MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Enterococcus faecalis V583 plasmid pTEF1

Total Repeats: 65

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004669	CAGTA	2	10	652	661	40 %	20 %	20 %	20 %	29377804
2	NC_004669	TCAAG	2	10	1773	1782	40 %	20 %	20 %	20 %	29377805
3	NC_004669	ATGGA	2	10	2003	2012	40 %	20 %	40 %	0 %	29377805
4	NC_004669	AATTT	2	10	2310	2319	40 %	60 %	0 %	0 %	29377805
5	NC_004669	AATTT	2	10	2338	2347	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004669	TTAAC	2	10	3000	3009	40 %	40 %	0 %	20 %	29377806
7	NC_004669	TTCTA	2	10	3274	3283	20 %	60 %	0 %	20 %	29377806
8	NC_004669	TTTTC	2	10	4000	4009	0 %	80 %	0 %	20 %	29377807
9	NC_004669	TTTTG	2	10	4488	4497	0 %	80 %	20 %	0 %	29377807
10	NC_004669	TAAGT	2	10	5088	5097	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004669	CAAGA	2	10	8542	8551	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
12	NC_004669	TCTTT	2	10	9153	9162	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_004669	GATAA	2	10	10115	10124	60 %	20 %	20 %	0 %	29377813
14	NC_004669	TTAGC	2	10	12167	12176	20 %	40 %	20 %	20 %	29377816
15	NC_004669	GTTGG	2	10	15146	15155	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004669	TTTTG	2	10	15741	15750	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004669	AATAC	2	10	17725	17734	60 %	20 %	0 %	20 %	29377822
18	NC_004669	AAAAT	2	10	18436	18445	80 %	20 %	0 %	0 %	29377823
19	NC_004669	TTACT	2	10	19463	19472	20 %	60 %	0 %	20 %	29377825
20	NC_004669	TTTTC	2	10	22058	22067	0 %	80 %	0 %	20 %	29377828
21	NC_004669	CAAGC	2	10	22986	22995	40 %	0 %	20 %	40 %	29377828
22	NC_004669	TGCTA	2	10	23919	23928	20 %	40 %	20 %	20 %	29377828
23	NC_004669	AAATC	2	10	24152	24161	60 %	20 %	0 %	20 %	29377828
24	NC_004669	TTTAT	2	10	24314	24323	20 %	80 %	0 %	0 %	29377829
25	NC_004669	TTTGG	2	10	24902	24911	0 %	60 %	40 %	0 %	29377830
26	NC_004669	TTGAT	2	10	25240	25249	20 %	60 %	20 %	0 %	29377830
27	NC_004669	CTTTT	2	10	27830	27839	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_004669	ATTTT	2	10	27881	27890	20 %	80 %	0 %	0 %	29377832
29	NC_004669	AAAGA	2	10	28020	28029	80 %	0 %	20 %	0 %	29377832
30	NC_004669	AATAA	2	10	28559	28568	80 %	20 %	0 %	0 %	29377834
31	NC_004669	ACTTT	2	10	29611	29620	20 %	60 %	0 %	20 %	29377835
32	NC_004669	TCTTT	2	10	30571	30580	0 %	80 %	0 %	20 %	29377837
33	NC_004669	TTTCA	2	10	34136	34145	20 %	60 %	0 %	20 %	29377841
34	NC_004669	TAAAA	2	10	34196	34205	80 %	20 %	0 %	0 %	29377841
35	NC_004669	TTTCT	2	10	35125	35134	0 %	80 %	0 %	20 %	29377844
36	NC_004669	TTGTT	2	10	37139	37148	0 %	80 %	20 %	0 %	29377844
37	NC_004669	TCTTT	2	10	39050	39059	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_004669	TCATG	2	10	40187	40196	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
39	NC_004669	TAAAA	2	10	40201	40210	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004669	TGCTT	2	10	40505	40514	0 %	60 %	20 %	20 %	29377848
41	NC_004669	TAAGT	2	10	41989	41998	40 %	40 %	20 %	0 %	29377848
42	NC_004669	GCTTG	2	10	42321	42330	0 %	40 %	40 %	20 %	29377848
43	NC_004669	ATTTT	2	10	42917	42926	20 %	80 %	0 %	0 %	29377848
44	NC_004669	TATAC	2	10	44512	44521	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
45	NC_004669	ACGAA	2	10	46688	46697	60 %	0 %	20 %	20 %	29377853
46	NC_004669	AATAT	2	10	46793	46802	60 %	40 %	0 %	0 %	29377853
47	NC_004669	AACGA	2	10	47808	47817	60 %	0 %	20 %	20 %	29377854
48	NC_004669	AACAG	2	10	47938	47947	60 %	0 %	20 %	20 %	29377854
49	NC_004669	TATGG	2	10	49426	49435	20 %	40 %	40 %	0 %	29377856
50	NC_004669	AGAAA	2	10	50545	50554	80 %	0 %	20 %	0 %	29377856
51	NC_004669	ATATA	2	10	50583	50592	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004669	CTGTT	2	10	51454	51463	0 %	60 %	20 %	20 %	29377857
53	NC_004669	TCGTT	2	10	51584	51593	0 %	60 %	20 %	20 %	29377857
54	NC_004669	ATTTG	2	10	54058	54067	20 %	60 %	20 %	0 %	29377861
55	NC_004669	ATTTG	2	10	54275	54284	20 %	60 %	20 %	0 %	29377861
56	NC_004669	CTTCT	2	10	58800	58809	0 %	60 %	0 %	40 %	29377865
57	NC_004669	GGAAA	2	10	59722	59731	60 %	0 %	40 %	0 %	29377866
58	NC_004669	AAAAC	2	10	60045	60054	80 %	0 %	0 %	20 %	29377867
59	NC_004669	CAAAA	2	10	60572	60581	80 %	0 %	0 %	20 %	29377868
60	NC_004669	ATATG	2	10	61071	61080	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004669	TATAG	2	10	62835	62844	40 %	40 %	20 %	0 %	29377871
62	NC_004669	TGAAT	2	10	63688	63697	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004669	TAAAA	2	10	64121	64130	80 %	20 %	0 %	0 %	29377873
64	NC_004669	TTTTA	2	10	64716	64725	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004669	ATCTA	2	10	64824	64833	40 %	40 %	0 %	20 %	29377874

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.