MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes SSI-1 chromosome

Total Repeats: 851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004606	ATTT	2	8	121	128	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004606	ACTA	2	8	147	154	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3	NC_004606	TTTA	2	8	1663	1670	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004606	TAAA	2	8	3160	3167	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004606	TTGA	2	8	3450	3457	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004606	GAAC	2	8	8784	8791	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_004606	TACT	2	8	16577	16584	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_004606	ACCC	2	8	16610	16617	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
9	NC_004606	AAAT	2	8	17019	17026	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004606	ACCT	2	8	17193	17200	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_004606	GTGA	2	8	17474	17481	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004606	TAAC	2	8	17557	17564	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_004606	AGCG	2	8	17645	17652	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_004606	TGGT	2	8	18310	18317	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004606	AGCC	2	8	18527	18534	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_004606	AGCG	2	8	18873	18880	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_004606	GTAA	2	8	19124	19131	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004606	ACTA	2	8	19166	19173	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
19	NC_004606	GAAG	2	8	19206	19213	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004606	GCGA	2	8	19280	19287	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
21	NC_004606	ATTC	2	8	20146	20153	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_004606	CTAA	2	8	20502	20509	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_004606	TAGG	2	8	21157	21164	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004606	TTGG	2	8	21340	21347	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004606	AATC	2	8	21349	21356	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_004606	GCGT	2	8	23196	23203	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_004606	TAAA	2	8	23747	23754	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004606	GTTA	2	8	24089	24096	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004606	ATTC	2	8	24889	24896	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_004606	ATTA	2	8	27674	27681	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004606	GGAA	2	8	30756	30763	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004606	TAGT	2	8	37365	37372	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004606	AAAG	2	8	38119	38126	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004606	AGAA	2	8	42547	42554	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004606	TTTA	2	8	48413	48420	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004606	GATT	2	8	49683	49690	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004606	AAAG	2	8	52473	52480	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004606	ATTT	2	8	55527	55534	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004606	TATT	2	8	61496	61503	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004606	TAAA	2	8	65158	65165	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004606	TTAA	2	8	65398	65405	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004606	TATT	2	8	69911	69918	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004606	AAAT	2	8	73998	74005	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004606	ACCT	2	8	74172	74179	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_004606	GTGA	2	8	74453	74460	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004606	TAAC	2	8	74536	74543	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_004606	AGCG	2	8	74624	74631	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
48	NC_004606	TGGT	2	8	75289	75296	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004606	AGCC	2	8	75506	75513	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_004606	AGCG	2	8	75852	75859	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_004606	GTAA	2	8	76103	76110	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004606	ACTA	2	8	76145	76152	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_004606	GAAG	2	8	76185	76192	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004606	GCGA	2	8	76259	76266	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_004606	ATTC	2	8	77125	77132	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_004606	CTAA	2	8	77481	77488	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_004606	TAGG	2	8	78136	78143	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004606	TTGG	2	8	78319	78326	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004606	AATC	2	8	78328	78335	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_004606	GCGT	2	8	79557	79564	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
61	NC_004606	AGTC	2	8	80872	80879	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_004606	TGAT	2	8	80898	80905	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004606	GTTC	2	8	80910	80917	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_004606	AAAT	2	8	80937	80944	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004606	CAAT	2	8	81072	81079	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
66	NC_004606	TTGC	2	8	81481	81488	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_004606	AAAC	2	8	81845	81852	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_004606	CAAT	2	8	91920	91927	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
69	NC_004606	ATTC	2	8	97196	97203	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_004606	GTTA	2	8	102250	102257	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004606	TAAG	2	8	104711	104718	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004606	ATTT	2	8	106454	106461	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004606	ATTA	2	8	111534	111541	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004606	CTTG	2	8	116970	116977	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_004606	TGAT	2	8	117029	117036	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004606	AAAG	2	8	118470	118477	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
77	NC_004606	AAAT	2	8	118518	118525	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004606	ATCG	2	8	120912	120919	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
79	NC_004606	CTTT	2	8	121793	121800	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_004606	GTCA	2	8	127195	127202	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_004606	TATC	2	8	127962	127969	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
82	NC_004606	AAGA	2	8	133065	133072	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004606	TTAG	2	8	134934	134941	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004606	GAAA	2	8	141189	141196	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004606	CCTG	2	8	141409	141416	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_004606	TAGT	2	8	142903	142910	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004606	ACAA	2	8	144988	144995	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_004606	AAAG	2	8	149349	149356	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004606	ATTT	2	8	149370	149377	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004606	TAGC	2	8	149462	149469	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
91	NC_004606	TAGT	2	8	149966	149973	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004606	AAAT	2	8	150340	150347	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004606	AAAT	2	8	150410	150417	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004606	GGAT	2	8	159977	159984	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004606	AGTC	2	8	161796	161803	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
96	NC_004606	ATAG	2	8	169369	169376	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004606	CGTG	2	8	169850	169857	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
98	NC_004606	TAAA	2	8	170370	170377	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004606	ATGG	2	8	170445	170452	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004606	AAGA	2	8	173880	173887	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004606	CTTC	2	8	177351	177358	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_004606	TTTA	2	8	177394	177401	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004606	AGTA	2	8	178209	178216	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
104	NC_004606	TAGA	2	8	178548	178555	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004606	AATA	2	8	181608	181615	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004606	GATT	2	8	181948	181955	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
107	NC_004606	AGGG	2	8	182076	182083	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004606	AGTG	2	8	183174	183181	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004606	CTTT	2	8	189505	189512	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
110	NC_004606	AGCA	2	8	189529	189536	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_004606	GGGA	2	8	190955	190962	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004606	ACCG	2	8	192415	192422	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
113	NC_004606	ACAA	2	8	193130	193137	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_004606	TTGA	2	8	197383	197390	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004606	TCTT	2	8	197509	197516	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_004606	TATT	2	8	197792	197799	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_004606	CAAT	2	8	197909	197916	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_004606	TAAA	2	8	199339	199346	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004606	CAAT	2	8	199374	199381	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
120	NC_004606	TCAA	2	8	199389	199396	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
121	NC_004606	TTTG	2	8	199478	199485	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004606	TAGT	2	8	201886	201893	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004606	GTTT	2	8	201931	201938	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_004606	AAAT	2	8	202067	202074	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004606	TAAA	2	8	206497	206504	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004606	CATA	2	8	206550	206557	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_004606	TTTG	2	8	206613	206620	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004606	AAAG	2	8	211861	211868	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004606	CAAA	2	8	222408	222415	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_004606	ATTT	2	8	225147	225154	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_004606	TAGG	2	8	225232	225239	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004606	AAAG	2	8	236462	236469	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_004606	TAGT	2	8	240893	240900	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004606	TAAA	2	8	241016	241023	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004606	GTCA	2	8	241050	241057	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
136	NC_004606	TAAA	2	8	249145	249152	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004606	AAAG	2	8	249267	249274	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004606	ATAA	2	8	249564	249571	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_004606	AAAT	2	8	250053	250060	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004606	ACCT	2	8	250227	250234	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
141	NC_004606	GTGA	2	8	250508	250515	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004606	TAAC	2	8	250591	250598	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
143	NC_004606	AGCG	2	8	250679	250686	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
144	NC_004606	TGGT	2	8	251344	251351	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_004606	AGCC	2	8	251561	251568	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_004606	AGCG	2	8	251907	251914	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_004606	GTAA	2	8	252158	252165	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_004606	ACTA	2	8	252200	252207	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_004606	GAAG	2	8	252240	252247	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_004606	GCGA	2	8	252314	252321	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_004606	ATTC	2	8	253180	253187	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
152	NC_004606	CTAA	2	8	253536	253543	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
153	NC_004606	TAGG	2	8	254191	254198	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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