MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Streptococcus pyogenes SSI-1 chromosome

Total Repeats: 25848

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004606	TTG	2	6	1	6	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004606	AAG	2	6	217	222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004606	ATG	2	6	320	325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894913
4	NC_004606	CTG	2	6	422	427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28894913
5	NC_004606	GAA	2	6	472	477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894913
6	NC_004606	AGC	2	6	524	529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894913
7	NC_004606	TGC	2	6	624	629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28894913
8	NC_004606	TTA	2	6	712	717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894913
9	NC_004606	TTA	2	6	788	793	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894913
10	NC_004606	TGA	2	6	873	878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894913
11	NC_004606	AAG	2	6	917	922	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894913
12	NC_004606	ATA	3	9	950	958	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28894913
13	NC_004606	ATC	2	6	995	1000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894913
14	NC_004606	AGA	2	6	1011	1016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894913
15	NC_004606	CCT	2	6	1063	1068	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28894913
16	NC_004606	TGC	2	6	1254	1259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28894913
17	NC_004606	GAA	2	6	1315	1320	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894913
18	NC_004606	CTA	2	6	1373	1378	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894913
19	NC_004606	TGG	2	6	1473	1478	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28894913
20	NC_004606	TAA	2	6	1509	1514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28894913
21	NC_004606	AAC	2	6	1635	1640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_004606	CTA	4	12	1696	1707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_004606	TTA	3	9	1709	1717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004606	TTA	2	6	1721	1726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004606	ATT	2	6	1768	1773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894914
26	NC_004606	TCA	2	6	1835	1840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894914
27	NC_004606	TTA	2	6	1967	1972	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894914
28	NC_004606	ATT	2	6	1994	1999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894914
29	NC_004606	AAC	2	6	2040	2045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28894914
30	NC_004606	GTT	2	6	2051	2056	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28894914
31	NC_004606	AAG	2	6	2121	2126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894914
32	NC_004606	ATT	2	6	2161	2166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894914
33	NC_004606	TAT	2	6	2173	2178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894914
34	NC_004606	GTC	2	6	2214	2219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28894914
35	NC_004606	CAG	2	6	2328	2333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894914
36	NC_004606	CAG	2	6	2376	2381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894914
37	NC_004606	GAT	2	6	2390	2395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894914
38	NC_004606	TTA	2	6	2504	2509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894914
39	NC_004606	GTT	2	6	2531	2536	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28894914
40	NC_004606	GAA	2	6	2834	2839	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894914
41	NC_004606	TTA	2	6	2912	2917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004606	ATA	2	6	2930	2935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004606	ATG	2	6	3097	3102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894915
44	NC_004606	AGA	2	6	3253	3258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004606	AAT	2	6	3331	3336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004606	TCT	2	6	3403	3408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_004606	TCT	2	6	3425	3430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_004606	TAA	2	6	3442	3447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004606	CAG	2	6	3490	3495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894916
50	NC_004606	GCT	2	6	3564	3569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28894916
51	NC_004606	TGA	3	9	3800	3808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894916
52	NC_004606	GTT	2	6	4062	4067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28894916
53	NC_004606	AAC	2	6	4085	4090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28894916
54	NC_004606	AGT	2	6	4199	4204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894916
55	NC_004606	AGA	3	9	4223	4231	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894916
56	NC_004606	AGA	2	6	4259	4264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894916
57	NC_004606	AGC	2	6	4316	4321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894916
58	NC_004606	ATC	2	6	4324	4329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894916
59	NC_004606	CAG	2	6	4354	4359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894916
60	NC_004606	GCT	2	6	4413	4418	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28894916
61	NC_004606	TAT	2	6	4421	4426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894916
62	NC_004606	ATG	2	6	4474	4479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894916
63	NC_004606	AAG	2	6	4513	4518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894916
64	NC_004606	GAA	2	6	4533	4538	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894916
65	NC_004606	TGT	2	6	4550	4555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28894916
66	NC_004606	CAT	2	6	4568	4573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894916
67	NC_004606	GAA	2	6	4623	4628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004606	TTG	2	6	4678	4683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28894917
69	NC_004606	GAT	2	6	4782	4787	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894917
70	NC_004606	TTA	2	6	4819	4824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894917
71	NC_004606	CTA	2	6	4852	4857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894917
72	NC_004606	AAT	2	6	4866	4871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28894917
73	NC_004606	CTA	2	6	4901	4906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894917
74	NC_004606	ATG	2	6	4939	4944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894917
75	NC_004606	CAG	2	6	4990	4995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894917
76	NC_004606	GAC	2	6	5071	5076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894917
77	NC_004606	TTA	2	6	5095	5100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894917
78	NC_004606	ATA	2	6	5131	5136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28894917
79	NC_004606	ATT	2	6	5251	5256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894918
80	NC_004606	ACC	2	6	5297	5302	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28894918
81	NC_004606	GAT	2	6	5372	5377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894918
82	NC_004606	TGA	2	6	5452	5457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894918
83	NC_004606	TGA	2	6	5703	5708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894918
84	NC_004606	GAT	2	6	5828	5833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894918
85	NC_004606	AAC	2	6	5880	5885	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28894918
86	NC_004606	TTA	2	6	5898	5903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894918
87	NC_004606	GAT	2	6	5987	5992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894918
88	NC_004606	AGA	2	6	6007	6012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894918
89	NC_004606	ATT	2	6	6070	6075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894918
90	NC_004606	ATT	2	6	6094	6099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894918
91	NC_004606	GAT	2	6	6134	6139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894918
92	NC_004606	AGA	2	6	6199	6204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894918
93	NC_004606	ACT	2	6	6237	6242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894918
94	NC_004606	CTT	2	6	6286	6291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28894918
95	NC_004606	AAC	2	6	6424	6429	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28894918
96	NC_004606	TGA	2	6	6586	6591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894918
97	NC_004606	ACG	2	6	6640	6645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894918
98	NC_004606	TAG	2	6	6847	6852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894918
99	NC_004606	CTG	2	6	6870	6875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28894918
100	NC_004606	TAA	2	6	6895	6900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28894918
101	NC_004606	ATG	2	6	6906	6911	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894918
102	NC_004606	TGA	2	6	6964	6969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894918
103	NC_004606	AAG	2	6	6991	6996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894918
104	NC_004606	GAT	2	6	7025	7030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894918
105	NC_004606	TGA	3	9	7048	7056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894918
106	NC_004606	AGA	2	6	7075	7080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894918
107	NC_004606	TAG	2	6	7146	7151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894918
108	NC_004606	CAG	2	6	7256	7261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28894918
109	NC_004606	GTA	2	6	7329	7334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894918
110	NC_004606	ATT	2	6	7385	7390	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894918
111	NC_004606	AAC	2	6	7461	7466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28894918
112	NC_004606	AAT	2	6	7646	7651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28894918
113	NC_004606	GGA	2	6	7694	7699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28894918
114	NC_004606	ATG	2	6	7854	7859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894918
115	NC_004606	ATC	2	6	7877	7882	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28894918
116	NC_004606	GAA	2	6	7980	7985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894918
117	NC_004606	GAG	2	6	8127	8132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28894918
118	NC_004606	ATT	2	6	8200	8205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894918
119	NC_004606	GAT	2	6	8297	8302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894918
120	NC_004606	AAT	2	6	8501	8506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28894918
121	NC_004606	CTT	2	6	8532	8537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28894918
122	NC_004606	ATT	2	6	8559	8564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894918
123	NC_004606	AGA	2	6	8668	8673	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894918
124	NC_004606	ATA	2	6	8737	8742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28894918
125	NC_004606	AAC	2	6	8749	8754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_004606	TGC	2	6	8828	8833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_004606	TTA	2	6	8936	8941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28894919
128	NC_004606	CGT	2	6	8944	8949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28894919
129	NC_004606	AAG	2	6	8960	8965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894919
130	NC_004606	GAA	2	6	9163	9168	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894919
131	NC_004606	AAT	2	6	9188	9193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28894920
132	NC_004606	GAA	4	12	9230	9241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28894920
133	NC_004606	ATG	2	6	9284	9289	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894920
134	NC_004606	GGT	2	6	9358	9363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28894920
135	NC_004606	GAT	2	6	9437	9442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894920
136	NC_004606	ATG	3	9	9529	9537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28894920
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