MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 9099

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004631	ACCA	2	8	466	473	50 %	0 %	0 %	50 %	29140545
2	NC_004631	GATC	2	8	777	784	25 %	25 %	25 %	25 %	29140545
3	NC_004631	ATGA	2	8	3128	3135	50 %	25 %	25 %	0 %	29140546
4	NC_004631	GATG	2	8	4633	4640	25 %	25 %	50 %	0 %	29140547
5	NC_004631	CAGC	2	8	4642	4649	25 %	0 %	25 %	50 %	29140547
6	NC_004631	CTGA	2	8	4700	4707	25 %	25 %	25 %	25 %	29140547
7	NC_004631	AAAG	2	8	4880	4887	75 %	0 %	25 %	0 %	29140547
8	NC_004631	CTGC	2	8	4970	4977	0 %	25 %	25 %	50 %	29140547
9	NC_004631	GCCA	2	8	6664	6671	25 %	0 %	25 %	50 %	29140549
10	NC_004631	GGCG	2	8	6790	6797	0 %	0 %	75 %	25 %	29140549
11	NC_004631	TGAA	2	8	7290	7297	50 %	25 %	25 %	0 %	29140549
12	NC_004631	GCGT	2	8	8156	8163	0 %	25 %	50 %	25 %	29140550
13	NC_004631	AAGA	2	8	8238	8245	75 %	0 %	25 %	0 %	29140550
14	NC_004631	TGGC	2	8	8819	8826	0 %	25 %	50 %	25 %	29140551
15	NC_004631	GAAC	2	8	9718	9725	50 %	0 %	25 %	25 %	29140552
16	NC_004631	CAGG	2	8	10122	10129	25 %	0 %	50 %	25 %	29140553
17	NC_004631	TGGC	2	8	11004	11011	0 %	25 %	50 %	25 %	29140554
18	NC_004631	TCGT	2	8	11124	11131	0 %	50 %	25 %	25 %	29140554
19	NC_004631	ATGG	2	8	11648	11655	25 %	25 %	50 %	0 %	29140555
20	NC_004631	TGGT	2	8	11739	11746	0 %	50 %	50 %	0 %	29140555
21	NC_004631	CAAC	2	8	12252	12259	50 %	0 %	0 %	50 %	29140555
22	NC_004631	AAGA	2	8	12326	12333	75 %	0 %	25 %	0 %	29140555
23	NC_004631	CCAT	2	8	12903	12910	25 %	25 %	0 %	50 %	29140555
24	NC_004631	GGCT	2	8	13423	13430	0 %	25 %	50 %	25 %	29140555
25	NC_004631	CGGT	2	8	14593	14600	0 %	25 %	50 %	25 %	29140556
26	NC_004631	TCAG	2	8	15249	15256	25 %	25 %	25 %	25 %	29140557
27	NC_004631	TTTG	2	8	15539	15546	0 %	75 %	25 %	0 %	29140557
28	NC_004631	CGAA	2	8	15754	15761	50 %	0 %	25 %	25 %	29140557
29	NC_004631	ATTG	2	8	15766	15773	25 %	50 %	25 %	0 %	29140557
30	NC_004631	ATAA	2	8	16526	16533	75 %	25 %	0 %	0 %	29140559
31	NC_004631	CAGC	2	8	16733	16740	25 %	0 %	25 %	50 %	29140559
32	NC_004631	AATA	2	8	18002	18009	75 %	25 %	0 %	0 %	29140561
33	NC_004631	GGGC	2	8	18588	18595	0 %	0 %	75 %	25 %	29140561
34	NC_004631	CGTG	2	8	19288	19295	0 %	25 %	50 %	25 %	29140561
35	NC_004631	TTTA	2	8	23504	23511	25 %	75 %	0 %	0 %	29140564
36	NC_004631	TTTC	2	8	23558	23565	0 %	75 %	0 %	25 %	29140564
37	NC_004631	TCTG	2	8	23961	23968	0 %	50 %	25 %	25 %	29140564
38	NC_004631	TGAA	2	8	24470	24477	50 %	25 %	25 %	0 %	29140565
39	NC_004631	CCAG	2	8	24741	24748	25 %	0 %	25 %	50 %	29140565
40	NC_004631	ACCG	2	8	25418	25425	25 %	0 %	25 %	50 %	29140566
41	NC_004631	TTTA	2	8	25441	25448	25 %	75 %	0 %	0 %	29140566
42	NC_004631	ATTA	2	8	28528	28535	50 %	50 %	0 %	0 %	29140567
43	NC_004631	GGCG	2	8	28770	28777	0 %	0 %	75 %	25 %	29140567
44	NC_004631	ATGA	2	8	29975	29982	50 %	25 %	25 %	0 %	29140568
45	NC_004631	TGCT	2	8	30545	30552	0 %	50 %	25 %	25 %	29140570
46	NC_004631	TATC	2	8	30601	30608	25 %	50 %	0 %	25 %	29140570
47	NC_004631	GTAA	2	8	30638	30645	50 %	25 %	25 %	0 %	29140570
48	NC_004631	TTCG	2	8	30900	30907	0 %	50 %	25 %	25 %	29140570
49	NC_004631	GTCA	2	8	31410	31417	25 %	25 %	25 %	25 %	29140571
50	NC_004631	ACCG	2	8	32230	32237	25 %	0 %	25 %	50 %	29140572
51	NC_004631	AGGC	2	8	32268	32275	25 %	0 %	50 %	25 %	29140572
52	NC_004631	CCTG	2	8	32704	32711	0 %	25 %	25 %	50 %	29140573
53	NC_004631	CGCA	2	8	32894	32901	25 %	0 %	25 %	50 %	29140573
54	NC_004631	TAAA	2	8	32964	32971	75 %	25 %	0 %	0 %	29140573
55	NC_004631	TTAT	2	8	33533	33540	25 %	75 %	0 %	0 %	29140574
56	NC_004631	TTGG	2	8	33917	33924	0 %	50 %	50 %	0 %	29140574
57	NC_004631	CTTT	2	8	34297	34304	0 %	75 %	0 %	25 %	29140574
58	NC_004631	GAAG	2	8	34337	34344	50 %	0 %	50 %	0 %	29140574
59	NC_004631	ATAA	2	8	34664	34671	75 %	25 %	0 %	0 %	29140575
60	NC_004631	GTGC	2	8	34787	34794	0 %	25 %	50 %	25 %	29140575
61	NC_004631	TTAA	2	8	34797	34804	50 %	50 %	0 %	0 %	29140575
62	NC_004631	TGAC	2	8	35736	35743	25 %	25 %	25 %	25 %	29140576
63	NC_004631	GGGA	2	8	36493	36500	25 %	0 %	75 %	0 %	29140576
64	NC_004631	ATAC	2	8	37478	37485	50 %	25 %	0 %	25 %	29140577
65	NC_004631	GAAG	2	8	37550	37557	50 %	0 %	50 %	0 %	29140577
66	NC_004631	CACG	2	8	38113	38120	25 %	0 %	25 %	50 %	29140577
67	NC_004631	TAAT	2	8	38215	38222	50 %	50 %	0 %	0 %	29140577
68	NC_004631	TCGT	2	8	38559	38566	0 %	50 %	25 %	25 %	29140577
69	NC_004631	CCAT	2	8	38671	38678	25 %	25 %	0 %	50 %	29140577
70	NC_004631	GCGG	2	8	40536	40543	0 %	0 %	75 %	25 %	29140579
71	NC_004631	CTGG	2	8	40754	40761	0 %	25 %	50 %	25 %	29140579
72	NC_004631	CCGA	2	8	41271	41278	25 %	0 %	25 %	50 %	29140579
73	NC_004631	ATCG	2	8	41427	41434	25 %	25 %	25 %	25 %	29140579
74	NC_004631	TCAA	2	8	41488	41495	50 %	25 %	0 %	25 %	29140579
75	NC_004631	AACC	2	8	41754	41761	50 %	0 %	0 %	50 %	29140580
76	NC_004631	GAAA	2	8	41806	41813	75 %	0 %	25 %	0 %	29140580
77	NC_004631	GGTC	2	8	42378	42385	0 %	25 %	50 %	25 %	29140580
78	NC_004631	TTTG	2	8	42902	42909	0 %	75 %	25 %	0 %	29140580
79	NC_004631	GTAT	2	8	43196	43203	25 %	50 %	25 %	0 %	29140581
80	NC_004631	TCCG	2	8	43590	43597	0 %	25 %	25 %	50 %	29140581
81	NC_004631	ATGA	2	8	45652	45659	50 %	25 %	25 %	0 %	29140582
82	NC_004631	AACG	2	8	45954	45961	50 %	0 %	25 %	25 %	29140582
83	NC_004631	GAAA	2	8	46902	46909	75 %	0 %	25 %	0 %	29140583
84	NC_004631	GCTG	2	8	47108	47115	0 %	25 %	50 %	25 %	29140583
85	NC_004631	CACG	2	8	47806	47813	25 %	0 %	25 %	50 %	29140584
86	NC_004631	CAGC	2	8	47833	47840	25 %	0 %	25 %	50 %	29140584
87	NC_004631	CCTG	3	12	47969	47980	0 %	25 %	25 %	50 %	29140584
88	NC_004631	CATG	2	8	48538	48545	25 %	25 %	25 %	25 %	29140585
89	NC_004631	AAGT	2	8	49332	49339	50 %	25 %	25 %	0 %	29140585
90	NC_004631	CCAG	2	8	49390	49397	25 %	0 %	25 %	50 %	29140585
91	NC_004631	TTGA	2	8	50171	50178	25 %	50 %	25 %	0 %	29140585
92	NC_004631	GAAA	2	8	50506	50513	75 %	0 %	25 %	0 %	29140586
93	NC_004631	GCCA	2	8	50847	50854	25 %	0 %	25 %	50 %	29140586
94	NC_004631	TAAA	2	8	51240	51247	75 %	25 %	0 %	0 %	29140586
95	NC_004631	CATA	2	8	52886	52893	50 %	25 %	0 %	25 %	29140589
96	NC_004631	TCAG	2	8	52897	52904	25 %	25 %	25 %	25 %	29140589
97	NC_004631	GCCC	2	8	53069	53076	0 %	0 %	25 %	75 %	29140589
98	NC_004631	TGGC	2	8	53611	53618	0 %	25 %	50 %	25 %	29140589
99	NC_004631	AGCC	2	8	57438	57445	25 %	0 %	25 %	50 %	29140592
100	NC_004631	AAAG	2	8	57517	57524	75 %	0 %	25 %	0 %	29140592
101	NC_004631	ATGG	2	8	57650	57657	25 %	25 %	50 %	0 %	29140592
102	NC_004631	TGAT	2	8	58322	58329	25 %	50 %	25 %	0 %	29140593
103	NC_004631	GCTG	2	8	58419	58426	0 %	25 %	50 %	25 %	29140593
104	NC_004631	TGGA	2	8	58991	58998	25 %	25 %	50 %	0 %	29140594
105	NC_004631	GATT	2	8	59389	59396	25 %	50 %	25 %	0 %	29140594
106	NC_004631	GATC	2	8	59758	59765	25 %	25 %	25 %	25 %	29140594
107	NC_004631	CTGC	2	8	60776	60783	0 %	25 %	25 %	50 %	29140595
108	NC_004631	CTGG	2	8	60883	60890	0 %	25 %	50 %	25 %	29140595
109	NC_004631	GTGG	2	8	61048	61055	0 %	25 %	75 %	0 %	29140595
110	NC_004631	CTGC	2	8	61258	61265	0 %	25 %	25 %	50 %	29140596
111	NC_004631	ACCA	2	8	61894	61901	50 %	0 %	0 %	50 %	29140597
112	NC_004631	GTGG	2	8	61929	61936	0 %	25 %	75 %	0 %	29140597
113	NC_004631	CATT	2	8	62119	62126	25 %	50 %	0 %	25 %	29140597
114	NC_004631	GCCA	2	8	64745	64752	25 %	0 %	25 %	50 %	29140598
115	NC_004631	GCTG	2	8	65133	65140	0 %	25 %	50 %	25 %	29140599
116	NC_004631	CAGC	2	8	65412	65419	25 %	0 %	25 %	50 %	29140599
117	NC_004631	CCCG	2	8	65740	65747	0 %	0 %	25 %	75 %	29140599
118	NC_004631	CCAG	2	8	66165	66172	25 %	0 %	25 %	50 %	29140599
119	NC_004631	TTCA	2	8	66880	66887	25 %	50 %	0 %	25 %	29140600
120	NC_004631	GAAG	2	8	67632	67639	50 %	0 %	50 %	0 %	29140601
121	NC_004631	CAGA	2	8	67805	67812	50 %	0 %	25 %	25 %	29140601
122	NC_004631	TTTC	2	8	68078	68085	0 %	75 %	0 %	25 %	29140601
123	NC_004631	AACA	2	8	68208	68215	75 %	0 %	0 %	25 %	29140601
124	NC_004631	AGTC	2	8	68237	68244	25 %	25 %	25 %	25 %	29140601
125	NC_004631	TAAT	2	8	68279	68286	50 %	50 %	0 %	0 %	29140601
126	NC_004631	ATTT	2	8	68665	68672	25 %	75 %	0 %	0 %	29140602
127	NC_004631	GTCG	2	8	68697	68704	0 %	25 %	50 %	25 %	29140602
128	NC_004631	GCAG	2	8	68982	68989	25 %	0 %	50 %	25 %	29140602
129	NC_004631	ACCG	2	8	69208	69215	25 %	0 %	25 %	50 %	29140602
130	NC_004631	GATC	2	8	69354	69361	25 %	25 %	25 %	25 %	29140602
131	NC_004631	GGCA	2	8	69728	69735	25 %	0 %	50 %	25 %	29140603
132	NC_004631	TCCA	2	8	69770	69777	25 %	25 %	0 %	50 %	29140603
133	NC_004631	GAAG	2	8	70606	70613	50 %	0 %	50 %	0 %	29140604
134	NC_004631	AAGG	2	8	70863	70870	50 %	0 %	50 %	0 %	29140604
135	NC_004631	CTGA	2	8	71472	71479	25 %	25 %	25 %	25 %	29140605
136	NC_004631	CAAT	2	8	71906	71913	50 %	25 %	0 %	25 %	29140605
137	NC_004631	ATGG	2	8	72670	72677	25 %	25 %	50 %	0 %	29140606
138	NC_004631	GTTG	2	8	72995	73002	0 %	50 %	50 %	0 %	29140607
139	NC_004631	TGGA	2	8	73128	73135	25 %	25 %	50 %	0 %	29140607
140	NC_004631	CGGG	2	8	74645	74652	0 %	0 %	75 %	25 %	29140608
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142	NC_004631	CTTA	2	8	75848	75855	25 %	50 %	0 %	25 %	29140609
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