MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 11277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004631	ATTG	2	8	40	47	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004631	AGAC	2	8	153	160	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_004631	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	29140545
4	NC_004631	GATC	2	8	777	784	25 %	25 %	25 %	25 %	29140545
5	NC_004631	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	29140546
6	NC_004631	GATG	2	8	4633	4640	25 %	25 %	50 %	0 %	29140547
7	NC_004631	CAGC	2	8	4642	4649	25 %	0 %	25 %	50 %	29140547
8	NC_004631	CTGA	2	8	4700	4707	25 %	25 %	25 %	25 %	29140547
9	NC_004631	AAAG	2	8	4880	4887	75 %	0 %	25 %	0 %	29140547
10	NC_004631	CTGC	2	8	4970	4977	0 %	25 %	25 %	50 %	29140547
11	NC_004631	GCCA	2	8	6664	6671	25 %	0 %	25 %	50 %	29140549
12	NC_004631	GGCG	2	8	6790	6797	0 %	0 %	75 %	25 %	29140549
13	NC_004631	TGAA	2	8	7290	7297	50 %	25 %	25 %	0 %	29140549
14	NC_004631	GCGT	2	8	8156	8163	0 %	25 %	50 %	25 %	29140550
15	NC_004631	AAGA	2	8	8238	8245	75 %	0 %	25 %	0 %	29140550
16	NC_004631	CTGT	2	8	8666	8673	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_004631	CCTT	2	8	8674	8681	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_004631	TGGC	2	8	8819	8826	0 %	25 %	50 %	25 %	29140551
19	NC_004631	GAAC	2	8	9718	9725	50 %	0 %	25 %	25 %	29140552
20	NC_004631	CAGG	2	8	10122	10129	25 %	0 %	50 %	25 %	29140553
21	NC_004631	TGGC	2	8	11004	11011	0 %	25 %	50 %	25 %	29140554
22	NC_004631	TCGT	2	8	11124	11131	0 %	50 %	25 %	25 %	29140554
23	NC_004631	ATTT	2	8	11370	11377	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004631	ATGG	2	8	11648	11655	25 %	25 %	50 %	0 %	29140555
25	NC_004631	TGGT	2	8	11739	11746	0 %	50 %	50 %	0 %	29140555
26	NC_004631	CAAC	2	8	12252	12259	50 %	0 %	0 %	50 %	29140555
27	NC_004631	AAGA	2	8	12326	12333	75 %	0 %	25 %	0 %	29140555
28	NC_004631	CCAT	2	8	12903	12910	25 %	25 %	0 %	50 %	29140555
29	NC_004631	GGCT	2	8	13423	13430	0 %	25 %	50 %	25 %	29140555
30	NC_004631	CGGT	2	8	14593	14600	0 %	25 %	50 %	25 %	29140556
31	NC_004631	GTAT	2	8	14770	14777	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004631	TCAG	2	8	15249	15256	25 %	25 %	25 %	25 %	29140557
33	NC_004631	TTTG	2	8	15539	15546	0 %	75 %	25 %	0 %	29140557
34	NC_004631	CGAA	2	8	15754	15761	50 %	0 %	25 %	25 %	29140557
35	NC_004631	ATTG	2	8	15766	15773	25 %	50 %	25 %	0 %	29140557
36	NC_004631	ATAA	2	8	16526	16533	75 %	25 %	0 %	0 %	29140559
37	NC_004631	CAGC	2	8	16733	16740	25 %	0 %	25 %	50 %	29140559
38	NC_004631	AATA	2	8	18002	18009	75 %	25 %	0 %	0 %	29140561
39	NC_004631	GGGC	2	8	18588	18595	0 %	0 %	75 %	25 %	29140561
40	NC_004631	CGTG	2	8	19288	19295	0 %	25 %	50 %	25 %	29140561
41	NC_004631	TCCA	2	8	20073	20080	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_004631	CCAA	2	8	21289	21296	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_004631	GACG	2	8	21635	21642	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_004631	GCCG	2	8	21887	21894	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_004631	TGGC	2	8	22288	22295	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_004631	TGGC	2	8	22394	22401	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_004631	CGCC	2	8	22660	22667	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48	NC_004631	CTGG	2	8	23006	23013	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
49	NC_004631	TTAT	2	8	23271	23278	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004631	TTTA	2	8	23504	23511	25 %	75 %	0 %	0 %	29140564
51	NC_004631	TTTC	2	8	23558	23565	0 %	75 %	0 %	25 %	29140564
52	NC_004631	TCTG	2	8	23961	23968	0 %	50 %	25 %	25 %	29140564
53	NC_004631	TGAA	2	8	24470	24477	50 %	25 %	25 %	0 %	29140565
54	NC_004631	CCAG	2	8	24741	24748	25 %	0 %	25 %	50 %	29140565
55	NC_004631	ACCG	2	8	25418	25425	25 %	0 %	25 %	50 %	29140566
56	NC_004631	TTTA	2	8	25441	25448	25 %	75 %	0 %	0 %	29140566
57	NC_004631	TCTG	2	8	25935	25942	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_004631	GCCT	2	8	26116	26123	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_004631	CCTT	2	8	26622	26629	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_004631	TCAG	2	8	26981	26988	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
61	NC_004631	ATCA	2	8	27394	27401	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_004631	AGCC	2	8	27928	27935	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_004631	CCGA	2	8	28135	28142	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_004631	GCGT	2	8	28181	28188	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_004631	ATTA	2	8	28528	28535	50 %	50 %	0 %	0 %	29140567
66	NC_004631	GGCG	2	8	28770	28777	0 %	0 %	75 %	25 %	29140567
67	NC_004631	ATGA	2	8	29975	29982	50 %	25 %	25 %	0 %	29140568
68	NC_004631	TGCT	2	8	30545	30552	0 %	50 %	25 %	25 %	29140570
69	NC_004631	TATC	2	8	30601	30608	25 %	50 %	0 %	25 %	29140570
70	NC_004631	GTAA	2	8	30638	30645	50 %	25 %	25 %	0 %	29140570
71	NC_004631	TTCG	2	8	30900	30907	0 %	50 %	25 %	25 %	29140570
72	NC_004631	GTCA	2	8	31410	31417	25 %	25 %	25 %	25 %	29140571
73	NC_004631	ACCG	2	8	32230	32237	25 %	0 %	25 %	50 %	29140572
74	NC_004631	AGGC	2	8	32268	32275	25 %	0 %	50 %	25 %	29140572
75	NC_004631	CCTG	2	8	32704	32711	0 %	25 %	25 %	50 %	29140573
76	NC_004631	CGCA	2	8	32894	32901	25 %	0 %	25 %	50 %	29140573
77	NC_004631	TAAA	2	8	32964	32971	75 %	25 %	0 %	0 %	29140573
78	NC_004631	CCAG	2	8	33350	33357	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_004631	TTAT	2	8	33533	33540	25 %	75 %	0 %	0 %	29140574
80	NC_004631	TTGG	2	8	33917	33924	0 %	50 %	50 %	0 %	29140574
81	NC_004631	CTTT	2	8	34297	34304	0 %	75 %	0 %	25 %	29140574
82	NC_004631	GAAG	2	8	34337	34344	50 %	0 %	50 %	0 %	29140574
83	NC_004631	TAAA	2	8	34389	34396	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004631	ATAA	2	8	34664	34671	75 %	25 %	0 %	0 %	29140575
85	NC_004631	GTGC	2	8	34787	34794	0 %	25 %	50 %	25 %	29140575
86	NC_004631	TTAA	2	8	34797	34804	50 %	50 %	0 %	0 %	29140575
87	NC_004631	TGAT	2	8	35032	35039	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004631	TGAC	2	8	35736	35743	25 %	25 %	25 %	25 %	29140576
89	NC_004631	GGGA	2	8	36493	36500	25 %	0 %	75 %	0 %	29140576
90	NC_004631	ATAC	2	8	37478	37485	50 %	25 %	0 %	25 %	29140577
91	NC_004631	GAAG	2	8	37550	37557	50 %	0 %	50 %	0 %	29140577
92	NC_004631	CACG	2	8	38113	38120	25 %	0 %	25 %	50 %	29140577
93	NC_004631	TAAT	2	8	38215	38222	50 %	50 %	0 %	0 %	29140577
94	NC_004631	TCGT	2	8	38559	38566	0 %	50 %	25 %	25 %	29140577
95	NC_004631	CCAT	2	8	38671	38678	25 %	25 %	0 %	50 %	29140577
96	NC_004631	ATTA	2	8	38765	38772	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004631	AATT	2	8	40045	40052	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004631	GCGG	2	8	40536	40543	0 %	0 %	75 %	25 %	29140579
99	NC_004631	CTGG	2	8	40754	40761	0 %	25 %	50 %	25 %	29140579
100	NC_004631	CCGA	2	8	41271	41278	25 %	0 %	25 %	50 %	29140579
101	NC_004631	ATCG	2	8	41427	41434	25 %	25 %	25 %	25 %	29140579
102	NC_004631	TCAA	2	8	41488	41495	50 %	25 %	0 %	25 %	29140579
103	NC_004631	AACC	2	8	41754	41761	50 %	0 %	0 %	50 %	29140580
104	NC_004631	GAAA	2	8	41806	41813	75 %	0 %	25 %	0 %	29140580
105	NC_004631	GGTC	2	8	42378	42385	0 %	25 %	50 %	25 %	29140580
106	NC_004631	TTTG	2	8	42902	42909	0 %	75 %	25 %	0 %	29140580
107	NC_004631	GTAT	2	8	43196	43203	25 %	50 %	25 %	0 %	29140581
108	NC_004631	TCCG	2	8	43590	43597	0 %	25 %	25 %	50 %	29140581
109	NC_004631	ATGA	2	8	45652	45659	50 %	25 %	25 %	0 %	29140582
110	NC_004631	AACG	2	8	45954	45961	50 %	0 %	25 %	25 %	29140582
111	NC_004631	TGAC	2	8	46038	46045	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_004631	GAAA	2	8	46902	46909	75 %	0 %	25 %	0 %	29140583
113	NC_004631	GCTG	2	8	47108	47115	0 %	25 %	50 %	25 %	29140583
114	NC_004631	CACG	2	8	47806	47813	25 %	0 %	25 %	50 %	29140584
115	NC_004631	CAGC	2	8	47833	47840	25 %	0 %	25 %	50 %	29140584
116	NC_004631	CCTG	3	12	47969	47980	0 %	25 %	25 %	50 %	29140584
117	NC_004631	TACC	2	8	48317	48324	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_004631	CATG	2	8	48538	48545	25 %	25 %	25 %	25 %	29140585
119	NC_004631	AAGT	2	8	49332	49339	50 %	25 %	25 %	0 %	29140585
120	NC_004631	CCAG	2	8	49390	49397	25 %	0 %	25 %	50 %	29140585
121	NC_004631	TTGA	2	8	50171	50178	25 %	50 %	25 %	0 %	29140585
122	NC_004631	GAAA	2	8	50506	50513	75 %	0 %	25 %	0 %	29140586
123	NC_004631	GCCA	2	8	50847	50854	25 %	0 %	25 %	50 %	29140586
124	NC_004631	TAAA	2	8	51240	51247	75 %	25 %	0 %	0 %	29140586
125	NC_004631	AGTA	2	8	51933	51940	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004631	ATCA	2	8	51973	51980	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_004631	GAAA	2	8	52093	52100	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004631	AGGG	2	8	52126	52133	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004631	CATA	2	8	52886	52893	50 %	25 %	0 %	25 %	29140589
130	NC_004631	TCAG	2	8	52897	52904	25 %	25 %	25 %	25 %	29140589
131	NC_004631	GCCC	2	8	53069	53076	0 %	0 %	25 %	75 %	29140589
132	NC_004631	TGGC	2	8	53611	53618	0 %	25 %	50 %	25 %	29140589
133	NC_004631	AGCC	2	8	57438	57445	25 %	0 %	25 %	50 %	29140592
134	NC_004631	AAAG	2	8	57517	57524	75 %	0 %	25 %	0 %	29140592
135	NC_004631	ATGG	2	8	57650	57657	25 %	25 %	50 %	0 %	29140592
136	NC_004631	TGAT	2	8	58322	58329	25 %	50 %	25 %	0 %	29140593
137	NC_004631	GCTG	2	8	58419	58426	0 %	25 %	50 %	25 %	29140593
138	NC_004631	TGGA	2	8	58991	58998	25 %	25 %	50 %	0 %	29140594
139	NC_004631	GATT	2	8	59389	59396	25 %	50 %	25 %	0 %	29140594
140	NC_004631	GATC	2	8	59758	59765	25 %	25 %	25 %	25 %	29140594
141	NC_004631	CTGC	2	8	60776	60783	0 %	25 %	25 %	50 %	29140595
142	NC_004631	CTGG	2	8	60883	60890	0 %	25 %	50 %	25 %	29140595
143	NC_004631	GTGG	2	8	61048	61055	0 %	25 %	75 %	0 %	29140595
144	NC_004631	CTGC	2	8	61258	61265	0 %	25 %	25 %	50 %	29140596
145	NC_004631	ACCA	2	8	61894	61901	50 %	0 %	0 %	50 %	29140597
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