MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Bacteroides thetaiotaomicron VPI-5482 chromosome

Total Repeats: 234

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004663	TATTTA	2	12	19352	19363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004663	TAGAGT	2	12	72421	72432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004663	TTGTGG	2	12	88645	88656	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004663	TTACTT	2	12	95121	95132	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_004663	AAAAAC	2	12	102781	102792	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_004663	CTGTTC	2	12	110884	110895	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_004663	AATATA	2	12	151494	151505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004663	GGGAAA	2	12	184870	184881	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004663	CTTTTG	2	12	212205	212216	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_004663	AATAAA	2	12	237815	237826	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004663	TTAAAT	2	12	241149	241160	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004663	TTTATA	2	12	387049	387060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004663	GATATT	2	12	446159	446170	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004663	TCTGTT	2	12	463088	463099	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_004663	CATTAA	2	12	547336	547347	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_004663	AGTTGG	2	12	577444	577455	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004663	ACATTT	2	12	600264	600275	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_004663	AACGAA	2	12	620520	620531	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_004663	TATTGT	2	12	654885	654896	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004663	TATTGC	2	12	657971	657982	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_004663	ATTGTT	2	12	674313	674324	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004663	TTTTTG	2	12	703016	703027	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004663	AACTAA	2	12	723283	723294	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_004663	GCTAAC	2	12	754400	754411	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_004663	TTGAAT	2	12	760852	760863	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004663	TGTGTT	2	12	768805	768816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004663	GTTTTT	2	12	849351	849362	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004663	TTGTCT	2	12	861343	861354	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
29	NC_004663	CAAAAG	2	12	878683	878694	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_004663	AAACAA	2	12	894728	894739	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_004663	TGTAAT	2	12	898744	898755	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004663	AAAGAA	2	12	934469	934480	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004663	AGAATG	2	12	953892	953903	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004663	CAGAAG	2	12	959147	959158	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_004663	GTGTTT	2	12	969186	969197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004663	TTATAT	2	12	970626	970637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004663	TATCTT	2	12	1012674	1012685	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_004663	GTTTTA	2	12	1018492	1018503	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004663	TAAAAA	2	12	1042520	1042531	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004663	TAATAT	2	12	1093023	1093034	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004663	TTTTTA	2	12	1111657	1111668	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004663	TCCATT	2	12	1149766	1149777	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_004663	ATCTTC	2	12	1149795	1149806	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_004663	AACAAA	2	12	1175658	1175669	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_004663	CAAACA	2	12	1252614	1252625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_004663	AATGAT	2	12	1268034	1268045	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004663	TTAAAT	2	12	1290687	1290698	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004663	TAGGAT	2	12	1298777	1298788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004663	CAAATA	2	12	1325040	1325051	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_004663	AGTTTC	2	12	1346878	1346889	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_004663	TCTATT	2	12	1350366	1350377	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_004663	CGGAAA	2	12	1359374	1359385	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_004663	ATATTC	2	12	1363624	1363635	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_004663	AAATGT	2	12	1551368	1551379	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004663	ATAAAG	2	12	1558757	1558768	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004663	GAAACT	2	12	1563006	1563017	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_004663	TCCATC	2	12	1563205	1563216	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_004663	TCGCTT	2	12	1628939	1628950	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_004663	ATTACT	2	12	1717312	1717323	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_004663	AATATG	2	12	1755325	1755336	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004663	GTCAAA	2	12	1769386	1769397	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_004663	CGGATA	2	12	1793751	1793762	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_004663	AAAAAT	2	12	1793800	1793811	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004663	AATAAG	2	12	1809786	1809797	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004663	AAAAAG	2	12	1809801	1809812	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004663	ATGAAA	2	12	1908466	1908477	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004663	TAAAAG	2	12	1914092	1914103	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004663	CCAACT	2	12	1942031	1942042	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_004663	ATCTGC	2	12	1948852	1948863	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_004663	ACATTT	2	12	1973361	1973372	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_004663	TAGCTT	2	12	1974948	1974959	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_004663	AAAGAT	2	12	2021553	2021564	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004663	AAAGTC	2	12	2100080	2100091	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
74	NC_004663	AAAAAT	2	12	2115270	2115281	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004663	CCAATT	2	12	2152765	2152776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_004663	ACATTT	2	12	2169226	2169237	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
77	NC_004663	CAGTGC	2	12	2217565	2217576	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_004663	TAATCT	2	12	2217643	2217654	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_004663	ACGGTG	2	12	2261539	2261550	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_004663	ATACTA	2	12	2261813	2261824	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
81	NC_004663	AGTATT	2	12	2265539	2265550	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004663	GTGAAG	2	12	2292016	2292027	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004663	ACAAAA	2	12	2310676	2310687	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
84	NC_004663	CTATAT	2	12	2313253	2313264	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_004663	CATTTC	2	12	2314715	2314726	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_004663	TCGCTT	2	12	2339464	2339475	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_004663	TTAAAA	2	12	2347427	2347438	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004663	GAATAA	2	12	2349035	2349046	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004663	AATAAG	2	12	2375508	2375519	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004663	CTTAAA	2	12	2422477	2422488	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_004663	ACTTAT	2	12	2463451	2463462	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_004663	CTATCA	2	12	2481481	2481492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_004663	TTGTAT	2	12	2482965	2482976	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004663	TGGCAG	2	12	2497803	2497814	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
95	NC_004663	AAGTAC	2	12	2497930	2497941	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_004663	AAATTA	2	12	2545092	2545103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004663	CCTCGC	2	12	2546687	2546698	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
98	NC_004663	TTTTAC	2	12	2553415	2553426	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
99	NC_004663	TTTCTG	2	12	2567633	2567644	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_004663	TTCTTT	2	12	2572160	2572171	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_004663	TCTGCC	2	12	2572935	2572946	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
102	NC_004663	TTGTAT	2	12	2583364	2583375	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004663	GCAATG	2	12	2590521	2590532	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_004663	TTTATT	2	12	2622222	2622233	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004663	ATAAAA	3	18	2637923	2637940	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004663	TTATTC	2	12	2690860	2690871	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_004663	AATATC	2	12	2693931	2693942	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
108	NC_004663	TAACAA	2	12	2699817	2699828	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
109	NC_004663	CTTTTC	2	12	2737135	2737146	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_004663	AAAATC	2	12	2740573	2740584	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_004663	CCGAAA	2	12	2784955	2784966	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_004663	TTACTT	2	12	2803789	2803800	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_004663	CTATTT	2	12	2827313	2827324	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_004663	CGGAAC	2	12	2861011	2861022	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_004663	TTGAAT	2	12	2876179	2876190	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004663	ATTAAT	2	12	2897307	2897318	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004663	ACAAAT	2	12	2936784	2936795	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
118	NC_004663	ACTAAT	2	12	2953105	2953116	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
119	NC_004663	ATCACA	2	12	2968128	2968139	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_004663	CATGAA	2	12	3010555	3010566	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_004663	TCGCTT	2	12	3033469	3033480	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_004663	GAAAAA	2	12	3036902	3036913	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004663	AAAAAG	2	12	3041487	3041498	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004663	ACAACT	2	12	3052691	3052702	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_004663	TCAAAT	2	12	3104547	3104558	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_004663	TGGGAG	2	12	3104843	3104854	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.