MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chlamydophila caviae GPIC plasmid pCpGP1

Total Repeats: 27

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004720	CTAG	2	8	310	317	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_004720	GAAA	2	8	445	452	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004720	AAAC	2	8	633	640	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_004720	ATTA	2	8	683	690	50 %	50 %	0 %	0 %	29839221
5	NC_004720	GAAA	2	8	797	804	75 %	0 %	25 %	0 %	29839221
6	NC_004720	TTAT	2	8	1059	1066	25 %	75 %	0 %	0 %	29839221
7	NC_004720	TCAA	2	8	1100	1107	50 %	25 %	0 %	25 %	29839221
8	NC_004720	CTTA	2	8	1123	1130	25 %	50 %	0 %	25 %	29839221
9	NC_004720	CCTT	2	8	1233	1240	0 %	50 %	0 %	50 %	29839221
10	NC_004720	AAGA	2	8	1730	1737	75 %	0 %	25 %	0 %	29839222
11	NC_004720	AAGA	2	8	2043	2050	75 %	0 %	25 %	0 %	29839222
12	NC_004720	TGAC	2	8	2521	2528	25 %	25 %	25 %	25 %	29839222
13	NC_004720	TTAG	2	8	2602	2609	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004720	TCAT	2	8	3139	3146	25 %	50 %	0 %	25 %	29839223
15	NC_004720	AGAA	2	8	3537	3544	75 %	0 %	25 %	0 %	29839223
16	NC_004720	TTTA	2	8	4725	4732	25 %	75 %	0 %	0 %	29839224
17	NC_004720	TTAC	2	8	4737	4744	25 %	50 %	0 %	25 %	29839224
18	NC_004720	CAAA	2	8	4757	4764	75 %	0 %	0 %	25 %	29839224
19	NC_004720	AGAA	2	8	5093	5100	75 %	0 %	25 %	0 %	29839224
20	NC_004720	GAAT	2	8	5453	5460	50 %	25 %	25 %	0 %	29839225
21	NC_004720	GAAA	2	8	5851	5858	75 %	0 %	25 %	0 %	29839225
22	NC_004720	AAGG	2	8	6750	6757	50 %	0 %	50 %	0 %	29839226
23	NC_004720	GTTA	2	8	6777	6784	25 %	50 %	25 %	0 %	29839226
24	NC_004720	TGTT	2	8	6809	6816	0 %	75 %	25 %	0 %	29839226
25	NC_004720	ATGA	2	8	7093	7100	50 %	25 %	25 %	0 %	29839227
26	NC_004720	TAAG	2	8	7517	7524	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004720	CTAG	2	8	7843	7850	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.