MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Bacteroides thetaiotaomicron VPI-5482 plasmid p5482

Total Repeats: 327

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004703	ATT	2	6	25	30	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29611501
2	NC_004703	TGT	2	6	33	38	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29611501
3	NC_004703	CGA	2	6	66	71	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611501
4	NC_004703	TTG	2	6	266	271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29611501
5	NC_004703	GTC	2	6	277	282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29611501
6	NC_004703	AAT	3	9	352	360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29611501
7	NC_004703	GGA	2	6	477	482	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611501
8	NC_004703	GAT	2	6	524	529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611501
9	NC_004703	CCA	2	6	691	696	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29611502
10	NC_004703	GGA	2	6	842	847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611502
11	NC_004703	GAT	2	6	962	967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611502
12	NC_004703	ATC	2	6	975	980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29611502
13	NC_004703	CTT	2	6	1121	1126	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29611503
14	NC_004703	ATG	2	6	1156	1161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611503
15	NC_004703	GAC	2	6	1227	1232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611503
16	NC_004703	GTC	2	6	1242	1247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29611503
17	NC_004703	GGA	2	6	1292	1297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611503
18	NC_004703	GAT	2	6	1374	1379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611503
19	NC_004703	GTA	2	6	1428	1433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611503
20	NC_004703	ACG	2	6	1791	1796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611504
21	NC_004703	GAC	2	6	1815	1820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611504
22	NC_004703	ACG	2	6	1837	1842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611504
23	NC_004703	CGC	2	6	1913	1918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29611504
24	NC_004703	AGG	2	6	2047	2052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611504
25	NC_004703	GAT	2	6	2105	2110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611504
26	NC_004703	GGA	2	6	2231	2236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611504
27	NC_004703	GGC	2	6	2273	2278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29611504
28	NC_004703	GAA	2	6	2328	2333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29611504
29	NC_004703	GAA	2	6	2375	2380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29611504
30	NC_004703	GCA	2	6	2806	2811	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611505
31	NC_004703	TCG	2	6	2868	2873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29611505
32	NC_004703	TTG	3	9	3002	3010	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29611505
33	NC_004703	AGG	2	6	3199	3204	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611505
34	NC_004703	TAA	2	6	3243	3248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29611505
35	NC_004703	TTC	2	6	3327	3332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29611505
36	NC_004703	CCG	2	6	3345	3350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29611505
37	NC_004703	GTA	2	6	3362	3367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611505
38	NC_004703	TGT	2	6	3427	3432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29611505
39	NC_004703	CGT	2	6	3437	3442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29611505
40	NC_004703	CAC	2	6	3446	3451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29611505
41	NC_004703	TGG	2	6	3471	3476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29611505
42	NC_004703	CAT	2	6	3515	3520	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29611505
43	NC_004703	TTG	2	6	3549	3554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29611505
44	NC_004703	TTC	2	6	3555	3560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29611505
45	NC_004703	TCG	2	6	3570	3575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29611505
46	NC_004703	CGA	2	6	3586	3591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611505
47	NC_004703	GTT	2	6	3619	3624	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29611505
48	NC_004703	AGG	2	6	3669	3674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611505
49	NC_004703	CTT	2	6	3739	3744	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29611505
50	NC_004703	AGG	2	6	3752	3757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611505
51	NC_004703	CAA	3	9	4575	4583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29611506
52	NC_004703	AAC	2	6	4693	4698	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29611506
53	NC_004703	GCC	2	6	4726	4731	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29611506
54	NC_004703	AAC	2	6	4821	4826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29611506
55	NC_004703	CGA	2	6	5062	5067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611506
56	NC_004703	GAA	2	6	5071	5076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29611506
57	NC_004703	ACG	2	6	5359	5364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611507
58	NC_004703	TTC	2	6	5370	5375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29611507
59	NC_004703	ATC	2	6	5599	5604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29611507
60	NC_004703	CGG	2	6	5950	5955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29611507
61	NC_004703	TCG	2	6	5965	5970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29611507
62	NC_004703	AAC	2	6	6079	6084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29611507
63	NC_004703	AGC	2	6	6097	6102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611507
64	NC_004703	ATG	2	6	6268	6273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611507
65	NC_004703	ACG	2	6	6285	6290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611507
66	NC_004703	GAA	2	6	6374	6379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29611507
67	NC_004703	GCC	2	6	6574	6579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29611507
68	NC_004703	AGG	2	6	6625	6630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611507
69	NC_004703	AGG	2	6	6745	6750	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611507
70	NC_004703	GCA	2	6	6755	6760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611507
71	NC_004703	CAG	2	6	6765	6770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611507
72	NC_004703	GAA	2	6	6798	6803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29611507
73	NC_004703	ATG	2	6	6880	6885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611507
74	NC_004703	GGT	2	6	7245	7250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29611507
75	NC_004703	ATG	2	6	7368	7373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611507
76	NC_004703	TAT	3	9	7434	7442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29611508
77	NC_004703	ATC	2	6	7465	7470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29611508
78	NC_004703	GTT	2	6	7471	7476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29611508
79	NC_004703	CAG	2	6	7504	7509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611508
80	NC_004703	TGG	2	6	7599	7604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29611508
81	NC_004703	GTG	2	6	7819	7824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29611508
82	NC_004703	GAT	2	6	7855	7860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611508
83	NC_004703	CGT	2	6	8027	8032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29611508
84	NC_004703	AGC	2	6	8107	8112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611508
85	NC_004703	AGC	2	6	8119	8124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611508
86	NC_004703	TTC	2	6	8335	8340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29611508
87	NC_004703	CGG	2	6	8441	8446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29611508
88	NC_004703	ACC	2	6	8596	8601	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29611508
89	NC_004703	AGC	2	6	8605	8610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611508
90	NC_004703	CAG	2	6	8827	8832	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611508
91	NC_004703	GTG	2	6	9252	9257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29611509
92	NC_004703	CAT	3	9	9341	9349	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29611509
93	NC_004703	TAT	2	6	9493	9498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29611510
94	NC_004703	TGG	2	6	9585	9590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29611510
95	NC_004703	GGA	2	6	9861	9866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611511
96	NC_004703	GAC	2	6	10273	10278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611511
97	NC_004703	AGA	2	6	10325	10330	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29611511
98	NC_004703	TGA	2	6	10353	10358	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611511
99	NC_004703	AGG	2	6	10409	10414	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611511
100	NC_004703	GGA	2	6	10518	10523	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611511
101	NC_004703	ATC	2	6	10618	10623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29611511
102	NC_004703	GGA	2	6	10671	10676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611511
103	NC_004703	ATC	2	6	10792	10797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29611511
104	NC_004703	AAC	2	6	10807	10812	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29611511
105	NC_004703	TCG	2	6	10849	10854	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29611511
106	NC_004703	AGG	2	6	10895	10900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611511
107	NC_004703	TCG	2	6	10994	10999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29611511
108	NC_004703	CGT	2	6	11027	11032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29611511
109	NC_004703	CAT	2	6	11037	11042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29611511
110	NC_004703	CAG	2	6	11044	11049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611511
111	NC_004703	TCG	3	9	11075	11083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29611511
112	NC_004703	GCA	2	6	11153	11158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611511
113	NC_004703	AGC	2	6	11195	11200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611511
114	NC_004703	GGA	2	6	11268	11273	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611511
115	NC_004703	GTT	2	6	11284	11289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29611511
116	NC_004703	TTA	2	6	11313	11318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29611511
117	NC_004703	TGA	2	6	11921	11926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611511
118	NC_004703	GGT	2	6	12003	12008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29611511
119	NC_004703	AGG	2	6	12089	12094	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611511
120	NC_004703	TGA	2	6	12180	12185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29611512
121	NC_004703	GGC	2	6	12424	12429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29611512
122	NC_004703	AGG	2	6	12465	12470	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611512
123	NC_004703	GGA	2	6	12508	12513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611512
124	NC_004703	CGA	2	6	12640	12645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611512
125	NC_004703	AAG	2	6	12710	12715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29611512
126	NC_004703	ATC	2	6	12789	12794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29611513
127	NC_004703	ATC	2	6	12819	12824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29611513
128	NC_004703	TTC	2	6	12897	12902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29611513
129	NC_004703	AGG	2	6	13018	13023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29611513
130	NC_004703	GGC	2	6	13090	13095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29611513
131	NC_004703	GCA	2	6	13109	13114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29611513
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.