MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Typhi str. Ty2 chromosome

Total Repeats: 10477

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004631	CAG	2	6	64	69	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_004631	ACA	2	6	181	186	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_004631	AAC	2	6	330	335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_004631	GTG	2	6	5062	5067	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004631	CGC	2	6	5931	5936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_004631	TTG	2	6	7408	7413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004631	TGA	2	6	7428	7433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004631	ATG	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004631	CGG	2	6	7505	7510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_004631	CGT	2	6	7599	7604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_004631	ATC	2	6	7608	7613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_004631	AAT	2	6	8722	8727	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004631	TAG	2	6	9334	9339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004631	TCC	2	6	9346	9351	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_004631	GGA	2	6	9359	9364	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004631	ATC	2	6	9954	9959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_004631	ATA	2	6	10017	10022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004631	TAA	2	6	10051	10056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004631	TTA	2	6	11333	11338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004631	GTT	2	6	11362	11367	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004631	TGA	2	6	11447	11452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004631	GTG	2	6	11487	11492	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004631	TTA	2	6	11541	11546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004631	ATG	2	6	11562	11567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004631	TTC	2	6	14755	14760	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_004631	TTG	2	6	14841	14846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004631	CAG	2	6	14883	14888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_004631	TGA	2	6	14924	14929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004631	TAT	2	6	14976	14981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004631	ATG	2	6	16007	16012	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004631	ATT	2	6	16061	16066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004631	ATT	2	6	17618	17623	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004631	GTT	2	6	17710	17715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004631	GTT	2	6	17734	17739	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004631	ATC	2	6	17763	17768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_004631	CCA	2	6	20037	20042	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_004631	TCA	2	6	20131	20136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_004631	GCG	2	6	20218	20223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_004631	CGC	2	6	20242	20247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_004631	AAC	2	6	20286	20291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_004631	ATC	2	6	20292	20297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_004631	TAA	2	6	20300	20305	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004631	CTT	2	6	20319	20324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_004631	CCG	2	6	20389	20394	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_004631	CGC	2	6	20474	20479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_004631	AAC	2	6	20485	20490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_004631	CCG	2	6	20491	20496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_004631	GAA	2	6	20753	20758	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004631	GGC	2	6	20795	20800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_004631	GCC	2	6	20832	20837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_004631	CCA	2	6	20894	20899	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_004631	ATG	2	6	21076	21081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004631	GCC	2	6	21138	21143	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_004631	TGA	2	6	21196	21201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004631	CAT	2	6	21327	21332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_004631	GAT	2	6	21356	21361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004631	TAA	2	6	21362	21367	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004631	CTG	2	6	21409	21414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_004631	CGC	2	6	21520	21525	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
60	NC_004631	CAG	2	6	21539	21544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_004631	ATG	2	6	21625	21630	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004631	TTG	2	6	21696	21701	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004631	GGC	2	6	21783	21788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_004631	GTT	2	6	21845	21850	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004631	ACG	2	6	21856	21861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_004631	CGG	3	9	21869	21877	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_004631	AAG	2	6	21982	21987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004631	GCG	2	6	22036	22041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_004631	TGG	2	6	22051	22056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004631	TTA	2	6	22099	22104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004631	GGC	2	6	22115	22120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_004631	GTA	2	6	22218	22223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004631	GGC	3	9	22259	22267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_004631	CGA	2	6	22325	22330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_004631	CGG	2	6	22426	22431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_004631	TGC	2	6	22438	22443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_004631	TGA	2	6	22544	22549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004631	GCT	2	6	22652	22657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_004631	GGC	2	6	22686	22691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_004631	AGA	2	6	22706	22711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004631	CGG	2	6	22748	22753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_004631	GGT	2	6	22953	22958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004631	CTA	2	6	22960	22965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_004631	CGG	2	6	23000	23005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_004631	TAT	2	6	23031	23036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004631	GCT	2	6	23037	23042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_004631	ATA	2	6	23057	23062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004631	TTA	2	6	23172	23177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004631	TAA	2	6	24101	24106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004631	AAG	2	6	24128	24133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004631	ATT	2	6	24134	24139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004631	ACA	2	6	24201	24206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_004631	GAT	2	6	24238	24243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004631	TAA	2	6	24265	24270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004631	TAA	2	6	24272	24277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004631	ACG	2	6	24312	24317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_004631	AAG	2	6	24359	24364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004631	GAA	2	6	24403	24408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004631	CAG	2	6	24413	24418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_004631	GGC	2	6	25992	25997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_004631	GAC	2	6	26073	26078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_004631	GGC	3	9	26184	26192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_004631	GCC	2	6	26227	26232	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_004631	GCA	2	6	26253	26258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_004631	GGC	2	6	26283	26288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_004631	GGC	2	6	26401	26406	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_004631	ACT	2	6	26474	26479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_004631	GCG	2	6	26498	26503	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_004631	GCA	2	6	26526	26531	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_004631	ATT	2	6	26610	26615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004631	GAC	2	6	26653	26658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_004631	CAT	2	6	26751	26756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_004631	GCC	2	6	26772	26777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
114	NC_004631	CCG	2	6	26810	26815	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_004631	GCG	2	6	26819	26824	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_004631	CCG	2	6	26885	26890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_004631	GGC	2	6	26912	26917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_004631	GCG	2	6	26926	26931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_004631	TAG	2	6	26955	26960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004631	GCG	2	6	27077	27082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_004631	ATA	2	6	27146	27151	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004631	GAT	2	6	27265	27270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004631	ATT	2	6	27347	27352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004631	TAT	2	6	27361	27366	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004631	AGG	2	6	27370	27375	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004631	TTA	2	6	27428	27433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_004631	TGA	2	6	27462	27467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004631	TTG	2	6	27478	27483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004631	ACA	2	6	27533	27538	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_004631	ATG	3	9	27620	27628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_004631	ACT	2	6	27720	27725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_004631	ACA	2	6	27746	27751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_004631	GCG	2	6	27788	27793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_004631	CAG	2	6	27868	27873	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_004631	GCG	2	6	27890	27895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_004631	TGG	2	6	27899	27904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004631	GGT	2	6	28032	28037	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004631	CGA	2	6	28046	28051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_004631	TGA	2	6	28095	28100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004631	TGA	2	6	28110	28115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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