MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Coxiella burnetii RSA 493 plasmid pQpH1

Total Repeats: 156

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004704	A	8	8	455	462	100 %	0 %	0 %	0 %	29648115
2	NC_004704	A	6	6	722	727	100 %	0 %	0 %	0 %	29648117
3	NC_004704	A	6	6	862	867	100 %	0 %	0 %	0 %	29648117
4	NC_004704	A	6	6	996	1001	100 %	0 %	0 %	0 %	29648117
5	NC_004704	A	7	7	1051	1057	100 %	0 %	0 %	0 %	29648117
6	NC_004704	T	6	6	1400	1405	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004704	T	7	7	1469	1475	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004704	G	6	6	1569	1574	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004704	A	6	6	1638	1643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004704	A	6	6	1698	1703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004704	T	6	6	1716	1721	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004704	A	6	6	2126	2131	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004704	T	6	6	2163	2168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004704	T	6	6	2482	2487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004704	A	9	9	2577	2585	100 %	0 %	0 %	0 %	29648119
16	NC_004704	T	6	6	2749	2754	0 %	100 %	0 %	0 %	29648119
17	NC_004704	A	6	6	3173	3178	100 %	0 %	0 %	0 %	29648119
18	NC_004704	A	7	7	3270	3276	100 %	0 %	0 %	0 %	29648119
19	NC_004704	A	7	7	3624	3630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004704	T	7	7	3647	3653	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004704	A	7	7	3708	3714	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004704	A	6	6	3931	3936	100 %	0 %	0 %	0 %	29648120
23	NC_004704	T	6	6	4190	4195	0 %	100 %	0 %	0 %	29648120
24	NC_004704	T	6	6	4332	4337	0 %	100 %	0 %	0 %	29648120
25	NC_004704	A	6	6	4712	4717	100 %	0 %	0 %	0 %	29648120
26	NC_004704	T	8	8	4815	4822	0 %	100 %	0 %	0 %	29648120
27	NC_004704	A	6	6	4918	4923	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004704	T	7	7	5027	5033	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004704	A	6	6	5095	5100	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004704	C	6	6	5358	5363	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
31	NC_004704	A	6	6	5834	5839	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004704	A	7	7	6632	6638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004704	A	6	6	6657	6662	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004704	T	6	6	6750	6755	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004704	A	7	7	7487	7493	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004704	A	6	6	8000	8005	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004704	A	7	7	9058	9064	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004704	A	7	7	9403	9409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004704	G	6	6	10378	10383	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004704	A	6	6	10739	10744	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004704	G	6	6	10827	10832	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
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43	NC_004704	T	6	6	12064	12069	0 %	100 %	0 %	0 %	29648122
44	NC_004704	A	7	7	12125	12131	100 %	0 %	0 %	0 %	29648122
45	NC_004704	T	6	6	12329	12334	0 %	100 %	0 %	0 %	29648122
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49	NC_004704	A	6	6	14084	14089	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004704	T	6	6	14323	14328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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53	NC_004704	A	6	6	14810	14815	100 %	0 %	0 %	0 %	29648125
54	NC_004704	T	6	6	15184	15189	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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73	NC_004704	A	6	6	18152	18157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004704	A	7	7	18366	18372	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004704	A	7	7	18662	18668	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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80	NC_004704	A	7	7	19279	19285	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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115	NC_004704	A	6	6	27616	27621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004704	T	6	6	27910	27915	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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118	NC_004704	T	6	6	28221	28226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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121	NC_004704	A	6	6	28831	28836	100 %	0 %	0 %	0 %	29648142
122	NC_004704	A	7	7	29060	29066	100 %	0 %	0 %	0 %	29648143
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124	NC_004704	A	8	8	29286	29293	100 %	0 %	0 %	0 %	29648143
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135	NC_004704	T	6	6	30887	30892	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004704	T	7	7	32116	32122	0 %	100 %	0 %	0 %	29648146
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139	NC_004704	A	6	6	32722	32727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004704	T	6	6	32735	32740	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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148	NC_004704	A	7	7	35626	35632	100 %	0 %	0 %	0 %	29648149
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151	NC_004704	A	6	6	36277	36282	100 %	0 %	0 %	0 %	29648149
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.