MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Enterococcus faecalis V583 plasmid pTEF3

Total Repeats: 245

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004670	TAT	2	6	40	45	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004670	ATT	2	6	67	72	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004670	TTA	2	6	84	89	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004670	AAC	2	6	107	112	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_004670	GAA	2	6	129	134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377877
6	NC_004670	TTA	2	6	166	171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377877
7	NC_004670	CTG	2	6	299	304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29377877
8	NC_004670	TAT	2	6	326	331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377877
9	NC_004670	AAT	2	6	415	420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377877
10	NC_004670	CAG	2	6	712	717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29377877
11	NC_004670	AGT	2	6	894	899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377877
12	NC_004670	ATG	2	6	932	937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377877
13	NC_004670	GAT	2	6	946	951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377877
14	NC_004670	CAA	2	6	1004	1009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29377877
15	NC_004670	GTA	2	6	1165	1170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377877
16	NC_004670	AGA	2	6	1251	1256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377877
17	NC_004670	CTT	2	6	1301	1306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29377877
18	NC_004670	CTA	2	6	1411	1416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29377877
19	NC_004670	AAT	2	6	1430	1435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377877
20	NC_004670	AGG	2	6	1449	1454	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004670	CAG	2	6	1489	1494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29377878
22	NC_004670	ATT	2	6	1501	1506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377878
23	NC_004670	CTA	2	6	1518	1523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29377878
24	NC_004670	ACG	2	6	1594	1599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29377878
25	NC_004670	ACT	2	6	1629	1634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29377878
26	NC_004670	ATT	2	6	1721	1726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377878
27	NC_004670	AGC	2	6	1794	1799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29377878
28	NC_004670	TGA	2	6	1833	1838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377878
29	NC_004670	AAT	2	6	1948	1953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377878
30	NC_004670	AAG	2	6	2075	2080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377878
31	NC_004670	TAT	2	6	2120	2125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377878
32	NC_004670	TAA	3	9	2206	2214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004670	GAA	2	6	2228	2233	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004670	AAC	2	6	2263	2268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_004670	TGA	2	6	2293	2298	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004670	CAA	2	6	2321	2326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_004670	TGA	2	6	2478	2483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004670	ATT	2	6	2516	2521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004670	TTA	2	6	2589	2594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004670	TGA	2	6	2605	2610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004670	TTC	2	6	2666	2671	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_004670	TAT	2	6	2828	2833	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004670	CAA	2	6	2946	2951	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_004670	GAA	2	6	3034	3039	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004670	AGT	3	9	3070	3078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004670	TAT	2	6	3095	3100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004670	TAA	2	6	3149	3154	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004670	TAA	2	6	3213	3218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004670	ATT	2	6	3325	3330	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004670	CTT	2	6	3370	3375	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_004670	TGG	2	6	3435	3440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004670	GAA	2	6	3553	3558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377879
53	NC_004670	TCA	2	6	3568	3573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29377879
54	NC_004670	AAT	2	6	3636	3641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377879
55	NC_004670	TCT	2	6	3648	3653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29377879
56	NC_004670	CTT	2	6	3659	3664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29377879
57	NC_004670	CAT	2	6	3749	3754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29377879
58	NC_004670	ATG	2	6	3758	3763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377879
59	NC_004670	TGG	2	6	3902	3907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29377879
60	NC_004670	TGT	2	6	4056	4061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29377879
61	NC_004670	TCT	2	6	4171	4176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29377879
62	NC_004670	ATA	2	6	4229	4234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377879
63	NC_004670	TTC	2	6	4320	4325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29377879
64	NC_004670	ATA	2	6	4503	4508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377879
65	NC_004670	GTT	2	6	4603	4608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29377879
66	NC_004670	AAT	2	6	4647	4652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377879
67	NC_004670	TCC	2	6	4705	4710	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_004670	AAT	2	6	4828	4833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004670	AAG	2	6	4919	4924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004670	AGC	2	6	4956	4961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_004670	CAC	2	6	4966	4971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_004670	GAG	2	6	4996	5001	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004670	AGA	2	6	5010	5015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004670	AAG	2	6	5024	5029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004670	TGT	2	6	5049	5054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29377880
76	NC_004670	GAA	2	6	5056	5061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377880
77	NC_004670	GAA	2	6	5077	5082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377880
78	NC_004670	AGA	2	6	5090	5095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377880
79	NC_004670	AGA	2	6	5100	5105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377880
80	NC_004670	TGA	2	6	5208	5213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377880
81	NC_004670	ATA	2	6	5288	5293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377880
82	NC_004670	ATT	2	6	5319	5324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377880
83	NC_004670	ATT	2	6	5387	5392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377880
84	NC_004670	TGA	2	6	5394	5399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377880
85	NC_004670	CAC	2	6	5432	5437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29377880
86	NC_004670	ATT	2	6	5686	5691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377880
87	NC_004670	ATT	2	6	5749	5754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377880
88	NC_004670	TCC	2	6	5856	5861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29377880
89	NC_004670	AAG	2	6	5867	5872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377880
90	NC_004670	GTT	2	6	5947	5952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29377880
91	NC_004670	ATT	2	6	6088	6093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377880
92	NC_004670	GGA	2	6	6298	6303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29377880
93	NC_004670	ATA	2	6	6410	6415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377880
94	NC_004670	CAG	2	6	6491	6496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29377880
95	NC_004670	ATT	2	6	6538	6543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377880
96	NC_004670	GTT	2	6	6633	6638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29377880
97	NC_004670	ATA	2	6	6698	6703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377880
98	NC_004670	TGA	2	6	6864	6869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377880
99	NC_004670	AAT	2	6	6880	6885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377880
100	NC_004670	ATA	2	6	7169	7174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004670	TTA	2	6	7352	7357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004670	ATT	2	6	7367	7372	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004670	TAA	2	6	7373	7378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_004670	AGA	2	6	7411	7416	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004670	CTT	2	6	7440	7445	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_004670	TCT	2	6	7466	7471	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_004670	AAG	2	6	7506	7511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004670	ATT	2	6	7530	7535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377881
109	NC_004670	ATT	2	6	7554	7559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377881
110	NC_004670	AAC	2	6	7624	7629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29377881
111	NC_004670	TTG	2	6	7635	7640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29377881
112	NC_004670	CTT	2	6	7683	7688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29377881
113	NC_004670	TGT	2	6	7771	7776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29377881
114	NC_004670	CCA	2	6	7778	7783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29377881
115	NC_004670	ATA	2	6	7821	7826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377881
116	NC_004670	AGA	2	6	7832	7837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377881
117	NC_004670	TGA	2	6	7846	7851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377881
118	NC_004670	AGA	2	6	7981	7986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377881
119	NC_004670	AGA	2	6	8372	8377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377881
120	NC_004670	CTA	2	6	8556	8561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29377881
121	NC_004670	AAT	2	6	8575	8580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004670	AGG	2	6	8594	8599	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004670	CAG	2	6	8634	8639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29377882
124	NC_004670	ATT	2	6	8646	8651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377882
125	NC_004670	CTA	2	6	8663	8668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29377882
126	NC_004670	ACG	2	6	8739	8744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29377882
127	NC_004670	ACT	2	6	8774	8779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29377882
128	NC_004670	ATT	2	6	8866	8871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377882
129	NC_004670	AGC	2	6	8939	8944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29377882
130	NC_004670	TGA	2	6	8978	8983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377882
131	NC_004670	AAT	2	6	9093	9098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377882
132	NC_004670	AAG	2	6	9220	9225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377882
133	NC_004670	TAT	2	6	9265	9270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377882
134	NC_004670	ATG	2	6	9422	9427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004670	TTA	2	6	9471	9476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004670	ATT	2	6	9557	9562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004670	GAA	3	9	9584	9592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377883
138	NC_004670	TGA	2	6	9598	9603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377883
139	NC_004670	TTA	2	6	9633	9638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377883
140	NC_004670	GAA	3	9	9784	9792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377883
141	NC_004670	TAT	2	6	9873	9878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377883
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.