MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633 chromosome 1

Total Repeats: 1039

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004603	CTTTCT	2	12	2772	2783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28896777
2	NC_004603	TGAAGT	2	12	9521	9532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28896786
3	NC_004603	ATGCCA	2	12	10174	10185	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	28896786
4	NC_004603	TCGTAA	2	12	12660	12671	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	28896788
5	NC_004603	CATTGG	2	12	13028	13039	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	28896788
6	NC_004603	TGCTTT	2	12	13953	13964	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	28896789
7	NC_004603	GCTGCG	2	12	17387	17398	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	28896794
8	NC_004603	CCATTA	2	12	19466	19477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28896795
9	NC_004603	TTCGCT	2	12	19918	19929	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	28896795
10	NC_004603	CGATAC	2	12	42327	42338	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	28896812
11	NC_004603	GATCTT	2	12	43153	43164	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	28896812
12	NC_004603	GCTTCA	2	12	45952	45963	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	28896813
13	NC_004603	ACACCA	2	12	47807	47818	50 %	0 %	0 %	50 %	28896815
14	NC_004603	TCAGCG	2	12	53589	53600	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	28896821
15	NC_004603	TTTCCT	2	12	56574	56585	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28896823
16	NC_004603	TGGCGA	2	12	56833	56844	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	28896824
17	NC_004603	GCCAAA	2	12	58110	58121	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	28896826
18	NC_004603	TTCGAT	2	12	60302	60313	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	28896827
19	NC_004603	GTCTTT	2	12	60506	60517	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	28896827
20	NC_004603	TACGCG	2	12	62480	62491	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	28896828
21	NC_004603	TGGTGA	2	12	64592	64603	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	28896830
22	NC_004603	GAGTTG	2	12	83906	83917	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	28896846
23	NC_004603	ATCACC	2	12	89275	89286	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	28896852
24	NC_004603	GTTTTG	2	12	91149	91160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28896854
25	NC_004603	GGAAGA	2	12	94001	94012	50 %	0 %	50 %	0 %	28896858
26	NC_004603	ATCTTT	2	12	94427	94438	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	28896859
27	NC_004603	TGACGT	2	12	98706	98717	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	28896865
28	NC_004603	TGTCGT	2	12	99744	99755	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	28896866
29	NC_004603	TTTGCT	2	12	101679	101690	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	28896866
30	NC_004603	GATAGA	2	12	102493	102504	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	28896867
31	NC_004603	GACAAA	2	12	105386	105397	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	28896869
32	NC_004603	GCTACC	2	12	105555	105566	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	28896869
33	NC_004603	CTTGAA	2	12	105994	106005	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	28896870
34	NC_004603	TTGGCG	2	12	107848	107859	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	28896871
35	NC_004603	TGAGTG	2	12	110755	110766	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	28896877
36	NC_004603	GGTAAA	2	12	114584	114595	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	28896881
37	NC_004603	CTCGAA	2	12	119520	119531	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	28896886
38	NC_004603	TTCGTA	2	12	122388	122399	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	28896890
39	NC_004603	CGATAC	2	12	122537	122548	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	28896890
40	NC_004603	CAATGC	2	12	123716	123727	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	28896891
41	NC_004603	TCAAAC	2	12	125044	125055	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	28896891
42	NC_004603	CAGTTG	2	12	128888	128899	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	28896894
43	NC_004603	CTGGTG	2	12	129097	129108	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	28896894
44	NC_004603	TTCTGG	2	12	132806	132817	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	28896896
45	NC_004603	ATCCGT	2	12	133182	133193	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	28896896
46	NC_004603	GCTGAT	2	12	134917	134928	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	28896899
47	NC_004603	TTGGAT	2	12	138558	138569	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	28896902
48	NC_004603	AGAATT	2	12	138958	138969	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	28896902
49	NC_004603	TGTTGG	2	12	139596	139607	0 %	50 %	50 %	0 %	28896903
50	NC_004603	TTGAAG	2	12	150473	150484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28896913
51	NC_004603	GTGTTG	2	12	150724	150735	0 %	50 %	50 %	0 %	28896914
52	NC_004603	GCAATG	2	12	154627	154638	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	28896918
53	NC_004603	AACCAA	2	12	155431	155442	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28896919
54	NC_004603	GTAATA	2	12	156526	156537	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	28896920
55	NC_004603	TCACTT	2	12	159150	159161	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	28896924
56	NC_004603	TTTTCG	2	12	162856	162867	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	28896925
57	NC_004603	TTGAGA	2	12	166470	166481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28896929
58	NC_004603	GTACTG	2	12	185463	185474	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	28896945
59	NC_004603	CGTCCT	2	12	186140	186151	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	28896946
60	NC_004603	AGCTGA	2	12	186912	186923	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	28896946
61	NC_004603	ACATGG	2	12	187116	187127	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	28896946
62	NC_004603	CAGCGT	2	12	188788	188799	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	28896948
63	NC_004603	AAAGGC	2	12	192139	192150	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	28896952
64	NC_004603	CCGTCG	2	12	200350	200361	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	28896962
65	NC_004603	TTGCGG	2	12	203620	203631	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	28896966
66	NC_004603	GGTGCT	2	12	212458	212469	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	28896975
67	NC_004603	AGCCAT	2	12	216523	216534	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	28896979
68	NC_004603	AGTCGT	2	12	224505	224516	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	28896987
69	NC_004603	TGTTTC	2	12	225234	225245	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	28896988
70	NC_004603	GTAGAA	3	18	229467	229484	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	28896992
71	NC_004603	GTTGAA	2	12	229491	229502	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28896992
72	NC_004603	CTACTG	2	12	229552	229563	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	28896992
73	NC_004603	TGCAGA	2	12	229577	229588	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	28896992
74	NC_004603	CAAATG	2	12	230999	231010	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	28896994
75	NC_004603	GTTTGG	2	12	232551	232562	0 %	50 %	50 %	0 %	28896994
76	NC_004603	AAGTTC	2	12	233283	233294	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	28896994
77	NC_004603	CTGAGT	2	12	237617	237628	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	28896998
78	NC_004603	ATATTG	2	12	237834	237845	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	28896998
79	NC_004603	TTTATC	2	12	238355	238366	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	28896999
80	NC_004603	AAAAAG	2	12	241497	241508	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	28897002
81	NC_004603	ATTTTT	2	12	242020	242031	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	28897002
82	NC_004603	TGCTTC	2	12	246469	246480	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	28897008
83	NC_004603	GAAACT	2	12	251384	251395	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	28897011
84	NC_004603	GACTTT	2	12	256433	256444	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	28897017
85	NC_004603	TTCACC	2	12	257574	257585	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	28897018
86	NC_004603	AGAAGC	2	12	258206	258217	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	28897020
87	NC_004603	TACCGC	2	12	259374	259385	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	28897022
88	NC_004603	ATCTTC	2	12	260155	260166	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	28897023
89	NC_004603	CGTATC	2	12	267457	267468	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	28897030
90	NC_004603	TCGCGC	2	12	268612	268623	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	28897032
91	NC_004603	TGAAGT	2	12	269169	269180	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28897033
92	NC_004603	AAAGGT	2	12	275043	275054	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	28897046
93	NC_004603	CGTGGT	2	12	280148	280159	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	28897056
94	NC_004603	CAAAAG	2	12	280838	280849	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	28897057
95	NC_004603	ACTTCT	2	12	282904	282915	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	28897060
96	NC_004603	GATATT	2	12	290781	290792	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	28897067
97	NC_004603	TGCCGC	2	12	293327	293338	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	28897069
98	NC_004603	GGCGCG	2	12	296301	296312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28897074
99	NC_004603	TCGTGA	2	12	298319	298330	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	28897076
100	NC_004603	CACCTT	2	12	299714	299725	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	28897078
101	NC_004603	ACCTGA	2	12	304170	304181	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	28897082
102	NC_004603	CAGCTT	2	12	305233	305244	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	28897082
103	NC_004603	ACATCA	2	12	305937	305948	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	28897082
104	NC_004603	AATTTG	2	12	306615	306626	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	28897082
105	NC_004603	TTACAT	2	12	309241	309252	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	28897087
106	NC_004603	TCGTCT	2	12	311996	312007	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	28897090
107	NC_004603	AAGTTG	2	12	312529	312540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28897090
108	NC_004603	TTTGAT	2	12	313509	313520	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	28897091
109	NC_004603	CAGTAT	2	12	314106	314117	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	28897091
110	NC_004603	ACCGAT	2	12	316690	316701	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	28897094
111	NC_004603	CTGCGC	2	12	319446	319457	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	28897096
112	NC_004603	CCATTT	2	12	320190	320201	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	161511062
113	NC_004603	GCCCTT	2	12	320786	320797	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	28897099
114	NC_004603	ATTCTG	2	12	322129	322140	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	28897101
115	NC_004603	GATGAC	2	12	325209	325220	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	28897104
116	NC_004603	TAGCGA	2	12	327605	327616	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	28897108
117	NC_004603	CTTTTT	2	12	329672	329683	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	28897111
118	NC_004603	CACTTC	2	12	333350	333361	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	28897113
119	NC_004603	TTGATG	2	12	336962	336973	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	28897117
120	NC_004603	TACCGA	2	12	337811	337822	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	28897117
121	NC_004603	TCACCT	2	12	339689	339700	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	28897119
122	NC_004603	GTTCTT	2	12	340132	340143	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	28897119
123	NC_004603	GCACGT	2	12	343164	343175	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	28897123
124	NC_004603	ATTGAT	2	12	349192	349203	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	28897126
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126	NC_004603	CTTTGT	2	12	354508	354519	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	28897130
127	NC_004603	GCTTTT	2	12	361200	361211	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	28897137
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129	NC_004603	ATCTTG	2	12	372244	372255	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	28897144
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137	NC_004603	GTACAC	2	12	413705	413716	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	28897188
138	NC_004603	ATACCG	2	12	418218	418229	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	28897192
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145	NC_004603	GTCGCC	2	12	443616	443627	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	28897215
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159	NC_004603	TTGCTT	2	12	466445	466456	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	28897237
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219	NC_004603	TGCTGG	2	12	667764	667775	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	28897410
220	NC_004603	AATACA	2	12	667870	667881	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	28897410
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222	NC_004603	GTCGAA	2	12	672583	672594	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	28897417
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228	NC_004603	GGCGAA	2	12	686679	686690	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	28897428
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230	NC_004603	TGCTGT	2	12	687294	687305	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	28897430
231	NC_004603	AGCGTG	2	12	697200	697211	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	28897440
232	NC_004603	TCAATG	2	12	697829	697840	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	28897440
233	NC_004603	GAAGCT	2	12	699955	699966	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	28897441
234	NC_004603	CCATGT	2	12	702859	702870	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	28897445
235	NC_004603	AGCAAA	2	12	710870	710881	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	28897451
236	NC_004603	AAAGCG	2	12	711243	711254	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	28897451
237	NC_004603	GCACCA	2	12	718226	718237	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	28897460
238	NC_004603	TACCAC	2	12	718485	718496	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	28897460
239	NC_004603	GTTGTA	2	12	729064	729075	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	28897470
240	NC_004603	ATCGGC	2	12	730786	730797	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	28897472
241	NC_004603	AAACCT	2	12	741619	741630	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	28897482
242	NC_004603	TTACCT	2	12	743834	743845	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	28897484
243	NC_004603	CATTAA	2	12	744433	744444	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	28897484
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245	NC_004603	CTTCTG	2	12	752103	752114	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	28897490
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247	NC_004603	TACGCT	2	12	758440	758451	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	28897496
248	NC_004603	TTAGAC	2	12	762182	762193	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	28897501
249	NC_004603	TTCTCG	2	12	762314	762325	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	28897501
250	NC_004603	TTCAGC	2	12	763168	763179	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	28897501
251	NC_004603	ACTTCA	2	12	765466	765477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28897503
252	NC_004603	CAACCA	2	12	765840	765851	50 %	0 %	0 %	50 %	28897503
253	NC_004603	CACGCA	2	12	766997	767008	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	28897504
254	NC_004603	TACCTG	2	12	768449	768460	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	28897506
255	NC_004603	TTTTCG	2	12	775562	775573	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	161511060
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258	NC_004603	GAAAAA	2	12	786680	786691	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	28897523
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260	NC_004603	GAAGCG	2	12	792737	792748	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	28897529
261	NC_004603	TCGCTT	2	12	794452	794463	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	28897530
262	NC_004603	GGCAAT	2	12	796204	796215	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	28897532
263	NC_004603	TTAGCT	2	12	797231	797242	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	28897532
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270	NC_004603	TCTGGT	2	12	815805	815816	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	28897555
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284	NC_004603	GCATTG	2	12	859417	859428	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	28897602
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322	NC_004603	GCAGTT	2	12	1000006	1000017	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	28897733
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326	NC_004603	GTTCAG	2	12	1026444	1026455	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	28897756
327	NC_004603	GTAGAG	2	12	1040738	1040749	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	28897769
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329	NC_004603	CGATTC	2	12	1049521	1049532	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	28897776
330	NC_004603	CCGATA	2	12	1050569	1050580	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	28897777
331	NC_004603	CCAACA	2	12	1052608	1052619	50 %	0 %	0 %	50 %	28897780
332	NC_004603	CGACCA	2	12	1056076	1056087	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	28897782
333	NC_004603	TTGGCT	5	30	1057806	1057835	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	28897784
334	NC_004603	TTGAAT	2	12	1064141	1064152	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	28897788
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337	NC_004603	TCTTTA	2	12	1079079	1079090	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	28897804
338	NC_004603	GGTGAA	2	12	1083997	1084008	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	28897809
339	NC_004603	TGCAGA	2	12	1084806	1084817	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	28897809
340	NC_004603	GAGCTT	2	12	1085309	1085320	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	28897810
341	NC_004603	AGCATG	2	12	1085878	1085889	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	28897810
342	NC_004603	ACACGT	2	12	1090260	1090271	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	28897811
343	NC_004603	GAGAGT	2	12	1114010	1114021	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	28897838
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345	NC_004603	TTTGGT	2	12	1115760	1115771	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28897841
346	NC_004603	TGGCCT	2	12	1119233	1119244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28897843
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457	NC_004603	AAAGTG	2	12	1489597	1489608	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	28898164
458	NC_004603	CTTTGT	2	12	1491972	1491983	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	28898165
459	NC_004603	TTTGTA	2	12	1492534	1492545	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	28898165
460	NC_004603	ACGAAG	2	12	1497565	1497576	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	28898168
461	NC_004603	CGTTAC	2	12	1498244	1498255	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	28898168
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464	NC_004603	GTCGAT	2	12	1505398	1505409	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	28898175
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