MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Coxiella burnetii RSA 493 plasmid pQpH1

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004704	CA	3	6	422	427	50 %	0 %	0 %	50 %	29648115
2	NC_004704	TG	3	6	3804	3809	0 %	50 %	50 %	0 %	29648120
3	NC_004704	AG	3	6	4775	4780	50 %	0 %	50 %	0 %	29648120
4	NC_004704	AG	3	6	16863	16868	50 %	0 %	50 %	0 %	29648128
5	NC_004704	GC	3	6	17906	17911	0 %	0 %	50 %	50 %	29648129
6	NC_004704	GC	3	6	20207	20212	0 %	0 %	50 %	50 %	29648132
7	NC_004704	GC	3	6	20739	20744	0 %	0 %	50 %	50 %	29648133
8	NC_004704	TC	3	6	22820	22825	0 %	50 %	0 %	50 %	29648135
9	NC_004704	GC	3	6	25023	25028	0 %	0 %	50 %	50 %	29648138
10	NC_004704	GC	3	6	25034	25039	0 %	0 %	50 %	50 %	29648138
11	NC_004704	AT	3	6	28380	28385	50 %	50 %	0 %	0 %	29648142
12	NC_004704	CT	3	6	28437	28442	0 %	50 %	0 %	50 %	29648142
13	NC_004704	TA	4	8	29996	30003	50 %	50 %	0 %	0 %	29648144
14	NC_004704	GC	3	6	32141	32146	0 %	0 %	50 %	50 %	29648146
15	NC_004704	GA	3	6	32312	32317	50 %	0 %	50 %	0 %	29648146
16	NC_004704	TG	3	6	33797	33802	0 %	50 %	50 %	0 %	29648147
17	NC_004704	GC	3	6	34881	34886	0 %	0 %	50 %	50 %	29648148
18	NC_004704	TG	3	6	34938	34943	0 %	50 %	50 %	0 %	29648148
19	NC_004704	GA	3	6	35698	35703	50 %	0 %	50 %	0 %	29648149
20	NC_004704	CG	3	6	36532	36537	0 %	0 %	50 %	50 %	29648150
21	NC_004704	CG	3	6	36883	36888	0 %	0 %	50 %	50 %	29648150

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.