MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Vibrio parahaemolyticus RIMD 2210633 chromosome 1

Total Repeats: 7365

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004603	ATCA	2	8	440	447	50 %	25 %	0 %	25 %	28896775
2	NC_004603	GTGG	2	8	641	648	0 %	25 %	75 %	0 %	28896775
3	NC_004603	GGTT	2	8	696	703	0 %	50 %	50 %	0 %	28896775
4	NC_004603	GTCG	2	8	1348	1355	0 %	25 %	50 %	25 %	28896776
5	NC_004603	ATCA	2	8	1873	1880	50 %	25 %	0 %	25 %	28896776
6	NC_004603	TTGG	2	8	2182	2189	0 %	50 %	50 %	0 %	28896776
7	NC_004603	ACCA	2	8	2465	2472	50 %	0 %	0 %	50 %	28896777
8	NC_004603	AGCA	2	8	2986	2993	50 %	0 %	25 %	25 %	28896777
9	NC_004603	GTGA	2	8	2994	3001	25 %	25 %	50 %	0 %	28896777
10	NC_004603	AGCC	2	8	3023	3030	25 %	0 %	25 %	50 %	28896777
11	NC_004603	TACG	2	8	3153	3160	25 %	25 %	25 %	25 %	28896777
12	NC_004603	TCGA	2	8	3779	3786	25 %	25 %	25 %	25 %	28896777
13	NC_004603	TTGA	2	8	3894	3901	25 %	50 %	25 %	0 %	28896777
14	NC_004603	AAGA	2	8	3959	3966	75 %	0 %	25 %	0 %	28896777
15	NC_004603	TTTG	2	8	4346	4353	0 %	75 %	25 %	0 %	28896778
16	NC_004603	CGAC	2	8	4410	4417	25 %	0 %	25 %	50 %	28896778
17	NC_004603	CACG	2	8	5394	5401	25 %	0 %	25 %	50 %	28896780
18	NC_004603	AAAC	2	8	5466	5473	75 %	0 %	0 %	25 %	28896780
19	NC_004603	GTAC	2	8	5723	5730	25 %	25 %	25 %	25 %	28896781
20	NC_004603	CCGA	2	8	6004	6011	25 %	0 %	25 %	50 %	28896781
21	NC_004603	CAAA	2	8	7029	7036	75 %	0 %	0 %	25 %	28896782
22	NC_004603	GAAA	2	8	7440	7447	75 %	0 %	25 %	0 %	28896783
23	NC_004603	ATCA	2	8	8058	8065	50 %	25 %	0 %	25 %	28896785
24	NC_004603	TTGG	2	8	8539	8546	0 %	50 %	50 %	0 %	28896785
25	NC_004603	TTCG	2	8	8754	8761	0 %	50 %	25 %	25 %	28896785
26	NC_004603	CTAA	2	8	8931	8938	50 %	25 %	0 %	25 %	28896785
27	NC_004603	TGCA	2	8	8995	9002	25 %	25 %	25 %	25 %	28896785
28	NC_004603	GTTC	2	8	9444	9451	0 %	50 %	25 %	25 %	28896786
29	NC_004603	ACGT	2	8	9598	9605	25 %	25 %	25 %	25 %	28896786
30	NC_004603	CGAC	2	8	9661	9668	25 %	0 %	25 %	50 %	28896786
31	NC_004603	GATG	2	8	9767	9774	25 %	25 %	50 %	0 %	28896786
32	NC_004603	CGTG	2	8	9815	9822	0 %	25 %	50 %	25 %	28896786
33	NC_004603	TTCT	2	8	9964	9971	0 %	75 %	0 %	25 %	28896786
34	NC_004603	ATTG	2	8	10190	10197	25 %	50 %	25 %	0 %	28896786
35	NC_004603	ATTT	2	8	10386	10393	25 %	75 %	0 %	0 %	28896787
36	NC_004603	TGTT	2	8	10462	10469	0 %	75 %	25 %	0 %	28896787
37	NC_004603	CCAT	2	8	11750	11757	25 %	25 %	0 %	50 %	28896788
38	NC_004603	CAAG	2	8	11985	11992	50 %	0 %	25 %	25 %	28896788
39	NC_004603	CGTT	2	8	12023	12030	0 %	50 %	25 %	25 %	28896788
40	NC_004603	GCCT	2	8	13334	13341	0 %	25 %	25 %	50 %	28896788
41	NC_004603	TGGT	2	8	13528	13535	0 %	50 %	50 %	0 %	28896788
42	NC_004603	ATCA	2	8	14192	14199	50 %	25 %	0 %	25 %	28896790
43	NC_004603	TCAT	2	8	14474	14481	25 %	50 %	0 %	25 %	28896790
44	NC_004603	GAAA	2	8	14589	14596	75 %	0 %	25 %	0 %	28896791
45	NC_004603	CAAT	2	8	15750	15757	50 %	25 %	0 %	25 %	28896793
46	NC_004603	GTCA	2	8	16255	16262	25 %	25 %	25 %	25 %	28896793
47	NC_004603	CAAA	2	8	16497	16504	75 %	0 %	0 %	25 %	28896793
48	NC_004603	GCGT	2	8	16761	16768	0 %	25 %	50 %	25 %	28896793
49	NC_004603	GGTA	2	8	17907	17914	25 %	25 %	50 %	0 %	28896794
50	NC_004603	GTCA	2	8	18530	18537	25 %	25 %	25 %	25 %	28896794
51	NC_004603	AGGT	2	8	18837	18844	25 %	25 %	50 %	0 %	28896794
52	NC_004603	GTTT	2	8	18960	18967	0 %	75 %	25 %	0 %	28896794
53	NC_004603	TAGG	2	8	21008	21015	25 %	25 %	50 %	0 %	28896795
54	NC_004603	TTCT	2	8	21457	21464	0 %	75 %	0 %	25 %	28896796
55	NC_004603	TGCG	2	8	21579	21586	0 %	25 %	50 %	25 %	28896796
56	NC_004603	GCAG	2	8	21632	21639	25 %	0 %	50 %	25 %	28896796
57	NC_004603	AAGT	2	8	21923	21930	50 %	25 %	25 %	0 %	28896796
58	NC_004603	CTAT	2	8	23029	23036	25 %	50 %	0 %	25 %	28896797
59	NC_004603	CATT	2	8	23145	23152	25 %	50 %	0 %	25 %	28896797
60	NC_004603	TTAT	2	8	23649	23656	25 %	75 %	0 %	0 %	28896798
61	NC_004603	ACTG	2	8	23694	23701	25 %	25 %	25 %	25 %	28896798
62	NC_004603	TACG	2	8	23801	23808	25 %	25 %	25 %	25 %	28896798
63	NC_004603	AAAC	2	8	23867	23874	75 %	0 %	0 %	25 %	28896798
64	NC_004603	AGAC	2	8	24308	24315	50 %	0 %	25 %	25 %	28896800
65	NC_004603	TTGA	2	8	25269	25276	25 %	50 %	25 %	0 %	28896801
66	NC_004603	AACC	2	8	26321	26328	50 %	0 %	0 %	50 %	28896802
67	NC_004603	CCAG	2	8	26387	26394	25 %	0 %	25 %	50 %	28896802
68	NC_004603	AGCA	2	8	27828	27835	50 %	0 %	25 %	25 %	28896803
69	NC_004603	TAGA	2	8	28084	28091	50 %	25 %	25 %	0 %	28896804
70	NC_004603	ATCA	2	8	28137	28144	50 %	25 %	0 %	25 %	28896804
71	NC_004603	CAAG	2	8	28628	28635	50 %	0 %	25 %	25 %	28896804
72	NC_004603	GCCA	2	8	28652	28659	25 %	0 %	25 %	50 %	28896804
73	NC_004603	TGCT	2	8	29321	29328	0 %	50 %	25 %	25 %	28896804
74	NC_004603	ACCA	2	8	29382	29389	50 %	0 %	0 %	50 %	28896804
75	NC_004603	ATGA	2	8	30512	30519	50 %	25 %	25 %	0 %	28896805
76	NC_004603	TACC	2	8	30586	30593	25 %	25 %	0 %	50 %	28896805
77	NC_004603	TGAC	2	8	31474	31481	25 %	25 %	25 %	25 %	28896806
78	NC_004603	CTTA	2	8	32600	32607	25 %	50 %	0 %	25 %	28896806
79	NC_004603	CTCA	2	8	32865	32872	25 %	25 %	0 %	50 %	28896807
80	NC_004603	GAAG	2	8	32949	32956	50 %	0 %	50 %	0 %	28896807
81	NC_004603	GGTT	2	8	33045	33052	0 %	50 %	50 %	0 %	28896807
82	NC_004603	ACCC	2	8	39234	39241	25 %	0 %	0 %	75 %	28896808
83	NC_004603	GACA	2	8	39447	39454	50 %	0 %	25 %	25 %	28896808
84	NC_004603	TTTG	2	8	39486	39493	0 %	75 %	25 %	0 %	28896808
85	NC_004603	AACA	2	8	39804	39811	75 %	0 %	0 %	25 %	28896808
86	NC_004603	ATGA	2	8	39918	39925	50 %	25 %	25 %	0 %	28896808
87	NC_004603	CGAT	2	8	40305	40312	25 %	25 %	25 %	25 %	28896809
88	NC_004603	TCAC	2	8	40902	40909	25 %	25 %	0 %	50 %	28896809
89	NC_004603	TCTA	2	8	40921	40928	25 %	50 %	0 %	25 %	28896809
90	NC_004603	TTAT	2	8	41762	41769	25 %	75 %	0 %	0 %	28896810
91	NC_004603	AGCT	2	8	41771	41778	25 %	25 %	25 %	25 %	28896810
92	NC_004603	GACC	2	8	42534	42541	25 %	0 %	25 %	50 %	28896812
93	NC_004603	GACC	2	8	42552	42559	25 %	0 %	25 %	50 %	28896812
94	NC_004603	GGCA	2	8	42784	42791	25 %	0 %	50 %	25 %	28896812
95	NC_004603	TCCA	2	8	42958	42965	25 %	25 %	0 %	50 %	28896812
96	NC_004603	GAAC	2	8	42968	42975	50 %	0 %	25 %	25 %	28896812
97	NC_004603	TGGC	2	8	43406	43413	0 %	25 %	50 %	25 %	28896812
98	NC_004603	CTTG	2	8	43777	43784	0 %	50 %	25 %	25 %	28896812
99	NC_004603	CAAT	2	8	44157	44164	50 %	25 %	0 %	25 %	28896812
100	NC_004603	TGCT	2	8	45058	45065	0 %	50 %	25 %	25 %	28896812
101	NC_004603	TAAA	2	8	46310	46317	75 %	25 %	0 %	0 %	28896813
102	NC_004603	AAAG	2	8	46365	46372	75 %	0 %	25 %	0 %	28896813
103	NC_004603	GCTT	2	8	46506	46513	0 %	50 %	25 %	25 %	28896814
104	NC_004603	CTAT	2	8	47781	47788	25 %	50 %	0 %	25 %	28896815
105	NC_004603	ATTG	2	8	47838	47845	25 %	50 %	25 %	0 %	28896815
106	NC_004603	TTGA	2	8	48223	48230	25 %	50 %	25 %	0 %	28896815
107	NC_004603	AAGC	2	8	48455	48462	50 %	0 %	25 %	25 %	28896815
108	NC_004603	TGGT	2	8	48529	48536	0 %	50 %	50 %	0 %	28896815
109	NC_004603	CATT	2	8	48600	48607	25 %	50 %	0 %	25 %	28896815
110	NC_004603	CAGC	2	8	48632	48639	25 %	0 %	25 %	50 %	28896815
111	NC_004603	ATCA	2	8	49272	49279	50 %	25 %	0 %	25 %	28896816
112	NC_004603	GGTT	2	8	49506	49513	0 %	50 %	50 %	0 %	28896816
113	NC_004603	CTTC	2	8	49514	49521	0 %	50 %	0 %	50 %	28896816
114	NC_004603	CCAC	2	8	51071	51078	25 %	0 %	0 %	75 %	28896818
115	NC_004603	TGCT	2	8	51256	51263	0 %	50 %	25 %	25 %	28896818
116	NC_004603	ATTC	2	8	52141	52148	25 %	50 %	0 %	25 %	28896820
117	NC_004603	ATCC	2	8	52253	52260	25 %	25 %	0 %	50 %	28896821
118	NC_004603	GTTG	2	8	52828	52835	0 %	50 %	50 %	0 %	28896821
119	NC_004603	CAGA	2	8	52994	53001	50 %	0 %	25 %	25 %	28896821
120	NC_004603	CTGG	2	8	53076	53083	0 %	25 %	50 %	25 %	28896821
121	NC_004603	TTTG	2	8	53166	53173	0 %	75 %	25 %	0 %	28896821
122	NC_004603	TGGC	2	8	53552	53559	0 %	25 %	50 %	25 %	28896821
123	NC_004603	TTGG	2	8	56225	56232	0 %	50 %	50 %	0 %	28896823
124	NC_004603	CGGG	2	8	56244	56251	0 %	0 %	75 %	25 %	28896823
125	NC_004603	GTTC	2	8	56371	56378	0 %	50 %	25 %	25 %	28896823
126	NC_004603	TGGA	2	8	56961	56968	25 %	25 %	50 %	0 %	28896824
127	NC_004603	CGGT	2	8	57073	57080	0 %	25 %	50 %	25 %	28896824
128	NC_004603	ACCA	2	8	57520	57527	50 %	0 %	0 %	50 %	28896824
129	NC_004603	CTTT	2	8	57953	57960	0 %	75 %	0 %	25 %	28896826
130	NC_004603	AGCG	2	8	57974	57981	25 %	0 %	50 %	25 %	28896826
131	NC_004603	GAAA	2	8	58036	58043	75 %	0 %	25 %	0 %	28896826
132	NC_004603	TCGC	2	8	58677	58684	0 %	25 %	25 %	50 %	28896826
133	NC_004603	TGTA	2	8	59404	59411	25 %	50 %	25 %	0 %	28896827
134	NC_004603	ATCC	2	8	59540	59547	25 %	25 %	0 %	50 %	28896827
135	NC_004603	TTGC	2	8	61323	61330	0 %	50 %	25 %	25 %	28896827
136	NC_004603	TAAG	2	8	62653	62660	50 %	25 %	25 %	0 %	28896828
137	NC_004603	CAGC	2	8	63277	63284	25 %	0 %	25 %	50 %	28896829
138	NC_004603	GAGC	2	8	63512	63519	25 %	0 %	50 %	25 %	28896829
139	NC_004603	TGTT	2	8	64303	64310	0 %	75 %	25 %	0 %	28896830
140	NC_004603	CAAC	2	8	64459	64466	50 %	0 %	0 %	50 %	28896830
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