MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633 chromosome 2

Total Repeats: 5281

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004605	CAAG	2	8	441	448	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_004605	TTTA	2	8	1077	1084	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004605	ATCG	2	8	2002	2009	25 %	25 %	25 %	25 %	28899856
4	NC_004605	CAAC	2	8	2579	2586	50 %	0 %	0 %	50 %	28899856
5	NC_004605	AAAG	2	8	2750	2757	75 %	0 %	25 %	0 %	28899856
6	NC_004605	TCAA	2	8	2875	2882	50 %	25 %	0 %	25 %	28899856
7	NC_004605	TGAT	2	8	3160	3167	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004605	CATT	2	8	3317	3324	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
9	NC_004605	CATC	2	8	3710	3717	25 %	25 %	0 %	50 %	28899857
10	NC_004605	CGTG	2	8	4085	4092	0 %	25 %	50 %	25 %	28899858
11	NC_004605	TCGC	2	8	4606	4613	0 %	25 %	25 %	50 %	28899858
12	NC_004605	CCAA	2	8	5669	5676	50 %	0 %	0 %	50 %	28899859
13	NC_004605	TGAA	2	8	5760	5767	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004605	GCTG	2	8	6260	6267	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_004605	TGTT	2	8	6318	6325	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004605	TGCT	2	8	6361	6368	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_004605	CAAC	2	8	7450	7457	50 %	0 %	0 %	50 %	28899861
18	NC_004605	CAAA	2	8	7476	7483	75 %	0 %	0 %	25 %	28899861
19	NC_004605	AGAT	2	8	7743	7750	50 %	25 %	25 %	0 %	28899863
20	NC_004605	CTTG	2	8	8289	8296	0 %	50 %	25 %	25 %	28899863
21	NC_004605	ACTG	2	8	8342	8349	25 %	25 %	25 %	25 %	28899863
22	NC_004605	ACTT	2	8	9554	9561	25 %	50 %	0 %	25 %	28899864
23	NC_004605	GATG	2	8	10131	10138	25 %	25 %	50 %	0 %	28899864
24	NC_004605	ATGA	2	8	10168	10175	50 %	25 %	25 %	0 %	28899864
25	NC_004605	TTAA	2	8	12349	12356	50 %	50 %	0 %	0 %	28899867
26	NC_004605	GAAA	2	8	12659	12666	75 %	0 %	25 %	0 %	28899867
27	NC_004605	CTCG	2	8	12979	12986	0 %	25 %	25 %	50 %	28899868
28	NC_004605	TCAA	2	8	13634	13641	50 %	25 %	0 %	25 %	28899869
29	NC_004605	CACT	2	8	13755	13762	25 %	25 %	0 %	50 %	28899869
30	NC_004605	CAAA	2	8	14339	14346	75 %	0 %	0 %	25 %	28899871
31	NC_004605	ACGC	2	8	14473	14480	25 %	0 %	25 %	50 %	28899871
32	NC_004605	CTTG	2	8	14529	14536	0 %	50 %	25 %	25 %	28899872
33	NC_004605	TGAG	2	8	14782	14789	25 %	25 %	50 %	0 %	28899872
34	NC_004605	AACG	2	8	14874	14881	50 %	0 %	25 %	25 %	28899872
35	NC_004605	CGTG	2	8	14912	14919	0 %	25 %	50 %	25 %	28899872
36	NC_004605	AAAC	2	8	15254	15261	75 %	0 %	0 %	25 %	28899872
37	NC_004605	GCGT	2	8	15311	15318	0 %	25 %	50 %	25 %	28899872
38	NC_004605	TCTA	2	8	15322	15329	25 %	50 %	0 %	25 %	28899872
39	NC_004605	TTTG	2	8	15691	15698	0 %	75 %	25 %	0 %	28899872
40	NC_004605	TTGA	2	8	15859	15866	25 %	50 %	25 %	0 %	28899873
41	NC_004605	CAAG	2	8	16347	16354	50 %	0 %	25 %	25 %	28899873
42	NC_004605	ATGG	2	8	16637	16644	25 %	25 %	50 %	0 %	28899874
43	NC_004605	AGCA	2	8	17515	17522	50 %	0 %	25 %	25 %	28899874
44	NC_004605	TTGT	2	8	17972	17979	0 %	75 %	25 %	0 %	28899875
45	NC_004605	TAAT	2	8	18157	18164	50 %	50 %	0 %	0 %	28899875
46	NC_004605	CAGC	2	8	18347	18354	25 %	0 %	25 %	50 %	28899875
47	NC_004605	CAAA	2	8	18446	18453	75 %	0 %	0 %	25 %	28899875
48	NC_004605	TTGA	2	8	18537	18544	25 %	50 %	25 %	0 %	28899875
49	NC_004605	TAAG	2	8	18922	18929	50 %	25 %	25 %	0 %	28899875
50	NC_004605	TGTT	2	8	19661	19668	0 %	75 %	25 %	0 %	28899876
51	NC_004605	GTTT	2	8	19712	19719	0 %	75 %	25 %	0 %	28899876
52	NC_004605	GTTT	2	8	20209	20216	0 %	75 %	25 %	0 %	28899877
53	NC_004605	TACT	2	8	20297	20304	25 %	50 %	0 %	25 %	28899877
54	NC_004605	TGGG	2	8	20349	20356	0 %	25 %	75 %	0 %	28899877
55	NC_004605	TCTA	2	8	20446	20453	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_004605	GGTT	2	8	20850	20857	0 %	50 %	50 %	0 %	28899878
57	NC_004605	ACCA	2	8	21175	21182	50 %	0 %	0 %	50 %	28899879
58	NC_004605	TTGG	2	8	21235	21242	0 %	50 %	50 %	0 %	28899879
59	NC_004605	GCAA	2	8	21620	21627	50 %	0 %	25 %	25 %	28899879
60	NC_004605	GAGC	2	8	22631	22638	25 %	0 %	50 %	25 %	28899879
61	NC_004605	AGGT	2	8	22733	22740	25 %	25 %	50 %	0 %	28899879
62	NC_004605	TATT	2	8	22896	22903	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004605	CAAC	2	8	23136	23143	50 %	0 %	0 %	50 %	28899880
64	NC_004605	ATGG	2	8	23962	23969	25 %	25 %	50 %	0 %	28899881
65	NC_004605	GAAT	2	8	24270	24277	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004605	AGCA	2	8	24616	24623	50 %	0 %	25 %	25 %	28899883
67	NC_004605	GGAA	2	8	25291	25298	50 %	0 %	50 %	0 %	28899884
68	NC_004605	TAAG	2	8	25330	25337	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004605	TGAA	2	8	25584	25591	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004605	GGTT	2	8	25885	25892	0 %	50 %	50 %	0 %	28899886
71	NC_004605	TTTC	2	8	26868	26875	0 %	75 %	0 %	25 %	28899886
72	NC_004605	GGTC	2	8	27369	27376	0 %	25 %	50 %	25 %	28899887
73	NC_004605	TCAC	2	8	27641	27648	25 %	25 %	0 %	50 %	28899887
74	NC_004605	AGAA	2	8	29099	29106	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004605	GTTA	2	8	29607	29614	25 %	50 %	25 %	0 %	28899890
76	NC_004605	AAAG	2	8	30135	30142	75 %	0 %	25 %	0 %	28899890
77	NC_004605	GTTC	2	8	31438	31445	0 %	50 %	25 %	25 %	28899891
78	NC_004605	TGGC	2	8	31481	31488	0 %	25 %	50 %	25 %	28899891
79	NC_004605	ATGA	2	8	32406	32413	50 %	25 %	25 %	0 %	28899893
80	NC_004605	ACTT	2	8	32486	32493	25 %	50 %	0 %	25 %	28899893
81	NC_004605	TCAC	2	8	33404	33411	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
82	NC_004605	TAAT	2	8	33918	33925	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004605	GAAA	2	8	34789	34796	75 %	0 %	25 %	0 %	28899896
84	NC_004605	CTTT	2	8	34920	34927	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
85	NC_004605	TGAT	2	8	35011	35018	25 %	50 %	25 %	0 %	28899897
86	NC_004605	AGCC	2	8	35624	35631	25 %	0 %	25 %	50 %	28899897
87	NC_004605	ATAA	2	8	35813	35820	75 %	25 %	0 %	0 %	28899898
88	NC_004605	CCAT	2	8	35985	35992	25 %	25 %	0 %	50 %	28899898
89	NC_004605	TGTT	2	8	36158	36165	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004605	ATCC	2	8	36881	36888	25 %	25 %	0 %	50 %	28899900
91	NC_004605	CCGA	2	8	36994	37001	25 %	0 %	25 %	50 %	28899900
92	NC_004605	TTGA	2	8	37166	37173	25 %	50 %	25 %	0 %	28899900
93	NC_004605	TTTG	2	8	37587	37594	0 %	75 %	25 %	0 %	28899900
94	NC_004605	AATC	2	8	38231	38238	50 %	25 %	0 %	25 %	28899900
95	NC_004605	CGTG	2	8	38565	38572	0 %	25 %	50 %	25 %	28899901
96	NC_004605	ACTG	2	8	38649	38656	25 %	25 %	25 %	25 %	28899901
97	NC_004605	GTTT	2	8	38783	38790	0 %	75 %	25 %	0 %	28899902
98	NC_004605	TGAG	2	8	38852	38859	25 %	25 %	50 %	0 %	28899903
99	NC_004605	CGAA	2	8	39161	39168	50 %	0 %	25 %	25 %	28899903
100	NC_004605	GCGG	2	8	39385	39392	0 %	0 %	75 %	25 %	28899903
101	NC_004605	CAGA	2	8	40127	40134	50 %	0 %	25 %	25 %	28899904
102	NC_004605	GATG	2	8	40895	40902	25 %	25 %	50 %	0 %	28899905
103	NC_004605	CCAT	2	8	40910	40917	25 %	25 %	0 %	50 %	28899905
104	NC_004605	AAAC	2	8	40962	40969	75 %	0 %	0 %	25 %	28899906
105	NC_004605	AAAG	2	8	41046	41053	75 %	0 %	25 %	0 %	28899906
106	NC_004605	ACAA	2	8	41728	41735	75 %	0 %	0 %	25 %	28899906
107	NC_004605	CCCG	2	8	41814	41821	0 %	0 %	25 %	75 %	28899906
108	NC_004605	GCAA	2	8	41847	41854	50 %	0 %	25 %	25 %	28899906
109	NC_004605	GTGA	2	8	42681	42688	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004605	GTGA	2	8	42724	42731	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_004605	CTGC	2	8	43293	43300	0 %	25 %	25 %	50 %	28899907
112	NC_004605	TAAG	2	8	43534	43541	50 %	25 %	25 %	0 %	28899907
113	NC_004605	ACCA	2	8	43557	43564	50 %	0 %	0 %	50 %	28899907
114	NC_004605	CGAG	2	8	43674	43681	25 %	0 %	50 %	25 %	28899907
115	NC_004605	AACC	2	8	43696	43703	50 %	0 %	0 %	50 %	28899907
116	NC_004605	TTAC	2	8	43826	43833	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_004605	CATG	2	8	43882	43889	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_004605	CATT	2	8	44364	44371	25 %	50 %	0 %	25 %	28899908
119	NC_004605	CTTG	2	8	44642	44649	0 %	50 %	25 %	25 %	28899908
120	NC_004605	TGAG	2	8	44788	44795	25 %	25 %	50 %	0 %	28899909
121	NC_004605	TGGT	2	8	45044	45051	0 %	50 %	50 %	0 %	28899909
122	NC_004605	TTGG	2	8	45228	45235	0 %	50 %	50 %	0 %	28899909
123	NC_004605	ATTG	2	8	45302	45309	25 %	50 %	25 %	0 %	28899909
124	NC_004605	ATCG	2	8	45428	45435	25 %	25 %	25 %	25 %	28899909
125	NC_004605	GAGC	2	8	45456	45463	25 %	0 %	50 %	25 %	28899909
126	NC_004605	TTGA	2	8	45627	45634	25 %	50 %	25 %	0 %	28899909
127	NC_004605	CTTG	2	8	45813	45820	0 %	50 %	25 %	25 %	28899910
128	NC_004605	GTCA	2	8	46290	46297	25 %	25 %	25 %	25 %	28899910
129	NC_004605	GCTT	2	8	46350	46357	0 %	50 %	25 %	25 %	28899910
130	NC_004605	GCCA	2	8	46542	46549	25 %	0 %	25 %	50 %	28899910
131	NC_004605	ATGA	2	8	46777	46784	50 %	25 %	25 %	0 %	28899910
132	NC_004605	GAAC	2	8	47073	47080	50 %	0 %	25 %	25 %	28899910
133	NC_004605	GTAC	2	8	47817	47824	25 %	25 %	25 %	25 %	28899910
134	NC_004605	TAAA	2	8	48479	48486	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_004605	TGGT	2	8	48575	48582	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004605	GAAT	2	8	48770	48777	50 %	25 %	25 %	0 %	28899911
137	NC_004605	AACG	2	8	49083	49090	50 %	0 %	25 %	25 %	28899911
138	NC_004605	ACAA	2	8	49233	49240	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_004605	TGAT	2	8	49305	49312	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004605	AGCG	2	8	50005	50012	25 %	0 %	50 %	25 %	28899913
141	NC_004605	GAGC	2	8	50123	50130	25 %	0 %	50 %	25 %	28899913
142	NC_004605	TAGG	2	8	50841	50848	25 %	25 %	50 %	0 %	28899914
143	NC_004605	GTAG	2	8	51033	51040	25 %	25 %	50 %	0 %	28899914
144	NC_004605	GGAG	2	8	51120	51127	25 %	0 %	75 %	0 %	28899914
145	NC_004605	CAAC	2	8	52015	52022	50 %	0 %	0 %	50 %	28899916
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