MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Bacillus megaterium QM B1551 plasmid pBM400

Total Repeats: 122

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004604	AG	3	6	120	125	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004604	CT	3	6	217	222	0 %	50 %	0 %	50 %	294663010
3	NC_004604	CT	3	6	249	254	0 %	50 %	0 %	50 %	294663010
4	NC_004604	CA	3	6	859	864	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_004604	TC	3	6	895	900	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_004604	CA	3	6	1050	1055	50 %	0 %	0 %	50 %	294663012
7	NC_004604	TA	3	6	1261	1266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004604	AC	3	6	1690	1695	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_004604	AT	3	6	1814	1819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004604	AT	3	6	3505	3510	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004604	CT	3	6	4295	4300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_004604	AT	3	6	4324	4329	50 %	50 %	0 %	0 %	294663014
13	NC_004604	TA	3	6	4490	4495	50 %	50 %	0 %	0 %	294663014
14	NC_004604	AG	3	6	4535	4540	50 %	0 %	50 %	0 %	294663014
15	NC_004604	AT	3	6	5224	5229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_004604	GC	3	6	5401	5406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_004604	TA	3	6	5468	5473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004604	TA	3	6	5523	5528	50 %	50 %	0 %	0 %	28894864
19	NC_004604	AG	4	8	5681	5688	50 %	0 %	50 %	0 %	28894864
20	NC_004604	AT	3	6	6764	6769	50 %	50 %	0 %	0 %	294663015
21	NC_004604	TA	3	6	6937	6942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004604	AT	3	6	6946	6951	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004604	GA	3	6	7156	7161	50 %	0 %	50 %	0 %	28894865
24	NC_004604	AT	3	6	7379	7384	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_004604	AT	3	6	7614	7619	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004604	GT	3	6	8346	8351	0 %	50 %	50 %	0 %	294663017
27	NC_004604	GA	4	8	8548	8555	50 %	0 %	50 %	0 %	294663017
28	NC_004604	TC	3	6	8953	8958	0 %	50 %	0 %	50 %	294663017
29	NC_004604	AT	3	6	10811	10816	50 %	50 %	0 %	0 %	28894862
30	NC_004604	GT	3	6	11321	11326	0 %	50 %	50 %	0 %	28894867
31	NC_004604	AG	3	6	11863	11868	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004604	AT	3	6	11935	11940	50 %	50 %	0 %	0 %	294663018
33	NC_004604	AT	3	6	12287	12292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004604	TG	3	6	12759	12764	0 %	50 %	50 %	0 %	28894869
35	NC_004604	GT	3	6	12937	12942	0 %	50 %	50 %	0 %	28894869
36	NC_004604	AT	3	6	13146	13151	50 %	50 %	0 %	0 %	28894869
37	NC_004604	TA	3	6	13220	13225	50 %	50 %	0 %	0 %	28894869
38	NC_004604	TA	3	6	13992	13997	50 %	50 %	0 %	0 %	28894905
39	NC_004604	AT	5	10	14411	14420	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004604	TA	3	6	14749	14754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004604	AT	3	6	14924	14929	50 %	50 %	0 %	0 %	294663019
42	NC_004604	AG	3	6	15274	15279	50 %	0 %	50 %	0 %	294663019
43	NC_004604	CA	3	6	15789	15794	50 %	0 %	0 %	50 %	28894871
44	NC_004604	AT	3	6	16085	16090	50 %	50 %	0 %	0 %	28894871
45	NC_004604	AT	3	6	16894	16899	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004604	AT	3	6	17227	17232	50 %	50 %	0 %	0 %	294663020
47	NC_004604	AC	3	6	17618	17623	50 %	0 %	0 %	50 %	294663021
48	NC_004604	TC	3	6	17832	17837	0 %	50 %	0 %	50 %	294663022
49	NC_004604	TA	3	6	17856	17861	50 %	50 %	0 %	0 %	294663022
50	NC_004604	CT	4	8	17974	17981	0 %	50 %	0 %	50 %	294663022
51	NC_004604	CT	3	6	18666	18671	0 %	50 %	0 %	50 %	294663022
52	NC_004604	GC	3	6	18707	18712	0 %	0 %	50 %	50 %	294663022
53	NC_004604	AG	3	6	19449	19454	50 %	0 %	50 %	0 %	294663022
54	NC_004604	GA	3	6	19956	19961	50 %	0 %	50 %	0 %	294663023
55	NC_004604	TA	3	6	20098	20103	50 %	50 %	0 %	0 %	294663023
56	NC_004604	GA	3	6	20785	20790	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004604	AT	3	6	21256	21261	50 %	50 %	0 %	0 %	294663024
58	NC_004604	CT	3	6	22977	22982	0 %	50 %	0 %	50 %	294663026
59	NC_004604	CT	3	6	23850	23855	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
60	NC_004604	TC	4	8	24125	24132	0 %	50 %	0 %	50 %	294663027
61	NC_004604	GA	3	6	24199	24204	50 %	0 %	50 %	0 %	294663027
62	NC_004604	CA	3	6	26555	26560	50 %	0 %	0 %	50 %	294663031
63	NC_004604	AG	3	6	26626	26631	50 %	0 %	50 %	0 %	294663031
64	NC_004604	CA	4	8	27897	27904	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_004604	GA	3	6	27909	27914	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004604	GA	3	6	27970	27975	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_004604	TA	3	6	28163	28168	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004604	TA	3	6	28193	28198	50 %	50 %	0 %	0 %	28894882
69	NC_004604	AG	3	6	28267	28272	50 %	0 %	50 %	0 %	28894882
70	NC_004604	CT	3	6	28565	28570	0 %	50 %	0 %	50 %	28894882
71	NC_004604	GA	3	6	29498	29503	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004604	CT	3	6	30184	30189	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_004604	AT	3	6	30609	30614	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004604	GA	3	6	31245	31250	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004604	AT	4	8	31558	31565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004604	AG	4	8	32209	32216	50 %	0 %	50 %	0 %	294663037
77	NC_004604	AC	3	6	33049	33054	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_004604	AT	3	6	33186	33191	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004604	TA	3	6	33309	33314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_004604	TA	4	8	33731	33738	50 %	50 %	0 %	0 %	294663038
81	NC_004604	CT	3	6	34619	34624	0 %	50 %	0 %	50 %	28894886
82	NC_004604	CA	3	6	35102	35107	50 %	0 %	0 %	50 %	28894886
83	NC_004604	AG	3	6	36060	36065	50 %	0 %	50 %	0 %	28894886
84	NC_004604	GA	3	6	36181	36186	50 %	0 %	50 %	0 %	28894886
85	NC_004604	GA	3	6	36605	36610	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_004604	TC	3	6	38048	38053	0 %	50 %	0 %	50 %	28894907
87	NC_004604	TA	3	6	38834	38839	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004604	TA	3	6	38886	38891	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_004604	GT	3	6	39029	39034	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_004604	TA	4	8	40814	40821	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_004604	TC	3	6	42220	42225	0 %	50 %	0 %	50 %	294663047
92	NC_004604	AT	3	6	42255	42260	50 %	50 %	0 %	0 %	294663047
93	NC_004604	TA	3	6	42514	42519	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_004604	AT	3	6	42827	42832	50 %	50 %	0 %	0 %	294663048
95	NC_004604	AT	3	6	42976	42981	50 %	50 %	0 %	0 %	294663048
96	NC_004604	AT	3	6	44051	44056	50 %	50 %	0 %	0 %	294663049
97	NC_004604	TA	3	6	44243	44248	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004604	TA	3	6	45456	45461	50 %	50 %	0 %	0 %	28894894
99	NC_004604	AT	4	8	45822	45829	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_004604	AC	3	6	46006	46011	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_004604	GC	3	6	46835	46840	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
102	NC_004604	TG	3	6	46979	46984	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004604	CT	3	6	47364	47369	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_004604	TA	3	6	47710	47715	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_004604	CT	3	6	47943	47948	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_004604	CA	3	6	48163	48168	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_004604	GT	3	6	48214	48219	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004604	TC	3	6	48889	48894	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_004604	CT	3	6	49146	49151	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_004604	TC	3	6	49227	49232	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_004604	TC	3	6	49247	49252	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_004604	GA	3	6	50070	50075	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_004604	GA	3	6	51094	51099	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_004604	GT	3	6	51299	51304	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_004604	GT	3	6	51468	51473	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_004604	GC	4	8	52118	52125	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_004604	GT	3	6	52875	52880	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004604	TA	3	6	53010	53015	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_004604	TA	3	6	53114	53119	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004604	TA	3	6	53278	53283	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_004604	TC	5	10	53809	53818	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_004604	CT	4	8	53824	53831	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.