061624
134	NC_004741	CAGC	2	8	60149	60156	25 %	0 %	25 %	50 %	30061624
135	NC_004741	TGCG	2	8	60542	60549	0 %	25 %	50 %	25 %	30061624
136	NC_004741	TCAA	2	8	61590	61597	50 %	25 %	0 %	25 %	30061625
137	NC_004741	GGCA	2	8	61794	61801	25 %	0 %	50 %	25 %	30061625
138	NC_004741	ATCA	2	8	61892	61899	50 %	25 %	0 %	25 %	30061625
139	NC_004741	GGCG	2	8	62862	62869	0 %	0 %	75 %	25 %	30061625
140	NC_004741	GCCA	2	8	63117	63124	25 %	0 %	25 %	50 %	30061625
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142	NC_004741	GTGG	2	8	63610	63617	0 %	25 %	75 %	0 %	30061626
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