MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pyogenes SSI-1 chromosome

Total Repeats: 3961

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004606	ATCA	2	8	508	515	50 %	25 %	0 %	25 %	28894913
2	NC_004606	GAAA	2	8	837	844	75 %	0 %	25 %	0 %	28894913
3	NC_004606	ACAA	2	8	959	966	75 %	0 %	0 %	25 %	28894913
4	NC_004606	CAAA	2	8	1224	1231	75 %	0 %	0 %	25 %	28894913
5	NC_004606	GTAA	2	8	1919	1926	50 %	25 %	25 %	0 %	28894914
6	NC_004606	GACT	2	8	2278	2285	25 %	25 %	25 %	25 %	28894914
7	NC_004606	AGTC	2	8	2696	2703	25 %	25 %	25 %	25 %	28894914
8	NC_004606	AATT	2	8	2850	2857	50 %	50 %	0 %	0 %	28894914
9	NC_004606	TAAG	2	8	2876	2883	50 %	25 %	25 %	0 %	28894914
10	NC_004606	AAAT	2	8	3740	3747	75 %	25 %	0 %	0 %	28894916
11	NC_004606	TCAA	2	8	3906	3913	50 %	25 %	0 %	25 %	28894916
12	NC_004606	CAAA	2	8	4160	4167	75 %	0 %	0 %	25 %	28894916
13	NC_004606	TTTA	2	8	5182	5189	25 %	75 %	0 %	0 %	28894917
14	NC_004606	TTGA	2	8	6389	6396	25 %	50 %	25 %	0 %	28894918
15	NC_004606	ACGA	2	8	6462	6469	50 %	0 %	25 %	25 %	28894918
16	NC_004606	CCTT	2	8	6502	6509	0 %	50 %	0 %	50 %	28894918
17	NC_004606	AGTG	2	8	6511	6518	25 %	25 %	50 %	0 %	28894918
18	NC_004606	GATT	2	8	7440	7447	25 %	50 %	25 %	0 %	28894918
19	NC_004606	TGAT	2	8	7449	7456	25 %	50 %	25 %	0 %	28894918
20	NC_004606	ACCA	2	8	7606	7613	50 %	0 %	0 %	50 %	28894918
21	NC_004606	AAAG	2	8	7738	7745	75 %	0 %	25 %	0 %	28894918
22	NC_004606	TTGA	2	8	7829	7836	25 %	50 %	25 %	0 %	28894918
23	NC_004606	TCGG	2	8	8174	8181	0 %	25 %	50 %	25 %	28894918
24	NC_004606	AGCA	2	8	8222	8229	50 %	0 %	25 %	25 %	28894918
25	NC_004606	AATC	2	8	8266	8273	50 %	25 %	0 %	25 %	28894918
26	NC_004606	TCAA	2	8	8356	8363	50 %	25 %	0 %	25 %	28894918
27	NC_004606	AAAT	2	8	9057	9064	75 %	25 %	0 %	0 %	28894919
28	NC_004606	GGAT	2	8	9266	9273	25 %	25 %	50 %	0 %	28894920
29	NC_004606	TATT	2	8	9294	9301	25 %	75 %	0 %	0 %	28894920
30	NC_004606	TCAA	2	8	9789	9796	50 %	25 %	0 %	25 %	28894922
31	NC_004606	CAAA	2	8	10153	10160	75 %	0 %	0 %	25 %	28894922
32	NC_004606	ATTT	2	8	10869	10876	25 %	75 %	0 %	0 %	28894922
33	NC_004606	AAAT	2	8	10890	10897	75 %	25 %	0 %	0 %	28894922
34	NC_004606	CAAA	2	8	11123	11130	75 %	0 %	0 %	25 %	28894923
35	NC_004606	TTCA	2	8	11559	11566	25 %	50 %	0 %	25 %	28894923
36	NC_004606	AGTT	2	8	11866	11873	25 %	50 %	25 %	0 %	28894923
37	NC_004606	TTTA	2	8	11978	11985	25 %	75 %	0 %	0 %	28894923
38	NC_004606	TTTA	2	8	12065	12072	25 %	75 %	0 %	0 %	28894923
39	NC_004606	GAAG	2	8	12511	12518	50 %	0 %	50 %	0 %	28894924
40	NC_004606	TGTT	2	8	12669	12676	0 %	75 %	25 %	0 %	28894924
41	NC_004606	ATTA	2	8	12939	12946	50 %	50 %	0 %	0 %	28894925
42	NC_004606	GAAA	2	8	13134	13141	75 %	0 %	25 %	0 %	28894925
43	NC_004606	TCAA	2	8	13332	13339	50 %	25 %	0 %	25 %	28894925
44	NC_004606	GTTC	2	8	13606	13613	0 %	50 %	25 %	25 %	28894925
45	NC_004606	ATGG	2	8	13753	13760	25 %	25 %	50 %	0 %	28894925
46	NC_004606	AAAG	2	8	14100	14107	75 %	0 %	25 %	0 %	28894925
47	NC_004606	TGAT	2	8	14528	14535	25 %	50 %	25 %	0 %	28894925
48	NC_004606	ATTG	2	8	14613	14620	25 %	50 %	25 %	0 %	28894925
49	NC_004606	ACTA	2	8	15059	15066	50 %	25 %	0 %	25 %	28894926
50	NC_004606	TTGC	2	8	15488	15495	0 %	50 %	25 %	25 %	28894926
51	NC_004606	TTTA	2	8	15676	15683	25 %	75 %	0 %	0 %	28894926
52	NC_004606	GTAT	2	8	16058	16065	25 %	50 %	25 %	0 %	28894926
53	NC_004606	ATAA	2	8	16494	16501	75 %	25 %	0 %	0 %	28894926
54	NC_004606	AAGT	2	8	25366	25373	50 %	25 %	25 %	0 %	28894927
55	NC_004606	AAGC	2	8	25674	25681	50 %	0 %	25 %	25 %	28894927
56	NC_004606	TGGT	2	8	26345	26352	0 %	50 %	50 %	0 %	28894927
57	NC_004606	ATTT	2	8	26372	26379	25 %	75 %	0 %	0 %	28894927
58	NC_004606	TTGA	2	8	27306	27313	25 %	50 %	25 %	0 %	28894928
59	NC_004606	TGAT	2	8	27319	27326	25 %	50 %	25 %	0 %	28894928
60	NC_004606	TTCT	2	8	27409	27416	0 %	75 %	0 %	25 %	28894928
61	NC_004606	CATT	2	8	28503	28510	25 %	50 %	0 %	25 %	28894929
62	NC_004606	GTTT	2	8	28971	28978	0 %	75 %	25 %	0 %	28894930
63	NC_004606	TAAT	2	8	29394	29401	50 %	50 %	0 %	0 %	28894930
64	NC_004606	GTAC	2	8	29579	29586	25 %	25 %	25 %	25 %	28894930
65	NC_004606	AACA	2	8	29728	29735	75 %	0 %	0 %	25 %	28894931
66	NC_004606	TTAG	2	8	29888	29895	25 %	50 %	25 %	0 %	28894931
67	NC_004606	AGAA	2	8	30021	30028	75 %	0 %	25 %	0 %	28894932
68	NC_004606	TTAT	2	8	30056	30063	25 %	75 %	0 %	0 %	28894932
69	NC_004606	TTGA	2	8	30556	30563	25 %	50 %	25 %	0 %	28894932
70	NC_004606	AATC	2	8	31482	31489	50 %	25 %	0 %	25 %	28894933
71	NC_004606	TACT	2	8	31528	31535	25 %	50 %	0 %	25 %	28894933
72	NC_004606	CTTG	2	8	32206	32213	0 %	50 %	25 %	25 %	28894933
73	NC_004606	GCAC	2	8	32750	32757	25 %	0 %	25 %	50 %	28894933
74	NC_004606	TGGC	2	8	33321	33328	0 %	25 %	50 %	25 %	28894933
75	NC_004606	CCAA	2	8	34206	34213	50 %	0 %	0 %	50 %	28894933
76	NC_004606	TTGG	2	8	34261	34268	0 %	50 %	50 %	0 %	28894933
77	NC_004606	ACTT	2	8	34909	34916	25 %	50 %	0 %	25 %	28894934
78	NC_004606	AATC	2	8	35029	35036	50 %	25 %	0 %	25 %	28894934
79	NC_004606	TGAT	2	8	35894	35901	25 %	50 %	25 %	0 %	28894934
80	NC_004606	AATT	2	8	36044	36051	50 %	50 %	0 %	0 %	28894934
81	NC_004606	TTGA	2	8	36127	36134	25 %	50 %	25 %	0 %	28894934
82	NC_004606	TGCT	2	8	36524	36531	0 %	50 %	25 %	25 %	28894935
83	NC_004606	AGTT	2	8	37568	37575	25 %	50 %	25 %	0 %	28894936
84	NC_004606	GATT	2	8	37718	37725	25 %	50 %	25 %	0 %	28894936
85	NC_004606	GTCT	2	8	37728	37735	0 %	50 %	25 %	25 %	28894936
86	NC_004606	CCTG	2	8	37814	37821	0 %	25 %	25 %	50 %	28894936
87	NC_004606	GCTA	2	8	39254	39261	25 %	25 %	25 %	25 %	28894937
88	NC_004606	CCAA	2	8	39428	39435	50 %	0 %	0 %	50 %	28894937
89	NC_004606	AACC	2	8	39548	39555	50 %	0 %	0 %	50 %	28894937
90	NC_004606	AAAC	2	8	39734	39741	75 %	0 %	0 %	25 %	28894937
91	NC_004606	ATTA	2	8	40970	40977	50 %	50 %	0 %	0 %	28894938
92	NC_004606	TAAT	2	8	41152	41159	50 %	50 %	0 %	0 %	28894939
93	NC_004606	CTAT	2	8	43314	43321	25 %	50 %	0 %	25 %	28894941
94	NC_004606	AATT	2	8	44627	44634	50 %	50 %	0 %	0 %	28894942
95	NC_004606	ATGG	2	8	44826	44833	25 %	25 %	50 %	0 %	28894942
96	NC_004606	AAAT	2	8	46100	46107	75 %	25 %	0 %	0 %	28894943
97	NC_004606	TTGG	2	8	46115	46122	0 %	50 %	50 %	0 %	28894943
98	NC_004606	CAAG	2	8	46367	46374	50 %	0 %	25 %	25 %	28894943
99	NC_004606	TTGA	2	8	47004	47011	25 %	50 %	25 %	0 %	28894943
100	NC_004606	ATTG	2	8	47129	47136	25 %	50 %	25 %	0 %	28894943
101	NC_004606	TAAG	2	8	47612	47619	50 %	25 %	25 %	0 %	28894944
102	NC_004606	ATCT	2	8	47931	47938	25 %	50 %	0 %	25 %	28894944
103	NC_004606	ATTT	2	8	48083	48090	25 %	75 %	0 %	0 %	28894944
104	NC_004606	CTAT	2	8	48244	48251	25 %	50 %	0 %	25 %	28894944
105	NC_004606	TGTC	2	8	48953	48960	0 %	50 %	25 %	25 %	28894945
106	NC_004606	ATTG	2	8	49062	49069	25 %	50 %	25 %	0 %	28894945
107	NC_004606	ACGA	2	8	49401	49408	50 %	0 %	25 %	25 %	28894945
108	NC_004606	AGGG	2	8	49424	49431	25 %	0 %	75 %	0 %	28894945
109	NC_004606	TGTC	2	8	49757	49764	0 %	50 %	25 %	25 %	28894946
110	NC_004606	ATTA	2	8	49917	49924	50 %	50 %	0 %	0 %	28894946
111	NC_004606	TTAG	2	8	50121	50128	25 %	50 %	25 %	0 %	28894946
112	NC_004606	GATA	2	8	50202	50209	50 %	25 %	25 %	0 %	28894947
113	NC_004606	AATG	2	8	50382	50389	50 %	25 %	25 %	0 %	28894947
114	NC_004606	TTGA	2	8	50742	50749	25 %	50 %	25 %	0 %	28894948
115	NC_004606	TTTG	2	8	51042	51049	0 %	75 %	25 %	0 %	28894948
116	NC_004606	ATTT	2	8	51180	51187	25 %	75 %	0 %	0 %	28894948
117	NC_004606	CTAT	2	8	51383	51390	25 %	50 %	0 %	25 %	28894948
118	NC_004606	ATTT	2	8	51991	51998	25 %	75 %	0 %	0 %	28894948
119	NC_004606	TCTA	2	8	52022	52029	25 %	50 %	0 %	25 %	28894948
120	NC_004606	TAAA	2	8	52367	52374	75 %	25 %	0 %	0 %	28894948
121	NC_004606	TAAA	2	8	53526	53533	75 %	25 %	0 %	0 %	28894949
122	NC_004606	AACA	2	8	57215	57222	75 %	0 %	0 %	25 %	28894951
123	NC_004606	TCGG	2	8	57266	57273	0 %	25 %	50 %	25 %	28894951
124	NC_004606	TTGG	2	8	57344	57351	0 %	50 %	50 %	0 %	28894951
125	NC_004606	TCTA	2	8	57503	57510	25 %	50 %	0 %	25 %	28894951
126	NC_004606	GGCA	2	8	58036	58043	25 %	0 %	50 %	25 %	28894951
127	NC_004606	CAAA	2	8	58473	58480	75 %	0 %	0 %	25 %	28894952
128	NC_004606	GGTT	2	8	59174	59181	0 %	50 %	50 %	0 %	28894954
129	NC_004606	AAAC	2	8	59486	59493	75 %	0 %	0 %	25 %	28894954
130	NC_004606	TCGT	2	8	61420	61427	0 %	50 %	25 %	25 %	161486360
131	NC_004606	GACG	2	8	61740	61747	25 %	0 %	50 %	25 %	28894958
132	NC_004606	CAAA	2	8	62008	62015	75 %	0 %	0 %	25 %	28894959
133	NC_004606	AAGA	2	8	63381	63388	75 %	0 %	25 %	0 %	28894962
134	NC_004606	TCGT	2	8	63722	63729	0 %	50 %	25 %	25 %	28894963
135	NC_004606	TCGT	2	8	64016	64023	0 %	50 %	25 %	25 %	28894964
136	NC_004606	AATC	2	8	64825	64832	50 %	25 %	0 %	25 %	28894966
137	NC_004606	TGAC	2	8	65509	65516	25 %	25 %	25 %	25 %	28894968
138	NC_004606	TGAC	2	8	65839	65846	25 %	25 %	25 %	25 %	28894968
139	NC_004606	ACTC	2	8	66198	66205	25 %	25 %	0 %	50 %	28894969
140	NC_004606	TACG	2	8	66604	66611	25 %	25 %	25 %	25 %	28894969
141	NC_004606	TGGT	2	8	67342	67349	0 %	50 %	50 %	0 %	28894971
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