MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 10433

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004572	ATA	2	6	130	135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28492968
2	NC_004572	GAT	2	6	169	174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28492968
3	NC_004572	CAA	2	6	191	196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28492968
4	NC_004572	GAA	2	6	280	285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492968
5	NC_004572	TTC	2	6	361	366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28492968
6	NC_004572	AAC	2	6	403	408	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28492968
7	NC_004572	CAA	2	6	416	421	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28492968
8	NC_004572	AGA	2	6	642	647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492968
9	NC_004572	TCT	2	6	676	681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28492968
10	NC_004572	TTC	2	6	947	952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28492968
11	NC_004572	AGA	2	6	953	958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492968
12	NC_004572	AGC	2	6	1021	1026	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28492968
13	NC_004572	AGA	2	6	1086	1091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492968
14	NC_004572	AAT	2	6	1167	1172	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28492968
15	NC_004572	AAT	2	6	1338	1343	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28492968
16	NC_004572	GAA	2	6	1355	1360	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492968
17	NC_004572	GAG	2	6	1428	1433	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28492968
18	NC_004572	ATT	2	6	1514	1519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004572	TTA	2	6	1642	1647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_004572	AAT	2	6	1676	1681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_004572	AAT	2	6	1719	1724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004572	TTA	2	6	1984	1989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28492969
23	NC_004572	GTA	2	6	1990	1995	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28492969
24	NC_004572	TGA	2	6	2012	2017	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28492969
25	NC_004572	AGA	2	6	2036	2041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492969
26	NC_004572	ACA	2	6	2187	2192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28492969
27	NC_004572	GAT	2	6	2205	2210	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28492969
28	NC_004572	GTC	2	6	2348	2353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28492969
29	NC_004572	AGA	2	6	2522	2527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492969
30	NC_004572	TAT	2	6	2714	2719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28492969
31	NC_004572	AAT	2	6	2896	2901	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28492969
32	NC_004572	AGA	2	6	3289	3294	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492970
33	NC_004572	GAT	2	6	3304	3309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28492970
34	NC_004572	ATG	2	6	3331	3336	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28492970
35	NC_004572	ATC	2	6	3405	3410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28492970
36	NC_004572	CCT	2	6	3423	3428	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28492970
37	NC_004572	TGG	2	6	3449	3454	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28492970
38	NC_004572	ATT	2	6	3561	3566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28492970
39	NC_004572	AGA	2	6	3624	3629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492970
40	NC_004572	AAG	2	6	3693	3698	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492970
41	NC_004572	TGT	2	6	3798	3803	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28492970
42	NC_004572	GAT	2	6	3811	3816	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28492970
43	NC_004572	AAC	3	9	3891	3899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28492970
44	NC_004572	AGA	2	6	3942	3947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492970
45	NC_004572	CAG	2	6	4070	4075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28492971
46	NC_004572	AAC	2	6	4152	4157	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28492971
47	NC_004572	GTT	2	6	4230	4235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28492971
48	NC_004572	AGG	2	6	4389	4394	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28492971
49	NC_004572	TTG	2	6	4621	4626	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28492972
50	NC_004572	CGG	2	6	4691	4696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28492972
51	NC_004572	GTT	2	6	4770	4775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28492972
52	NC_004572	GGA	2	6	4812	4817	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28492972
53	NC_004572	CGG	2	6	4829	4834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28492972
54	NC_004572	TGT	2	6	4856	4861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28492972
55	NC_004572	CTG	2	6	4945	4950	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28492972
56	NC_004572	GAA	2	6	4965	4970	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492972
57	NC_004572	TGA	3	9	5006	5014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28492972
58	NC_004572	TGC	2	6	5047	5052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28492972
59	NC_004572	AAC	2	6	5133	5138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28492972
60	NC_004572	GAA	2	6	5217	5222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492972
61	NC_004572	GCA	2	6	5370	5375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28492972
62	NC_004572	CAC	2	6	5559	5564	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28492972
63	NC_004572	ATT	2	6	5622	5627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28492972
64	NC_004572	CTT	2	6	5637	5642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28492972
65	NC_004572	TTG	2	6	5776	5781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28492972
66	NC_004572	AAT	2	6	5984	5989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28492972
67	NC_004572	AAG	2	6	6171	6176	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492972
68	NC_004572	ACC	2	6	6276	6281	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28492972
69	NC_004572	GAC	2	6	6321	6326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28492972
70	NC_004572	TGA	2	6	6338	6343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28492972
71	NC_004572	GGA	2	6	6365	6370	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28492972
72	NC_004572	TCG	2	6	6380	6385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28492972
73	NC_004572	GAG	2	6	6474	6479	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28492973
74	NC_004572	ATG	2	6	6772	6777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28492973
75	NC_004572	GCC	2	6	6783	6788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28492973
76	NC_004572	TGA	2	6	6845	6850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28492973
77	NC_004572	ATG	2	6	6877	6882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28492973
78	NC_004572	CGC	2	6	6979	6984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28492973
79	NC_004572	GTG	2	6	7016	7021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28492973
80	NC_004572	GAG	2	6	7047	7052	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28492973
81	NC_004572	GTT	2	6	7176	7181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28492973
82	NC_004572	GAA	2	6	7188	7193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492973
83	NC_004572	TTG	2	6	7213	7218	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28492973
84	NC_004572	GGT	2	6	7382	7387	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28492973
85	NC_004572	TTG	2	6	7450	7455	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28492973
86	NC_004572	AGC	2	6	7561	7566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28492973
87	NC_004572	CGA	2	6	7610	7615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28492973
88	NC_004572	TCT	2	6	7635	7640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28492973
89	NC_004572	GAG	2	6	7650	7655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28492973
90	NC_004572	GCG	2	6	7727	7732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	28492973
91	NC_004572	GCC	2	6	7737	7742	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28492973
92	NC_004572	AGA	2	6	7781	7786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492973
93	NC_004572	AGA	2	6	7847	7852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492973
94	NC_004572	ACG	2	6	7886	7891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28492973
95	NC_004572	AAT	2	6	7898	7903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	28492973
96	NC_004572	GTT	3	9	7959	7967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28492973
97	NC_004572	GGT	2	6	8028	8033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28492973
98	NC_004572	TGA	2	6	8063	8068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28492973
99	NC_004572	TGC	2	6	8074	8079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28492973
100	NC_004572	ACA	3	9	8091	8099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28492973
101	NC_004572	TCT	2	6	8204	8209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28492973
102	NC_004572	AAG	2	6	8408	8413	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492973
103	NC_004572	CAT	2	6	8423	8428	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28492973
104	NC_004572	CTT	2	6	8538	8543	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28492973
105	NC_004572	GAC	2	6	8565	8570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28492973
106	NC_004572	TGT	2	6	8582	8587	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28492973
107	NC_004572	GAT	2	6	8721	8726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	28492973
108	NC_004572	TAC	2	6	8801	8806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28492973
109	NC_004572	CTC	3	9	8917	8925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28492974
110	NC_004572	ATT	2	6	9203	9208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28492974
111	NC_004572	AGG	2	6	9406	9411	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_004572	CCA	2	6	9436	9441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_004572	GCC	2	6	9709	9714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28492975
114	NC_004572	AAG	2	6	9733	9738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	28492975
115	NC_004572	GTT	2	6	9820	9825	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28492975
116	NC_004572	CTC	2	6	9844	9849	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28492975
117	NC_004572	CAC	2	6	9943	9948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	28492975
118	NC_004572	GCC	2	6	10032	10037	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28492975
119	NC_004572	CTT	2	6	10213	10218	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28492975
120	NC_004572	GCC	2	6	10231	10236	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	28492975
121	NC_004572	CTT	2	6	10269	10274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28492975
122	NC_004572	GAC	2	6	10349	10354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_004572	TCC	2	6	10501	10506	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28492976
124	NC_004572	GGA	2	6	10632	10637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	28492976
125	NC_004572	CCT	2	6	10681	10686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	28492976
126	NC_004572	GTG	2	6	10705	10710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	28492976
127	NC_004572	AGC	2	6	10728	10733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28492976
128	NC_004572	TGC	2	6	10783	10788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28492976
129	NC_004572	CTT	2	6	10856	10861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	28492976
130	NC_004572	TTG	2	6	10989	10994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28492976
131	NC_004572	ATT	2	6	11023	11028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28492976
132	NC_004572	CTG	2	6	11081	11086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	28492976
133	NC_004572	CAT	2	6	11148	11153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28492977
134	NC_004572	ATT	2	6	11170	11175	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	28492977
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136	NC_004572	TAT	2	6	11383	11388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_004572	GCA	2	6	11461	11466	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	28492978
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142	NC_004572	CAA	2	6	11974	11979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	28492978
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145	NC_004572	TTG	2	6	12189	12194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	28492979
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261	NC_004572	ACT	2	6	22912	22917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	28492988
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272	NC_004572	GTG	2	6	23729	23734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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276	NC_004572	ATT	2	6	23909	23914	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
277	NC_004572	GTA	2	6	23983	23988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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