MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Enterococcus faecalis V583 plasmid pTEF3

Total Repeats: 179

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004670	GAA	2	6	129	134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377877
2	NC_004670	TTA	2	6	166	171	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377877
3	NC_004670	CTG	2	6	299	304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29377877
4	NC_004670	TAT	2	6	326	331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377877
5	NC_004670	AAT	2	6	415	420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377877
6	NC_004670	CAG	2	6	712	717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29377877
7	NC_004670	AGT	2	6	894	899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377877
8	NC_004670	ATG	2	6	932	937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377877
9	NC_004670	GAT	2	6	946	951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377877
10	NC_004670	CAA	2	6	1004	1009	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29377877
11	NC_004670	GTA	2	6	1165	1170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377877
12	NC_004670	AGA	2	6	1251	1256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377877
13	NC_004670	CTT	2	6	1301	1306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29377877
14	NC_004670	CTA	2	6	1411	1416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29377877
15	NC_004670	AAT	2	6	1430	1435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377877
16	NC_004670	CAG	2	6	1489	1494	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29377878
17	NC_004670	ATT	2	6	1501	1506	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377878
18	NC_004670	CTA	2	6	1518	1523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29377878
19	NC_004670	ACG	2	6	1594	1599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29377878
20	NC_004670	ACT	2	6	1629	1634	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29377878
21	NC_004670	ATT	2	6	1721	1726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377878
22	NC_004670	AGC	2	6	1794	1799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29377878
23	NC_004670	TGA	2	6	1833	1838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377878
24	NC_004670	AAT	2	6	1948	1953	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377878
25	NC_004670	AAG	2	6	2075	2080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377878
26	NC_004670	TAT	2	6	2120	2125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377878
27	NC_004670	GAA	2	6	3553	3558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377879
28	NC_004670	TCA	2	6	3568	3573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29377879
29	NC_004670	AAT	2	6	3636	3641	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377879
30	NC_004670	TCT	2	6	3648	3653	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29377879
31	NC_004670	CTT	2	6	3659	3664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29377879
32	NC_004670	CAT	2	6	3749	3754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29377879
33	NC_004670	ATG	2	6	3758	3763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377879
34	NC_004670	TGG	2	6	3902	3907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29377879
35	NC_004670	TGT	2	6	4056	4061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29377879
36	NC_004670	TCT	2	6	4171	4176	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29377879
37	NC_004670	ATA	2	6	4229	4234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377879
38	NC_004670	TTC	2	6	4320	4325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29377879
39	NC_004670	ATA	2	6	4503	4508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377879
40	NC_004670	GTT	2	6	4603	4608	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29377879
41	NC_004670	AAT	2	6	4647	4652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377879
42	NC_004670	TGT	2	6	5049	5054	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29377880
43	NC_004670	GAA	2	6	5056	5061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377880
44	NC_004670	GAA	2	6	5077	5082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377880
45	NC_004670	AGA	2	6	5090	5095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377880
46	NC_004670	AGA	2	6	5100	5105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377880
47	NC_004670	TGA	2	6	5208	5213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377880
48	NC_004670	ATA	2	6	5288	5293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377880
49	NC_004670	ATT	2	6	5319	5324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377880
50	NC_004670	ATT	2	6	5387	5392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377880
51	NC_004670	TGA	2	6	5394	5399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377880
52	NC_004670	CAC	2	6	5432	5437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29377880
53	NC_004670	ATT	2	6	5686	5691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377880
54	NC_004670	ATT	2	6	5749	5754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377880
55	NC_004670	TCC	2	6	5856	5861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29377880
56	NC_004670	AAG	2	6	5867	5872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377880
57	NC_004670	GTT	2	6	5947	5952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29377880
58	NC_004670	ATT	2	6	6088	6093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377880
59	NC_004670	GGA	2	6	6298	6303	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29377880
60	NC_004670	ATA	2	6	6410	6415	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377880
61	NC_004670	CAG	2	6	6491	6496	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29377880
62	NC_004670	ATT	2	6	6538	6543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377880
63	NC_004670	GTT	2	6	6633	6638	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29377880
64	NC_004670	ATA	2	6	6698	6703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377880
65	NC_004670	TGA	2	6	6864	6869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377880
66	NC_004670	AAT	2	6	6880	6885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377880
67	NC_004670	ATT	2	6	7530	7535	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377881
68	NC_004670	ATT	2	6	7554	7559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377881
69	NC_004670	AAC	2	6	7624	7629	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29377881
70	NC_004670	TTG	2	6	7635	7640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29377881
71	NC_004670	CTT	2	6	7683	7688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29377881
72	NC_004670	TGT	2	6	7771	7776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29377881
73	NC_004670	CCA	2	6	7778	7783	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29377881
74	NC_004670	ATA	2	6	7821	7826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377881
75	NC_004670	AGA	2	6	7832	7837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377881
76	NC_004670	TGA	2	6	7846	7851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377881
77	NC_004670	AGA	2	6	7981	7986	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377881
78	NC_004670	AGA	2	6	8372	8377	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377881
79	NC_004670	CTA	2	6	8556	8561	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29377881
80	NC_004670	CAG	2	6	8634	8639	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29377882
81	NC_004670	ATT	2	6	8646	8651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377882
82	NC_004670	CTA	2	6	8663	8668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29377882
83	NC_004670	ACG	2	6	8739	8744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29377882
84	NC_004670	ACT	2	6	8774	8779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29377882
85	NC_004670	ATT	2	6	8866	8871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377882
86	NC_004670	AGC	2	6	8939	8944	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29377882
87	NC_004670	TGA	2	6	8978	8983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377882
88	NC_004670	AAT	2	6	9093	9098	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377882
89	NC_004670	AAG	2	6	9220	9225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377882
90	NC_004670	TAT	2	6	9265	9270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377882
91	NC_004670	GAA	3	9	9584	9592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377883
92	NC_004670	TGA	2	6	9598	9603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377883
93	NC_004670	TTA	2	6	9633	9638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377883
94	NC_004670	GAA	3	9	9784	9792	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377883
95	NC_004670	TAT	2	6	9873	9878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377883
96	NC_004670	AAG	2	6	9883	9888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377883
97	NC_004670	AGA	2	6	10192	10197	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377884
98	NC_004670	ACT	2	6	10198	10203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29377884
99	NC_004670	TCT	2	6	10289	10294	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29377884
100	NC_004670	AAT	2	6	10298	10303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377884
101	NC_004670	CTT	2	6	10321	10326	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29377884
102	NC_004670	ATG	2	6	10379	10384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377884
103	NC_004670	AAG	2	6	10440	10445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377884
104	NC_004670	GAA	2	6	10622	10627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377884
105	NC_004670	AAT	2	6	10644	10649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377884
106	NC_004670	ATT	2	6	10683	10688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377885
107	NC_004670	ATT	2	6	10809	10814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377885
108	NC_004670	GAA	2	6	10863	10868	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377885
109	NC_004670	GTA	2	6	11009	11014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377886
110	NC_004670	GTT	2	6	11097	11102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29377886
111	NC_004670	TAA	2	6	11143	11148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377886
112	NC_004670	GAA	2	6	11179	11184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377887
113	NC_004670	TGA	2	6	11308	11313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377887
114	NC_004670	AGT	2	6	11844	11849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377888
115	NC_004670	CCT	2	6	11929	11934	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29377888
116	NC_004670	AGA	2	6	12028	12033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29377889
117	NC_004670	CTA	2	6	12042	12047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29377889
118	NC_004670	AGT	2	6	12109	12114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377889
119	NC_004670	TGT	2	6	12135	12140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29377889
120	NC_004670	ATT	2	6	12206	12211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377889
121	NC_004670	ATT	2	6	12388	12393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377890
122	NC_004670	TGA	2	6	12499	12504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377890
123	NC_004670	GTG	2	6	12505	12510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29377890
124	NC_004670	TGC	2	6	12536	12541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29377890
125	NC_004670	CCA	2	6	12627	12632	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29377890
126	NC_004670	TAA	2	6	12668	12673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29377890
127	NC_004670	ATT	2	6	12795	12800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377890
128	NC_004670	TTG	2	6	12910	12915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29377890
129	NC_004670	GCT	2	6	12999	13004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29377890
130	NC_004670	TTG	2	6	13303	13308	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29377890
131	NC_004670	CAA	2	6	13379	13384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29377890
132	NC_004670	TAC	2	6	13490	13495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29377890
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.