MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 679

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004631	GAAAA	2	10	10061	10070	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004631	TCTTT	2	10	11323	11332	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_004631	TATTG	2	10	17582	17591	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004631	GGCCG	2	10	21680	21689	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
5	NC_004631	GCGTC	2	10	28361	28370	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_004631	TTTTA	2	10	33215	33224	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004631	ATCGT	2	10	34918	34927	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_004631	ATTTT	2	10	34962	34971	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004631	ATTTT	2	10	35222	35231	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004631	TAAAA	2	10	44187	44196	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004631	GAAGG	2	10	47360	47369	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004631	AGCGC	2	10	57231	57240	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_004631	ATTTG	2	10	75254	75263	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004631	AAGCG	2	10	81504	81513	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_004631	TAAAA	2	10	95568	95577	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004631	TTTCC	2	10	96007	96016	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
17	NC_004631	GCGCT	2	10	97727	97736	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
18	NC_004631	AGCGC	2	10	97794	97803	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
19	NC_004631	AAGCG	2	10	109085	109094	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_004631	TAATT	2	10	118129	118138	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004631	ATTTT	2	10	118155	118164	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004631	TAGTG	2	10	128210	128219	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004631	GGTTT	2	10	135569	135578	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004631	CCCAA	2	10	139583	139592	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
25	NC_004631	TTGTT	2	10	140930	140939	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004631	CGCGG	2	10	160069	160078	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
27	NC_004631	GCGCT	2	10	209264	209273	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_004631	CGCGT	2	10	209316	209325	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
29	NC_004631	TTGCG	2	10	210229	210238	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
30	NC_004631	ATTTA	2	10	217726	217735	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004631	GTTGA	2	10	228622	228631	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004631	TTCAA	2	10	228728	228737	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_004631	GGAAT	2	10	229482	229491	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004631	GCAGC	2	10	230141	230150	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
35	NC_004631	TGCTC	2	10	243047	243056	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_004631	CGCTT	2	10	244237	244246	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
37	NC_004631	GTCTG	2	10	253983	253992	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
38	NC_004631	GCCGC	2	10	271836	271845	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
39	NC_004631	GCCGG	2	10	273066	273075	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
40	NC_004631	GCGCT	2	10	277547	277556	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
41	NC_004631	TGTGT	2	10	284649	284658	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004631	AATGA	2	10	286360	286369	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004631	AGCGC	2	10	292835	292844	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
44	NC_004631	GCTGT	2	10	304165	304174	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
45	NC_004631	ATAAA	2	10	308915	308924	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004631	TTTGG	2	10	309216	309225	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004631	TGTAG	2	10	312088	312097	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004631	ATTTT	2	10	332756	332765	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004631	CGCTA	2	10	340842	340851	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
50	NC_004631	TGTGT	2	10	347073	347082	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004631	TGCTG	2	10	350907	350916	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
52	NC_004631	AAGCG	2	10	357217	357226	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
53	NC_004631	AAGCG	2	10	364532	364541	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_004631	TTTAA	2	10	375210	375219	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004631	GGGGC	2	10	376448	376457	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
56	NC_004631	GGAAA	2	10	377367	377376	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004631	ATTTT	2	10	380023	380032	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004631	AGCGC	2	10	389172	389181	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
59	NC_004631	GCAGA	2	10	389473	389482	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
60	NC_004631	TTATT	2	10	389563	389572	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004631	CTTTT	2	10	389690	389699	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
62	NC_004631	GCGCA	2	10	391135	391144	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
63	NC_004631	CGGGC	2	10	400517	400526	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
64	NC_004631	TTGCC	2	10	402628	402637	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_004631	CCGGC	2	10	404565	404574	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
66	NC_004631	AATCA	2	10	407387	407396	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_004631	CTGCA	2	10	407737	407746	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_004631	TGACC	2	10	407897	407906	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
69	NC_004631	TTGAG	2	10	409486	409495	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004631	TCGAA	2	10	435882	435891	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
71	NC_004631	AAAGT	2	10	461992	462001	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004631	TACTG	2	10	481948	481957	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
73	NC_004631	TATCG	2	10	484200	484209	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_004631	TTTCA	2	10	484251	484260	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
75	NC_004631	CGCTT	2	10	485892	485901	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_004631	GCGCC	2	10	486932	486941	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
77	NC_004631	AGGTG	2	10	499612	499621	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004631	AGCGC	2	10	511776	511785	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
79	NC_004631	GGCAG	2	10	513961	513970	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
80	NC_004631	GCATG	2	10	514999	515008	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
81	NC_004631	GCATG	2	10	515117	515126	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
82	NC_004631	TACTG	2	10	518933	518942	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_004631	AAATG	2	10	528899	528908	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004631	AAAAT	2	10	530652	530661	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004631	TATAA	2	10	539495	539504	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004631	CATGA	2	10	539922	539931	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
87	NC_004631	ATAAA	2	10	543050	543059	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004631	ACCCG	2	10	552965	552974	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
89	NC_004631	GTACC	2	10	556910	556919	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
90	NC_004631	GAAAG	2	10	563350	563359	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004631	AGGGC	2	10	571011	571020	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
92	NC_004631	CGCGC	2	10	584194	584203	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
93	NC_004631	ACAGG	2	10	585369	585378	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
94	NC_004631	GCAAA	2	10	598127	598136	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_004631	ATTAA	2	10	643248	643257	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004631	TGCTT	2	10	643304	643313	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_004631	GAGTA	2	10	652750	652759	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004631	TGAGC	2	10	660631	660640	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
99	NC_004631	ATTGT	2	10	667678	667687	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004631	AATAA	2	10	687812	687821	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004631	GTGGC	2	10	700384	700393	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
102	NC_004631	TTAAA	2	10	701497	701506	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004631	TTACC	2	10	702498	702507	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_004631	GGTGC	2	10	706892	706901	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
105	NC_004631	CGCGC	2	10	707008	707017	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
106	NC_004631	TGATG	2	10	707212	707221	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004631	CGGGG	2	10	711577	711586	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
108	NC_004631	TTTAT	2	10	715982	715991	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004631	TCCGC	2	10	727725	727734	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
110	NC_004631	GGTCT	2	10	743096	743105	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
111	NC_004631	GAGAG	2	10	758248	758257	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004631	AAAGA	2	10	785812	785821	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004631	TCGCT	2	10	792029	792038	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
114	NC_004631	AGGTA	2	10	802100	802109	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004631	CCAGA	2	10	805305	805314	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
116	NC_004631	TTAAT	2	10	806000	806009	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004631	TCTAT	2	10	812421	812430	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_004631	ATCAT	2	10	814740	814749	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_004631	AGCGC	2	10	819428	819437	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
120	NC_004631	TAGTT	2	10	820095	820104	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
121	NC_004631	CGGCA	2	10	831879	831888	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
122	NC_004631	AATGC	2	10	842714	842723	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
123	NC_004631	GTGGA	2	10	842833	842842	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004631	TATTT	2	10	884744	884753	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004631	AGCGC	2	10	896608	896617	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
126	NC_004631	CGGGT	2	10	905790	905799	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
127	NC_004631	TAAAA	2	10	906078	906087	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004631	ATAAA	2	10	909843	909852	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004631	AAAGA	2	10	910873	910882	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004631	ATTTA	2	10	930653	930662	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_004631	TGTTT	2	10	932000	932009	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004631	CGGCG	2	10	936244	936253	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
133	NC_004631	TGTCC	2	10	943738	943747	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
134	NC_004631	TGCCG	2	10	943969	943978	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
135	NC_004631	GCGTT	2	10	944060	944069	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
136	NC_004631	TTTTA	2	10	960418	960427	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004631	ATAAA	2	10	964112	964121	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004631	CTAAT	2	10	964872	964881	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
139	NC_004631	TAAAT	2	10	964978	964987	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004631	TCTTT	2	10	970601	970610	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_004631	TAAAA	2	10	970697	970706	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004631	TTCTC	2	10	975219	975228	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
143	NC_004631	CAATT	2	10	979713	979722	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
144	NC_004631	ATAAA	2	10	985646	985655	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004631	AGCGT	2	10	990703	990712	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
146	NC_004631	TAAAG	2	10	995600	995609	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
147	NC_004631	GACGC	2	10	1006934	1006943	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
148	NC_004631	TTATT	2	10	1032918	1032927	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_004631	TGTAG	2	10	1033629	1033638	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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151	NC_004631	AAGCG	2	10	1035829	1035838	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
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184	NC_004631	ATTCT	2	10	1198817	1198826	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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197	NC_004631	AATGG	2	10	1270001	1270010	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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199	NC_004631	AGGTT	2	10	1277809	1277818	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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426	NC_004631	CGTGG	2	10	2795489	2795498	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
427	NC_004631	CAGGC	2	10	2804882	2804891	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
428	NC_004631	TATCT	2	10	2808496	2808505	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
429	NC_004631	ATAAG	2	10	2812940	2812949	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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431	NC_004631	CTCCC	2	10	2815690	2815699	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
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435	NC_004631	ATTAA	2	10	2878324	2878333	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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437	NC_004631	TGCCT	2	10	2923654	2923663	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
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440	NC_004631	TTTGC	2	10	2956123	2956132	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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442	NC_004631	AGCGC	2	10	2965906	2965915	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
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444	NC_004631	GCGCT	2	10	2985613	2985622	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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446	NC_004631	TGGTC	2	10	3027832	3027841	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
447	NC_004631	TTAAG	2	10	3043288	3043297	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_004631	TGGCC	2	10	3046561	3046570	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
450	NC_004631	AAATT	2	10	3056778	3056787	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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453	NC_004631	AGCGC	2	10	3076402	3076411	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
454	NC_004631	AGCGC	2	10	3090071	3090080	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
455	NC_004631	TTTGC	2	10	3113191	3113200	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
456	NC_004631	GCGCC	2	10	3114782	3114791	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
457	NC_004631	AGAAT	2	10	3115190	3115199	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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459	NC_004631	TCACG	2	10	3115986	3115995	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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461	NC_004631	CATAG	2	10	3122802	3122811	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
462	NC_004631	GCCCG	2	10	3131900	3131909	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
463	NC_004631	TGCAA	2	10	3132967	3132976	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
464	NC_004631	ATTTT	2	10	3133269	3133278	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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466	NC_004631	CGCCA	2	10	3155929	3155938	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
467	NC_004631	CGCGC	2	10	3156514	3156523	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
468	NC_004631	TGGAA	2	10	3171912	3171921	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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471	NC_004631	CGCCC	2	10	3201777	3201786	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
472	NC_004631	CTTTA	2	10	3205429	3205438	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
473	NC_004631	GCGCT	2	10	3213480	3213489	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
474	NC_004631	CGCCA	2	10	3230023	3230032	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
475	NC_004631	GGATC	2	10	3230272	3230281	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
476	NC_004631	GCGCT	2	10	3231277	3231286	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
477	NC_004631	AGCGC	2	10	3244953	3244962	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
478	NC_004631	ATCCT	2	10	3254356	3254365	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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481	NC_004631	AGCGC	2	10	3284868	3284877	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
482	NC_004631	TTTAC	2	10	3287446	3287455	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
483	NC_004631	GGACG	2	10	3299944	3299953	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
484	NC_004631	TTCTA	2	10	3300211	3300220	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
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487	NC_004631	TCCTC	2	10	3340470	3340479	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
488	NC_004631	ATGAC	2	10	3340620	3340629	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
489	NC_004631	GATGT	2	10	3355907	3355916	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
490	NC_004631	GCGCT	2	10	3373377	3373386	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
491	NC_004631	AAATA	2	10	3402933	3402942	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
492	NC_004631	TCGGT	2	10	3406191	3406200	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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494	NC_004631	AAAAG	2	10	3429482	3429491	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
495	NC_004631	ACACA	2	10	3439334	3439343	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
496	NC_004631	CAATC	2	10	3442642	3442651	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
497	NC_004631	ATGAC	2	10	3480361	3480370	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
498	NC_004631	CAAAA	2	10	3480385	3480394	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
499	NC_004631	CGCTT	2	10	3485474	3485483	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
500	NC_004631	AAATG	2	10	3493734	3493743	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding

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