MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptococcus pyogenes SSI-1 chromosome

Total Repeats: 3591

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004606	TTG	2	6	1	6	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004606	AAG	2	6	217	222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004606	AAC	2	6	1635	1640	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_004606	CTA	4	12	1696	1707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_004606	TTA	3	9	1709	1717	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004606	TTA	2	6	1721	1726	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004606	TTA	2	6	2912	2917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004606	ATA	2	6	2930	2935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004606	AGA	2	6	3253	3258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004606	AAT	2	6	3331	3336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004606	TCT	2	6	3403	3408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_004606	TCT	2	6	3425	3430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_004606	TAA	2	6	3442	3447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004606	GAA	2	6	4623	4628	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004606	AAC	2	6	8749	8754	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_004606	TGC	2	6	8828	8833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_004606	TTA	2	6	14908	14913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004606	AAT	2	6	14994	14999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004606	AGA	2	6	15000	15005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004606	AGA	2	6	15008	15013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004606	ATA	2	6	16509	16514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004606	TAA	2	6	16830	16835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004606	AGT	2	6	16884	16889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004606	AAG	2	6	16919	16924	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004606	GGC	2	6	17102	17107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_004606	CGA	2	6	17347	17352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_004606	GCA	2	6	17421	17426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_004606	CGC	2	6	17468	17473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_004606	TGT	2	6	17507	17512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004606	AGA	2	6	17516	17521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004606	ATG	2	6	17522	17527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004606	CCA	2	6	17543	17548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_004606	CAG	2	6	17590	17595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_004606	GGA	2	6	17780	17785	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004606	GAA	2	6	18044	18049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004606	GGT	2	6	18118	18123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004606	GTC	2	6	18132	18137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_004606	CAT	2	6	18200	18205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_004606	TAA	2	6	18235	18240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004606	GGA	2	6	18244	18249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004606	ATC	2	6	18268	18273	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_004606	CGC	2	6	18434	18439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_004606	CAC	2	6	18479	18484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
44	NC_004606	GAT	2	6	18550	18555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004606	CCT	2	6	18606	18611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_004606	AGG	2	6	18705	18710	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004606	CTA	2	6	18751	18756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_004606	ATT	2	6	18993	18998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004606	TAA	2	6	18999	19004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004606	TAA	2	6	19031	19036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004606	GAA	2	6	19084	19089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004606	ACG	2	6	19101	19106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_004606	TAG	2	6	19272	19277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004606	AGG	2	6	19294	19299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004606	AGA	2	6	19360	19365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004606	GGA	2	6	19476	19481	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004606	ACA	2	6	19594	19599	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_004606	ATG	2	6	19661	19666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004606	TGT	2	6	19731	19736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004606	GGA	2	6	19794	19799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_004606	ATC	2	6	20001	20006	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_004606	ACC	2	6	20059	20064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_004606	AGC	2	6	20139	20144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_004606	AAG	2	6	20276	20281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004606	GAG	2	6	20291	20296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004606	TAG	2	6	20604	20609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004606	GAT	2	6	20850	20855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004606	AGG	2	6	20895	20900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004606	CGG	2	6	20941	20946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_004606	GTT	2	6	21201	21206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004606	TAC	2	6	21211	21216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_004606	CCT	2	6	21299	21304	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_004606	GGT	2	6	21435	21440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004606	TCG	2	6	21550	21555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_004606	CGT	2	6	21630	21635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_004606	CAG	2	6	22071	22076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_004606	AGT	2	6	22328	22333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004606	CGT	2	6	22668	22673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_004606	CTC	2	6	22847	22852	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_004606	CGC	2	6	23013	23018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_004606	TAT	2	6	23019	23024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004606	ATT	2	6	23129	23134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004606	GGA	2	6	23137	23142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_004606	TCC	2	6	23220	23225	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_004606	TCG	2	6	23260	23265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_004606	GTT	2	6	23324	23329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004606	CGG	2	6	23377	23382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_004606	TGT	2	6	23454	23459	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004606	GGT	2	6	23534	23539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004606	GGT	2	6	23569	23574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004606	AGA	2	6	23761	23766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004606	ATT	2	6	23830	23835	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_004606	ACT	2	6	23863	23868	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_004606	GTT	2	6	23908	23913	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004606	AAT	2	6	24038	24043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004606	TAT	2	6	24126	24131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004606	TGA	2	6	24132	24137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004606	TAG	2	6	24320	24325	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_004606	TAA	2	6	24348	24353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004606	GAT	2	6	24488	24493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004606	TAA	2	6	24749	24754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004606	ATA	2	6	24813	24818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004606	TTA	2	6	24861	24866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_004606	AAG	2	6	24898	24903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004606	TTA	2	6	24951	24956	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004606	GCT	2	6	25055	25060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_004606	TTA	2	6	25099	25104	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004606	AGT	2	6	25179	25184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004606	ATT	2	6	26394	26399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004606	GTT	2	6	26412	26417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004606	ATT	2	6	26430	26435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004606	GGA	2	6	26633	26638	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004606	ATA	2	6	27623	27628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004606	TAA	2	6	27721	27726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004606	AAC	2	6	27734	27739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_004606	ACG	2	6	27778	27783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_004606	TAA	2	6	28590	28595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004606	AAT	2	6	29896	29901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004606	TAT	2	6	29923	29928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004606	ATA	2	6	29973	29978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_004606	AGA	2	6	30750	30755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004606	TCC	2	6	30826	30831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_004606	ATC	2	6	34782	34787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_004606	AAG	2	6	34798	34803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
125	NC_004606	CGT	2	6	37434	37439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_004606	ATC	2	6	37483	37488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_004606	AGA	2	6	38100	38105	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_004606	TCG	2	6	38187	38192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_004606	CCT	2	6	40978	40983	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130	NC_004606	TTA	2	6	40989	40994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_004606	GAT	2	6	41028	41033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004606	CTA	2	6	41117	41122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_004606	CGT	2	6	42634	42639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_004606	TTG	2	6	45998	46003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004606	CTT	2	6	47366	47371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_004606	ATA	2	6	47441	47446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004606	GTT	2	6	47456	47461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004606	ATA	2	6	48385	48390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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140	NC_004606	AGA	2	6	48470	48475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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