MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Coding Repeats of Streptococcus pyogenes SSI-1 chromosome

Total Repeats: 1445

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004606	AT	3	6	768	773	50 %	50 %	0 %	0 %	28894913
2	NC_004606	CT	3	6	904	909	0 %	50 %	0 %	50 %	28894913
3	NC_004606	GA	3	6	2365	2370	50 %	0 %	50 %	0 %	28894914
4	NC_004606	GC	3	6	7039	7044	0 %	0 %	50 %	50 %	28894918
5	NC_004606	AC	3	6	10307	10312	50 %	0 %	0 %	50 %	28894922
6	NC_004606	AT	3	6	11812	11817	50 %	50 %	0 %	0 %	28894923
7	NC_004606	TA	5	10	12846	12855	50 %	50 %	0 %	0 %	28894925
8	NC_004606	CA	3	6	12909	12914	50 %	0 %	0 %	50 %	28894925
9	NC_004606	TC	3	6	14489	14494	0 %	50 %	0 %	50 %	28894925
10	NC_004606	TA	3	6	15911	15916	50 %	50 %	0 %	0 %	28894926
11	NC_004606	GA	3	6	30497	30502	50 %	0 %	50 %	0 %	28894932
12	NC_004606	CA	3	6	31553	31558	50 %	0 %	0 %	50 %	28894933
13	NC_004606	AT	3	6	31636	31641	50 %	50 %	0 %	0 %	28894933
14	NC_004606	TC	4	8	33301	33308	0 %	50 %	0 %	50 %	28894933
15	NC_004606	CT	3	6	34188	34193	0 %	50 %	0 %	50 %	28894933
16	NC_004606	GT	3	6	36076	36081	0 %	50 %	50 %	0 %	28894934
17	NC_004606	TC	3	6	36111	36116	0 %	50 %	0 %	50 %	28894934
18	NC_004606	TG	3	6	36578	36583	0 %	50 %	50 %	0 %	28894935
19	NC_004606	CA	3	6	38772	38777	50 %	0 %	0 %	50 %	28894937
20	NC_004606	TC	3	6	42341	42346	0 %	50 %	0 %	50 %	28894939
21	NC_004606	TC	3	6	43164	43169	0 %	50 %	0 %	50 %	28894940
22	NC_004606	CT	3	6	43977	43982	0 %	50 %	0 %	50 %	28894941
23	NC_004606	TG	3	6	44575	44580	0 %	50 %	50 %	0 %	28894942
24	NC_004606	TA	4	8	44785	44792	50 %	50 %	0 %	0 %	28894942
25	NC_004606	TA	3	6	45017	45022	50 %	50 %	0 %	0 %	28894942
26	NC_004606	AT	3	6	45462	45467	50 %	50 %	0 %	0 %	28894942
27	NC_004606	TA	3	6	45481	45486	50 %	50 %	0 %	0 %	28894942
28	NC_004606	GC	3	6	46890	46895	0 %	0 %	50 %	50 %	28894943
29	NC_004606	TG	3	6	47540	47545	0 %	50 %	50 %	0 %	28894944
30	NC_004606	AT	3	6	48008	48013	50 %	50 %	0 %	0 %	28894944
31	NC_004606	AG	3	6	48042	48047	50 %	0 %	50 %	0 %	28894944
32	NC_004606	AT	3	6	48684	48689	50 %	50 %	0 %	0 %	28894945
33	NC_004606	TA	3	6	48971	48976	50 %	50 %	0 %	0 %	28894945
34	NC_004606	TA	3	6	50492	50497	50 %	50 %	0 %	0 %	28894947
35	NC_004606	GT	3	6	50534	50539	0 %	50 %	50 %	0 %	28894947
36	NC_004606	TA	3	6	51492	51497	50 %	50 %	0 %	0 %	28894948
37	NC_004606	TG	3	6	53201	53206	0 %	50 %	50 %	0 %	28894949
38	NC_004606	AC	3	6	54683	54688	50 %	0 %	0 %	50 %	28894949
39	NC_004606	AT	3	6	56984	56989	50 %	50 %	0 %	0 %	28894951
40	NC_004606	GT	3	6	57570	57575	0 %	50 %	50 %	0 %	28894951
41	NC_004606	TC	3	6	58225	58230	0 %	50 %	0 %	50 %	28894951
42	NC_004606	AC	3	6	58673	58678	50 %	0 %	0 %	50 %	28894952
43	NC_004606	CA	3	6	60395	60400	50 %	0 %	0 %	50 %	28894956
44	NC_004606	CA	3	6	63100	63105	50 %	0 %	0 %	50 %	28894961
45	NC_004606	GT	3	6	65683	65688	0 %	50 %	50 %	0 %	28894968
46	NC_004606	AT	3	6	68713	68718	50 %	50 %	0 %	0 %	28894974
47	NC_004606	AT	3	6	69520	69525	50 %	50 %	0 %	0 %	28894974
48	NC_004606	CA	3	6	71509	71514	50 %	0 %	0 %	50 %	28894979
49	NC_004606	TC	3	6	82445	82450	0 %	50 %	0 %	50 %	28894983
50	NC_004606	AG	4	8	86840	86847	50 %	0 %	50 %	0 %	28894987
51	NC_004606	AT	3	6	87461	87466	50 %	50 %	0 %	0 %	28894987
52	NC_004606	AC	3	6	89358	89363	50 %	0 %	0 %	50 %	28894988
53	NC_004606	TG	4	8	93334	93341	0 %	50 %	50 %	0 %	28894989
54	NC_004606	AC	3	6	94551	94556	50 %	0 %	0 %	50 %	28894989
55	NC_004606	GC	3	6	95549	95554	0 %	0 %	50 %	50 %	28894989
56	NC_004606	AG	3	6	99775	99780	50 %	0 %	50 %	0 %	28894997
57	NC_004606	AT	3	6	100036	100041	50 %	50 %	0 %	0 %	28894998
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59	NC_004606	CG	3	6	102129	102134	0 %	0 %	50 %	50 %	28894999
60	NC_004606	GT	3	6	104327	104332	0 %	50 %	50 %	0 %	28895002
61	NC_004606	TA	3	6	105267	105272	50 %	50 %	0 %	0 %	28895004
62	NC_004606	TC	3	6	106584	106589	0 %	50 %	0 %	50 %	28895007
63	NC_004606	GA	3	6	106830	106835	50 %	0 %	50 %	0 %	28895007
64	NC_004606	GA	3	6	107266	107271	50 %	0 %	50 %	0 %	28895008
65	NC_004606	AT	3	6	109830	109835	50 %	50 %	0 %	0 %	28895011
66	NC_004606	TA	3	6	110810	110815	50 %	50 %	0 %	0 %	28895011
67	NC_004606	AT	3	6	111740	111745	50 %	50 %	0 %	0 %	28895012
68	NC_004606	AT	3	6	112178	112183	50 %	50 %	0 %	0 %	28895012
69	NC_004606	GA	3	6	112691	112696	50 %	0 %	50 %	0 %	28895012
70	NC_004606	GA	4	8	114506	114513	50 %	0 %	50 %	0 %	28895014
71	NC_004606	CT	3	6	115933	115938	0 %	50 %	0 %	50 %	28895015
72	NC_004606	AG	3	6	116044	116049	50 %	0 %	50 %	0 %	28895015
73	NC_004606	AG	4	8	116432	116439	50 %	0 %	50 %	0 %	28895016
74	NC_004606	TG	3	6	117838	117843	0 %	50 %	50 %	0 %	28895017
75	NC_004606	TA	3	6	119483	119488	50 %	50 %	0 %	0 %	28895018
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79	NC_004606	GA	3	6	123687	123692	50 %	0 %	50 %	0 %	28895021
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81	NC_004606	GT	3	6	127034	127039	0 %	50 %	50 %	0 %	28895024
82	NC_004606	GT	3	6	128777	128782	0 %	50 %	50 %	0 %	28895027
83	NC_004606	TA	3	6	131007	131012	50 %	50 %	0 %	0 %	28895029
84	NC_004606	TA	3	6	131964	131969	50 %	50 %	0 %	0 %	28895029
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86	NC_004606	TA	3	6	137752	137757	50 %	50 %	0 %	0 %	28895035
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91	NC_004606	TG	3	6	142572	142577	0 %	50 %	50 %	0 %	28895039
92	NC_004606	AC	3	6	144634	144639	50 %	0 %	0 %	50 %	28895041
93	NC_004606	CA	3	6	145501	145506	50 %	0 %	0 %	50 %	28895042
94	NC_004606	AG	3	6	147044	147049	50 %	0 %	50 %	0 %	28895043
95	NC_004606	AG	3	6	148741	148746	50 %	0 %	50 %	0 %	28895044
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101	NC_004606	CT	3	6	155291	155296	0 %	50 %	0 %	50 %	28895050
102	NC_004606	CT	3	6	155820	155825	0 %	50 %	0 %	50 %	28895050
103	NC_004606	CA	3	6	157201	157206	50 %	0 %	0 %	50 %	28895052
104	NC_004606	GC	3	6	158246	158251	0 %	0 %	50 %	50 %	28895054
105	NC_004606	TG	3	6	158807	158812	0 %	50 %	50 %	0 %	28895054
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108	NC_004606	AG	3	6	160827	160832	50 %	0 %	50 %	0 %	28895057
109	NC_004606	GC	3	6	164470	164475	0 %	0 %	50 %	50 %	28895059
110	NC_004606	CT	3	6	167384	167389	0 %	50 %	0 %	50 %	28895061
111	NC_004606	GT	3	6	168627	168632	0 %	50 %	50 %	0 %	28895061
112	NC_004606	GA	3	6	169575	169580	50 %	0 %	50 %	0 %	28895062
113	NC_004606	AG	3	6	171272	171277	50 %	0 %	50 %	0 %	28895064
114	NC_004606	TG	3	6	174308	174313	0 %	50 %	50 %	0 %	28895069
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117	NC_004606	TG	3	6	174935	174940	0 %	50 %	50 %	0 %	28895070
118	NC_004606	GA	3	6	176227	176232	50 %	0 %	50 %	0 %	28895071
119	NC_004606	CA	3	6	179723	179728	50 %	0 %	0 %	50 %	28895074
120	NC_004606	AG	3	6	180838	180843	50 %	0 %	50 %	0 %	28895075
121	NC_004606	GT	3	6	183143	183148	0 %	50 %	50 %	0 %	28895077
122	NC_004606	AG	3	6	185316	185321	50 %	0 %	50 %	0 %	28895080
123	NC_004606	AC	3	6	187587	187592	50 %	0 %	0 %	50 %	28895082
124	NC_004606	AT	3	6	187934	187939	50 %	50 %	0 %	0 %	28895083
125	NC_004606	TG	3	6	190158	190163	0 %	50 %	50 %	0 %	28895084
126	NC_004606	GA	3	6	191539	191544	50 %	0 %	50 %	0 %	28895086
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128	NC_004606	GA	3	6	192764	192769	50 %	0 %	50 %	0 %	28895087
129	NC_004606	GC	3	6	192797	192802	0 %	0 %	50 %	50 %	28895087
130	NC_004606	CT	3	6	192936	192941	0 %	50 %	0 %	50 %	28895087
131	NC_004606	AT	3	6	195895	195900	50 %	50 %	0 %	0 %	28895090
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133	NC_004606	CT	3	6	202673	202678	0 %	50 %	0 %	50 %	28895096
134	NC_004606	GA	4	8	204787	204794	50 %	0 %	50 %	0 %	28895099
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136	NC_004606	TA	3	6	205416	205421	50 %	50 %	0 %	0 %	28895099
137	NC_004606	CT	3	6	205544	205549	0 %	50 %	0 %	50 %	28895099
138	NC_004606	CT	4	8	206680	206687	0 %	50 %	0 %	50 %	28895101
139	NC_004606	CA	3	6	207721	207726	50 %	0 %	0 %	50 %	28895102
140	NC_004606	AC	3	6	209435	209440	50 %	0 %	0 %	50 %	28895104
141	NC_004606	GA	3	6	209987	209992	50 %	0 %	50 %	0 %	28895104
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