MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633 chromosome 1

Total Repeats: 2249

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004603	GAAGA	2	10	929	938	60 %	0 %	40 %	0 %	28896776
2	NC_004603	AAATC	2	10	6376	6385	60 %	20 %	0 %	20 %	28896781
3	NC_004603	AGAAA	2	10	6410	6419	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004603	CCAAA	2	10	12357	12366	60 %	0 %	0 %	40 %	28896788
5	NC_004603	AAGCG	2	10	12450	12459	40 %	0 %	40 %	20 %	28896788
6	NC_004603	TATGT	2	10	14520	14529	20 %	60 %	20 %	0 %	28896790
7	NC_004603	GTTGG	2	10	16274	16283	0 %	40 %	60 %	0 %	28896793
8	NC_004603	TCGGA	2	10	17275	17284	20 %	20 %	40 %	20 %	28896794
9	NC_004603	TCGAA	2	10	17563	17572	40 %	20 %	20 %	20 %	28896794
10	NC_004603	CGTTG	2	10	18551	18560	0 %	40 %	40 %	20 %	28896794
11	NC_004603	AATAA	2	10	22462	22471	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004603	TTTGG	2	10	23662	23671	0 %	60 %	40 %	0 %	28896798
13	NC_004603	CCCAA	2	10	24833	24842	40 %	0 %	0 %	60 %	28896801
14	NC_004603	GTGTT	2	10	25158	25167	0 %	60 %	40 %	0 %	28896801
15	NC_004603	CGCAA	2	10	25297	25306	40 %	0 %	20 %	40 %	28896801
16	NC_004603	AGCTC	2	10	30191	30200	20 %	20 %	20 %	40 %	28896804
17	NC_004603	CACTT	2	10	32518	32527	20 %	40 %	0 %	40 %	28896806
18	NC_004603	GTAGT	2	10	34094	34103	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004603	TAAAG	2	10	35231	35240	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004603	GAATG	2	10	39372	39381	40 %	20 %	40 %	0 %	28896808
21	NC_004603	CCAAG	2	10	42589	42598	40 %	0 %	20 %	40 %	28896812
22	NC_004603	TCGTT	2	10	46157	46166	0 %	60 %	20 %	20 %	28896813
23	NC_004603	TTGGT	2	10	46182	46191	0 %	60 %	40 %	0 %	28896813
24	NC_004603	TTTTG	2	10	47650	47659	0 %	80 %	20 %	0 %	28896815
25	NC_004603	CGTGG	2	10	47900	47909	0 %	20 %	60 %	20 %	28896815
26	NC_004603	ATAAA	2	10	50766	50775	80 %	20 %	0 %	0 %	28896817
27	NC_004603	TGAAC	2	10	53721	53730	40 %	20 %	20 %	20 %	28896821
28	NC_004603	CTCAG	2	10	55658	55667	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
29	NC_004603	CCAAA	2	10	58342	58351	60 %	0 %	0 %	40 %	28896826
30	NC_004603	ATGTG	2	10	58831	58840	20 %	40 %	40 %	0 %	28896826
31	NC_004603	TCATC	2	10	59800	59809	20 %	40 %	0 %	40 %	28896827
32	NC_004603	GCTTG	2	10	61056	61065	0 %	40 %	40 %	20 %	28896827
33	NC_004603	ATGTG	2	10	63480	63489	20 %	40 %	40 %	0 %	28896829
34	NC_004603	ATCAC	2	10	65083	65092	40 %	20 %	0 %	40 %	28896830
35	NC_004603	GTTTG	2	10	69420	69429	0 %	60 %	40 %	0 %	28896834
36	NC_004603	AATCA	2	10	70127	70136	60 %	20 %	0 %	20 %	28896836
37	NC_004603	ACCAA	2	10	70146	70155	60 %	0 %	0 %	40 %	28896836
38	NC_004603	CAACC	2	10	74094	74103	40 %	0 %	0 %	60 %	28896839
39	NC_004603	GTTTG	2	10	75304	75313	0 %	60 %	40 %	0 %	28896840
40	NC_004603	CTTCT	2	10	76736	76745	0 %	60 %	0 %	40 %	28896842
41	NC_004603	GATGC	2	10	77769	77778	20 %	20 %	40 %	20 %	28896842
42	NC_004603	CCAAC	2	10	79456	79465	40 %	0 %	0 %	60 %	28896844
43	NC_004603	CTGAG	2	10	79801	79810	20 %	20 %	40 %	20 %	28896844
44	NC_004603	CTCAA	2	10	82632	82641	40 %	20 %	0 %	40 %	28896846
45	NC_004603	CTTTG	2	10	85335	85344	0 %	60 %	20 %	20 %	28896847
46	NC_004603	ACGGC	2	10	85520	85529	20 %	0 %	40 %	40 %	28896847
47	NC_004603	AAGGA	2	10	87588	87597	60 %	0 %	40 %	0 %	28896849
48	NC_004603	GTTTG	2	10	90090	90099	0 %	60 %	40 %	0 %	28896853
49	NC_004603	AATTC	2	10	90787	90796	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_004603	CAATC	2	10	92047	92056	40 %	20 %	0 %	40 %	28896854
51	NC_004603	TTTGG	2	10	93422	93431	0 %	60 %	40 %	0 %	28896857
52	NC_004603	GTTGC	2	10	94174	94183	0 %	40 %	40 %	20 %	28896859
53	NC_004603	CGTCA	2	10	98347	98356	20 %	20 %	20 %	40 %	28896864
54	NC_004603	GCGAT	2	10	99891	99900	20 %	20 %	40 %	20 %	28896866
55	NC_004603	AGCGA	2	10	101992	102001	40 %	0 %	40 %	20 %	28896866
56	NC_004603	GCCAA	2	10	102650	102659	40 %	0 %	20 %	40 %	28896867
57	NC_004603	AAAGC	2	10	103471	103480	60 %	0 %	20 %	20 %	28896868
58	NC_004603	CTCAC	2	10	104277	104286	20 %	20 %	0 %	60 %	28896868
59	NC_004603	AACGA	2	10	104960	104969	60 %	0 %	20 %	20 %	28896869
60	NC_004603	CGTAA	2	10	105374	105383	40 %	20 %	20 %	20 %	28896869
61	NC_004603	TGGTC	2	10	108320	108329	0 %	40 %	40 %	20 %	28896873
62	NC_004603	AAGAA	2	10	109739	109748	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004603	TGCTC	2	10	110392	110401	0 %	40 %	20 %	40 %	28896876
64	NC_004603	TCTAA	2	10	111553	111562	40 %	40 %	0 %	20 %	28896878
65	NC_004603	GAGAA	2	10	112084	112093	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004603	TTGGT	2	10	112299	112308	0 %	60 %	40 %	0 %	28896879
67	NC_004603	CATGA	2	10	112873	112882	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_004603	CGCAG	2	10	115568	115577	20 %	0 %	40 %	40 %	28896881
69	NC_004603	AAATC	2	10	115632	115641	60 %	20 %	0 %	20 %	28896881
70	NC_004603	AAAGT	2	10	115845	115854	60 %	20 %	20 %	0 %	28896881
71	NC_004603	TGGCA	2	10	117767	117776	20 %	20 %	40 %	20 %	28896884
72	NC_004603	TGTGG	2	10	119348	119357	0 %	40 %	60 %	0 %	28896886
73	NC_004603	GGAAA	2	10	123081	123090	60 %	0 %	40 %	0 %	28896890
74	NC_004603	AAGAG	2	10	123681	123690	60 %	0 %	40 %	0 %	28896891
75	NC_004603	GGCCA	2	10	127553	127562	20 %	0 %	40 %	40 %	28896893
76	NC_004603	GCCCG	2	10	127692	127701	0 %	0 %	40 %	60 %	28896893
77	NC_004603	ACGTC	2	10	128330	128339	20 %	20 %	20 %	40 %	28896893
78	NC_004603	TTTTC	2	10	129022	129031	0 %	80 %	0 %	20 %	28896894
79	NC_004603	GCGAG	2	10	129425	129434	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
80	NC_004603	CACTG	2	10	134842	134851	20 %	20 %	20 %	40 %	28896899
81	NC_004603	TGATT	2	10	135962	135971	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004603	CGGTC	2	10	136424	136433	0 %	20 %	40 %	40 %	28896901
83	NC_004603	TGCCA	2	10	137726	137735	20 %	20 %	20 %	40 %	28896902
84	NC_004603	AAGTG	2	10	139003	139012	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_004603	GCTTT	2	10	139279	139288	0 %	60 %	20 %	20 %	28896903
86	NC_004603	CGGGG	2	10	140886	140895	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
87	NC_004603	GCCGC	2	10	141307	141316	0 %	0 %	40 %	60 %	28896904
88	NC_004603	TCGTA	2	10	144267	144276	20 %	40 %	20 %	20 %	28896907
89	NC_004603	AACGC	2	10	146361	146370	40 %	0 %	20 %	40 %	28896908
90	NC_004603	GACAT	2	10	146607	146616	40 %	20 %	20 %	20 %	28896908
91	NC_004603	TGGCA	2	10	146915	146924	20 %	20 %	40 %	20 %	28896908
92	NC_004603	CAAAG	2	10	147319	147328	60 %	0 %	20 %	20 %	28896909
93	NC_004603	TGATG	2	10	148069	148078	20 %	40 %	40 %	0 %	28896909
94	NC_004603	CATTG	2	10	149240	149249	20 %	40 %	20 %	20 %	28896911
95	NC_004603	AATTT	2	10	152768	152777	40 %	60 %	0 %	0 %	28896916
96	NC_004603	AGCGG	2	10	156998	157007	20 %	0 %	60 %	20 %	28896921
97	NC_004603	AATAA	2	10	157425	157434	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_004603	TGGTT	2	10	157704	157713	0 %	60 %	40 %	0 %	28896922
99	NC_004603	CTTTG	2	10	158950	158959	0 %	60 %	20 %	20 %	28896924
100	NC_004603	GAAAC	2	10	159200	159209	60 %	0 %	20 %	20 %	28896924
101	NC_004603	GCCGT	2	10	160094	160103	0 %	20 %	40 %	40 %	28896924
102	NC_004603	AGTTC	2	10	162418	162427	20 %	40 %	20 %	20 %	28896925
103	NC_004603	CCTAA	2	10	163370	163379	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
104	NC_004603	TGGAA	2	10	164488	164497	40 %	20 %	40 %	0 %	28896927
105	NC_004603	ACGCC	2	10	164938	164947	20 %	0 %	20 %	60 %	28896928
106	NC_004603	CGTAG	2	10	170484	170493	20 %	20 %	40 %	20 %	28896931
107	NC_004603	TTGGT	2	10	171082	171091	0 %	60 %	40 %	0 %	28896932
108	NC_004603	TGGAA	2	10	171932	171941	40 %	20 %	40 %	0 %	28896933
109	NC_004603	GATTG	2	10	174731	174740	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004603	ATGCC	2	10	175135	175144	20 %	20 %	20 %	40 %	28896936
111	NC_004603	GAACT	2	10	178813	178822	40 %	20 %	20 %	20 %	28896940
112	NC_004603	TGCCT	2	10	183949	183958	0 %	40 %	20 %	40 %	28896944
113	NC_004603	ACCCA	2	10	186667	186676	40 %	0 %	0 %	60 %	28896946
114	NC_004603	CTATC	2	10	189519	189528	20 %	40 %	0 %	40 %	28896949
115	NC_004603	AATAA	2	10	189704	189713	80 %	20 %	0 %	0 %	28896949
116	NC_004603	TCAAT	2	10	192319	192328	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_004603	CTTTT	2	10	192352	192361	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_004603	CAAAT	2	10	195334	195343	60 %	20 %	0 %	20 %	28896956
119	NC_004603	GAAAA	2	10	195432	195441	80 %	0 %	20 %	0 %	28896956
120	NC_004603	TGAGT	2	10	196591	196600	20 %	40 %	40 %	0 %	28896957
121	NC_004603	AGCCA	2	10	197786	197795	40 %	0 %	20 %	40 %	28896958
122	NC_004603	AGTAA	2	10	198719	198728	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004603	TCTTA	2	10	198826	198835	20 %	60 %	0 %	20 %	28896961
124	NC_004603	GAACT	2	10	200615	200624	40 %	20 %	20 %	20 %	28896962
125	NC_004603	AGCCT	2	10	200646	200655	20 %	20 %	20 %	40 %	28896962
126	NC_004603	GCAAG	2	10	201352	201361	40 %	0 %	40 %	20 %	28896963
127	NC_004603	GTTTG	2	10	202108	202117	0 %	60 %	40 %	0 %	28896964
128	NC_004603	CAATC	2	10	204424	204433	40 %	20 %	0 %	40 %	28896967
129	NC_004603	ATTCG	2	10	207155	207164	20 %	40 %	20 %	20 %	28896970
130	NC_004603	GGGAA	2	10	213360	213369	40 %	0 %	60 %	0 %	28896976
131	NC_004603	GCAAA	2	10	216356	216365	60 %	0 %	20 %	20 %	28896979
132	NC_004603	CAAAT	2	10	216721	216730	60 %	20 %	0 %	20 %	28896980
133	NC_004603	GATTA	2	10	217291	217300	40 %	40 %	20 %	0 %	28896980
134	NC_004603	ACCAA	2	10	220346	220355	60 %	0 %	0 %	40 %	28896983
135	NC_004603	TTAGA	2	10	220800	220809	40 %	40 %	20 %	0 %	28896984
136	NC_004603	GGAAT	2	10	225275	225284	40 %	20 %	40 %	0 %	28896988
137	NC_004603	GAAAA	2	10	235834	235843	80 %	0 %	20 %	0 %	28896996
138	NC_004603	ATTTT	2	10	240446	240455	20 %	80 %	0 %	0 %	28897001
139	NC_004603	CTTTA	2	10	241104	241113	20 %	60 %	0 %	20 %	28897002
140	NC_004603	ACTTT	2	10	241327	241336	20 %	60 %	0 %	20 %	28897002
141	NC_004603	ACTGG	2	10	246303	246312	20 %	20 %	40 %	20 %	28897008
142	NC_004603	AAGAT	2	10	246759	246768	60 %	20 %	20 %	0 %	28897008
143	NC_004603	CAGCG	2	10	246993	247002	20 %	0 %	40 %	40 %	28897008
144	NC_004603	ATATT	2	10	247622	247631	40 %	60 %	0 %	0 %	28897009
145	NC_004603	TTACC	2	10	247782	247791	20 %	40 %	0 %	40 %	28897009
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147	NC_004603	TTGCT	2	10	254291	254300	0 %	60 %	20 %	20 %	28897013
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150	NC_004603	GTCGT	2	10	256047	256056	0 %	40 %	40 %	20 %	28897017
151	NC_004603	GTATT	2	10	258942	258951	20 %	60 %	20 %	0 %	28897021
152	NC_004603	CAATG	2	10	259011	259020	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
153	NC_004603	GTTCA	2	10	261424	261433	20 %	40 %	20 %	20 %	28897023
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155	NC_004603	GCGCT	2	10	262944	262953	0 %	20 %	40 %	40 %	28897026
156	NC_004603	TTCTG	2	10	263528	263537	0 %	60 %	20 %	20 %	28897026
157	NC_004603	AGTTG	2	10	265018	265027	20 %	40 %	40 %	0 %	28897027
158	NC_004603	GTGTG	2	10	266710	266719	0 %	40 %	60 %	0 %	28897028
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161	NC_004603	CAGTT	2	10	273329	273338	20 %	40 %	20 %	20 %	28897043
162	NC_004603	AACCA	2	10	277078	277087	60 %	0 %	0 %	40 %	28897051
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168	NC_004603	TGTGG	2	10	291212	291221	0 %	40 %	60 %	0 %	28897067
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171	NC_004603	TTTGG	2	10	295696	295705	0 %	60 %	40 %	0 %	28897073
172	NC_004603	TCCGA	2	10	296843	296852	20 %	20 %	20 %	40 %	28897074
173	NC_004603	AGCAA	2	10	299071	299080	60 %	0 %	20 %	20 %	28897077
174	NC_004603	TATAA	2	10	299169	299178	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_004603	ACCTT	2	10	301790	301799	20 %	40 %	0 %	40 %	28897081
176	NC_004603	CTCAA	2	10	303009	303018	40 %	20 %	0 %	40 %	28897082
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178	NC_004603	TCCGA	2	10	306227	306236	20 %	20 %	20 %	40 %	28897082
179	NC_004603	GTTTA	2	10	309535	309544	20 %	60 %	20 %	0 %	28897088
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189	NC_004603	GCTTG	2	10	324596	324605	0 %	40 %	40 %	20 %	28897104
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196	NC_004603	AAAAC	2	10	336161	336170	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
197	NC_004603	AACCA	2	10	336787	336796	60 %	0 %	0 %	40 %	28897116
198	NC_004603	TGCGA	2	10	337138	337147	20 %	20 %	40 %	20 %	28897117
199	NC_004603	TGACC	2	10	337355	337364	20 %	20 %	20 %	40 %	28897117
200	NC_004603	TTCCT	2	10	338250	338259	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
201	NC_004603	AACAT	2	10	338690	338699	60 %	20 %	0 %	20 %	28897118
202	NC_004603	CTGGG	2	10	338709	338718	0 %	20 %	60 %	20 %	28897118
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218	NC_004603	CTTGG	2	10	365933	365942	0 %	40 %	40 %	20 %	28897140
219	NC_004603	AAAGA	2	10	368425	368434	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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222	NC_004603	TTTGA	2	10	372646	372655	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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227	NC_004603	CGTAA	2	10	379241	379250	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
228	NC_004603	TGTTT	2	10	383801	383810	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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234	NC_004603	ATCTA	2	10	388040	388049	40 %	40 %	0 %	20 %	28897161
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238	NC_004603	AACTG	2	10	390718	390727	40 %	20 %	20 %	20 %	28897162
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241	NC_004603	TAAAT	2	10	396198	396207	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
242	NC_004603	TTTAC	2	10	397086	397095	20 %	60 %	0 %	20 %	28897172
243	NC_004603	GATGG	2	10	397343	397352	20 %	20 %	60 %	0 %	28897172
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246	NC_004603	TCATT	2	10	399518	399527	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
247	NC_004603	TCTAA	2	10	399712	399721	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
248	NC_004603	CTTTT	2	10	400431	400440	0 %	80 %	0 %	20 %	28897175
249	NC_004603	AAATT	2	10	405915	405924	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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251	NC_004603	TGGTT	2	10	409019	409028	0 %	60 %	40 %	0 %	28897182
252	NC_004603	GTGAT	2	10	410543	410552	20 %	40 %	40 %	0 %	28897183
253	NC_004603	CGTTT	2	10	415318	415327	0 %	60 %	20 %	20 %	28897189
254	NC_004603	GGCTG	2	10	415614	415623	0 %	20 %	60 %	20 %	28897189
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260	NC_004603	TGGGA	2	10	424494	424503	20 %	20 %	60 %	0 %	28897197
261	NC_004603	ACTTA	2	10	425954	425963	40 %	40 %	0 %	20 %	28897197
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263	NC_004603	AATTG	2	10	427847	427856	40 %	40 %	20 %	0 %	28897198
264	NC_004603	CTACG	2	10	428878	428887	20 %	20 %	20 %	40 %	28897199
265	NC_004603	GTTTG	2	10	428938	428947	0 %	60 %	40 %	0 %	28897199
266	NC_004603	TTTGC	2	10	429802	429811	0 %	60 %	20 %	20 %	28897199
267	NC_004603	CGTCA	2	10	431229	431238	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
268	NC_004603	GCTTG	2	10	431784	431793	0 %	40 %	40 %	20 %	28897202
269	NC_004603	GATGC	2	10	433845	433854	20 %	20 %	40 %	20 %	28897204
270	NC_004603	CTACG	2	10	434418	434427	20 %	20 %	20 %	40 %	28897204
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293	NC_004603	CGAAA	2	10	473467	473476	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
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