MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004572	ACGATG	2	12	47811	47822	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_004572	GCCACA	2	12	169859	169870	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
3	NC_004572	AACCAT	2	12	170320	170331	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_004572	AACCAT	2	12	176829	176840	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_004572	ACTGCA	2	12	177280	177291	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_004572	TGTTAC	2	12	177891	177902	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_004572	ACATAA	2	12	182037	182048	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_004572	AGCCAT	2	12	183051	183062	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_004572	GCACCT	2	12	185001	185012	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
10	NC_004572	CCTGCT	2	12	185599	185610	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
11	NC_004572	AACCAT	2	12	185803	185814	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_004572	TGGTAC	2	12	217574	217585	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_004572	TTATTT	2	12	220298	220309	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_004572	CAAACC	2	12	241014	241025	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_004572	ACTGCA	2	12	244759	244770	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_004572	ACCTGC	2	12	251280	251291	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
17	NC_004572	GCTGTG	2	12	252242	252253	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
18	NC_004572	CATATA	2	12	252265	252276	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
19	NC_004572	GACACA	2	12	256372	256383	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_004572	CCAGTA	2	12	257516	257527	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_004572	TCACAT	2	12	257830	257841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_004572	ACTGCA	2	12	261999	262010	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_004572	ACATAA	2	12	271313	271324	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_004572	GCTGTG	2	12	272581	272592	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_004572	CATATA	2	12	272604	272615	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_004572	ACATAC	2	12	280038	280049	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_004572	TTTTAC	2	12	281251	281262	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_004572	ACTGCA	2	12	283260	283271	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_004572	GCGTAA	2	12	357113	357124	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_004572	ATGACA	2	12	569074	569085	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_004572	TATGGT	2	12	688132	688143	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004572	TGCAGT	2	12	688243	688254	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
33	NC_004572	TGCAGT	2	12	696199	696210	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_004572	TATGGT	2	12	701864	701875	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004572	AGCAGG	2	12	702069	702080	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_004572	AGGCAC	2	12	704817	704828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_004572	TATGGT	2	12	707938	707949	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004572	TGCAGT	2	12	708049	708060	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_004572	CTGTGG	2	12	708277	708288	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_004572	TGCAGT	2	12	712533	712544	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_004572	TATGGT	2	12	712744	712755	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004572	AAACCT	2	12	766543	766554	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_004572	TACCTG	2	12	773822	773833	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_004572	AGCCAT	2	12	778340	778351	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_004572	TTTCTT	2	12	813386	813397	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_004572	GCCTCA	2	12	867014	867025	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
47	NC_004572	TATGGC	2	12	871862	871873	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_004572	ATACAT	2	12	875865	875876	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.