MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 68924

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004631	CAG	2	6	64	69	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_004631	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_004631	CAC	3	9	204	212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140544
4	NC_004631	ACC	2	6	217	222	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140544
5	NC_004631	AAC	2	6	330	335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_004631	CGG	2	6	354	359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140545
7	NC_004631	TGG	2	6	476	481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140545
8	NC_004631	GAT	2	6	483	488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140545
9	NC_004631	CGG	2	6	501	506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140545
10	NC_004631	CTG	2	6	664	669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140545
11	NC_004631	CGC	2	6	693	698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140545
12	NC_004631	CTG	2	6	796	801	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140545
13	NC_004631	CGC	2	6	858	863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140545
14	NC_004631	TGG	2	6	932	937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140545
15	NC_004631	CCG	3	9	965	973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140545
16	NC_004631	GCC	2	6	979	984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140545
17	NC_004631	CTG	2	6	999	1004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140545
18	NC_004631	CGA	2	6	1233	1238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140545
19	NC_004631	AAC	2	6	1273	1278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140545
20	NC_004631	GAT	2	6	1317	1322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140545
21	NC_004631	GGC	2	6	1329	1334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140545
22	NC_004631	CGC	2	6	1344	1349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140545
23	NC_004631	GGT	2	6	1371	1376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140545
24	NC_004631	TCC	2	6	1390	1395	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	29140545
25	NC_004631	CCG	2	6	1446	1451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140545
26	NC_004631	GCT	2	6	1491	1496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140545
27	NC_004631	TGT	2	6	1536	1541	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140545
28	NC_004631	TTC	2	6	1582	1587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140545
29	NC_004631	TCT	2	6	1636	1641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140545
30	NC_004631	TGG	2	6	1658	1663	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	29140545
31	NC_004631	ACG	2	6	1670	1675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140545
32	NC_004631	CCA	2	6	1679	1684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140545
33	NC_004631	CGG	2	6	1755	1760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140545
34	NC_004631	CGG	2	6	1764	1769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140545
35	NC_004631	GAA	2	6	1809	1814	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140545
36	NC_004631	GCG	2	6	1838	1843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140545
37	NC_004631	ATC	2	6	1967	1972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140545
38	NC_004631	TTG	2	6	1988	1993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140545
39	NC_004631	TCG	2	6	2086	2091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140545
40	NC_004631	ACT	2	6	2096	2101	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140545
41	NC_004631	CGC	3	9	2118	2126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140545
42	NC_004631	CTG	2	6	2200	2205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140545
43	NC_004631	TGA	2	6	2214	2219	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140545
44	NC_004631	GAC	2	6	2512	2517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140545
45	NC_004631	GCC	2	6	2524	2529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140545
46	NC_004631	TGA	2	6	2547	2552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140545
47	NC_004631	ATT	2	6	2684	2689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140545
48	NC_004631	TGC	2	6	2708	2713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140545
49	NC_004631	ATG	2	6	2732	2737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140545
50	NC_004631	CGG	3	9	2741	2749	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140545
51	NC_004631	AGC	2	6	2917	2922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140546
52	NC_004631	GCC	2	6	2968	2973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140546
53	NC_004631	CGT	2	6	3106	3111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140546
54	NC_004631	CGC	2	6	3112	3117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140546
55	NC_004631	GCA	2	6	3207	3212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140546
56	NC_004631	TGA	2	6	3258	3263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140546
57	NC_004631	GAA	2	6	3266	3271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140546
58	NC_004631	ATT	2	6	3278	3283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	29140546
59	NC_004631	CAG	2	6	3287	3292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140546
60	NC_004631	TGA	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140546
61	NC_004631	GCC	2	6	3464	3469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140546
62	NC_004631	TGA	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140546
63	NC_004631	CGG	2	6	3705	3710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140546
64	NC_004631	AGT	2	6	3718	3723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140546
65	NC_004631	CAG	2	6	3809	3814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140547
66	NC_004631	TGA	2	6	3862	3867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140547
67	NC_004631	GCA	2	6	3937	3942	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140547
68	NC_004631	CGG	2	6	4060	4065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140547
69	NC_004631	GCG	2	6	4098	4103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140547
70	NC_004631	GTC	2	6	4190	4195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140547
71	NC_004631	GGC	2	6	4253	4258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140547
72	NC_004631	TGA	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140547
73	NC_004631	GAA	2	6	4331	4336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140547
74	NC_004631	GCC	2	6	4383	4388	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140547
75	NC_004631	CTA	2	6	4405	4410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140547
76	NC_004631	CTG	2	6	4502	4507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140547
77	NC_004631	CGC	2	6	4543	4548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140547
78	NC_004631	GGA	2	6	4669	4674	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29140547
79	NC_004631	CCG	2	6	4681	4686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140547
80	NC_004631	GCG	2	6	4718	4723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140547
81	NC_004631	ACA	2	6	4741	4746	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140547
82	NC_004631	GCG	2	6	4793	4798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140547
83	NC_004631	CAT	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140547
84	NC_004631	GCC	2	6	4985	4990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140547
85	NC_004631	ATG	2	6	5003	5008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140547
86	NC_004631	GTG	2	6	5062	5067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004631	TCA	2	6	5163	5168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140548
88	NC_004631	AAT	2	6	5228	5233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29140548
89	NC_004631	TCA	2	6	5242	5247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140548
90	NC_004631	ACC	2	6	5277	5282	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140548
91	NC_004631	TCA	2	6	5301	5306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140548
92	NC_004631	TTC	2	6	5340	5345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	29140548
93	NC_004631	CAC	3	9	5384	5392	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140548
94	NC_004631	TGT	2	6	5568	5573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140548
95	NC_004631	CGT	2	6	5593	5598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140548
96	NC_004631	GCG	2	6	5755	5760	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140548
97	NC_004631	GCT	2	6	5788	5793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140548
98	NC_004631	CGC	2	6	5931	5936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_004631	ACC	2	6	6096	6101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140549
100	NC_004631	CAA	2	6	6110	6115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	29140549
101	NC_004631	CGA	2	6	6301	6306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140549
102	NC_004631	CAG	2	6	6437	6442	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140549
103	NC_004631	ATC	2	6	6447	6452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140549
104	NC_004631	GAT	2	6	6467	6472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140549
105	NC_004631	ACG	2	6	6535	6540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140549
106	NC_004631	GAT	2	6	6815	6820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140549
107	NC_004631	GCG	2	6	6862	6867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140549
108	NC_004631	CGA	2	6	6940	6945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140549
109	NC_004631	GCC	2	6	7013	7018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140549
110	NC_004631	AGG	2	6	7078	7083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	29140549
111	NC_004631	ATG	2	6	7095	7100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140549
112	NC_004631	GCG	2	6	7140	7145	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140549
113	NC_004631	GCC	2	6	7226	7231	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	29140549
114	NC_004631	AGC	2	6	7332	7337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140549
115	NC_004631	TAA	2	6	7372	7377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	29140549
116	NC_004631	TTG	2	6	7408	7413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004631	TGA	2	6	7428	7433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004631	ATG	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004631	CGG	2	6	7505	7510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_004631	CGT	2	6	7599	7604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_004631	ATC	2	6	7608	7613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_004631	CAC	2	6	7697	7702	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	29140550
123	NC_004631	CAG	2	6	7845	7850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140550
124	NC_004631	AGC	2	6	7851	7856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140550
125	NC_004631	CAG	2	6	7866	7871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140550
126	NC_004631	GTT	2	6	7872	7877	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	29140550
127	NC_004631	ATG	2	6	8023	8028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	29140550
128	NC_004631	AAG	2	6	8107	8112	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	29140550
129	NC_004631	GCT	2	6	8132	8137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140550
130	NC_004631	TAC	2	6	8298	8303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	29140550
131	NC_004631	CGT	2	6	8324	8329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140550
132	NC_004631	GCA	2	6	8513	8518	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	29140550
133	NC_004631	CTG	2	6	8610	8615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	29140550
134	NC_004631	AAT	2	6	8722	8727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004631	GCG	2	6	8778	8783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	29140551
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155	NC_004631	TAA	2	6	10051	10056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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264	NC_004631	ATT	2	6	16061	16066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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281	NC_004631	ATT	2	6	17618	17623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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387	NC_004631	ACG	2	6	24312	24317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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390	NC_004631	CAG	2	6	24413	24418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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