MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Streptomyces avermitilis MA-4680 plasmid SAP1

Total Repeats: 230

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004719	GGCC	2	8	1279	1286	0 %	0 %	50 %	50 %	29826444
2	NC_004719	GCTG	2	8	1459	1466	0 %	25 %	50 %	25 %	29826444
3	NC_004719	GGAA	2	8	2139	2146	50 %	0 %	50 %	0 %	29826445
4	NC_004719	CGCC	2	8	2193	2200	0 %	0 %	25 %	75 %	29826445
5	NC_004719	AAGC	2	8	2303	2310	50 %	0 %	25 %	25 %	29826445
6	NC_004719	CCCG	2	8	2506	2513	0 %	0 %	25 %	75 %	29826446
7	NC_004719	GCCG	2	8	2517	2524	0 %	0 %	50 %	50 %	29826446
8	NC_004719	GGCG	2	8	4250	4257	0 %	0 %	75 %	25 %	29826447
9	NC_004719	CGGC	2	8	4585	4592	0 %	0 %	50 %	50 %	29826447
10	NC_004719	CGGA	2	8	4700	4707	25 %	0 %	50 %	25 %	29826448
11	NC_004719	GGTG	2	8	8878	8885	0 %	25 %	75 %	0 %	29826452
12	NC_004719	GCGG	2	8	8963	8970	0 %	0 %	75 %	25 %	29826452
13	NC_004719	CGTG	2	8	9649	9656	0 %	25 %	50 %	25 %	29826454
14	NC_004719	CCGC	2	8	10144	10151	0 %	0 %	25 %	75 %	29826454
15	NC_004719	CCCG	2	8	10636	10643	0 %	0 %	25 %	75 %	29826455
16	NC_004719	CACG	2	8	10995	11002	25 %	0 %	25 %	50 %	29826456
17	NC_004719	GGCA	2	8	12509	12516	25 %	0 %	50 %	25 %	29826459
18	NC_004719	GCAG	2	8	13361	13368	25 %	0 %	50 %	25 %	29826459
19	NC_004719	AGCC	2	8	13528	13535	25 %	0 %	25 %	50 %	29826459
20	NC_004719	GATT	2	8	13838	13845	25 %	50 %	25 %	0 %	29826460
21	NC_004719	CTGG	2	8	14036	14043	0 %	25 %	50 %	25 %	29826460
22	NC_004719	CGGT	2	8	14352	14359	0 %	25 %	50 %	25 %	29826460
23	NC_004719	TCGG	2	8	14587	14594	0 %	25 %	50 %	25 %	29826460
24	NC_004719	TTCC	2	8	14923	14930	0 %	50 %	0 %	50 %	29826460
25	NC_004719	CAGG	2	8	15662	15669	25 %	0 %	50 %	25 %	29826461
26	NC_004719	GTCG	2	8	16256	16263	0 %	25 %	50 %	25 %	29826461
27	NC_004719	CAGC	2	8	16279	16286	25 %	0 %	25 %	50 %	29826461
28	NC_004719	GTCG	2	8	16406	16413	0 %	25 %	50 %	25 %	29826461
29	NC_004719	GGCC	2	8	16726	16733	0 %	0 %	50 %	50 %	29826461
30	NC_004719	GCCG	2	8	18009	18016	0 %	0 %	50 %	50 %	29826462
31	NC_004719	GGCG	2	8	19926	19933	0 %	0 %	75 %	25 %	29826464
32	NC_004719	CGGG	2	8	20689	20696	0 %	0 %	75 %	25 %	29826465
33	NC_004719	GCCC	2	8	20712	20719	0 %	0 %	25 %	75 %	29826465
34	NC_004719	CGGC	2	8	20853	20860	0 %	0 %	50 %	50 %	29826465
35	NC_004719	CGAG	2	8	21438	21445	25 %	0 %	50 %	25 %	29826465
36	NC_004719	GCCG	2	8	22075	22082	0 %	0 %	50 %	50 %	29826465
37	NC_004719	TCGG	2	8	22520	22527	0 %	25 %	50 %	25 %	29826465
38	NC_004719	ACCC	2	8	22612	22619	25 %	0 %	0 %	75 %	29826465
39	NC_004719	CAGC	2	8	22773	22780	25 %	0 %	25 %	50 %	29826466
40	NC_004719	CCGG	2	8	22870	22877	0 %	0 %	50 %	50 %	29826466
41	NC_004719	ACCG	2	8	23540	23547	25 %	0 %	25 %	50 %	29826466
42	NC_004719	TACG	2	8	23984	23991	25 %	25 %	25 %	25 %	29826466
43	NC_004719	CGGC	2	8	24671	24678	0 %	0 %	50 %	50 %	29826467
44	NC_004719	GATG	2	8	25332	25339	25 %	25 %	50 %	0 %	29826468
45	NC_004719	ACGA	2	8	25975	25982	50 %	0 %	25 %	25 %	29826469
46	NC_004719	GTGG	2	8	26140	26147	0 %	25 %	75 %	0 %	29826469
47	NC_004719	GGCC	2	8	26234	26241	0 %	0 %	50 %	50 %	29826469
48	NC_004719	CGCC	2	8	26688	26695	0 %	0 %	25 %	75 %	29826469
49	NC_004719	CCGG	2	8	26950	26957	0 %	0 %	50 %	50 %	29826469
50	NC_004719	CGCC	2	8	27015	27022	0 %	0 %	25 %	75 %	29826469
51	NC_004719	CCGC	2	8	27077	27084	0 %	0 %	25 %	75 %	29826469
52	NC_004719	GACC	2	8	27210	27217	25 %	0 %	25 %	50 %	29826469
53	NC_004719	GGCT	2	8	27589	27596	0 %	25 %	50 %	25 %	29826469
54	NC_004719	CGCC	2	8	27599	27606	0 %	0 %	25 %	75 %	29826469
55	NC_004719	CGCA	2	8	27984	27991	25 %	0 %	25 %	50 %	29826469
56	NC_004719	GCCG	2	8	28276	28283	0 %	0 %	50 %	50 %	29826469
57	NC_004719	CCGT	2	8	28394	28401	0 %	25 %	25 %	50 %	29826469
58	NC_004719	CTGG	2	8	29051	29058	0 %	25 %	50 %	25 %	29826470
59	NC_004719	CCGC	2	8	29161	29168	0 %	0 %	25 %	75 %	29826471
60	NC_004719	GGCC	2	8	29895	29902	0 %	0 %	50 %	50 %	29826472
61	NC_004719	GACT	2	8	30330	30337	25 %	25 %	25 %	25 %	29826472
62	NC_004719	CTTC	2	8	30786	30793	0 %	50 %	0 %	50 %	29826472
63	NC_004719	CCAG	2	8	31014	31021	25 %	0 %	25 %	50 %	29826472
64	NC_004719	CGGC	2	8	31592	31599	0 %	0 %	50 %	50 %	29826472
65	NC_004719	ACCA	2	8	31961	31968	50 %	0 %	0 %	50 %	29826472
66	NC_004719	GAAG	2	8	32128	32135	50 %	0 %	50 %	0 %	29826473
67	NC_004719	CCAG	2	8	32181	32188	25 %	0 %	25 %	50 %	29826473
68	NC_004719	TTCC	2	8	32389	32396	0 %	50 %	0 %	50 %	29826474
69	NC_004719	GCAC	2	8	32891	32898	25 %	0 %	25 %	50 %	29826474
70	NC_004719	CGAG	2	8	32900	32907	25 %	0 %	50 %	25 %	29826474
71	NC_004719	CCGT	2	8	33243	33250	0 %	25 %	25 %	50 %	29826474
72	NC_004719	CCCG	2	8	33438	33445	0 %	0 %	25 %	75 %	29826474
73	NC_004719	GCAC	2	8	33516	33523	25 %	0 %	25 %	50 %	29826474
74	NC_004719	CAGC	2	8	34159	34166	25 %	0 %	25 %	50 %	29826476
75	NC_004719	CCGG	2	8	34667	34674	0 %	0 %	50 %	50 %	29826476
76	NC_004719	GGCC	2	8	34675	34682	0 %	0 %	50 %	50 %	29826476
77	NC_004719	CGGC	2	8	34782	34789	0 %	0 %	50 %	50 %	29826476
78	NC_004719	GACG	2	8	35282	35289	25 %	0 %	50 %	25 %	29826476
79	NC_004719	GCCT	2	8	35689	35696	0 %	25 %	25 %	50 %	29826476
80	NC_004719	CACC	2	8	35716	35723	25 %	0 %	0 %	75 %	29826476
81	NC_004719	CGGC	2	8	37101	37108	0 %	0 %	50 %	50 %	29826477
82	NC_004719	GCCG	2	8	37254	37261	0 %	0 %	50 %	50 %	29826477
83	NC_004719	CCGC	2	8	37623	37630	0 %	0 %	25 %	75 %	29826478
84	NC_004719	GCGG	2	8	37977	37984	0 %	0 %	75 %	25 %	29826478
85	NC_004719	AGTC	2	8	38540	38547	25 %	25 %	25 %	25 %	29826478
86	NC_004719	ACCA	2	8	38604	38611	50 %	0 %	0 %	50 %	29826478
87	NC_004719	GGCC	2	8	38855	38862	0 %	0 %	50 %	50 %	29826478
88	NC_004719	ACGC	2	8	38921	38928	25 %	0 %	25 %	50 %	29826478
89	NC_004719	CCCG	2	8	39284	39291	0 %	0 %	25 %	75 %	29826478
90	NC_004719	CCCG	2	8	40729	40736	0 %	0 %	25 %	75 %	29826479
91	NC_004719	GCCG	2	8	40872	40879	0 %	0 %	50 %	50 %	29826479
92	NC_004719	CGGG	2	8	41311	41318	0 %	0 %	75 %	25 %	29826479
93	NC_004719	TCGT	2	8	41442	41449	0 %	50 %	25 %	25 %	29826480
94	NC_004719	ACCG	2	8	41495	41502	25 %	0 %	25 %	50 %	29826480
95	NC_004719	CCAG	2	8	41986	41993	25 %	0 %	25 %	50 %	29826480
96	NC_004719	CGTC	2	8	42507	42514	0 %	25 %	25 %	50 %	29826480
97	NC_004719	CGCT	2	8	42644	42651	0 %	25 %	25 %	50 %	29826480
98	NC_004719	CGAG	2	8	43215	43222	25 %	0 %	50 %	25 %	29826481
99	NC_004719	CGGC	2	8	43225	43232	0 %	0 %	50 %	50 %	29826481
100	NC_004719	TGCA	2	8	43954	43961	25 %	25 %	25 %	25 %	29826482
101	NC_004719	GTCC	2	8	43982	43989	0 %	25 %	25 %	50 %	29826482
102	NC_004719	GGCG	2	8	44018	44025	0 %	0 %	75 %	25 %	29826482
103	NC_004719	GACC	2	8	44457	44464	25 %	0 %	25 %	50 %	29826482
104	NC_004719	CGGC	2	8	44904	44911	0 %	0 %	50 %	50 %	29826483
105	NC_004719	GGCC	2	8	45041	45048	0 %	0 %	50 %	50 %	29826483
106	NC_004719	CTGG	2	8	45280	45287	0 %	25 %	50 %	25 %	29826483
107	NC_004719	GGGC	2	8	45667	45674	0 %	0 %	75 %	25 %	29826484
108	NC_004719	GCAC	2	8	45959	45966	25 %	0 %	25 %	50 %	29826485
109	NC_004719	GGCC	2	8	46346	46353	0 %	0 %	50 %	50 %	29826486
110	NC_004719	CTGG	2	8	46382	46389	0 %	25 %	50 %	25 %	29826486
111	NC_004719	GCCC	2	8	46598	46605	0 %	0 %	25 %	75 %	29826486
112	NC_004719	CCGG	2	8	46783	46790	0 %	0 %	50 %	50 %	29826487
113	NC_004719	ACGC	2	8	46939	46946	25 %	0 %	25 %	50 %	29826487
114	NC_004719	ACCG	2	8	47164	47171	25 %	0 %	25 %	50 %	29826487
115	NC_004719	ACCG	2	8	47737	47744	25 %	0 %	25 %	50 %	29826487
116	NC_004719	AAGG	2	8	48088	48095	50 %	0 %	50 %	0 %	29826487
117	NC_004719	GCGG	2	8	48214	48221	0 %	0 %	75 %	25 %	29826487
118	NC_004719	CGCC	2	8	48251	48258	0 %	0 %	25 %	75 %	29826487
119	NC_004719	GGTC	2	8	48572	48579	0 %	25 %	50 %	25 %	29826487
120	NC_004719	ACGG	2	8	48702	48709	25 %	0 %	50 %	25 %	29826487
121	NC_004719	GAAG	2	8	49317	49324	50 %	0 %	50 %	0 %	29826488
122	NC_004719	TCGG	2	8	49449	49456	0 %	25 %	50 %	25 %	29826488
123	NC_004719	GAAG	2	8	49521	49528	50 %	0 %	50 %	0 %	29826489
124	NC_004719	ACGG	2	8	49703	49710	25 %	0 %	50 %	25 %	29826489
125	NC_004719	ACGT	2	8	49958	49965	25 %	25 %	25 %	25 %	29826490
126	NC_004719	GTCC	2	8	50505	50512	0 %	25 %	25 %	50 %	29826490
127	NC_004719	CCGG	2	8	50733	50740	0 %	0 %	50 %	50 %	29826490
128	NC_004719	GCGG	2	8	50959	50966	0 %	0 %	75 %	25 %	29826490
129	NC_004719	GGCG	2	8	51256	51263	0 %	0 %	75 %	25 %	29826490
130	NC_004719	CGGC	2	8	51508	51515	0 %	0 %	50 %	50 %	29826490
131	NC_004719	CCCG	2	8	51519	51526	0 %	0 %	25 %	75 %	29826490
132	NC_004719	GCGG	2	8	51722	51729	0 %	0 %	75 %	25 %	29826490
133	NC_004719	CGGA	2	8	51746	51753	25 %	0 %	50 %	25 %	29826490
134	NC_004719	CACC	2	8	52448	52455	25 %	0 %	0 %	75 %	29826491
135	NC_004719	TGGA	2	8	52899	52906	25 %	25 %	50 %	0 %	29826492
136	NC_004719	CGCA	2	8	53121	53128	25 %	0 %	25 %	50 %	29826492
137	NC_004719	GGGC	2	8	53303	53310	0 %	0 %	75 %	25 %	29826492
138	NC_004719	TGGA	2	8	53316	53323	25 %	25 %	50 %	0 %	29826492
139	NC_004719	GGAC	2	8	53386	53393	25 %	0 %	50 %	25 %	29826492
140	NC_004719	GGAC	2	8	53831	53838	25 %	0 %	50 %	25 %	29826492
141	NC_004719	TCGG	2	8	53887	53894	0 %	25 %	50 %	25 %	29826492
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.