MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633 chromosome 1

Total Repeats: 350

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004603	AGAAA	2	10	6410	6419	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004603	AATAA	2	10	22462	22471	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004603	GTAGT	2	10	34094	34103	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004603	TAAAG	2	10	35231	35240	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004603	CTCAG	2	10	55658	55667	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_004603	AATTC	2	10	90787	90796	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_004603	AAGAA	2	10	109739	109748	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004603	GAGAA	2	10	112084	112093	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004603	CATGA	2	10	112873	112882	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_004603	GCGAG	2	10	129425	129434	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
11	NC_004603	TGATT	2	10	135962	135971	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004603	AAGTG	2	10	139003	139012	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004603	CGGGG	2	10	140886	140895	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
14	NC_004603	AATAA	2	10	157425	157434	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004603	CCTAA	2	10	163370	163379	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
16	NC_004603	GATTG	2	10	174731	174740	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004603	TCAAT	2	10	192319	192328	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
18	NC_004603	CTTTT	2	10	192352	192361	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_004603	AGTAA	2	10	198719	198728	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004603	CAATG	2	10	259011	259020	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_004603	TATAA	2	10	299169	299178	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004603	AACAG	2	10	320498	320507	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
23	NC_004603	AAAAC	2	10	336161	336170	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_004603	TTCCT	2	10	338250	338259	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
25	NC_004603	AAAGA	2	10	368425	368434	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004603	TTTGA	2	10	372646	372655	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004603	TTTCC	2	10	379097	379106	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
28	NC_004603	CGTAA	2	10	379241	379250	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
29	NC_004603	TGTTT	2	10	383801	383810	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004603	TAAAT	2	10	396198	396207	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004603	CATAA	2	10	399421	399430	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
32	NC_004603	TCATT	2	10	399518	399527	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_004603	TCTAA	2	10	399712	399721	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_004603	AAATT	2	10	405915	405924	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004603	CGTCA	2	10	431229	431238	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
36	NC_004603	CGATA	2	10	464889	464898	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_004603	CGAAA	2	10	473467	473476	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_004603	AAAAG	2	10	479701	479710	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004603	CGACA	2	10	508393	508402	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
40	NC_004603	TAGAA	2	10	515226	515235	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004603	ATTCT	2	10	528336	528345	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
42	NC_004603	GTTTG	2	10	543040	543049	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004603	CAACA	2	10	545831	545840	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_004603	AACCT	2	10	557072	557081	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
45	NC_004603	AAAAG	2	10	565469	565478	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004603	TTTGT	2	10	568945	568954	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004603	AAAAC	2	10	575785	575794	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_004603	GTAGT	2	10	582087	582096	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004603	TCCGC	2	10	586896	586905	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
50	NC_004603	AATTA	2	10	608413	608422	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004603	TGTTT	2	10	608492	608501	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004603	TGAAT	2	10	612543	612552	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004603	ATTTT	2	10	639304	639313	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004603	GATTG	2	10	641328	641337	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004603	CTTTT	2	10	646220	646229	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
56	NC_004603	TATTG	2	10	646362	646371	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004603	TTTCT	2	10	653291	653300	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
58	NC_004603	AAGCA	2	10	667014	667023	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_004603	TATTG	2	10	668041	668050	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004603	CTTAA	2	10	671069	671078	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
61	NC_004603	ACTTC	2	10	671886	671895	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
62	NC_004603	TGAGT	2	10	676785	676794	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004603	AACCG	2	10	693438	693447	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
64	NC_004603	CTTTT	2	10	699452	699461	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
65	NC_004603	AAAAT	2	10	699537	699546	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004603	CAGCT	2	10	699609	699618	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_004603	TAATT	2	10	704452	704461	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004603	GGTTT	2	10	731715	731724	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004603	CTTTT	2	10	741885	741894	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
70	NC_004603	TTTTC	2	10	744535	744544	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_004603	CATCT	2	10	759671	759680	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
72	NC_004603	TGCGT	2	10	761430	761439	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
73	NC_004603	AAAAT	2	10	784666	784675	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004603	TCGGG	2	10	789656	789665	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
75	NC_004603	ATTTT	2	10	794179	794188	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004603	CTTTT	2	10	811198	811207	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_004603	ATGAG	2	10	811231	811240	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004603	GGTTT	2	10	827660	827669	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
79	NC_004603	CCTTA	2	10	829492	829501	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
80	NC_004603	GTAAA	2	10	832221	832230	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
81	NC_004603	TGGTG	2	10	837685	837694	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
82	NC_004603	ATTAC	2	10	840880	840889	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
83	NC_004603	CTAAA	2	10	857069	857078	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
84	NC_004603	AACAT	2	10	861779	861788	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
85	NC_004603	CAAAA	2	10	865352	865361	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
86	NC_004603	TAAAA	2	10	883876	883885	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_004603	GAGTT	2	10	886697	886706	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
88	NC_004603	TGCCA	2	10	890596	890605	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
89	NC_004603	TTCAA	2	10	896136	896145	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
90	NC_004603	CTGTG	2	10	899992	900001	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_004603	AAATA	2	10	900010	900019	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_004603	GCTGT	2	10	902588	902597	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
93	NC_004603	TCAGA	2	10	912481	912490	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
94	NC_004603	AAAGC	2	10	936328	936337	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_004603	TAAAC	2	10	963242	963251	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
96	NC_004603	TTAAT	2	10	984646	984655	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_004603	TATCA	2	10	984675	984684	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
98	NC_004603	TAAGC	2	10	992565	992574	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
99	NC_004603	ACTTT	2	10	995870	995879	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
100	NC_004603	TCTCG	2	10	1002202	1002211	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
101	NC_004603	GTAAG	2	10	1019072	1019081	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
102	NC_004603	TTATT	2	10	1036639	1036648	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_004603	AAATA	2	10	1044989	1044998	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_004603	TTACA	2	10	1047397	1047406	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_004603	TAAAT	2	10	1055029	1055038	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_004603	TCAAA	2	10	1064200	1064209	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
107	NC_004603	TTTGT	2	10	1072617	1072626	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
108	NC_004603	GAATA	2	10	1081319	1081328	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_004603	GTTTT	2	10	1127267	1127276	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
110	NC_004603	AACTT	2	10	1127661	1127670	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
111	NC_004603	TTTGT	2	10	1131807	1131816	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004603	TCCTT	2	10	1143686	1143695	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
113	NC_004603	TACGT	2	10	1157178	1157187	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
114	NC_004603	ATCTT	2	10	1158107	1158116	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
115	NC_004603	ATTTC	2	10	1162591	1162600	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
116	NC_004603	CAACA	2	10	1172799	1172808	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
117	NC_004603	TGTGT	2	10	1207220	1207229	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
118	NC_004603	CGTTT	2	10	1238440	1238449	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
119	NC_004603	ATAAA	2	10	1241890	1241899	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_004603	ACACA	2	10	1243747	1243756	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
121	NC_004603	TTTAA	2	10	1262830	1262839	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_004603	TTTAT	2	10	1263145	1263154	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_004603	CCCGG	2	10	1266509	1266518	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
124	NC_004603	CTAAA	2	10	1306085	1306094	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
125	NC_004603	TGAAA	2	10	1306137	1306146	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_004603	AATGT	2	10	1331409	1331418	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
127	NC_004603	AAAAC	2	10	1359167	1359176	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
128	NC_004603	GTTTA	2	10	1360020	1360029	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
129	NC_004603	AAGGA	2	10	1360411	1360420	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
130	NC_004603	GTACT	2	10	1360605	1360614	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_004603	GTTAT	2	10	1361290	1361299	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_004603	TCTTT	2	10	1375904	1375913	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
133	NC_004603	AAAAG	2	10	1376760	1376769	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
134	NC_004603	CGATT	2	10	1388135	1388144	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
135	NC_004603	ATAAA	2	10	1393275	1393284	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_004603	ATCCA	2	10	1408277	1408286	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_004603	AAAGG	2	10	1414620	1414629	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_004603	TGAAA	2	10	1422388	1422397	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_004603	AATTT	2	10	1431843	1431852	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_004603	TGAAT	2	10	1437540	1437549	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
141	NC_004603	TAAAA	2	10	1470858	1470867	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_004603	TTTAT	2	10	1470979	1470988	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_004603	AATTA	2	10	1483353	1483362	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_004603	TTTTC	2	10	1491173	1491182	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
145	NC_004603	AAACA	2	10	1495939	1495948	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
146	NC_004603	ATGCA	2	10	1516837	1516846	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_004603	TTTAT	2	10	1517192	1517201	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_004603	TATAA	2	10	1526353	1526362	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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150	NC_004603	ATGAA	2	10	1541844	1541853	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
151	NC_004603	ATTTT	2	10	1541907	1541916	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_004603	GCAAT	2	10	1541963	1541972	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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154	NC_004603	CTTTT	2	10	1569603	1569612	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
155	NC_004603	TAAAA	2	10	1573092	1573101	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_004603	TTGTT	2	10	1577265	1577274	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_004603	TGCTT	2	10	1875712	1875721	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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192	NC_004603	TTTGA	2	10	1916666	1916675	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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285	NC_004603	AATTA	2	10	2801627	2801636	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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334	NC_004603	TTTCT	2	10	3138713	3138722	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
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339	NC_004603	ATTAA	2	10	3192195	3192204	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
340	NC_004603	TCGGT	2	10	3195613	3195622	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
341	NC_004603	ACTAC	2	10	3197944	3197953	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
342	NC_004603	AAAAC	2	10	3204329	3204338	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
343	NC_004603	ACAAG	2	10	3212056	3212065	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
344	NC_004603	TTAAG	2	10	3218704	3218713	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
345	NC_004603	GCGGA	2	10	3234330	3234339	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
346	NC_004603	TCGGT	2	10	3236805	3236814	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
347	NC_004603	CTTTA	2	10	3238144	3238153	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
348	NC_004603	ACTAC	2	10	3239281	3239290	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
349	NC_004603	CTTTA	2	10	3250434	3250443	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
350	NC_004603	GTTAT	2	10	3264733	3264742	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.