MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633 chromosome 1

Total Repeats: 1899

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004603	GAAGA	2	10	929	938	60 %	0 %	40 %	0 %	28896776
2	NC_004603	AAATC	2	10	6376	6385	60 %	20 %	0 %	20 %	28896781
3	NC_004603	CCAAA	2	10	12357	12366	60 %	0 %	0 %	40 %	28896788
4	NC_004603	AAGCG	2	10	12450	12459	40 %	0 %	40 %	20 %	28896788
5	NC_004603	TATGT	2	10	14520	14529	20 %	60 %	20 %	0 %	28896790
6	NC_004603	GTTGG	2	10	16274	16283	0 %	40 %	60 %	0 %	28896793
7	NC_004603	TCGGA	2	10	17275	17284	20 %	20 %	40 %	20 %	28896794
8	NC_004603	TCGAA	2	10	17563	17572	40 %	20 %	20 %	20 %	28896794
9	NC_004603	CGTTG	2	10	18551	18560	0 %	40 %	40 %	20 %	28896794
10	NC_004603	TTTGG	2	10	23662	23671	0 %	60 %	40 %	0 %	28896798
11	NC_004603	CCCAA	2	10	24833	24842	40 %	0 %	0 %	60 %	28896801
12	NC_004603	GTGTT	2	10	25158	25167	0 %	60 %	40 %	0 %	28896801
13	NC_004603	CGCAA	2	10	25297	25306	40 %	0 %	20 %	40 %	28896801
14	NC_004603	AGCTC	2	10	30191	30200	20 %	20 %	20 %	40 %	28896804
15	NC_004603	CACTT	2	10	32518	32527	20 %	40 %	0 %	40 %	28896806
16	NC_004603	GAATG	2	10	39372	39381	40 %	20 %	40 %	0 %	28896808
17	NC_004603	CCAAG	2	10	42589	42598	40 %	0 %	20 %	40 %	28896812
18	NC_004603	TCGTT	2	10	46157	46166	0 %	60 %	20 %	20 %	28896813
19	NC_004603	TTGGT	2	10	46182	46191	0 %	60 %	40 %	0 %	28896813
20	NC_004603	TTTTG	2	10	47650	47659	0 %	80 %	20 %	0 %	28896815
21	NC_004603	CGTGG	2	10	47900	47909	0 %	20 %	60 %	20 %	28896815
22	NC_004603	ATAAA	2	10	50766	50775	80 %	20 %	0 %	0 %	28896817
23	NC_004603	TGAAC	2	10	53721	53730	40 %	20 %	20 %	20 %	28896821
24	NC_004603	CCAAA	2	10	58342	58351	60 %	0 %	0 %	40 %	28896826
25	NC_004603	ATGTG	2	10	58831	58840	20 %	40 %	40 %	0 %	28896826
26	NC_004603	TCATC	2	10	59800	59809	20 %	40 %	0 %	40 %	28896827
27	NC_004603	GCTTG	2	10	61056	61065	0 %	40 %	40 %	20 %	28896827
28	NC_004603	ATGTG	2	10	63480	63489	20 %	40 %	40 %	0 %	28896829
29	NC_004603	ATCAC	2	10	65083	65092	40 %	20 %	0 %	40 %	28896830
30	NC_004603	GTTTG	2	10	69420	69429	0 %	60 %	40 %	0 %	28896834
31	NC_004603	AATCA	2	10	70127	70136	60 %	20 %	0 %	20 %	28896836
32	NC_004603	ACCAA	2	10	70146	70155	60 %	0 %	0 %	40 %	28896836
33	NC_004603	CAACC	2	10	74094	74103	40 %	0 %	0 %	60 %	28896839
34	NC_004603	GTTTG	2	10	75304	75313	0 %	60 %	40 %	0 %	28896840
35	NC_004603	CTTCT	2	10	76736	76745	0 %	60 %	0 %	40 %	28896842
36	NC_004603	GATGC	2	10	77769	77778	20 %	20 %	40 %	20 %	28896842
37	NC_004603	CCAAC	2	10	79456	79465	40 %	0 %	0 %	60 %	28896844
38	NC_004603	CTGAG	2	10	79801	79810	20 %	20 %	40 %	20 %	28896844
39	NC_004603	CTCAA	2	10	82632	82641	40 %	20 %	0 %	40 %	28896846
40	NC_004603	CTTTG	2	10	85335	85344	0 %	60 %	20 %	20 %	28896847
41	NC_004603	ACGGC	2	10	85520	85529	20 %	0 %	40 %	40 %	28896847
42	NC_004603	AAGGA	2	10	87588	87597	60 %	0 %	40 %	0 %	28896849
43	NC_004603	GTTTG	2	10	90090	90099	0 %	60 %	40 %	0 %	28896853
44	NC_004603	CAATC	2	10	92047	92056	40 %	20 %	0 %	40 %	28896854
45	NC_004603	TTTGG	2	10	93422	93431	0 %	60 %	40 %	0 %	28896857
46	NC_004603	GTTGC	2	10	94174	94183	0 %	40 %	40 %	20 %	28896859
47	NC_004603	CGTCA	2	10	98347	98356	20 %	20 %	20 %	40 %	28896864
48	NC_004603	GCGAT	2	10	99891	99900	20 %	20 %	40 %	20 %	28896866
49	NC_004603	AGCGA	2	10	101992	102001	40 %	0 %	40 %	20 %	28896866
50	NC_004603	GCCAA	2	10	102650	102659	40 %	0 %	20 %	40 %	28896867
51	NC_004603	AAAGC	2	10	103471	103480	60 %	0 %	20 %	20 %	28896868
52	NC_004603	CTCAC	2	10	104277	104286	20 %	20 %	0 %	60 %	28896868
53	NC_004603	AACGA	2	10	104960	104969	60 %	0 %	20 %	20 %	28896869
54	NC_004603	CGTAA	2	10	105374	105383	40 %	20 %	20 %	20 %	28896869
55	NC_004603	TGGTC	2	10	108320	108329	0 %	40 %	40 %	20 %	28896873
56	NC_004603	TGCTC	2	10	110392	110401	0 %	40 %	20 %	40 %	28896876
57	NC_004603	TCTAA	2	10	111553	111562	40 %	40 %	0 %	20 %	28896878
58	NC_004603	TTGGT	2	10	112299	112308	0 %	60 %	40 %	0 %	28896879
59	NC_004603	CGCAG	2	10	115568	115577	20 %	0 %	40 %	40 %	28896881
60	NC_004603	AAATC	2	10	115632	115641	60 %	20 %	0 %	20 %	28896881
61	NC_004603	AAAGT	2	10	115845	115854	60 %	20 %	20 %	0 %	28896881
62	NC_004603	TGGCA	2	10	117767	117776	20 %	20 %	40 %	20 %	28896884
63	NC_004603	TGTGG	2	10	119348	119357	0 %	40 %	60 %	0 %	28896886
64	NC_004603	GGAAA	2	10	123081	123090	60 %	0 %	40 %	0 %	28896890
65	NC_004603	AAGAG	2	10	123681	123690	60 %	0 %	40 %	0 %	28896891
66	NC_004603	GGCCA	2	10	127553	127562	20 %	0 %	40 %	40 %	28896893
67	NC_004603	GCCCG	2	10	127692	127701	0 %	0 %	40 %	60 %	28896893
68	NC_004603	ACGTC	2	10	128330	128339	20 %	20 %	20 %	40 %	28896893
69	NC_004603	TTTTC	2	10	129022	129031	0 %	80 %	0 %	20 %	28896894
70	NC_004603	CACTG	2	10	134842	134851	20 %	20 %	20 %	40 %	28896899
71	NC_004603	CGGTC	2	10	136424	136433	0 %	20 %	40 %	40 %	28896901
72	NC_004603	TGCCA	2	10	137726	137735	20 %	20 %	20 %	40 %	28896902
73	NC_004603	GCTTT	2	10	139279	139288	0 %	60 %	20 %	20 %	28896903
74	NC_004603	GCCGC	2	10	141307	141316	0 %	0 %	40 %	60 %	28896904
75	NC_004603	TCGTA	2	10	144267	144276	20 %	40 %	20 %	20 %	28896907
76	NC_004603	AACGC	2	10	146361	146370	40 %	0 %	20 %	40 %	28896908
77	NC_004603	GACAT	2	10	146607	146616	40 %	20 %	20 %	20 %	28896908
78	NC_004603	TGGCA	2	10	146915	146924	20 %	20 %	40 %	20 %	28896908
79	NC_004603	CAAAG	2	10	147319	147328	60 %	0 %	20 %	20 %	28896909
80	NC_004603	TGATG	2	10	148069	148078	20 %	40 %	40 %	0 %	28896909
81	NC_004603	CATTG	2	10	149240	149249	20 %	40 %	20 %	20 %	28896911
82	NC_004603	AATTT	2	10	152768	152777	40 %	60 %	0 %	0 %	28896916
83	NC_004603	AGCGG	2	10	156998	157007	20 %	0 %	60 %	20 %	28896921
84	NC_004603	TGGTT	2	10	157704	157713	0 %	60 %	40 %	0 %	28896922
85	NC_004603	CTTTG	2	10	158950	158959	0 %	60 %	20 %	20 %	28896924
86	NC_004603	GAAAC	2	10	159200	159209	60 %	0 %	20 %	20 %	28896924
87	NC_004603	GCCGT	2	10	160094	160103	0 %	20 %	40 %	40 %	28896924
88	NC_004603	AGTTC	2	10	162418	162427	20 %	40 %	20 %	20 %	28896925
89	NC_004603	TGGAA	2	10	164488	164497	40 %	20 %	40 %	0 %	28896927
90	NC_004603	ACGCC	2	10	164938	164947	20 %	0 %	20 %	60 %	28896928
91	NC_004603	CGTAG	2	10	170484	170493	20 %	20 %	40 %	20 %	28896931
92	NC_004603	TTGGT	2	10	171082	171091	0 %	60 %	40 %	0 %	28896932
93	NC_004603	TGGAA	2	10	171932	171941	40 %	20 %	40 %	0 %	28896933
94	NC_004603	ATGCC	2	10	175135	175144	20 %	20 %	20 %	40 %	28896936
95	NC_004603	GAACT	2	10	178813	178822	40 %	20 %	20 %	20 %	28896940
96	NC_004603	TGCCT	2	10	183949	183958	0 %	40 %	20 %	40 %	28896944
97	NC_004603	ACCCA	2	10	186667	186676	40 %	0 %	0 %	60 %	28896946
98	NC_004603	CTATC	2	10	189519	189528	20 %	40 %	0 %	40 %	28896949
99	NC_004603	AATAA	2	10	189704	189713	80 %	20 %	0 %	0 %	28896949
100	NC_004603	CAAAT	2	10	195334	195343	60 %	20 %	0 %	20 %	28896956
101	NC_004603	GAAAA	2	10	195432	195441	80 %	0 %	20 %	0 %	28896956
102	NC_004603	TGAGT	2	10	196591	196600	20 %	40 %	40 %	0 %	28896957
103	NC_004603	AGCCA	2	10	197786	197795	40 %	0 %	20 %	40 %	28896958
104	NC_004603	TCTTA	2	10	198826	198835	20 %	60 %	0 %	20 %	28896961
105	NC_004603	GAACT	2	10	200615	200624	40 %	20 %	20 %	20 %	28896962
106	NC_004603	AGCCT	2	10	200646	200655	20 %	20 %	20 %	40 %	28896962
107	NC_004603	GCAAG	2	10	201352	201361	40 %	0 %	40 %	20 %	28896963
108	NC_004603	GTTTG	2	10	202108	202117	0 %	60 %	40 %	0 %	28896964
109	NC_004603	CAATC	2	10	204424	204433	40 %	20 %	0 %	40 %	28896967
110	NC_004603	ATTCG	2	10	207155	207164	20 %	40 %	20 %	20 %	28896970
111	NC_004603	GGGAA	2	10	213360	213369	40 %	0 %	60 %	0 %	28896976
112	NC_004603	GCAAA	2	10	216356	216365	60 %	0 %	20 %	20 %	28896979
113	NC_004603	CAAAT	2	10	216721	216730	60 %	20 %	0 %	20 %	28896980
114	NC_004603	GATTA	2	10	217291	217300	40 %	40 %	20 %	0 %	28896980
115	NC_004603	ACCAA	2	10	220346	220355	60 %	0 %	0 %	40 %	28896983
116	NC_004603	TTAGA	2	10	220800	220809	40 %	40 %	20 %	0 %	28896984
117	NC_004603	GGAAT	2	10	225275	225284	40 %	20 %	40 %	0 %	28896988
118	NC_004603	GAAAA	2	10	235834	235843	80 %	0 %	20 %	0 %	28896996
119	NC_004603	ATTTT	2	10	240446	240455	20 %	80 %	0 %	0 %	28897001
120	NC_004603	CTTTA	2	10	241104	241113	20 %	60 %	0 %	20 %	28897002
121	NC_004603	ACTTT	2	10	241327	241336	20 %	60 %	0 %	20 %	28897002
122	NC_004603	ACTGG	2	10	246303	246312	20 %	20 %	40 %	20 %	28897008
123	NC_004603	AAGAT	2	10	246759	246768	60 %	20 %	20 %	0 %	28897008
124	NC_004603	CAGCG	2	10	246993	247002	20 %	0 %	40 %	40 %	28897008
125	NC_004603	ATATT	2	10	247622	247631	40 %	60 %	0 %	0 %	28897009
126	NC_004603	TTACC	2	10	247782	247791	20 %	40 %	0 %	40 %	28897009
127	NC_004603	TTTTG	2	10	252399	252408	0 %	80 %	20 %	0 %	28897012
128	NC_004603	TTGCT	2	10	254291	254300	0 %	60 %	20 %	20 %	28897013
129	NC_004603	TCGCA	2	10	255319	255328	20 %	20 %	20 %	40 %	28897015
130	NC_004603	TTGCG	2	10	255831	255840	0 %	40 %	40 %	20 %	28897016
131	NC_004603	GTCGT	2	10	256047	256056	0 %	40 %	40 %	20 %	28897017
132	NC_004603	GTATT	2	10	258942	258951	20 %	60 %	20 %	0 %	28897021
133	NC_004603	GTTCA	2	10	261424	261433	20 %	40 %	20 %	20 %	28897023
134	NC_004603	AATCA	2	10	261678	261687	60 %	20 %	0 %	20 %	28897024
135	NC_004603	GCGCT	2	10	262944	262953	0 %	20 %	40 %	40 %	28897026
136	NC_004603	TTCTG	2	10	263528	263537	0 %	60 %	20 %	20 %	28897026
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157	NC_004603	TCCGA	2	10	306227	306236	20 %	20 %	20 %	40 %	28897082
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