MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bacteroides thetaiotaomicron VPI-5482 plasmid p5482

Total Repeats: 88

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004703	TTTC	2	8	159	166	0 %	75 %	0 %	25 %	29611501
2	NC_004703	GACG	2	8	180	187	25 %	0 %	50 %	25 %	29611501
3	NC_004703	GAAA	2	8	287	294	75 %	0 %	25 %	0 %	29611501
4	NC_004703	GGGA	2	8	2192	2199	25 %	0 %	75 %	0 %	29611504
5	NC_004703	TACC	2	8	2281	2288	25 %	25 %	0 %	50 %	29611504
6	NC_004703	GACG	2	8	2696	2703	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_004703	TCTT	2	8	2766	2773	0 %	75 %	0 %	25 %	29611505
8	NC_004703	ACGA	2	8	2991	2998	50 %	0 %	25 %	25 %	29611505
9	NC_004703	TCGA	2	8	3234	3241	25 %	25 %	25 %	25 %	29611505
10	NC_004703	TATT	2	8	3884	3891	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004703	AGCA	2	8	4394	4401	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_004703	TATG	2	8	4465	4472	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004703	CATA	2	8	4480	4487	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_004703	TATG	2	8	4542	4549	25 %	50 %	25 %	0 %	29611506
15	NC_004703	GGGA	2	8	5263	5270	25 %	0 %	75 %	0 %	29611507
16	NC_004703	AAGG	2	8	6005	6012	50 %	0 %	50 %	0 %	29611507
17	NC_004703	CCGG	2	8	6150	6157	0 %	0 %	50 %	50 %	29611507
18	NC_004703	TTTC	2	8	6670	6677	0 %	75 %	0 %	25 %	29611507
19	NC_004703	TTCT	2	8	7133	7140	0 %	75 %	0 %	25 %	29611507
20	NC_004703	TTGC	2	8	7158	7165	0 %	50 %	25 %	25 %	29611507
21	NC_004703	CAAA	2	8	7256	7263	75 %	0 %	0 %	25 %	29611507
22	NC_004703	CGGA	2	8	7296	7303	25 %	0 %	50 %	25 %	29611507
23	NC_004703	GCCT	2	8	7450	7457	0 %	25 %	25 %	50 %	29611508
24	NC_004703	GAGG	2	8	7550	7557	25 %	0 %	75 %	0 %	29611508
25	NC_004703	CCGT	2	8	8392	8399	0 %	25 %	25 %	50 %	29611508
26	NC_004703	TATT	2	8	8963	8970	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004703	ATTT	2	8	9091	9098	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004703	GGAC	2	8	9284	9291	25 %	0 %	50 %	25 %	29611509
29	NC_004703	GACG	2	8	10012	10019	25 %	0 %	50 %	25 %	29611511
30	NC_004703	CAGC	2	8	10419	10426	25 %	0 %	25 %	50 %	29611511
31	NC_004703	TTTC	2	8	10831	10838	0 %	75 %	0 %	25 %	29611511
32	NC_004703	AACG	2	8	10912	10919	50 %	0 %	25 %	25 %	29611511
33	NC_004703	AAAG	2	8	11553	11560	75 %	0 %	25 %	0 %	29611511
34	NC_004703	ACAT	2	8	11705	11712	50 %	25 %	0 %	25 %	29611511
35	NC_004703	TTGC	2	8	12034	12041	0 %	50 %	25 %	25 %	29611511
36	NC_004703	GTGG	2	8	12214	12221	0 %	25 %	75 %	0 %	29611512
37	NC_004703	ACGC	2	8	13290	13297	25 %	0 %	25 %	50 %	29611513
38	NC_004703	ACGC	2	8	13700	13707	25 %	0 %	25 %	50 %	29611514
39	NC_004703	ACGG	3	12	14340	14351	25 %	0 %	50 %	25 %	29611515
40	NC_004703	TCCG	2	8	14772	14779	0 %	25 %	25 %	50 %	29611515
41	NC_004703	GGAC	2	8	14825	14832	25 %	0 %	50 %	25 %	29611515
42	NC_004703	GACG	2	8	14927	14934	25 %	0 %	50 %	25 %	29611515
43	NC_004703	GCCT	2	8	15117	15124	0 %	25 %	25 %	50 %	29611516
44	NC_004703	AGCA	2	8	15269	15276	50 %	0 %	25 %	25 %	29611516
45	NC_004703	GAGG	2	8	15299	15306	25 %	0 %	75 %	0 %	29611516
46	NC_004703	CTAT	2	8	15396	15403	25 %	50 %	0 %	25 %	29611516
47	NC_004703	CCGG	2	8	15704	15711	0 %	0 %	50 %	50 %	29611516
48	NC_004703	CCGG	2	8	17506	17513	0 %	0 %	50 %	50 %	29611518
49	NC_004703	GTCG	2	8	18284	18291	0 %	25 %	50 %	25 %	29611520
50	NC_004703	CTTT	2	8	18863	18870	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
51	NC_004703	GATA	2	8	18873	18880	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004703	AATA	2	8	18988	18995	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004703	TTTG	2	8	19045	19052	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004703	TGTT	2	8	19059	19066	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004703	GTTT	2	8	19495	19502	0 %	75 %	25 %	0 %	29611522
56	NC_004703	CAGG	2	8	21125	21132	25 %	0 %	50 %	25 %	29611525
57	NC_004703	CGGT	2	8	21578	21585	0 %	25 %	50 %	25 %	29611526
58	NC_004703	CTTT	2	8	21842	21849	0 %	75 %	0 %	25 %	29611526
59	NC_004703	CTTT	2	8	22154	22161	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_004703	TTGT	2	8	22690	22697	0 %	75 %	25 %	0 %	29611527
61	NC_004703	ATGG	2	8	23439	23446	25 %	25 %	50 %	0 %	29611528
62	NC_004703	CCGA	2	8	23575	23582	25 %	0 %	25 %	50 %	29611528
63	NC_004703	GAAA	2	8	23700	23707	75 %	0 %	25 %	0 %	29611528
64	NC_004703	GGAA	2	8	23835	23842	50 %	0 %	50 %	0 %	29611528
65	NC_004703	ATTA	2	8	24331	24338	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004703	TATT	2	8	24339	24346	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004703	GCGA	2	8	24662	24669	25 %	0 %	50 %	25 %	29611529
68	NC_004703	TACA	2	8	25963	25970	50 %	25 %	0 %	25 %	29611531
69	NC_004703	TTCT	2	8	26130	26137	0 %	75 %	0 %	25 %	29611531
70	NC_004703	GAGG	2	8	26316	26323	25 %	0 %	75 %	0 %	29611531
71	NC_004703	CAGG	2	8	26435	26442	25 %	0 %	50 %	25 %	29611531
72	NC_004703	AAAT	2	8	26820	26827	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004703	GTAT	2	8	26918	26925	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004703	TAAA	2	8	26964	26971	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004703	GTTT	2	8	27228	27235	0 %	75 %	25 %	0 %	29611532
76	NC_004703	GTAA	2	8	27305	27312	50 %	25 %	25 %	0 %	29611532
77	NC_004703	ATAG	2	8	27490	27497	50 %	25 %	25 %	0 %	29611533
78	NC_004703	AGAT	2	8	27725	27732	50 %	25 %	25 %	0 %	29611533
79	NC_004703	TAAA	2	8	28887	28894	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004703	CCTG	2	8	29425	29432	0 %	25 %	25 %	50 %	29611535
81	NC_004703	CGTT	2	8	30022	30029	0 %	50 %	25 %	25 %	29611535
82	NC_004703	GATT	2	8	30949	30956	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004703	AGCC	2	8	31188	31195	25 %	0 %	25 %	50 %	29611537
84	NC_004703	TAGT	2	8	31722	31729	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004703	CACC	2	8	31817	31824	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
86	NC_004703	TTTC	2	8	31972	31979	0 %	75 %	0 %	25 %	29611538
87	NC_004703	TCGC	2	8	32494	32501	0 %	25 %	25 %	50 %	29611538
88	NC_004703	GATA	2	8	33005	33012	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.