MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Enterococcus faecalis V583 plasmid pTEF1

Total Repeats: 33

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004669	AATTTA	2	12	1129	1140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004669	CAACCA	2	12	2588	2599	50 %	0 %	0 %	50 %	29377806
3	NC_004669	TTTATT	2	12	5052	5063	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004669	GAAAAA	2	12	5630	5641	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	29377809
5	NC_004669	TTTTTC	2	12	8067	8078	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	29377811
6	NC_004669	TTTTGA	2	12	8392	8403	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004669	ATATTT	2	12	8717	8728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377812
8	NC_004669	TTTTAA	2	12	9565	9576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004669	GTTAAG	2	12	10482	10493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29377813
10	NC_004669	TTTTTC	2	12	11330	11341	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	29377814
11	NC_004669	AGCATA	2	12	15128	15139	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_004669	ACTTCT	2	12	20805	20816	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	29377827
13	NC_004669	ACAAAG	2	12	23869	23880	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	29377828
14	NC_004669	CTTCGT	2	12	26231	26242	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	29377830
15	NC_004669	TTTATC	2	12	26316	26327	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	29377830
16	NC_004669	ATTAAG	2	12	28391	28402	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	29377833
17	NC_004669	CACTTG	2	12	28961	28972	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	29377834
18	NC_004669	TTTTAC	2	12	31115	31126	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	29377838
19	NC_004669	ATTTTA	2	12	33067	33078	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29377840
20	NC_004669	GTTCTT	2	12	33777	33788	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	29377840
21	NC_004669	AAGCCT	2	12	35142	35153	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	29377844
22	NC_004669	CATTTT	2	12	38221	38232	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	29377844
23	NC_004669	TTCCGC	2	12	42289	42300	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	29377848
24	NC_004669	TCTTTT	2	12	42665	42676	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	29377848
25	NC_004669	AAATAA	2	12	44200	44211	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004669	TTTTTC	2	12	45106	45117	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	29377851
27	NC_004669	GTAAAA	2	12	47438	47449	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004669	TTGATA	2	12	48782	48793	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	29377855
29	NC_004669	GTATAT	2	12	49105	49116	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	29377855
30	NC_004669	ATTATC	2	12	49394	49405	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	29377856
31	NC_004669	TTTTAC	2	12	51952	51963	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_004669	TTTTTC	2	12	52507	52518	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	29377858
33	NC_004669	TAATCA	2	12	65546	65557	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	29377875

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.