MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Chlamydophila caviae GPIC plasmid pCpGP1

Total Repeats: 25

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004720	T	6	6	705	710	0 %	100 %	0 %	0 %	29839221
2	NC_004720	A	7	7	712	718	100 %	0 %	0 %	0 %	29839221
3	NC_004720	A	6	6	747	752	100 %	0 %	0 %	0 %	29839221
4	NC_004720	A	6	6	802	807	100 %	0 %	0 %	0 %	29839221
5	NC_004720	A	6	6	934	939	100 %	0 %	0 %	0 %	29839221
6	NC_004720	T	6	6	1451	1456	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004720	A	8	8	1584	1591	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004720	A	6	6	2205	2210	100 %	0 %	0 %	0 %	29839222
9	NC_004720	G	7	7	2584	2590	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004720	T	6	6	2637	2642	0 %	100 %	0 %	0 %	29839223
11	NC_004720	T	6	6	3101	3106	0 %	100 %	0 %	0 %	29839223
12	NC_004720	T	6	6	3778	3783	0 %	100 %	0 %	0 %	29839224
13	NC_004720	A	7	7	4183	4189	100 %	0 %	0 %	0 %	29839224
14	NC_004720	A	6	6	4206	4211	100 %	0 %	0 %	0 %	29839224
15	NC_004720	T	7	7	4638	4644	0 %	100 %	0 %	0 %	29839224
16	NC_004720	A	6	6	5427	5432	100 %	0 %	0 %	0 %	29839225
17	NC_004720	A	6	6	5682	5687	100 %	0 %	0 %	0 %	29839225
18	NC_004720	A	7	7	5964	5970	100 %	0 %	0 %	0 %	29839225
19	NC_004720	A	6	6	6060	6065	100 %	0 %	0 %	0 %	29839225
20	NC_004720	G	6	6	6633	6638	0 %	0 %	100 %	0 %	29839226
21	NC_004720	T	7	7	7041	7047	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004720	A	6	6	7061	7066	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004720	A	6	6	7193	7198	100 %	0 %	0 %	0 %	29839227
24	NC_004720	T	6	6	7203	7208	0 %	100 %	0 %	0 %	29839227
25	NC_004720	A	6	6	7342	7347	100 %	0 %	0 %	0 %	29839227

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.