MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Bacillus megaterium QM B1551 plasmid pBM400

Total Repeats: 177

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004604	GCTT	2	8	639	646	0 %	50 %	25 %	25 %	294663011
2	NC_004604	ATCA	2	8	1014	1021	50 %	25 %	0 %	25 %	294663012
3	NC_004604	CATC	2	8	1239	1246	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_004604	AGAA	2	8	1336	1343	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004604	AGTT	2	8	1990	1997	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004604	TTAA	2	8	2067	2074	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004604	GAAA	2	8	2209	2216	75 %	0 %	25 %	0 %	28894898
8	NC_004604	AGAA	2	8	2235	2242	75 %	0 %	25 %	0 %	28894898
9	NC_004604	TACT	2	8	2263	2270	25 %	50 %	0 %	25 %	28894898
10	NC_004604	CAAT	2	8	3037	3044	50 %	25 %	0 %	25 %	28894898
11	NC_004604	ACAT	2	8	3093	3100	50 %	25 %	0 %	25 %	28894898
12	NC_004604	TGTT	2	8	3677	3684	0 %	75 %	25 %	0 %	28894901
13	NC_004604	AAAG	2	8	3687	3694	75 %	0 %	25 %	0 %	28894901
14	NC_004604	AGAA	2	8	3929	3936	75 %	0 %	25 %	0 %	28894901
15	NC_004604	GAAA	2	8	3984	3991	75 %	0 %	25 %	0 %	28894901
16	NC_004604	AATG	2	8	5291	5298	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004604	TTAA	2	8	6425	6432	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004604	TTTA	2	8	6801	6808	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004604	TGCC	2	8	6861	6868	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_004604	TAAC	2	8	7018	7025	50 %	25 %	0 %	25 %	28894865
21	NC_004604	TAAT	2	8	7345	7352	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004604	GAAT	2	8	7591	7598	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004604	ATGT	2	8	7629	7636	25 %	50 %	25 %	0 %	294663017
24	NC_004604	GAAG	2	8	7735	7742	50 %	0 %	50 %	0 %	294663017
25	NC_004604	ACGT	2	8	7972	7979	25 %	25 %	25 %	25 %	294663017
26	NC_004604	ATCA	2	8	8153	8160	50 %	25 %	0 %	25 %	294663017
27	NC_004604	TCAT	2	8	8297	8304	25 %	50 %	0 %	25 %	294663017
28	NC_004604	TGGT	2	8	8313	8320	0 %	50 %	50 %	0 %	294663017
29	NC_004604	GAAA	2	8	8889	8896	75 %	0 %	25 %	0 %	294663017
30	NC_004604	CAAG	2	8	8898	8905	50 %	0 %	25 %	25 %	294663017
31	NC_004604	TAAA	2	8	9068	9075	75 %	25 %	0 %	0 %	294663017
32	NC_004604	AAAC	2	8	9119	9126	75 %	0 %	0 %	25 %	294663017
33	NC_004604	AGAA	2	8	9245	9252	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004604	TACT	2	8	10146	10153	25 %	50 %	0 %	25 %	28894862
35	NC_004604	ACTC	2	8	11779	11786	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_004604	ATCT	2	8	12275	12282	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_004604	TTTC	2	8	12602	12609	0 %	75 %	0 %	25 %	28894869
38	NC_004604	TAAA	2	8	12990	12997	75 %	25 %	0 %	0 %	28894869
39	NC_004604	TCTA	2	8	13560	13567	25 %	50 %	0 %	25 %	28894905
40	NC_004604	GTTT	2	8	13654	13661	0 %	75 %	25 %	0 %	28894905
41	NC_004604	GATG	2	8	13800	13807	25 %	25 %	50 %	0 %	28894905
42	NC_004604	TGAA	2	8	14020	14027	50 %	25 %	25 %	0 %	28894905
43	NC_004604	TTTA	2	8	14340	14347	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004604	TAAA	2	8	14619	14626	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004604	TGTT	2	8	14956	14963	0 %	75 %	25 %	0 %	294663019
46	NC_004604	CAAA	2	8	15353	15360	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
47	NC_004604	TATC	2	8	15452	15459	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_004604	AATA	2	8	15516	15523	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004604	AAAG	2	8	15572	15579	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004604	AGCG	2	8	15692	15699	25 %	0 %	50 %	25 %	28894871
51	NC_004604	TCAT	2	8	15901	15908	25 %	50 %	0 %	25 %	28894871
52	NC_004604	TGCG	2	8	16061	16068	0 %	25 %	50 %	25 %	28894871
53	NC_004604	TTTA	2	8	16069	16076	25 %	75 %	0 %	0 %	28894871
54	NC_004604	CTAT	2	8	16306	16313	25 %	50 %	0 %	25 %	28894871
55	NC_004604	TATT	2	8	16568	16575	25 %	75 %	0 %	0 %	28894871
56	NC_004604	AAAC	2	8	16762	16769	75 %	0 %	0 %	25 %	28894871
57	NC_004604	AGAA	2	8	16980	16987	75 %	0 %	25 %	0 %	294663020
58	NC_004604	AATT	2	8	17081	17088	50 %	50 %	0 %	0 %	294663020
59	NC_004604	AGGG	2	8	17258	17265	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004604	AACT	2	8	17477	17484	50 %	25 %	0 %	25 %	294663021
61	NC_004604	CAAG	2	8	18026	18033	50 %	0 %	25 %	25 %	294663022
62	NC_004604	TGGA	2	8	18502	18509	25 %	25 %	50 %	0 %	294663022
63	NC_004604	GTTA	2	8	18824	18831	25 %	50 %	25 %	0 %	294663022
64	NC_004604	AAGC	2	8	19110	19117	50 %	0 %	25 %	25 %	294663022
65	NC_004604	ATGA	2	8	19239	19246	50 %	25 %	25 %	0 %	294663022
66	NC_004604	CAAC	2	8	19261	19268	50 %	0 %	0 %	50 %	294663022
67	NC_004604	AGTT	2	8	19693	19700	25 %	50 %	25 %	0 %	294663022
68	NC_004604	AGGG	2	8	19877	19884	25 %	0 %	75 %	0 %	294663022
69	NC_004604	ATTC	2	8	20485	20492	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_004604	TTTA	2	8	20989	20996	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004604	ACCG	2	8	21066	21073	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_004604	TAAT	2	8	21566	21573	50 %	50 %	0 %	0 %	294663025
73	NC_004604	ATTT	2	8	22072	22079	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004604	TTCG	2	8	22347	22354	0 %	50 %	25 %	25 %	294663026
75	NC_004604	CAAT	2	8	22935	22942	50 %	25 %	0 %	25 %	294663026
76	NC_004604	GAAA	2	8	23003	23010	75 %	0 %	25 %	0 %	294663026
77	NC_004604	ATTT	2	8	23471	23478	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004604	TCAC	2	8	23619	23626	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_004604	CAAA	2	8	23641	23648	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_004604	ATAG	2	8	23983	23990	50 %	25 %	25 %	0 %	294663027
81	NC_004604	TATT	2	8	24208	24215	25 %	75 %	0 %	0 %	294663027
82	NC_004604	TATT	2	8	24357	24364	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_004604	GAAG	2	8	24549	24556	50 %	0 %	50 %	0 %	294663028
84	NC_004604	TAGC	2	8	24994	25001	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
85	NC_004604	GATC	2	8	26006	26013	25 %	25 %	25 %	25 %	294663031
86	NC_004604	TAAA	2	8	26074	26081	75 %	25 %	0 %	0 %	294663031
87	NC_004604	CCTA	2	8	26171	26178	25 %	25 %	0 %	50 %	294663031
88	NC_004604	TCAT	2	8	26203	26210	25 %	50 %	0 %	25 %	294663031
89	NC_004604	GCCA	2	8	26664	26671	25 %	0 %	25 %	50 %	294663031
90	NC_004604	AGGC	2	8	26775	26782	25 %	0 %	50 %	25 %	294663031
91	NC_004604	AAGA	2	8	28336	28343	75 %	0 %	25 %	0 %	28894882
92	NC_004604	ATTT	2	8	28510	28517	25 %	75 %	0 %	0 %	28894882
93	NC_004604	ATGG	2	8	28625	28632	25 %	25 %	50 %	0 %	28894882
94	NC_004604	ATTA	2	8	28997	29004	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_004604	ATTA	2	8	29183	29190	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_004604	TATT	2	8	29291	29298	25 %	75 %	0 %	0 %	294663033
97	NC_004604	TTTA	2	8	29346	29353	25 %	75 %	0 %	0 %	294663033
98	NC_004604	ATGG	2	8	29602	29609	25 %	25 %	50 %	0 %	294663034
99	NC_004604	TATT	2	8	30291	30298	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004604	AGAT	2	8	30413	30420	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
101	NC_004604	GATT	2	8	30857	30864	25 %	50 %	25 %	0 %	294663035
102	NC_004604	AAAT	2	8	31471	31478	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004604	GATG	2	8	31575	31582	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
104	NC_004604	TAAA	2	8	31899	31906	75 %	25 %	0 %	0 %	294663036
105	NC_004604	TATC	2	8	32495	32502	25 %	50 %	0 %	25 %	294663037
106	NC_004604	AATA	2	8	32513	32520	75 %	25 %	0 %	0 %	294663037
107	NC_004604	AATT	2	8	32629	32636	50 %	50 %	0 %	0 %	294663037
108	NC_004604	ATTA	2	8	32795	32802	50 %	50 %	0 %	0 %	294663037
109	NC_004604	AGAA	2	8	33152	33159	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004604	TCCT	2	8	33719	33726	0 %	50 %	0 %	50 %	294663038
111	NC_004604	CTTG	2	8	34240	34247	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_004604	GAAG	2	8	34342	34349	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004604	ACAA	2	8	34513	34520	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
114	NC_004604	AAAT	2	8	34567	34574	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004604	ATTG	2	8	34665	34672	25 %	50 %	25 %	0 %	28894886
116	NC_004604	AACG	2	8	34875	34882	50 %	0 %	25 %	25 %	28894886
117	NC_004604	AACA	2	8	35221	35228	75 %	0 %	0 %	25 %	28894886
118	NC_004604	CTTA	2	8	35533	35540	25 %	50 %	0 %	25 %	28894886
119	NC_004604	TTAT	2	8	35655	35662	25 %	75 %	0 %	0 %	28894886
120	NC_004604	TAAA	2	8	36254	36261	75 %	25 %	0 %	0 %	28894886
121	NC_004604	TGCC	2	8	36349	36356	0 %	25 %	25 %	50 %	294663039
122	NC_004604	AAAT	2	8	36740	36747	75 %	25 %	0 %	0 %	294663040
123	NC_004604	CGTT	2	8	36852	36859	0 %	50 %	25 %	25 %	294663040
124	NC_004604	CAAA	2	8	37096	37103	75 %	0 %	0 %	25 %	294663040
125	NC_004604	ATTT	2	8	37137	37144	25 %	75 %	0 %	0 %	294663040
126	NC_004604	TTAT	2	8	37215	37222	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_004604	CTAT	2	8	37508	37515	25 %	50 %	0 %	25 %	294663041
128	NC_004604	TTAT	2	8	37927	37934	25 %	75 %	0 %	0 %	28894907
129	NC_004604	TTAT	2	8	38911	38918	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004604	AAAG	2	8	39101	39108	75 %	0 %	25 %	0 %	294663043
131	NC_004604	AATT	2	8	39312	39319	50 %	50 %	0 %	0 %	294663044
132	NC_004604	TGTT	2	8	39871	39878	0 %	75 %	25 %	0 %	294663045
133	NC_004604	AAAT	2	8	39890	39897	75 %	25 %	0 %	0 %	294663045
134	NC_004604	TCTT	2	8	40129	40136	0 %	75 %	0 %	25 %	294663045
135	NC_004604	CTTT	2	8	40288	40295	0 %	75 %	0 %	25 %	294663045
136	NC_004604	TGCA	2	8	40365	40372	25 %	25 %	25 %	25 %	294663045
137	NC_004604	GAAT	2	8	40587	40594	50 %	25 %	25 %	0 %	294663045
138	NC_004604	GTTG	2	8	40623	40630	0 %	50 %	50 %	0 %	294663045
139	NC_004604	TTAT	2	8	40795	40802	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004604	TTTA	2	8	40834	40841	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_004604	CATA	2	8	41105	41112	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
142	NC_004604	TTCC	2	8	41131	41138	0 %	50 %	0 %	50 %	294663047
143	NC_004604	GTTC	2	8	41333	41340	0 %	50 %	25 %	25 %	294663047
144	NC_004604	GATG	2	8	41486	41493	25 %	25 %	50 %	0 %	294663047
145	NC_004604	TTTC	2	8	41509	41516	0 %	75 %	0 %	25 %	294663047
146	NC_004604	TTTC	2	8	42149	42156	0 %	75 %	0 %	25 %	294663047
147	NC_004604	TATG	2	8	42362	42369	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_004604	ATTA	2	8	42444	42451	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_004604	ATTT	2	8	42477	42484	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_004604	ACTT	2	8	42535	42542	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
151	NC_004604	AGTT	2	8	42634	42641	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_004604	TGAT	2	8	42745	42752	25 %	50 %	25 %	0 %	294663048
153	NC_004604	AAAG	2	8	43178	43185	75 %	0 %	25 %	0 %	294663048
154	NC_004604	AATT	2	8	43276	43283	50 %	50 %	0 %	0 %	294663048
155	NC_004604	ATTT	2	8	43405	43412	25 %	75 %	0 %	0 %	294663048
156	NC_004604	TTGA	2	8	43473	43480	25 %	50 %	25 %	0 %	294663048
157	NC_004604	GTTT	2	8	44935	44942	0 %	75 %	25 %	0 %	28894894
158	NC_004604	AAAC	2	8	45191	45198	75 %	0 %	0 %	25 %	28894894
159	NC_004604	AAGA	2	8	45271	45278	75 %	0 %	25 %	0 %	28894894
160	NC_004604	AACC	2	8	45527	45534	50 %	0 %	0 %	50 %	28894894
161	NC_004604	CAGG	2	8	46517	46524	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
162	NC_004604	AGGC	2	8	46714	46721	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
163	NC_004604	TCGA	2	8	48007	48014	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
164	NC_004604	TCAG	2	8	48021	48028	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
165	NC_004604	CCTA	2	8	48769	48776	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
166	NC_004604	CGTG	2	8	50141	50148	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
167	NC_004604	TCGC	2	8	50674	50681	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
168	NC_004604	TTAT	2	8	50964	50971	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_004604	ACGT	2	8	51131	51138	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
170	NC_004604	CCAT	2	8	51452	51459	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
171	NC_004604	CAGG	2	8	52571	52578	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
172	NC_004604	AAGC	2	8	52620	52627	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
173	NC_004604	TACT	2	8	52909	52916	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
174	NC_004604	TATT	2	8	52948	52955	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_004604	TAAA	2	8	53041	53048	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_004604	GCGT	2	8	53049	53056	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
177	NC_004604	ATGT	2	8	53228	53235	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.