MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptococcus pyogenes SSI-1 chromosome

Total Repeats: 4812

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004606	ATTT	2	8	121	128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004606	ACTA	2	8	147	154	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_004606	ATCA	2	8	508	515	50 %	25 %	0 %	25 %	28894913
4	NC_004606	GAAA	2	8	837	844	75 %	0 %	25 %	0 %	28894913
5	NC_004606	ACAA	2	8	959	966	75 %	0 %	0 %	25 %	28894913
6	NC_004606	CAAA	2	8	1224	1231	75 %	0 %	0 %	25 %	28894913
7	NC_004606	TTTA	2	8	1663	1670	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004606	GTAA	2	8	1919	1926	50 %	25 %	25 %	0 %	28894914
9	NC_004606	GACT	2	8	2278	2285	25 %	25 %	25 %	25 %	28894914
10	NC_004606	AGTC	2	8	2696	2703	25 %	25 %	25 %	25 %	28894914
11	NC_004606	AATT	2	8	2850	2857	50 %	50 %	0 %	0 %	28894914
12	NC_004606	TAAG	2	8	2876	2883	50 %	25 %	25 %	0 %	28894914
13	NC_004606	TAAA	2	8	3160	3167	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004606	TTGA	2	8	3450	3457	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004606	AAAT	2	8	3740	3747	75 %	25 %	0 %	0 %	28894916
16	NC_004606	TCAA	2	8	3906	3913	50 %	25 %	0 %	25 %	28894916
17	NC_004606	CAAA	2	8	4160	4167	75 %	0 %	0 %	25 %	28894916
18	NC_004606	TTTA	2	8	5182	5189	25 %	75 %	0 %	0 %	28894917
19	NC_004606	TTGA	2	8	6389	6396	25 %	50 %	25 %	0 %	28894918
20	NC_004606	ACGA	2	8	6462	6469	50 %	0 %	25 %	25 %	28894918
21	NC_004606	CCTT	2	8	6502	6509	0 %	50 %	0 %	50 %	28894918
22	NC_004606	AGTG	2	8	6511	6518	25 %	25 %	50 %	0 %	28894918
23	NC_004606	GATT	2	8	7440	7447	25 %	50 %	25 %	0 %	28894918
24	NC_004606	TGAT	2	8	7449	7456	25 %	50 %	25 %	0 %	28894918
25	NC_004606	ACCA	2	8	7606	7613	50 %	0 %	0 %	50 %	28894918
26	NC_004606	AAAG	2	8	7738	7745	75 %	0 %	25 %	0 %	28894918
27	NC_004606	TTGA	2	8	7829	7836	25 %	50 %	25 %	0 %	28894918
28	NC_004606	TCGG	2	8	8174	8181	0 %	25 %	50 %	25 %	28894918
29	NC_004606	AGCA	2	8	8222	8229	50 %	0 %	25 %	25 %	28894918
30	NC_004606	AATC	2	8	8266	8273	50 %	25 %	0 %	25 %	28894918
31	NC_004606	TCAA	2	8	8356	8363	50 %	25 %	0 %	25 %	28894918
32	NC_004606	GAAC	2	8	8784	8791	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_004606	AAAT	2	8	9057	9064	75 %	25 %	0 %	0 %	28894919
34	NC_004606	GGAT	2	8	9266	9273	25 %	25 %	50 %	0 %	28894920
35	NC_004606	TATT	2	8	9294	9301	25 %	75 %	0 %	0 %	28894920
36	NC_004606	TCAA	2	8	9789	9796	50 %	25 %	0 %	25 %	28894922
37	NC_004606	CAAA	2	8	10153	10160	75 %	0 %	0 %	25 %	28894922
38	NC_004606	ATTT	2	8	10869	10876	25 %	75 %	0 %	0 %	28894922
39	NC_004606	AAAT	2	8	10890	10897	75 %	25 %	0 %	0 %	28894922
40	NC_004606	CAAA	2	8	11123	11130	75 %	0 %	0 %	25 %	28894923
41	NC_004606	TTCA	2	8	11559	11566	25 %	50 %	0 %	25 %	28894923
42	NC_004606	AGTT	2	8	11866	11873	25 %	50 %	25 %	0 %	28894923
43	NC_004606	TTTA	2	8	11978	11985	25 %	75 %	0 %	0 %	28894923
44	NC_004606	TTTA	2	8	12065	12072	25 %	75 %	0 %	0 %	28894923
45	NC_004606	GAAG	2	8	12511	12518	50 %	0 %	50 %	0 %	28894924
46	NC_004606	TGTT	2	8	12669	12676	0 %	75 %	25 %	0 %	28894924
47	NC_004606	ATTA	2	8	12939	12946	50 %	50 %	0 %	0 %	28894925
48	NC_004606	GAAA	2	8	13134	13141	75 %	0 %	25 %	0 %	28894925
49	NC_004606	TCAA	2	8	13332	13339	50 %	25 %	0 %	25 %	28894925
50	NC_004606	GTTC	2	8	13606	13613	0 %	50 %	25 %	25 %	28894925
51	NC_004606	ATGG	2	8	13753	13760	25 %	25 %	50 %	0 %	28894925
52	NC_004606	AAAG	2	8	14100	14107	75 %	0 %	25 %	0 %	28894925
53	NC_004606	TGAT	2	8	14528	14535	25 %	50 %	25 %	0 %	28894925
54	NC_004606	ATTG	2	8	14613	14620	25 %	50 %	25 %	0 %	28894925
55	NC_004606	ACTA	2	8	15059	15066	50 %	25 %	0 %	25 %	28894926
56	NC_004606	TTGC	2	8	15488	15495	0 %	50 %	25 %	25 %	28894926
57	NC_004606	TTTA	2	8	15676	15683	25 %	75 %	0 %	0 %	28894926
58	NC_004606	GTAT	2	8	16058	16065	25 %	50 %	25 %	0 %	28894926
59	NC_004606	ATAA	2	8	16494	16501	75 %	25 %	0 %	0 %	28894926
60	NC_004606	TACT	2	8	16577	16584	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_004606	ACCC	2	8	16610	16617	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
62	NC_004606	AAAT	2	8	17019	17026	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004606	ACCT	2	8	17193	17200	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_004606	GTGA	2	8	17474	17481	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004606	TAAC	2	8	17557	17564	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_004606	AGCG	2	8	17645	17652	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_004606	TGGT	2	8	18310	18317	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004606	AGCC	2	8	18527	18534	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_004606	AGCG	2	8	18873	18880	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_004606	GTAA	2	8	19124	19131	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004606	ACTA	2	8	19166	19173	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_004606	GAAG	2	8	19206	19213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004606	GCGA	2	8	19280	19287	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_004606	ATTC	2	8	20146	20153	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_004606	CTAA	2	8	20502	20509	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
76	NC_004606	TAGG	2	8	21157	21164	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004606	TTGG	2	8	21340	21347	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004606	AATC	2	8	21349	21356	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_004606	GCGT	2	8	23196	23203	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
80	NC_004606	TAAA	2	8	23747	23754	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004606	GTTA	2	8	24089	24096	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004606	ATTC	2	8	24889	24896	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_004606	AAGT	2	8	25366	25373	50 %	25 %	25 %	0 %	28894927
84	NC_004606	AAGC	2	8	25674	25681	50 %	0 %	25 %	25 %	28894927
85	NC_004606	TGGT	2	8	26345	26352	0 %	50 %	50 %	0 %	28894927
86	NC_004606	ATTT	2	8	26372	26379	25 %	75 %	0 %	0 %	28894927
87	NC_004606	TTGA	2	8	27306	27313	25 %	50 %	25 %	0 %	28894928
88	NC_004606	TGAT	2	8	27319	27326	25 %	50 %	25 %	0 %	28894928
89	NC_004606	TTCT	2	8	27409	27416	0 %	75 %	0 %	25 %	28894928
90	NC_004606	ATTA	2	8	27674	27681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004606	CATT	2	8	28503	28510	25 %	50 %	0 %	25 %	28894929
92	NC_004606	GTTT	2	8	28971	28978	0 %	75 %	25 %	0 %	28894930
93	NC_004606	TAAT	2	8	29394	29401	50 %	50 %	0 %	0 %	28894930
94	NC_004606	GTAC	2	8	29579	29586	25 %	25 %	25 %	25 %	28894930
95	NC_004606	AACA	2	8	29728	29735	75 %	0 %	0 %	25 %	28894931
96	NC_004606	TTAG	2	8	29888	29895	25 %	50 %	25 %	0 %	28894931
97	NC_004606	AGAA	2	8	30021	30028	75 %	0 %	25 %	0 %	28894932
98	NC_004606	TTAT	2	8	30056	30063	25 %	75 %	0 %	0 %	28894932
99	NC_004606	TTGA	2	8	30556	30563	25 %	50 %	25 %	0 %	28894932
100	NC_004606	GGAA	2	8	30756	30763	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004606	AATC	2	8	31482	31489	50 %	25 %	0 %	25 %	28894933
102	NC_004606	TACT	2	8	31528	31535	25 %	50 %	0 %	25 %	28894933
103	NC_004606	CTTG	2	8	32206	32213	0 %	50 %	25 %	25 %	28894933
104	NC_004606	GCAC	2	8	32750	32757	25 %	0 %	25 %	50 %	28894933
105	NC_004606	TGGC	2	8	33321	33328	0 %	25 %	50 %	25 %	28894933
106	NC_004606	CCAA	2	8	34206	34213	50 %	0 %	0 %	50 %	28894933
107	NC_004606	TTGG	2	8	34261	34268	0 %	50 %	50 %	0 %	28894933
108	NC_004606	ACTT	2	8	34909	34916	25 %	50 %	0 %	25 %	28894934
109	NC_004606	AATC	2	8	35029	35036	50 %	25 %	0 %	25 %	28894934
110	NC_004606	TGAT	2	8	35894	35901	25 %	50 %	25 %	0 %	28894934
111	NC_004606	AATT	2	8	36044	36051	50 %	50 %	0 %	0 %	28894934
112	NC_004606	TTGA	2	8	36127	36134	25 %	50 %	25 %	0 %	28894934
113	NC_004606	TGCT	2	8	36524	36531	0 %	50 %	25 %	25 %	28894935
114	NC_004606	TAGT	2	8	37365	37372	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004606	AGTT	2	8	37568	37575	25 %	50 %	25 %	0 %	28894936
116	NC_004606	GATT	2	8	37718	37725	25 %	50 %	25 %	0 %	28894936
117	NC_004606	GTCT	2	8	37728	37735	0 %	50 %	25 %	25 %	28894936
118	NC_004606	CCTG	2	8	37814	37821	0 %	25 %	25 %	50 %	28894936
119	NC_004606	AAAG	2	8	38119	38126	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004606	GCTA	2	8	39254	39261	25 %	25 %	25 %	25 %	28894937
121	NC_004606	CCAA	2	8	39428	39435	50 %	0 %	0 %	50 %	28894937
122	NC_004606	AACC	2	8	39548	39555	50 %	0 %	0 %	50 %	28894937
123	NC_004606	AAAC	2	8	39734	39741	75 %	0 %	0 %	25 %	28894937
124	NC_004606	ATTA	2	8	40970	40977	50 %	50 %	0 %	0 %	28894938
125	NC_004606	TAAT	2	8	41152	41159	50 %	50 %	0 %	0 %	28894939
126	NC_004606	AGAA	2	8	42547	42554	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_004606	CTAT	2	8	43314	43321	25 %	50 %	0 %	25 %	28894941
128	NC_004606	AATT	2	8	44627	44634	50 %	50 %	0 %	0 %	28894942
129	NC_004606	ATGG	2	8	44826	44833	25 %	25 %	50 %	0 %	28894942
130	NC_004606	AAAT	2	8	46100	46107	75 %	25 %	0 %	0 %	28894943
131	NC_004606	TTGG	2	8	46115	46122	0 %	50 %	50 %	0 %	28894943
132	NC_004606	CAAG	2	8	46367	46374	50 %	0 %	25 %	25 %	28894943
133	NC_004606	TTGA	2	8	47004	47011	25 %	50 %	25 %	0 %	28894943
134	NC_004606	ATTG	2	8	47129	47136	25 %	50 %	25 %	0 %	28894943
135	NC_004606	TAAG	2	8	47612	47619	50 %	25 %	25 %	0 %	28894944
136	NC_004606	ATCT	2	8	47931	47938	25 %	50 %	0 %	25 %	28894944
137	NC_004606	ATTT	2	8	48083	48090	25 %	75 %	0 %	0 %	28894944
138	NC_004606	CTAT	2	8	48244	48251	25 %	50 %	0 %	25 %	28894944
139	NC_004606	TTTA	2	8	48413	48420	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004606	TGTC	2	8	48953	48960	0 %	50 %	25 %	25 %	28894945
141	NC_004606	ATTG	2	8	49062	49069	25 %	50 %	25 %	0 %	28894945
142	NC_004606	ACGA	2	8	49401	49408	50 %	0 %	25 %	25 %	28894945
143	NC_004606	AGGG	2	8	49424	49431	25 %	0 %	75 %	0 %	28894945
144	NC_004606	GATT	2	8	49683	49690	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004606	TGTC	2	8	49757	49764	0 %	50 %	25 %	25 %	28894946
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147	NC_004606	TTAG	2	8	50121	50128	25 %	50 %	25 %	0 %	28894946
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