MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633 chromosome 2

Total Repeats: 68

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004605	TAAAAA	2	12	26912	26923	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004605	ATTAAA	2	12	29324	29335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004605	AAAGCC	2	12	30739	30750	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_004605	TAGCTT	2	12	45715	45726	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_004605	TGAAAT	2	12	137163	137174	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004605	TGCAAA	2	12	145303	145314	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_004605	TATTTT	2	12	224457	224468	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004605	ATAAAT	2	12	265770	265781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004605	ACATAA	2	12	300546	300557	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
10	NC_004605	ATGCCA	2	12	302992	303003	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_004605	TGTTTT	2	12	330657	330668	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004605	TAGATT	2	12	349438	349449	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004605	CTAAAC	2	12	410290	410301	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_004605	TAACAT	2	12	432143	432154	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_004605	TTTTTA	2	12	445278	445289	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004605	TGCATT	2	12	530711	530722	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
17	NC_004605	CGATGA	2	12	654258	654269	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_004605	TTATGA	2	12	693317	693328	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004605	CGAACA	2	12	694430	694441	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_004605	AAAAAC	2	12	697456	697467	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_004605	AAAAAG	2	12	704297	704308	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004605	TACTAT	2	12	741950	741961	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_004605	ACTTAT	2	12	748811	748822	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_004605	TGAGCA	2	12	815067	815078	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_004605	TTCCCT	2	12	870129	870140	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
26	NC_004605	AATTGG	2	12	878068	878079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004605	TATCAT	2	12	926712	926723	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_004605	TTTAGT	2	12	933604	933615	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_004605	TTGACT	2	12	947816	947827	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_004605	TCCCCC	2	12	1040521	1040532	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
31	NC_004605	CTTTTT	2	12	1110457	1110468	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_004605	AAAAAT	2	12	1151574	1151585	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004605	TTAACG	2	12	1187454	1187465	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_004605	ATATGT	2	12	1225233	1225244	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004605	ATTCTC	2	12	1233075	1233086	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_004605	TACTTC	2	12	1255516	1255527	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_004605	ATTTTA	2	12	1280525	1280536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004605	TCGTTA	2	12	1304257	1304268	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_004605	ATGAAT	2	12	1306196	1306207	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004605	GCACTG	2	12	1306223	1306234	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_004605	AGAATA	2	12	1323766	1323777	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004605	GATGAG	2	12	1367925	1367936	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004605	ATTTTC	2	12	1374011	1374022	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_004605	CAGCAC	2	12	1387962	1387973	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_004605	AAACAT	2	12	1395307	1395318	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_004605	AAATAA	2	12	1399790	1399801	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004605	AGAAAT	2	12	1401298	1401309	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004605	CACTTA	2	12	1438044	1438055	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_004605	ATTTCT	2	12	1451630	1451641	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_004605	TCCCCC	2	12	1499321	1499332	0 %	16.67 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
51	NC_004605	GAAAAA	2	12	1535354	1535365	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004605	TATAAA	2	12	1539262	1539273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004605	AAAAAG	2	12	1552997	1553008	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004605	AACGAA	2	12	1574107	1574118	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_004605	TTAAAA	2	12	1612581	1612592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004605	TAAAAC	2	12	1642558	1642569	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_004605	ACAAAA	2	12	1650897	1650908	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_004605	GTTTTT	2	12	1729425	1729436	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004605	AAACTA	2	12	1733143	1733154	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_004605	AAACGA	2	12	1740242	1740253	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_004605	ATTTTA	2	12	1740511	1740522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_004605	ATTTAG	2	12	1741236	1741247	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004605	ACAATA	2	12	1775880	1775891	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_004605	AATTTT	2	12	1845837	1845848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004605	CTTTAT	2	12	1848431	1848442	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_004605	AAACAC	2	12	1848443	1848454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_004605	GATATT	2	12	1862702	1862713	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004605	CAAAAA	2	12	1872677	1872688	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.