MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Enterococcus faecalis V583 plasmid pTEF2

Total Repeats: 66

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004671	AAAAT	2	10	338	347	80 %	20 %	0 %	0 %	29377896
2	NC_004671	TCCTA	2	10	1817	1826	20 %	40 %	0 %	40 %	29377897
3	NC_004671	TACTT	2	10	2209	2218	20 %	60 %	0 %	20 %	29377897
4	NC_004671	AAACA	2	10	2947	2956	80 %	0 %	0 %	20 %	29377898
5	NC_004671	TGAAA	2	10	4015	4024	60 %	20 %	20 %	0 %	29377898
6	NC_004671	ATAAA	2	10	4067	4076	80 %	20 %	0 %	0 %	29377898
7	NC_004671	TTTTC	2	10	4177	4186	0 %	80 %	0 %	20 %	29377899
8	NC_004671	TAAAA	2	10	4356	4365	80 %	20 %	0 %	0 %	29377899
9	NC_004671	AACTG	2	10	4465	4474	40 %	20 %	20 %	20 %	29377899
10	NC_004671	TAGAA	2	10	5330	5339	60 %	20 %	20 %	0 %	29377900
11	NC_004671	CGTAT	2	10	5918	5927	20 %	40 %	20 %	20 %	29377901
12	NC_004671	AAAAT	2	10	7084	7093	80 %	20 %	0 %	0 %	29377904
13	NC_004671	CAAGC	2	10	7680	7689	40 %	0 %	20 %	40 %	29377904
14	NC_004671	CAAAA	2	10	9499	9508	80 %	0 %	0 %	20 %	29377904
15	NC_004671	CTTTT	2	10	11531	11540	0 %	80 %	0 %	20 %	29377905
16	NC_004671	AACAA	2	10	11846	11855	80 %	0 %	0 %	20 %	29377905
17	NC_004671	AGAAA	2	10	13860	13869	80 %	0 %	20 %	0 %	29377905
18	NC_004671	TGCTT	2	10	15223	15232	0 %	60 %	20 %	20 %	29377907
19	NC_004671	TTTAT	2	10	15234	15243	20 %	80 %	0 %	0 %	29377907
20	NC_004671	GAAAA	2	10	16053	16062	80 %	0 %	20 %	0 %	29377907
21	NC_004671	TTTAA	2	10	17888	17897	40 %	60 %	0 %	0 %	29377911
22	NC_004671	AAGCA	2	10	21823	21832	60 %	0 %	20 %	20 %	29377914
23	NC_004671	CTAAA	2	10	23292	23301	60 %	20 %	0 %	20 %	29377914
24	NC_004671	AGTAA	2	10	23946	23955	60 %	20 %	20 %	0 %	29377915
25	NC_004671	AGGCG	2	10	24225	24234	20 %	0 %	60 %	20 %	29377917
26	NC_004671	GTTTT	2	10	27431	27440	0 %	80 %	20 %	0 %	29377920
27	NC_004671	CATGC	2	10	29047	29056	20 %	20 %	20 %	40 %	29377920
28	NC_004671	GGCAT	2	10	30543	30552	20 %	20 %	40 %	20 %	29377923
29	NC_004671	AATCC	2	10	30712	30721	40 %	20 %	0 %	40 %	29377923
30	NC_004671	GAAAT	2	10	31965	31974	60 %	20 %	20 %	0 %	29377923
31	NC_004671	CTTTT	2	10	32228	32237	0 %	80 %	0 %	20 %	29377924
32	NC_004671	GTTGG	2	10	32294	32303	0 %	40 %	60 %	0 %	29377924
33	NC_004671	CTTTT	2	10	33097	33106	0 %	80 %	0 %	20 %	29377926
34	NC_004671	ATACA	2	10	33367	33376	60 %	20 %	0 %	20 %	29377926
35	NC_004671	TTTCG	2	10	33762	33771	0 %	60 %	20 %	20 %	29377926
36	NC_004671	TTTTG	2	10	34194	34203	0 %	80 %	20 %	0 %	29377926
37	NC_004671	ACAGG	2	10	35584	35593	40 %	0 %	40 %	20 %	29377928
38	NC_004671	AAACG	2	10	37880	37889	60 %	0 %	20 %	20 %	29377934
39	NC_004671	TTTGG	2	10	38933	38942	0 %	60 %	40 %	0 %	29377937
40	NC_004671	GGATG	2	10	39055	39064	20 %	20 %	60 %	0 %	29377937
41	NC_004671	AAATT	2	10	42081	42090	60 %	40 %	0 %	0 %	29377940
42	NC_004671	TTGTA	2	10	42945	42954	20 %	60 %	20 %	0 %	29377941
43	NC_004671	AAGAA	2	10	43793	43802	80 %	0 %	20 %	0 %	29377942
44	NC_004671	ATTTA	2	10	44029	44038	40 %	60 %	0 %	0 %	29377942
45	NC_004671	TTTTA	2	10	44384	44393	20 %	80 %	0 %	0 %	29377942
46	NC_004671	ATAAA	2	10	44598	44607	80 %	20 %	0 %	0 %	29377942
47	NC_004671	TAAAT	2	10	45657	45666	60 %	40 %	0 %	0 %	29377943
48	NC_004671	AACTT	2	10	45670	45679	40 %	40 %	0 %	20 %	29377943
49	NC_004671	AGTAT	2	10	46135	46144	40 %	40 %	20 %	0 %	29377943
50	NC_004671	GTATC	2	10	46545	46554	20 %	40 %	20 %	20 %	29377943
51	NC_004671	CTGTT	2	10	47588	47597	0 %	60 %	20 %	20 %	29377944
52	NC_004671	TCGTT	2	10	47718	47727	0 %	60 %	20 %	20 %	29377944
53	NC_004671	ATGTA	2	10	48633	48642	40 %	40 %	20 %	0 %	29377946
54	NC_004671	TTCAA	2	10	48936	48945	40 %	40 %	0 %	20 %	29377947
55	NC_004671	AAAAT	2	10	50156	50165	80 %	20 %	0 %	0 %	29377949
56	NC_004671	AAGCA	2	10	51001	51010	60 %	0 %	20 %	20 %	29377951
57	NC_004671	AGTAT	2	10	51252	51261	40 %	40 %	20 %	0 %	29377951
58	NC_004671	TTGAT	2	10	51721	51730	20 %	60 %	20 %	0 %	29377951
59	NC_004671	ATAAA	2	10	51808	51817	80 %	20 %	0 %	0 %	29377951
60	NC_004671	AAATA	2	10	52097	52106	80 %	20 %	0 %	0 %	29377951
61	NC_004671	ACTAT	2	10	52151	52160	40 %	40 %	0 %	20 %	29377951
62	NC_004671	GCATT	2	10	56444	56453	20 %	40 %	20 %	20 %	29377956
63	NC_004671	ATTAT	2	10	56724	56733	40 %	60 %	0 %	0 %	29377956
64	NC_004671	CAAAT	2	10	56964	56973	60 %	20 %	0 %	20 %	29377956
65	NC_004671	CAATC	2	10	57344	57353	40 %	20 %	0 %	40 %	29377957
66	NC_004671	AAAAT	2	10	57487	57496	80 %	20 %	0 %	0 %	29377957

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.