MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Non-Coding Repeats of Tropheryma whipplei str. Twist

Total Repeats: 78

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_004572	A	7	7	1460	1466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_004572	A	6	6	1710	1715	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_004572	T	6	6	14104	14109	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_004572	T	6	6	22434	22439	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_004572	T	7	7	25687	25693	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_004572	T	6	6	41238	41243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_004572	A	6	6	64515	64520	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_004572	T	6	6	69847	69852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_004572	A	6	6	107052	107057	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_004572	A	6	6	114930	114935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_004572	A	6	6	171728	171733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_004572	A	6	6	177185	177190	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_004572	C	6	6	178226	178231	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14	NC_004572	A	6	6	182317	182322	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_004572	C	6	6	184541	184546	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
16	NC_004572	G	9	9	184568	184576	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
17	NC_004572	A	6	6	192753	192758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_004572	T	6	6	206158	206163	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_004572	C	6	6	214478	214483	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
20	NC_004572	C	7	7	216710	216716	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
21	NC_004572	G	6	6	218530	218535	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
22	NC_004572	T	7	7	220243	220249	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_004572	T	6	6	220284	220289	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_004572	C	6	6	263934	263939	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
25	NC_004572	T	6	6	270915	270920	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_004572	A	6	6	271593	271598	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_004572	A	6	6	278104	278109	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_004572	C	6	6	278470	278475	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29	NC_004572	T	7	7	285029	285035	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_004572	T	7	7	288845	288851	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_004572	G	7	7	298471	298477	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
32	NC_004572	T	6	6	323445	323450	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_004572	T	7	7	359513	359519	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_004572	T	7	7	360086	360092	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_004572	A	6	6	364018	364023	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_004572	T	7	7	376112	376118	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_004572	T	6	6	395377	395382	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_004572	T	6	6	414538	414543	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_004572	A	6	6	439210	439215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_004572	T	6	6	496606	496611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_004572	T	6	6	549472	549477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_004572	A	6	6	557595	557600	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_004572	A	6	6	561617	561622	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_004572	A	6	6	564135	564140	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_004572	A	7	7	564286	564292	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_004572	A	6	6	579332	579337	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_004572	A	6	6	585616	585621	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_004572	A	6	6	615812	615817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_004572	G	6	6	628333	628338	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
50	NC_004572	A	6	6	628506	628511	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_004572	A	6	6	637249	637254	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_004572	A	6	6	649436	649441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_004572	A	6	6	673642	673647	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_004572	G	6	6	681052	681057	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
55	NC_004572	G	6	6	701348	701353	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
56	NC_004572	T	6	6	707847	707852	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_004572	A	8	8	711834	711841	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_004572	T	6	6	712650	712655	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_004572	A	6	6	718038	718043	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_004572	C	6	6	726724	726729	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
61	NC_004572	C	9	9	732980	732988	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
62	NC_004572	G	6	6	733010	733015	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
63	NC_004572	A	6	6	734466	734471	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_004572	A	6	6	738648	738653	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_004572	A	8	8	744525	744532	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_004572	C	7	7	752202	752208	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
67	NC_004572	A	6	6	761261	761266	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_004572	A	6	6	768869	768874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_004572	A	6	6	791947	791952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_004572	A	7	7	825189	825195	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_004572	A	6	6	826293	826298	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_004572	A	6	6	828452	828457	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_004572	A	7	7	835518	835524	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_004572	G	6	6	852944	852949	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
75	NC_004572	T	6	6	861884	861889	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_004572	C	6	6	883680	883685	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
77	NC_004572	G	6	6	889345	889350	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
78	NC_004572	A	6	6	922778	922783	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.