MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Coding Repeats of Coxiella burnetii RSA 493 plasmid pQpH1

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004704	A	8	8	455	462	100 %	0 %	0 %	0 %	29648115
2	NC_004704	A	6	6	722	727	100 %	0 %	0 %	0 %	29648117
3	NC_004704	A	6	6	862	867	100 %	0 %	0 %	0 %	29648117
4	NC_004704	A	6	6	996	1001	100 %	0 %	0 %	0 %	29648117
5	NC_004704	A	7	7	1051	1057	100 %	0 %	0 %	0 %	29648117
6	NC_004704	A	9	9	2577	2585	100 %	0 %	0 %	0 %	29648119
7	NC_004704	T	6	6	2749	2754	0 %	100 %	0 %	0 %	29648119
8	NC_004704	A	6	6	3173	3178	100 %	0 %	0 %	0 %	29648119
9	NC_004704	A	7	7	3270	3276	100 %	0 %	0 %	0 %	29648119
10	NC_004704	A	6	6	3931	3936	100 %	0 %	0 %	0 %	29648120
11	NC_004704	T	6	6	4190	4195	0 %	100 %	0 %	0 %	29648120
12	NC_004704	T	6	6	4332	4337	0 %	100 %	0 %	0 %	29648120
13	NC_004704	A	6	6	4712	4717	100 %	0 %	0 %	0 %	29648120
14	NC_004704	T	8	8	4815	4822	0 %	100 %	0 %	0 %	29648120
15	NC_004704	T	8	8	11395	11402	0 %	100 %	0 %	0 %	29648122
16	NC_004704	T	6	6	12064	12069	0 %	100 %	0 %	0 %	29648122
17	NC_004704	A	7	7	12125	12131	100 %	0 %	0 %	0 %	29648122
18	NC_004704	T	6	6	12329	12334	0 %	100 %	0 %	0 %	29648122
19	NC_004704	A	6	6	12961	12966	100 %	0 %	0 %	0 %	29648123
20	NC_004704	T	7	7	14426	14432	0 %	100 %	0 %	0 %	29648125
21	NC_004704	A	6	6	14652	14657	100 %	0 %	0 %	0 %	29648125
22	NC_004704	A	6	6	14810	14815	100 %	0 %	0 %	0 %	29648125
23	NC_004704	A	6	6	15619	15624	100 %	0 %	0 %	0 %	29648126
24	NC_004704	A	6	6	16833	16838	100 %	0 %	0 %	0 %	29648128
25	NC_004704	A	6	6	16933	16938	100 %	0 %	0 %	0 %	29648128
26	NC_004704	T	6	6	17611	17616	0 %	100 %	0 %	0 %	29648128
27	NC_004704	A	8	8	17665	17672	100 %	0 %	0 %	0 %	29648128
28	NC_004704	A	6	6	17765	17770	100 %	0 %	0 %	0 %	29648129
29	NC_004704	A	7	7	17821	17827	100 %	0 %	0 %	0 %	29648129
30	NC_004704	A	7	7	17844	17850	100 %	0 %	0 %	0 %	29648129
31	NC_004704	A	8	8	17933	17940	100 %	0 %	0 %	0 %	29648129
32	NC_004704	T	7	7	19829	19835	0 %	100 %	0 %	0 %	29648132
33	NC_004704	A	6	6	19865	19870	100 %	0 %	0 %	0 %	29648132
34	NC_004704	T	6	6	19904	19909	0 %	100 %	0 %	0 %	29648132
35	NC_004704	T	6	6	19967	19972	0 %	100 %	0 %	0 %	29648132
36	NC_004704	T	7	7	20105	20111	0 %	100 %	0 %	0 %	29648132
37	NC_004704	G	6	6	20507	20512	0 %	0 %	100 %	0 %	29648132
38	NC_004704	T	8	8	20565	20572	0 %	100 %	0 %	0 %	29648132
39	NC_004704	A	6	6	20702	20707	100 %	0 %	0 %	0 %	29648133
40	NC_004704	C	6	6	20763	20768	0 %	0 %	0 %	100 %	29648133
41	NC_004704	A	6	6	21344	21349	100 %	0 %	0 %	0 %	29648133
42	NC_004704	T	7	7	22614	22620	0 %	100 %	0 %	0 %	29648135
43	NC_004704	T	6	6	22677	22682	0 %	100 %	0 %	0 %	29648135
44	NC_004704	T	6	6	23226	23231	0 %	100 %	0 %	0 %	29648135
45	NC_004704	T	8	8	24378	24385	0 %	100 %	0 %	0 %	29648137
46	NC_004704	T	6	6	24434	24439	0 %	100 %	0 %	0 %	29648137
47	NC_004704	T	6	6	24442	24447	0 %	100 %	0 %	0 %	29648137
48	NC_004704	T	7	7	24470	24476	0 %	100 %	0 %	0 %	29648137
49	NC_004704	A	7	7	25075	25081	100 %	0 %	0 %	0 %	29648138
50	NC_004704	T	8	8	25704	25711	0 %	100 %	0 %	0 %	29648139
51	NC_004704	A	7	7	25867	25873	100 %	0 %	0 %	0 %	29648140
52	NC_004704	T	6	6	25948	25953	0 %	100 %	0 %	0 %	29648140
53	NC_004704	T	6	6	28585	28590	0 %	100 %	0 %	0 %	29648142
54	NC_004704	T	6	6	28645	28650	0 %	100 %	0 %	0 %	29648142
55	NC_004704	A	6	6	28831	28836	100 %	0 %	0 %	0 %	29648142
56	NC_004704	A	7	7	29060	29066	100 %	0 %	0 %	0 %	29648143
57	NC_004704	T	6	6	29186	29191	0 %	100 %	0 %	0 %	29648143
58	NC_004704	A	8	8	29286	29293	100 %	0 %	0 %	0 %	29648143
59	NC_004704	A	6	6	29499	29504	100 %	0 %	0 %	0 %	29648143
60	NC_004704	T	6	6	29823	29828	0 %	100 %	0 %	0 %	29648144
61	NC_004704	A	7	7	30035	30041	100 %	0 %	0 %	0 %	29648144
62	NC_004704	G	6	6	30126	30131	0 %	0 %	100 %	0 %	29648144
63	NC_004704	A	6	6	30543	30548	100 %	0 %	0 %	0 %	29648145
64	NC_004704	T	8	8	30576	30583	0 %	100 %	0 %	0 %	29648145
65	NC_004704	T	7	7	30594	30600	0 %	100 %	0 %	0 %	29648145
66	NC_004704	T	7	7	32116	32122	0 %	100 %	0 %	0 %	29648146
67	NC_004704	A	7	7	32907	32913	100 %	0 %	0 %	0 %	29648147
68	NC_004704	A	6	6	33045	33050	100 %	0 %	0 %	0 %	29648147
69	NC_004704	A	7	7	33193	33199	100 %	0 %	0 %	0 %	29648147
70	NC_004704	A	7	7	34064	34070	100 %	0 %	0 %	0 %	29648148
71	NC_004704	A	7	7	34622	34628	100 %	0 %	0 %	0 %	29648148
72	NC_004704	A	6	6	34696	34701	100 %	0 %	0 %	0 %	29648148
73	NC_004704	A	7	7	35342	35348	100 %	0 %	0 %	0 %	29648149
74	NC_004704	A	7	7	35626	35632	100 %	0 %	0 %	0 %	29648149
75	NC_004704	A	6	6	35743	35748	100 %	0 %	0 %	0 %	29648149
76	NC_004704	A	6	6	35765	35770	100 %	0 %	0 %	0 %	29648149
77	NC_004704	A	6	6	36277	36282	100 %	0 %	0 %	0 %	29648149
78	NC_004704	A	6	6	36679	36684	100 %	0 %	0 %	0 %	29648150
79	NC_004704	A	6	6	36742	36747	100 %	0 %	0 %	0 %	29648150
80	NC_004704	T	6	6	36871	36876	0 %	100 %	0 %	0 %	29648150
81	NC_004704	T	8	8	36940	36947	0 %	100 %	0 %	0 %	29648150

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.