MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Bacteroides thetaiotaomicron VPI-5482 plasmid p5482

Total Repeats: 21

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004703	CGTTT	2	10	993	1002	0 %	60 %	20 %	20 %	29611502
2	NC_004703	TTCAT	2	10	1177	1186	20 %	60 %	0 %	20 %	29611503
3	NC_004703	TATGA	2	10	7417	7426	40 %	40 %	20 %	0 %	29611507
4	NC_004703	AGAGG	2	10	8571	8580	40 %	0 %	60 %	0 %	29611508
5	NC_004703	GGGGA	2	10	8612	8621	20 %	0 %	80 %	0 %	29611508
6	NC_004703	GGCCT	2	10	10594	10603	0 %	20 %	40 %	40 %	29611511
7	NC_004703	CGATA	2	10	11598	11607	40 %	20 %	20 %	20 %	29611511
8	NC_004703	CAGGA	2	10	14745	14754	40 %	0 %	40 %	20 %	29611515
9	NC_004703	TGAAA	2	10	15040	15049	60 %	20 %	20 %	0 %	29611515
10	NC_004703	AAATA	2	10	16882	16891	80 %	20 %	0 %	0 %	29611517
11	NC_004703	CGGGA	2	10	18540	18549	20 %	0 %	60 %	20 %	29611520
12	NC_004703	TGACG	2	10	18588	18597	20 %	20 %	40 %	20 %	29611520
13	NC_004703	CACCC	2	10	23778	23787	20 %	0 %	0 %	80 %	29611528
14	NC_004703	AATTT	2	10	24894	24903	40 %	60 %	0 %	0 %	29611529
15	NC_004703	CAAAG	2	10	24931	24940	60 %	0 %	20 %	20 %	29611529
16	NC_004703	TGGAT	2	10	25857	25866	20 %	40 %	40 %	0 %	29611530
17	NC_004703	TTTGC	2	10	26682	26691	0 %	60 %	20 %	20 %	29611531
18	NC_004703	GCTTC	2	10	29484	29493	0 %	40 %	20 %	40 %	29611535
19	NC_004703	GAAAG	2	10	29954	29963	60 %	0 %	40 %	0 %	29611535
20	NC_004703	GATCT	2	10	30709	30718	20 %	40 %	20 %	20 %	29611536
21	NC_004703	CTTTT	2	10	31028	31037	0 %	80 %	0 %	20 %	29611537

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.