MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633 chromosome 2

Total Repeats: 1024

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004605	TCGTG	2	10	4552	4561	0 %	40 %	40 %	20 %	28899858
2	NC_004605	AAGCT	2	10	6939	6948	40 %	20 %	20 %	20 %	28899861
3	NC_004605	ATCCT	2	10	8388	8397	20 %	40 %	0 %	40 %	28899863
4	NC_004605	CGGTG	2	10	9006	9015	0 %	20 %	60 %	20 %	28899864
5	NC_004605	CTTGG	2	10	9826	9835	0 %	40 %	40 %	20 %	28899864
6	NC_004605	TTTGG	2	10	10529	10538	0 %	60 %	40 %	0 %	28899865
7	NC_004605	TCATC	2	10	19437	19446	20 %	40 %	0 %	40 %	28899876
8	NC_004605	AAGGG	2	10	19508	19517	40 %	0 %	60 %	0 %	28899876
9	NC_004605	AGTAA	2	10	19630	19639	60 %	20 %	20 %	0 %	28899876
10	NC_004605	GGCTT	2	10	20160	20169	0 %	40 %	40 %	20 %	28899877
11	NC_004605	AGTTC	2	10	20993	21002	20 %	40 %	20 %	20 %	28899878
12	NC_004605	GCAAC	2	10	21387	21396	40 %	0 %	20 %	40 %	28899879
13	NC_004605	ACAGA	2	10	22204	22213	60 %	0 %	20 %	20 %	28899879
14	NC_004605	TCTTG	2	10	22452	22461	0 %	60 %	20 %	20 %	28899879
15	NC_004605	ATTGG	2	10	23399	23408	20 %	40 %	40 %	0 %	28899881
16	NC_004605	CACGG	2	10	26066	26075	20 %	0 %	40 %	40 %	28899886
17	NC_004605	TGGTG	2	10	30264	30273	0 %	40 %	60 %	0 %	28899890
18	NC_004605	CGCTT	2	10	34529	34538	0 %	40 %	20 %	40 %	28899896
19	NC_004605	CGAAT	2	10	37467	37476	40 %	20 %	20 %	20 %	28899900
20	NC_004605	CAACG	2	10	37577	37586	40 %	0 %	20 %	40 %	28899900
21	NC_004605	CCAAG	2	10	38339	38348	40 %	0 %	20 %	40 %	28899901
22	NC_004605	ATTTG	2	10	38436	38445	20 %	60 %	20 %	0 %	28899901
23	NC_004605	AGAGA	2	10	53000	53009	60 %	0 %	40 %	0 %	28899916
24	NC_004605	AACCA	2	10	54924	54933	60 %	0 %	0 %	40 %	28899917
25	NC_004605	GCACC	2	10	56974	56983	20 %	0 %	20 %	60 %	28899920
26	NC_004605	TTTGG	2	10	61945	61954	0 %	60 %	40 %	0 %	28899925
27	NC_004605	TCGCG	2	10	66364	66373	0 %	20 %	40 %	40 %	28899930
28	NC_004605	TTTGG	2	10	69763	69772	0 %	60 %	40 %	0 %	28899933
29	NC_004605	ACTTA	2	10	70744	70753	40 %	40 %	0 %	20 %	28899935
30	NC_004605	CCAAG	2	10	73236	73245	40 %	0 %	20 %	40 %	28899937
31	NC_004605	ATGAA	2	10	73269	73278	60 %	20 %	20 %	0 %	28899938
32	NC_004605	AGGCA	2	10	73339	73348	40 %	0 %	40 %	20 %	28899938
33	NC_004605	AGTGC	2	10	74330	74339	20 %	20 %	40 %	20 %	28899939
34	NC_004605	ACGGC	2	10	77255	77264	20 %	0 %	40 %	40 %	28899941
35	NC_004605	CGGTG	2	10	78354	78363	0 %	20 %	60 %	20 %	28899941
36	NC_004605	GTGAT	2	10	81013	81022	20 %	40 %	40 %	0 %	28899943
37	NC_004605	AGCAC	2	10	82012	82021	40 %	0 %	20 %	40 %	28899943
38	NC_004605	GCGCA	2	10	82382	82391	20 %	0 %	40 %	40 %	28899944
39	NC_004605	AATTG	2	10	84938	84947	40 %	40 %	20 %	0 %	28899947
40	NC_004605	AACCG	2	10	85253	85262	40 %	0 %	20 %	40 %	28899947
41	NC_004605	CAGAA	2	10	87141	87150	60 %	0 %	20 %	20 %	28899950
42	NC_004605	ATTCC	2	10	94759	94768	20 %	40 %	0 %	40 %	28899957
43	NC_004605	GATTA	2	10	99174	99183	40 %	40 %	20 %	0 %	28899960
44	NC_004605	TTTCA	2	10	102034	102043	20 %	60 %	0 %	20 %	28899963
45	NC_004605	ACTTT	2	10	102932	102941	20 %	60 %	0 %	20 %	28899965
46	NC_004605	CAGCT	2	10	105664	105673	20 %	20 %	20 %	40 %	28899967
47	NC_004605	CGTGC	2	10	114295	114304	0 %	20 %	40 %	40 %	28899976
48	NC_004605	CAAAA	2	10	115345	115354	80 %	0 %	0 %	20 %	28899978
49	NC_004605	AATGG	2	10	120563	120572	40 %	20 %	40 %	0 %	28899983
50	NC_004605	AGTAA	2	10	121424	121433	60 %	20 %	20 %	0 %	28899984
51	NC_004605	CGAAA	2	10	121597	121606	60 %	0 %	20 %	20 %	28899984
52	NC_004605	CTTTG	2	10	123332	123341	0 %	60 %	20 %	20 %	28899986
53	NC_004605	GAGCA	2	10	125358	125367	40 %	0 %	40 %	20 %	28899988
54	NC_004605	CGCTG	2	10	126124	126133	0 %	20 %	40 %	40 %	28899989
55	NC_004605	GTGCT	2	10	126311	126320	0 %	40 %	40 %	20 %	28899990
56	NC_004605	TGGCT	2	10	127043	127052	0 %	40 %	40 %	20 %	28899991
57	NC_004605	GTTGC	2	10	131969	131978	0 %	40 %	40 %	20 %	28899996
58	NC_004605	TTGTT	2	10	132015	132024	0 %	80 %	20 %	0 %	28899996
59	NC_004605	GATGT	2	10	143336	143345	20 %	40 %	40 %	0 %	28900003
60	NC_004605	CCGAG	2	10	144857	144866	20 %	0 %	40 %	40 %	28900004
61	NC_004605	CGGTG	2	10	145462	145471	0 %	20 %	60 %	20 %	28900005
62	NC_004605	CGTAC	2	10	145961	145970	20 %	20 %	20 %	40 %	28900005
63	NC_004605	AGCTA	2	10	154314	154323	40 %	20 %	20 %	20 %	28900014
64	NC_004605	CGCTG	2	10	157391	157400	0 %	20 %	40 %	40 %	28900019
65	NC_004605	TAATT	2	10	158635	158644	40 %	60 %	0 %	0 %	28900020
66	NC_004605	TTTCA	2	10	160685	160694	20 %	60 %	0 %	20 %	28900022
67	NC_004605	GCATC	2	10	166759	166768	20 %	20 %	20 %	40 %	28900025
68	NC_004605	CAAAC	2	10	166823	166832	60 %	0 %	0 %	40 %	28900025
69	NC_004605	GAGGC	2	10	166878	166887	20 %	0 %	60 %	20 %	28900025
70	NC_004605	TGTAT	2	10	168270	168279	20 %	60 %	20 %	0 %	28900026
71	NC_004605	CCACA	2	10	169268	169277	40 %	0 %	0 %	60 %	28900028
72	NC_004605	ATTCA	2	10	172520	172529	40 %	40 %	0 %	20 %	28900032
73	NC_004605	GGTGT	2	10	172657	172666	0 %	40 %	60 %	0 %	28900032
74	NC_004605	CTGGC	2	10	175271	175280	0 %	20 %	40 %	40 %	28900034
75	NC_004605	ACGAA	2	10	175966	175975	60 %	0 %	20 %	20 %	28900034
76	NC_004605	GCCAC	2	10	178430	178439	20 %	0 %	20 %	60 %	28900037
77	NC_004605	TGCAT	2	10	186674	186683	20 %	40 %	20 %	20 %	28900044
78	NC_004605	CGAAG	3	15	187553	187567	40 %	0 %	40 %	20 %	28900044
79	NC_004605	TTGGC	2	10	188233	188242	0 %	40 %	40 %	20 %	28900044
80	NC_004605	TTTGG	2	10	188573	188582	0 %	60 %	40 %	0 %	28900044
81	NC_004605	GTGTG	2	10	188605	188614	0 %	40 %	60 %	0 %	28900044
82	NC_004605	GCGCT	2	10	190202	190211	0 %	20 %	40 %	40 %	28900046
83	NC_004605	TCCAA	2	10	191844	191853	40 %	20 %	0 %	40 %	28900047
84	NC_004605	GATTC	2	10	193844	193853	20 %	40 %	20 %	20 %	28900050
85	NC_004605	TTTGG	2	10	196153	196162	0 %	60 %	40 %	0 %	28900052
86	NC_004605	CCATC	2	10	196353	196362	20 %	20 %	0 %	60 %	28900052
87	NC_004605	CAAGG	2	10	196576	196585	40 %	0 %	40 %	20 %	28900052
88	NC_004605	GCTGC	2	10	198665	198674	0 %	20 %	40 %	40 %	28900054
89	NC_004605	GCCCG	2	10	201216	201225	0 %	0 %	40 %	60 %	28900055
90	NC_004605	GGGTA	2	10	201572	201581	20 %	20 %	60 %	0 %	28900055
91	NC_004605	GCCAT	2	10	201940	201949	20 %	20 %	20 %	40 %	28900055
92	NC_004605	GCAAG	2	10	202907	202916	40 %	0 %	40 %	20 %	28900056
93	NC_004605	CATGC	2	10	205216	205225	20 %	20 %	20 %	40 %	28900058
94	NC_004605	TTACG	2	10	205917	205926	20 %	40 %	20 %	20 %	28900059
95	NC_004605	GCTAA	2	10	209784	209793	40 %	20 %	20 %	20 %	28900063
96	NC_004605	AGTGT	2	10	210888	210897	20 %	40 %	40 %	0 %	28900065
97	NC_004605	AAGTG	2	10	213665	213674	40 %	20 %	40 %	0 %	28900067
98	NC_004605	GAAGA	2	10	213858	213867	60 %	0 %	40 %	0 %	28900067
99	NC_004605	TGAAG	2	10	215081	215090	40 %	20 %	40 %	0 %	28900067
100	NC_004605	GATGC	2	10	216813	216822	20 %	20 %	40 %	20 %	28900067
101	NC_004605	ACAGA	2	10	222005	222014	60 %	0 %	20 %	20 %	28900075
102	NC_004605	TGACC	2	10	222608	222617	20 %	20 %	20 %	40 %	28900076
103	NC_004605	TTGGC	2	10	227981	227990	0 %	40 %	40 %	20 %	28900079
104	NC_004605	CCAAG	2	10	228608	228617	40 %	0 %	20 %	40 %	28900080
105	NC_004605	AGCCA	2	10	229218	229227	40 %	0 %	20 %	40 %	28900080
106	NC_004605	CAAAC	2	10	230199	230208	60 %	0 %	0 %	40 %	28900081
107	NC_004605	GCCGC	2	10	230323	230332	0 %	0 %	40 %	60 %	28900081
108	NC_004605	TTGAT	2	10	230506	230515	20 %	60 %	20 %	0 %	28900081
109	NC_004605	CCAAA	2	10	232030	232039	60 %	0 %	0 %	40 %	28900082
110	NC_004605	TGCTT	2	10	238437	238446	0 %	60 %	20 %	20 %	28900089
111	NC_004605	CATGG	2	10	240436	240445	20 %	20 %	40 %	20 %	28900090
112	NC_004605	CTTTG	2	10	244717	244726	0 %	60 %	20 %	20 %	28900094
113	NC_004605	CTACG	2	10	245731	245740	20 %	20 %	20 %	40 %	28900095
114	NC_004605	TTTGA	2	10	245974	245983	20 %	60 %	20 %	0 %	28900095
115	NC_004605	TGGTG	2	10	246018	246027	0 %	40 %	60 %	0 %	28900095
116	NC_004605	AAAGC	2	10	249809	249818	60 %	0 %	20 %	20 %	28900100
117	NC_004605	AGCAG	2	10	250776	250785	40 %	0 %	40 %	20 %	28900101
118	NC_004605	AGGCA	2	10	251571	251580	40 %	0 %	40 %	20 %	28900101
119	NC_004605	ACATC	2	10	255130	255139	40 %	20 %	0 %	40 %	28900105
120	NC_004605	TGTTT	2	10	255917	255926	0 %	80 %	20 %	0 %	28900106
121	NC_004605	TGACA	2	10	256378	256387	40 %	20 %	20 %	20 %	28900107
122	NC_004605	AGCGC	2	10	257589	257598	20 %	0 %	40 %	40 %	28900108
123	NC_004605	GTTTA	2	10	258104	258113	20 %	60 %	20 %	0 %	28900108
124	NC_004605	CACCT	2	10	258826	258835	20 %	20 %	0 %	60 %	28900109
125	NC_004605	AAAGA	2	10	263994	264003	80 %	0 %	20 %	0 %	28900115
126	NC_004605	ATTTC	2	10	264678	264687	20 %	60 %	0 %	20 %	28900117
127	NC_004605	CTTCA	2	10	266751	266760	20 %	40 %	0 %	40 %	28900121
128	NC_004605	GGGCC	2	10	271125	271134	0 %	0 %	60 %	40 %	28900126
129	NC_004605	AAAGC	2	10	272214	272223	60 %	0 %	20 %	20 %	28900127
130	NC_004605	TGACG	2	10	272535	272544	20 %	20 %	40 %	20 %	28900128
131	NC_004605	ACGCC	2	10	276151	276160	20 %	0 %	20 %	60 %	28900131
132	NC_004605	TCCAA	2	10	277815	277824	40 %	20 %	0 %	40 %	28900131
133	NC_004605	TTATT	2	10	279183	279192	20 %	80 %	0 %	0 %	28900132
134	NC_004605	TCTAA	2	10	284046	284055	40 %	40 %	0 %	20 %	28900137
135	NC_004605	TGTGG	2	10	284381	284390	0 %	40 %	60 %	0 %	28900137
136	NC_004605	ACATT	2	10	284437	284446	40 %	40 %	0 %	20 %	28900137
137	NC_004605	CCGAC	2	10	285428	285437	20 %	0 %	20 %	60 %	28900138
138	NC_004605	TACTG	2	10	286974	286983	20 %	40 %	20 %	20 %	28900142
139	NC_004605	CCAAA	2	10	289347	289356	60 %	0 %	0 %	40 %	28900143
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143	NC_004605	GTTCT	2	10	292700	292709	0 %	60 %	20 %	20 %	28900148
144	NC_004605	GCTAT	2	10	292971	292980	20 %	40 %	20 %	20 %	28900149
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149	NC_004605	CGGTA	2	10	302591	302600	20 %	20 %	40 %	20 %	28900156
150	NC_004605	ACTTG	2	10	302686	302695	20 %	40 %	20 %	20 %	28900156
151	NC_004605	AAAGA	2	10	304096	304105	80 %	0 %	20 %	0 %	28900158
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153	NC_004605	ACAAG	2	10	306796	306805	60 %	0 %	20 %	20 %	28900161
154	NC_004605	AGCGC	2	10	309384	309393	20 %	0 %	40 %	40 %	28900164
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156	NC_004605	TGCTT	2	10	311917	311926	0 %	60 %	20 %	20 %	28900168
157	NC_004605	ACCAA	2	10	312715	312724	60 %	0 %	0 %	40 %	28900169
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161	NC_004605	TCATA	2	10	316209	316218	40 %	40 %	0 %	20 %	28900172
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251	NC_004605	TGATT	2	10	505730	505739	20 %	60 %	20 %	0 %	28900353
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257	NC_004605	GCACC	2	10	511172	511181	20 %	0 %	20 %	60 %	28900359
258	NC_004605	GTTGC	2	10	511765	511774	0 %	40 %	40 %	20 %	28900360
259	NC_004605	CTTTG	2	10	516489	516498	0 %	60 %	20 %	20 %	28900366
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261	NC_004605	GTTTT	2	10	517597	517606	0 %	80 %	20 %	0 %	28900366
262	NC_004605	TTACT	2	10	519382	519391	20 %	60 %	0 %	20 %	28900367
263	NC_004605	GATCC	2	10	522171	522180	20 %	20 %	20 %	40 %	28900371
264	NC_004605	AGCGA	2	10	524173	524182	40 %	0 %	40 %	20 %	28900373
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